BtaINT0050256 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000013078 | DNAH11
Description
dynein, axonemal, heavy chain 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2942]
Coordinates
chr4:30527885-30552094:+
Coord C1 exon
chr4:30527885-30528118
Coord A exon
chr4:30528119-30551962
Coord C2 exon
chr4:30551963-30552094
Length
23844 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATTT
5' ss Score
7.51
3' ss Seq
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3' ss Score
6.01
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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Vast-tools module Information
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Protein Impact
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Features
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A:
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NO
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NA
Other Inclusion Isoforms:
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Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]