DreINT0046780 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000017790 | chrnb2b
Description
cholinergic receptor, nicotinic, beta 2b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-070821-3]
Coordinates
chr16:22744380-22758033:+
Coord C1 exon
chr16:22744380-22745511
Coord A exon
chr16:22745512-22757787
Coord C2 exon
chr16:22757788-22758033
Length
12276 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGCGTGAGT
5' ss Score
8.2
3' ss Seq
CTTTATTTTTAATCTTACAGGTG
3' ss Score
10.84
Exon sequences
Seq C1 exon
TGCTGACGGCATGTATGAGGTGTCATTCTACTCCAATGCTGTCGTCTCCTATGATGGAAGTGTCTTCTGGTTGCCACCAGCGATCTATAAGAGTGCCTGTAAAATTGAGGTGAAGCACTTCCCATTCGACCAGCAAAACTGCACTCTAAGCTTTCGTTCCTGGACCTATGACCGTACAGAAGTGGACTTGGTTCTGCGTGCAGACGTGGCAAGCATGGATGATTTCACACCCAGTGGTGAGTGGGATATCATTGCTCTTCCTGGCCGTCGAAATGAGAACCCTTCAGACCCAACTTACGTAGACATCACCTACGACTTCATCATCCGCCGAAAACCCCTGTTCTACACAATCAACCTCATCATTCCTTGCGTCCTCATCACCTCGCTGGCCATCCTGGTGTTCTACCTGCCGTCAGACTGTGGCGAAAAGATGACGCTGTGCATCTCGGTGCTCCTTGCCCTCACTGTGTTCCTGCTGCTGATCTCTAAAATTGTGCCCCCCACTTCTCTCGATGTCCCTCTGGTTGGGAAGTATCTGATGTTCACCATGGTGCTGGTCACATTCTCCATTGTGACGAGTGTGTGTGTGCTGAACGTGCACCACCGGTCGCCCACCACACACACTATGCCTCCGTGGGTGAAGTTGGTGTTCCTCAACAAGTTGCCTGCTCTTCTCTTCATGCGGCAGCCGCGTAACAGCAGTGAACGACAGCGTCTGCGCCAACGTCGGCGTGCCAATGAACAGCAGGAAGGTGGGCGAGGGGGTCTGGCTGCCGGGCTCATGGCAGGATTGGGTCTGAGCGGCTCTTCATCAGGGAGCAAAGAGAACAATGAGGCTTGCACATGCTATGTGAACCGGGCCTCTGTGAAACAGTTTGGGGCAGAGTTGGGTGGAGGGGGTGGTGGAGGTGGGTCAACAGATGGACTAAACGGAATAAGAGAAGGGGGCAGAGAGACCAGGGAAGGAGGTGCAAATCCATTGCAGGGATCTGCTCTACCTCGGGGGAAACAGCAGCCCCCTACTGTCCTCACTCAGGCTCTGCTGGCCCAGGCCTGTCCAGGGTTTGAGGAGGCTGTAGATGGAGTCCGCTTCATCGCAAACCACATGAAGAGTGAGGATGACGATCGTAGC
Seq A exon
GTGAGTCATTCTCTTTCATAATCACTTTTCTGTATGCACAGATACATGTTTTCATTTTGGCAACAATAGCATGCTATCATTCATATCAGTCATAGTTCAAGTAATGCTTCCTGTTCATTGTTGTACCTTTTAATGATAAAGTGACAACAGACTTGGTGACTCAGACTAGAAATATGAGAGGAAAACATTTCTTCTTGTTCAGCCCAAATAACTTTGATATGAAACTGAAATATTATTAGGCCTGTTGTCAAATGAATAAATAATCTGCTGCTGTGATTCCTGTAAAGCATTATAGCATTATATTTAAAGGCATACTGTAGTTCAACCAAAAATTTATTCTCAATATTTACGCATCAACATTGCTCTAACACATTAAACTTTTTTATGTTCTAAGCCTAAATGAAGATATTTAAAAAAAAAAAAGCTAAAATGTTTCAGTCCTTCCATAGCAAGTCCAAACACGCAACACTTTTACCAATGACGTTTGCTCTTTAATGTTTATGTGTAAATAAAATTCAATCAAATCACATGCCAAGTTAAATCATATAGAGCAGTGGTCTCTTATGAAAGCTTGAATTAATCAGTATAACTTTAACCATTAACTGTTTAAATGACTTTCAATGGAGGTACAAGAATTTCTGCTTCCAAATAATTTGTCTTTGTGCCTACATTTATTTTGCCATGATGAATCAGAAGCTTTTAAGAAGTGTTTTAATTTGATTTATCATAAAACTGCAATACATTAAATCTGTAATCTAATTACTTTACACTGTGAAACATTTTAGGTCATTACAGCAACAACAAAAACAATCTTTATTTCTTTTTTCGCTTTTTCTTGTACACTCAACTTTTTAAAACATTATTTTACTTAAAATGACTTGTCAGTAATGCAAAAAACATTTAGTTAACATAGGATTATATATTTTTTTATAATTTGTAATTTTTTGTTTATAATTTCTACTGAAAACAAAACCTTTTTAAGTTGTGCCAACTGAACATTTCTTGTCTGCAGATCTGGAATACCTGAAGTTTAGTGAACAAAAAAGCAAATCGAAATTAGTATTATGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACTGACTTAATTTTTTTTACGCCATGAACACCTGACCACCATGTATCAACACACTAACCACTACACTATTGGCCCCAACGTGTACTCAAATTTTGAAAACATCAGTAGCACCTAAAATGAGAAAAGTTGAGTGAACAAAAAACTCTTGTGGAAATTGGAATTAAAAAATAATACATTATCAGATTAAACAAACTTAGTTCAATTAAAAAAGAAAAAGTAAAACAGAGACAAATATTAACAAAACATTTATTAGACAGAATTACAAATAGAACAGGAGATAAAACAACAATAATGGTAAACAAGACAATGATCAAAACATGGCAGGGAAACAGGGAAAAATGCTTTTTAATGCTTCACATTTTTGTTCACTCAACTTCAGACATTTTAGGCCAGCGCAGCCAATGAGAAATAGGGCTGTGCGATTTGGGGAAAATATCTCATTTTGTTTTGACAGATATTAATTTACGATTTAATTCAAGTTCCAAGCTGATTTTAGTTTAATTTAAGCTTCAGCTTAATAATCTGTAAGGCGTGGCAACAATTCTGCAATAGCTCTTAAAATATACCTGTTTTTGTTCAGTGTCTGTGACTTTAAAACCAAAATATTCCCATATTACAAATGCTGTTTTTCTTTGATATTAATTTGTCTATTAATGCTTCTGAAGCAGCAGACCCATTATCCCACTTGTCAGCACTTTGCTGTTTGTTTTCTTTTTGTTATTGTGGGTGTAGTTCAGTTGTGCAATTCTGATTGGGCAGAACGAAAGTGTGGTCACTCAATTGGCTAGTTATAAAAGCCAGGTCAGATCACATGATTTTGGCACAATTTCCTTGATTTCCTTGACGTATGACTTGTGGGGAGTCGTAAATGACAATGTATTGATGACAATTGGCATGCCCGCAGCTCAGCCCGCGTTCTGGGTATAGGTGCCTGCTATGCGTGATCCCCTGCAGGCGATCCCATAAGCTCAGTCAACCCAGGTTTAGTCCCCCCTGTGTTAAGGTGGGCTCGTGTCTTCCCTCCAAGCTAACCATCCTCTTATGTACCCCTCCCCCGTTCCGGTGCTGGGCCACAGGCTGTCACCAGGTCTCCCCTCCTTGAGTAGCAGGTGAACTCCGCAGCGTCCTCCCTATCAGGACTGAACGCTTTCCCAACGTGCTGTCGTATTAAAACCCTTTTTACTGGGTTATTTTCGACTCCCCGAAAAATATAGCTAAACCGGAACAGGTAAGTAAGGTAAGTAAGGGCCAGGGGACACGTTGGAAGACTGCATCTCGCGGTGTTGTAGGTGCGCTCGCTTTACTGCGTGCCGCACCCTTCGCCAGGGACGCAGTATGGTGCTTTCGTTGTGGCGTTTTCCATAGATTTCATTGGAGTTCCCCATCCGAAGGGGAATGCTTTGGTTACTTAAGTAACCCTCTCTGTACTCTCTGTAAATGCTCTGTACCTTCGCCACAACGATCGTCCCTTAGCTGTTGAGTGTGAAAGTCTCCGAGCATTGCACTAGCCGTGTCTTATATACTTGACTGATTGTCATTGAAGTCAGCTGTGCATGCTGACGCTGCCAATTCATTTGGCATTTCATTGGCCCGATTTTATACTCTTTCAGATTATTGGTTTCTGACGAAAACCCCATAGTGGAAGGTTTTCCACATAGCATTTCCATTCCCCCCCTCGGGGAACGAGGGTTACTTTAGTAACCGTAGCGTTCTCTTATGATTATGCAGCAACTACACCTTTATCGGATGAACTGTAAAAATGAATAGATAACTAGTTATACACCAGTGATGCTGTTACAGAAGCAGAGCTAAACTGGAGTTTAAAATTACACTGCAGTATTTTTATGTCAGTGTTAAGATTATTTTCATGCAGCTACACCAACAAGAAGTTTGAAATTAATCGTACACTGTCAGAGCATTGAATTATACAGCCCTCACTCAAAACTTGACATTCATTATGAGCTGATTGCGAGCTAACACACATTCCCACAGACACACTTAGATCAATATGCAGCTCCACACTTGTGCTTTAATAATCTCTGATGTGGAGGCTTTGACAGGCAAGTCGTATAGCATTAAAAAAAGAGATCTGGTGTTTAGCCAAAGCACAGCTACACATCAGCACTACACTCACTCTTGGCATTTAAATGGCTTACAGTCCCATTCTGTCAAACACCGTCTGAGTCTAAGCATTACTCACGAATGAGAGAAGCAGTTGTGCTCGATACTAGAAAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGATGAAAACAAACATCTATCTGTTAGCAATGTGATGGCAAACATGTTTCTTAAATCAGTTAGGCGTGTGTTAAATCATGCTACAAACATGCTAACAACATAACAAAACATGCTAGCAGTGTTCTTAGTCATGCTACAAACATATTAAAAAGGTCATTTTCACTAAAAAAATGCCTTTAAGACGTCAGAATTAAAAAAAAAAAAAGTTTGAGATTTTTTATTTAACCACATTGCTTTATTAATGAGACCTTCAGCTTTAAGAAATGAATGTTGGTCAAGCTTCTGCACTATTTATAAATAAACTGCAAGTAGAAAAACAGTAAACAAACCTCAAATTGTGTCAACCATGTCATGGAAAAATTCAAAGTAGTCTAAGTATATTGTCATTGCAGTGTGACTATAAAATATATATTTTCAGAAAGCTTATGTGTCCCTTTACCAAGACAACTTTTTCGATTCTGGAAAAAGTGAAGTCTATTTAATAATGTAATAATGGACAAAACATTTATTTCCCAATAAAATATACTATCTTTACACATTCTTTTCAAAATAAAACACAACATCTAAAATATTTTGTCAAACTTTCCAACAATAATAACTGGCTCTTATTGGTTAATTAAGAAATCACACAAATATTTTTGCTAAGTTTATAAATAATTTGTTTATTTTTATAAAAGTTTAACATGACAGTGGAAAACAAGATGACAGGGTGGACATTGGCATGTATTTTATTTTTATTTGAAACAGCCAGTGAGATCCATTATATCAGGGGTGGCCAACCCTGTTCCTGGAGAGCCACCTTCCTGCAGTTTTCAGTTGCTACCCATATCAAACACACCAAACCAATTAATTAGGATCTGAACACCAGGTGATAATTACAGAGAGGTGTGTTTGATATGAGTTGCAACTGAAATCTGCAGGAAGGTGGCTCTCTAGGAACAGGGTTGGCCACCCCAGCATTATATGGACTTTAAAAGGATATCTTTTATATACAGTAGACTGAGACAGATATTGGCAAAAGGTTTGTATTGTCCACTCATGTATTGCATTTACTGGTGTAGTATGTGTGCATTGTTACATAAAAATTAACAAATTAACAATAAGATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGATGTGTCAATAACAATGCATACAGTTGAAGTCAGAATTATTAGCCCCCCTGAATTATTAGCCCCCTGTTTATTTTTTTCCCCAATTTATATTTAACGGAGAGAAGATTTTTTTCAACACATTTCTAAACATAATAGTTTTAATAACTAATTTCTATTAACTTATTTATTATATATTTGTCATGATGACAGTAAATAATATTTGACTAGATATTTTTCAAGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCTTAACTAGGTTAATTGGGTTAACTAGGCGGGTTAGGGTAATTAGGCAAGTTATTGTATAATGATGGTTTGTTCAGTAGACTATCGAAAAAAAAATATAGCCTAAAGGGGCTAAAAATATTGATTTTAAAATGGCTTTTACAAAATTAATAACTGATTTTATTCTAGCCAAAATAAAACAAATAAGACTTTCTTCAGAAGAAAAAATATTATCAGACATACTGTGAAAATTTCCTTGCTCTGTTAAACATAATTAGGGAAATATTTAAAAAAGAAAAAAAATTCAAATGGGGGACTAATATTTCTGACTAATTCTAACTGTATGTTCACCTTGTCAAGGAAGGATTTAGGACAGGGTGGACAATGAGAGGGGGGATATTTTTGGCTAAAGATAGCATTTATTCAACACATGTTGTACCTGCAGCAGGTAAAGTGTTTCCCTATTTAAGCTCTTTGTACACAGTTTAAAAGCTATATATTTTATTTCTGATTTGCTTGAATATTAATTAATATTTCACTATCACAGGGTTGACAAGCTTGACAACATATAGTTTCAAACACTATATGTGAAAAAATTGGAAACATAAGTGTAGATAGTTACTGTTTGCGCATCAGATGTTTTAACCTCCTCTACAGAAAGACAAAACGGGCATGGGGATGCCAATGAGTACACCAGAGGGTTCCTTAAAGGGACATTTACCACGTCACGACAGGGTGAACAGCGATTTCAAGGACATGTGCAAAATGATTAATGATATTATAAATACAAAATAAAAGTTTTCAAAATTACTTATTTTATCAAATAACTTGGGTAAGACAGTAAGAATATTTAAAAATCTTTAGAATTTTATTTAATTTACCTACTTTTTAGAATCACTGATGTTGGTTGAGCAGTGTGCGGGACATAGCAAAATCACACCTATTTAATGACAAAATATGTCAAAAATTGACAAAAACATTTCAAAACAGTTATAATTCTACCTGCAAGTGTGTATATGTTTAACCAATTATATTAAAACATCAGTATTTCATTTTTTTACTTTATGTTTTTATAGGACTGATTCAATCTTGTGGGACATCACAGGCACTTTATAGTGAATATGCTCCAAAATACATAAGGAGTGTGTTAGATTATGCTAACGTTAAAATAGTGTCACCTTGTGTTAGATGAAACCAGTAGTCACTATGAGGTGCCGTGTAGGATTTAAATCAAACTTTGCTTATCAACACATACATAAAACACATGTATATACACCTATAATTTACTCGCATATACACCTATACTACTGGATGTTCAAAACAACATAGATGAAACTTGTGTATATACATATAAACTTGACGCATAAATACACCCACATACACACATATAAACTCGATCCTCACATAAACACTCACATTAACACACGCACATACATATAAACTTGCTGCATGCAAAAACACACCTATGCACACTCGCATATACATATAAACTCGCAGCATGCAAACACACCTACATAAATCGCATATACATATAAACTCGATCTATGCATATAAATAATAAAAAAATATTATACAAATATTATATAAAAATAATATTATATTTAATAAAAAATAAATAAAACTCACAAACGTTTATCACGAATCTGGTTATTGCAAAGCTTATGAAATATAAATAATGCAATTAATAGAGGGATTAAATATGTTAAATTATGAACATATGATATATAAAATATGAGTCTATATAAATAGACTACTCAAAATAAGAAATATTTTTACTTTAAACCTTTTCATTTAATAAGGTAATTACATACACAAATACAAAAGGGTTAGAACCCTTATTAGAACCTTTAAAGGATGTTTAAAAAGCAACCATAAATATAAATGTATACTCAAACTAAACTCCTCTTTTCTATTGCAAATGTTAATGTAGCCTATAGTCTTCTTGTTTTGTTTTTTAAATTCCTATAATTATTATGCTTTTTATAGGTTTTAACAATGTGGGTTTTAAAATTGCAAGATTTTGGTATCATTTTGATTGTTAATTATTCAGCATATACAAAAAAAAAAATAATAATAAACCCCCCCCCCCCATGGAAAAGCTATATATATTCTCTGGACACTCCTTTTATGTTTAACAACTACTACTTATATTTTTACAGCAGCTGGCATCCAGCATTTTGGTGCATTAGCCTGTGTATTGGTAACAGGAAAACCCACTTAAGTGCATTCCTGCCCCCTACTGGACATAAGTATGTATCATAACCCTTGACGAATAGTGACACCAATAATAAAACAAACATAAAAAACTAATATTAGACAAACATATTTTATTCAAAGTGATTACTTAAGCAACCTTATATTTATTAAACCATAATAACATTTCCAATAATTTAATTGCATAATAAACCTTCAATTTTGCAGGAGCATTCCTTAGCATTACCTTTATATTTATTTATTTTTAGAATTAGCATAATCTATTTTCATAATTCAACAGATGTAATTCCTCTATTTATCGCATTATTTCTGTTTCTTAAGCTTTGTAATAACCTGATTAATGACAAATAATAATCTTGTTCATTACACTCAAAGGACTTTTACGTTGAAATTAAACTACTTCCTTTTAAAGTGAAATAACTTCCTTTTACTGTGAAAATTCATGCATACACACATATGTATGTGCGTGTGTTAATGTGAGTGTTTATGTGAGGATCAAGTTTATATGTCTGTGCGTGTGTATGTGGGTGTATTCATGCGTCAAGTTTATTTGTATATACACAAGTTTCATCTATGTTGTTTTGAACATCCAGTAGTATAGGTTTATATGCGAGTAAATTATAGGTGTATATACATGTGTTTTATGTATGTGTTGATAAGCAAAGTTTGATTAAAATCCTACACGGCACCTCATAAGTCACTAGCCCCTTTCACACCGGCAATTTTCCGGAAAGGTTTGTATGTGTGAACAGGCCCTTTTTGGAAATGCCGGTAAATTCATTCTGGTAATTTTCTGGAAAGAGAAGTTGTAACATTAACGGTAATTTGCCAGAATGCTGCTCTGTGTGGACACAGAAGGAAAATTGCCGGAAAGAGCGCGTTCATGCTTAGAACAGGATGACATGAGACGTGTAGTCAAGCCAATCAGAACATTCAGATGCATTCACATCCGCACTGTTTATAAAAAGTAACACCTTTGAATATATTTCCAAAAATAGGTGCTAGATGTTAGTCAGAAAACGTTTCTACAGTATGTTCCAACTGTGCAAAAAAATTATCAATAAAATGCTTATTACATTATATATATTTTTTTACCTTCAAGCTCTGCTTCAGTTGCTTGACGCACGTGAAGCAGCCAGTGAGCGCCAACACACACATATTATAAACATCTCGACATGCGAAAGTGTAATGTAGTCAAAAGTTTACAAGCATAAGCTAAGACGTTTAGAGCTCATTTCTAGCAAATGATGTCAGAATTTACCGGTGTTTTGGAATGGAATGGAAAACATTTCCGGATATTTACCGTTATCACTGTGTGAAAGGGGCTACTGACTTCAATATTAGGATTAATTAAAATGTTGGGGGGGAAATATAAATATAGATGTCAATGGCTTCTGGTTTCTAACATATGAAAAATATATATCTCCTTTTTTGTACACTGTAAGAACTCAATAGTCAATGTTTTCAAGTAAAATGAGTGTAGTTAACTCAAAAATGACTGGAATGTTAATTCTACTCATTTGAAAAGAAACTCACTGTTGAAGTTAATGGGTTAATGAAATGATTAAGTAAGTGTTGATTGAGCATTAATAATGTACATGTACATGGGCTGCTAACTAATTATCTCTTTACTTCAACTCAAATGGAGTAAGTTCACAGTACTCATATAAATTGGATTTGAACTCAAATGGTTTGTAGCAATCGGTTTGCTCAAACGGTTTAAGTTGCTTGATTTCATTTTACAGTACTCAATTGGGTTGAGTTCTCTTAATTTATTGGGTTTTACTGTGCTCAAATTGTTTCATGTACTCAAATGGATTACGTTCACAATACTCATTAGGATTAGTTTTTTTAACCTAAATGGTCTGTTGCAATTGGTTTCCTCAAATGGTTCGAGTAACCTTAACCTTTTGGTTTTACAGTGTAACAAGAGATAAAAGTTTGAGCAACTGATGACAGAATTTCATTTTTGGTTCAACTATATATCTTCAAATGGTCCAGTTTCATACCGCAAAACTGCTGAATGAGAAGAGATTCTGGTAGATTTATGGCTAGTGAGTTATTTTCTTTATTTGTTTCACATTACTTTGATGATATTGTTCAATTGGAACAGTCAGCAATATATTTTACAGCTAAGCAATATTTTTAAGTGGGCTTAAGCAGTGGTTGTCCCTTTAAGAGCAGGAATACTGTCCACAAGAGGTAAAATTAACAGCACTCAGTAATTCTGTCAATCATCTTAACTTGCACACAGTCTCATTCCCATGGTAACAAGGCGTCTCCATGCCAGCTCCCTCCCAGCCTTTGCCATGGTTTGGGTTCAGGTCCCTAGTGTCTCACCTCATCAGAGCAGTGTTGCGGAACCAAGTCTCTGTTCACATTAACCTTTTCCTTCACCCTCTTCTCTCACTTCCACACATCCGCATTCAGTCTCACATTTTTTGTTTACCTCTCAGTCTTTTTTACCCCACCCCCACATCTTTTATAGGTGACTCATCTTTGTCTTGTCTACTTCACCTTCATTTCTGACATTTAGCTTTTTAAAAATGAAAAATGAAAATTTCAGGTCTTAAAATAATTTGCTGCTGTCTTTTTCATGAAGCGCAACAGGGGGATTTTAACGCACAGCATTGTGCAGTGTAATGAGTTCAATGTAAGCACATCTGTCAAGCTCCTAAAAGGAAGACTTTCCTTCACTGATTCATTCGTTGTTATTCATTCCTTTCTAGTGTCTATGGCAGCTCTTAAATCAAATATGGCATCTATGGCCTAGATTTCGCATCATGACGTATGGTCACATGTACTCTCATGCTACCAGGGGCCTGATTTATAACTGTAAAGGATTTTCCATGAAAGACGTATGTGAAAGCTGCTGATGCTCCTATCAGACATGATTCATGTGATATTAAGAAAACACATTCTCCTAAAGGACATTTTAAATGAATTGTGGCAGTCACGACTTCCATTTTTAAAGTCTGAAATGCAGAAAATGACAAAACGCAAGCAGTTTTAGTGATTATATGGAAGTACAGTAAATTCCATTTGCTTGTCCAGCATTTGATTTGTTAATTGGCTTGCCAGGTAAAAATACAAATATATACACTACCGTTCAAAAGTTTGGAGTCAGTTTATTTTTGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAGGCAATTATTCTGTTCATAAAGGCAGCTTATTAAATGCAAAAAAGTTAAATTGTTAAATAATTATTACAATTTTAAATAGCTGCTTTCTTATTGCATTTAGTTTCAAATGAAATTATTACTCCTGTCATTATTGCTTTTTTTACTAATACTATTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATTATCATTATTATTAATATTATCAATATTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAATATTAGAGTGATTTCTGAAGGATCATGTGACTCATGAAGACTGGAGTAATGAAGCTGAAATTCATCATTAAAGTCACTGAAATTAATGATTACATTAAATGATAAACAACTTTTGGGCAGTTAAATTATAATACAATAACATTTCACAGATTTTACAATTTGTACTGTATTTTTGAATAAATAAATGCAACTTTGGTGAGCAGGAAAAAACTTATTTTAAAACATTTAAAAATCCTACTGACCGGTAGTGTATTTGTATTTAAGAATAAAATGGTTCATTGCTTAAAGACTAGGAAAATGTGGTTTCCATCGCCAAACCTATTGAGACGCTGAACATTAGACCATGTGTATATGCTCAGTAAAGTAATGAAGCAGATAAAAAAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTAAGCATCGTCATACAAATATTTAATAAAAATATGAAATGTATTTTCCATAGTGGTTCCACATAAGATGTATTTTATGGTATAAAGTTCAATTTTGAAGGAAGATTCTCAAGTTAAAATCTAGTTCGTCTTCACAAACTTTTTTTTGCATTAATTGATTTTTTAAATAATTGATGAAATGTTAATGTTTTCCTTAAATCAAAATAATTGAATATCGGTATTCCTTTATCCTGTTTGTTACCTCAATATTACAAGTGTTTTTTGTAAAAATATTAGAGAATAACAAAATAGAGATGTGGGTATCACGGTGGCACAGTGGGTAGCACGATCGCAAGTCGCTGGTTTGAGCCCCAGCTGAGTCAGTTGGGACTTCTCTGTGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGATTAGGTGAATTGAATAAGCTAAATTGTCCGTGGTGTATGTGTTTGAATGTAAGAGGATATGGGTGTTTCCCAGTGTTGCGTTGCGGCTGGAAGGGCATTCGCTGCATAAAACATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATCCCACTGTTGCGACCCCTGATTAATTAAGGGACTAAGCGGAAAAGAAAATGAATGAATGAATTAATAAATGAATATAGAGATTTTAAAATAATATCAAGCTTAAAAAAAAAAAACAGTGTACATTACCTAATGACATAATCTAATTTTCATTTTGGAATAAATATATCACTTTTCCGCTTGTTTTTTTCATTTCTGTCTTTTATTCTACATCCAAAAATGGACTGAATCTGTGTTGTTTTTAATACTGCATATATAAATTGAACTTACCAATTTTTTTTTTTACTGTATTTTATTTTAATGTTCTCTTCATTATATAAAGATTGAGGCTTTAACTGTAATTAATGAAAGCCAAGCCAGGACCTTAAAGTAGGCAGGGATTAGTTTAAGCTGAGTTTGTTTACCGGGTAAAATGTTGATTCTTTACAGAATTGTTGCTAACCTAATTAACATAGTTAAGCCTTTAAATGTTACTTTAAGCTGTATAGAAGTATCTTGAAAAATATCTAGTCAAATATGATTTACTGTTCTCATGGTAACGATGAAATAAATCAGTTATTAGAGATGAGTTATTAAAACTATTATGATTAAAAGTGTGTTGAAAAAATCTTCTTGTGGAAAAAATAAACAGGGGGGCTAATAATTCTGACATCAACTGTATATATAATTTTAGTATACTAATTTCAATTTCTTTATTTCCAGGTGTTTAAGTTTATTTCCAATTGTACAAATTTGTTATGTGCTTTTGACATTTGTATGAGTTTCTAGTTAACTTTACAAGTGTAAGTTTAGATTTTATTGGAGCTTATTTTATTATTTAGCTTTATCTATCAGTAACAACACTATGTTTCTCAATCCATCAATCCTTCATAAGCTTTGTTTCTTATCCACCGTTCTTTATTTTTAATCTTACAG
Seq C2 exon
GTGAGTGAAGACTGGAAATATGTGGCCATGGTGATTGATCGCCTTTTCCTCTGGATCTTTGTGTTTGTGTGCGTCTTTGGCACAATCGGAATGTTCCTCCAACCTCTGTTTCAAAACTACACAGCCAAAACAATCACCCACACACCAGGCTGACTAACCACCACCCCCCGGCACAACAATGGACTCTACCCACCATCAGCTGCGACAGGAGGGCGAAGGCAGGAGGGGGGGTCTGCGGAAGGGGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000017790:ENSDART00000143043:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.183 A=NA C2=0.020
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0293118=Neur_chan_LBD=PD(54.4=29.6),PF103294=DUF2417=WD(100=39.2),PF0293211=Neur_chan_memb=PU(88.7=68.3)
A:
NA
C2:
PF0293211=Neur_chan_memb=PD(10.7=60.8)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]