DreINT0053169 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000003779 | ctnnd2b
Description
catenin (cadherin-associated protein), delta 2b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-070912-532]
Coordinates
chr2:30672022-30684979:-
Coord C1 exon
chr2:30684846-30684979
Coord A exon
chr2:30672135-30684845
Coord C2 exon
chr2:30672022-30672134
Length
12711 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGC
5' ss Score
9.6
3' ss Seq
TGACTGCTCTATGTGTGCAGGAG
3' ss Score
7.96
Exon sequences
Seq C1 exon
AAGTAATGCCAGTACCAGACCAGCCCTCTGGCACAGAGAACTCCAGCATGTTGAGCCCGGTACTGAACGCCTCCAATGGAGACGGATCTGAAACAGAGACCACCTCTGCCATCTTGGCCTCTGTGAAAGAACAG
Seq A exon
GTGAGCGCTTTGTGTCAAAACTGTGAAATCCTTCATTCTTATGGAGTGTCTGAAATAGAAGGTTATGTTTTCCCCACACTCATAGACTCGAGCTTTACGGAAACACTCATTTTCCAACAGTTTAATTAGAAACTCTCTAAATCTTTATATACTGTAAACAGTAATTACACAGAGCCATACCAGTCCTCAGATGAACTGCATATGCCATCTGGGATACGAAGCCACAAGGTTTGGTGTGTGTGTTTTTTTTTGTGTTGCGTGAGTCATTTCTATCATTTTGTGCTACCGGTTTCATTTAGCGCCTGGTGTCTAAATTCACAGATACAAATGGTTTTTGATGGTCAACACACTGAAAATGTGCCATTTCGCCTCACATGGTTTTGTGGATGAGTGGGAGGAGTGGATGTAGGTTTGAGGGCTGTGTGGTGTAAGAAATGTGAAATATTTGACACGCCATGTTGCAATCAGGTCTCCATGCTATGCTAGTCACAGCGCCGCGGCCTATCTATAATAAGATTGGTCACCTGCTTGTCAGACAGGTGGACAGATTCCCAGACACTGGCAAAACCTTACAATAAACCAGCTTGATCTGTCAGGAATAATGACAGATGATTGTAATTGCTTATAAGCTCCTGTCATAAAAAATCCTGTCGATTGTGAAATGCCTTATAGGATTATTGCATATGTCAGAATTTAGTGTGCGATAGTCTACAGTATTCCACACTTTAAGTTTGCATATATGTCTGTCTTGGCTGGAGGCCATTTTTGAGTCAAGGCCATGTGTAGATAAAAATGGATCATGACAGGCTCTTCGCTTCCTACTAGCGTTTAGCTCACACTTTTAACCATGAGATAGAAAAAGACGACATGCTCTCAGCATCGGAAATCTGCACAGGGAGTGTTAAAGTAGGCCAGAGCCATAGGCTGCTGTGGGCCAGTCTAATAGCTCTCCTATCAGAGCGAGAAAAACTGTCTGCCATCTTTTTTTTTTTTTTTGATGCTTTTCACTAGAGGGTACTGGTGGACAGGGTCCATGTCACATGAACTGCTTCTCTGAGAGATTAAAAAAAACATCTAAATGGTCTGAATATTTCTTTTCTGAGTGGGTGTATTTTCTTTTGAAACAGGATGATTGTGAGGGACATATTTAAAAGGTTTAGTCATTTATAAACTGCAAAATTAAAATATTTAAAATATTTTCCAAATGATGTTTAAGAGAACAAGGAATTTTTCCACAGTATTTCCTATAATATTTTTTATTCCAGAGAAAGTCTTATTTCTTTTATTTCAGCTAGAATAAAAGCAGTTTTTAATAATAATAATAATAAAAAAAACATTTTAAGGTCAATATTATTAAACTTACTAAGCAATATTTTTCGATTGGCTGTGCAGAACAAACTAGTGTTATACATTGACTTGCCTAATTACCCTAACTTGCCTAGTTAATCTAATTAACATAGTAAGGCCTTTAAATTGCACTTTAAGGAAAATAGTAAATTGAAAAATATGTAATAAAAATGTAATGTCATCATGGCAAAGCTGAAATAAATCAGTTATTAGAAATTTGTTATTAAAACTAATACGTTTAGAAATGTGTTCAATAAATCTTCTTTGCGTTAAACTGAAATTGGGGAAAAAACATTCAGGGGGGGGGGATAACTTCAACTGTAAATTCATTTATTTGCTCAAATATAGAGTAAAAACTGTATTATTATAAAATATTATCTCATATAGTATAATACCATTTTAACTAATTGTTATATTGGCATAAGAGTGTGGTCACCTAACATCTTTCATTTAATTTAAAAATAAACTTTAGGGGGGGAAAATACACAGTTTTTCTTTTAATTACACAATTGTTTTGTTTTCTCTTCCAATTTGTAAAAGTAAGTTGGGTGTTTTTCTCATAAATCTGTAAATATTTCTGTTGTGAACTCATTTATCCTGGGGTGACTATATATATTTATAGCAGTATTCACATTGTTTTATTATCCATTAACAATCATTCTATTATGGTTATTTGGTAAAATATACACTCATCGGCCACTTTATTAAGTACATCTTGGGTTGGACCCCCTTTTGCTTTCAGAACTGCCTTAATCCTTCATGGCATAGGTTGAACAAGATACTGGAAATATTACTTAGAAATTTTAGTCCTTATTGAAATGATAGCATCATGTCGTTGCTGTAGATTTGTTGGTGCACTGCACATCCATGATGTAAATCTCATGTTCCACCACATCCCAAAGGTGCTCTATTGGATGAGATCTGGTAACTGTGAAGGCCATTTGAGTACAGTGAATTCATTGTCATTTTCAAGAAACTAGTCTGAGATGATTCGTGCTTTATAACATGGTGTGCTATCCTGCTGAAAGTAGCCATCAGAAGATAGGTACCCTGTGGTCATAAAGGGATTACAGTTTTTCTCAGTGGCTTTGGTGCATTTTTCACTACACTATTTACATTTGCACAACAGGTAATGCATTTCTCAAAACAATTAGTCATTTGTGCACATCCTAGTAGCAGTTTCTCATTCTTTACAAAAAATTGCAAATGCTTTTGGACATGCATCAATTGATTTCACACAACTCTCTACTCTAAAATTGTAGTACAAGTTTACAAGATGATACACCATTATTTCTGCTCCAAAATATACATTTTATACAATTTGTCAACATTTAGGAGTATGTTAGCATTAAGAATAAAAAAACTACAAATAATATTTAATTGTTTTAATAATTTCTATACAAATCCACATCCCACTGAGTTCCAGTATGACCTTAGCTTGTGCATTTTTCTCAGTCCTTTGTTATTACAGTCATATTTAAGTAGTTCTGATTCACTATGATGATGTAATCAAGTGTAGCAGACATGTTGTTGTTTTCAGAATACACCGAAAAGAAATGTTTATCATTCTGCCACTGCTTGTCTACCTCACTTATATTATGATAGATCACCTTCGTTTATTTTGTCCTCCACTAGATGGCAATCTCCCATTTTGAAGGCGTCTAGTAGATGGAGTTTATCTAAGAGGTCATCACGCAAAAATCACAAAATAAACTGAAGCGTAGATCCAAAACCAATGTAGATTATGATGACAAATGGTACTCTGTAGTTCTGAAACATCTCCCCTCTGCTGTGTATAATTACTATATACCAATATGTCTGGCAGAATGTCCATGTCTCTTGTATGTGTGCTTTGTGTGCAGTTTTCAAGGTTGCACGTGCAAGCAGAACACAGCCTCTCCTGTGTGAGACTCTCTCCCATTAAAATTCTCCTGTATCACTTGTGCTAAACAGAATCACATGCAAGGGAGAGCTGATTTAACAACCTAAACATTTATAAAATGCCTTATTGCTGATAAGAACTACAGCAGACACTTTTCTTCTTCTATATTGAACACTTTTTTAATTATTTCCCTTTGAGTGTAACTTTCTGAGATTAGTTTGACATAGAGATTAAAGTACAGAGTGTCTATTTATTTTCAGAAGACTGTTTTTGTGGGTCACTTTAATTTGATGTTAATTAGGGAAATTTATCTTAGTGCTTTTAAATTGACACATTAATACTTATAAAAAAGCCACTGGCAAATGAGGTTTTATTATGAGCATGGCAGGGATTTTTTGGAGAGAGCGCCAGTGTTTGTAAGGGCTAAAACAGTTAAGGTCAAGATTGACTTTCCATTTAATTTGAACTCTGCATTTCGGTCTTTTTATTTTAGACGAAGAATGTTAATCAGCTCATTATATCTCTGTCCGGCAGGAGTGATTTGTTTTAGCCAGGAGTGAAGTCATTTAGAATTTTTCTTTCTTTCACGTATACAGGAATTATTAATGTCACATATTCAATCAAATGAGGCAGTTCTTTTAATTACTTGTGTTTTTATGAGTTAGGTTGAGGCTGTTTGGGGCAAATGAGCATATTATCAACTGTTTAAGATTATCTGAGGTGTTTTGGGAGGCCTCAATTTTCCGTAATTTGCAGGAAAATGGAACTTTTCTGTTTTAAGTGAGACAGAATAAACTAATTCATTTGAGTAATTCCTGTTTGTTTAACGGGCTTAAACAGTGGTGCAGTCGTAGAAACTTCTGATATGGGAAAATGGGTCTGTGCAGGTTTCCCATTGACATTTTGAAATACTCTGGGGCTTTTAAGGCTTTATTTATCATCACAACTCGCATAATAAATAGAATATTCTGAGTGAAGGATGTTTATGTTTTTACATCGCCACTGGGGAATACTTCAGAATAATTTAGTCATTTACTTGCATTGCTACAGTAGGTTATTGATTTGCACATAAACCTGCAAATCAGGTTTTATTTGTTTAATTTATGAACTTATTTGAGGTTGTTAAGTAAACATGTCCACTGTTCTATGGTGTTGGGTCTGTGTGGTCAGGCTTGAGTGGATCTGGACTCATTAAACGGCATGAAATTATTGAAATTGGGTTAAGTCCTTAAAGGAACTCGCGAGGCGAACCCCAAGTGACATTTTGCAATCAAATGGACCAGTGAAGAAACTTAAATGTCAGTCTTTGTCCACAGGGCGCAATTAGGCATTTAGGCCAAAAGACCACGTTCAGCTCTGGAAGCAGTCAAATCAATTTCTCTGTCCCTCGGCTGTTTATTTTCTAAACAAAAAGGTTTAACAGCCTTTTCTGAAGTTTTTATGTAAGATAATGTAAATACAATTCTGTTTCTCAACCTTCATCTCTGTACACATTTGGTACTTCTGTGCTGTCAGCCATTTGGTGAGAAGTGCTCAAACAAGAGATTGTTTCCACCTGGTTTTAGCATGTATTCAGATGCATGTTTTTTAAAATAACCACTACTAAGTACTGAGTTTTGTTATCTTATAAAAGTGATATATAGGTACTAGTGTGATAAAAGACTGGTTAAGTACACAGGATCTAAATTTTAGGGCAGGGGAACCCAAACTTGTTCCTGGAGGCTCCTGATGACCTGCAAAGATTAGTTACAAACCAATCAGACACACCTTGGATAGCTAATCAAGCTCTTACTAGGCTATCTAGAAACATCTCTGCAGGTGTGCTGAGGCAGGTTGGAGCTAAAATCTGCAGGACATTGGCCCTCTAGGACTGAGTTTGGGCACCCCTGATTTGGGGTTTTGTAGGTAAGTGATAGCATTTTGTGTTCAATATGTAATTTCAATAAAGCTGTTATAACTTGAAGAATGAAGTGCTGAGAATCTGTGTGGAACCAAATTGTAAAGCTTCTGTTTAAATATCTTGCTTGAATTTAAAAGAAGGAAATTATTTTTCATTTATTGCTGTTAAATTAGATAATGTTGTGATTTCTTACATTTTTTTAGAAAATACAGCTGGGTGTTATGTGCAAAACTAAAACAACTAACCCTTTGTTTTCTAATAATATTGCCAAGGGGCAGCATAATTATTGAAAAAAGGAGAGGGCTTAAGACAGTTCCTTGCTGCACTATTTACTTTACTACAGCTAATTTGTGACAGTGGTCACACAAGGATTTAAACAAGTTTAAACTATTAAACCATTCATACTTATTTCAAGTTCTACTACCCTTATAAAAATACTGCAGTTTAAAACAATGTACTGCAGTATTTTTAAAGGAATACTGCAGCATTAGTTAACTTCTGAAAAGTGCAGTTTTTTGGACACAATAAACTGCTTTATTAAAGTATACTGCAGTATTACTGAAATACAACTTTAGTACTATAATAGAACCAACTGCAGTACATCTACTGCAATACAACTAAAGTACTACTACAGTACAACTGCTGTACAACTACTGCAATAATACTGAAGTGATACTACTACTATAATAAAGTACAACTACTACAATGGTATTGAAGTTCTACGACTACTATAATGTAGTACTGCTACTGCAATTCAACGGAAGAACTACTACAGTACAACTGCCATACCACTATTGAAATACAACTGAAGTACTTCTACAATACAACTGCAGAACAACTACTATTTTTCCTGCTTGATGGACAATGATTTCCAAATGAGATTTCAGTACTTCAGTTGTATTGCTATAGTACTACCACAATATATTGTATTGCACATTATACTGTAATTTTGCAGTTGCGTTGAATTTGCCACAGTTATCCTTGTATATAGGCTACTGCAGATGTACTGTTCTACAGTTATTTTTTATTATCCATTTTTGCAAACAAACTCTTAAAAATCTAATTAGAAAATTACTTGAATCCAAATAACATCCCTGAAAAAAAGTACAAAATATTGTTGGAAGATGTTGAAGAACAAACCCCTTGGAACAGAAGTGCAGTACAGTTCCTACCACATCGTTGGCATATTAGACAACAGCAGCACAAGTGCAGTAAAGAGTTTACTCGTTTTTACTCCAGTTTACTGCAACTTATACTGCTGTTGTAACTTAACTTTATTGTACTGTATTTAAATTGTGTATATACTACATTGTATTGCAATAAAGGGTATTTAATAAACAGACTCATGTTAAACACAAGTGGGTGTGTAAGTGAATAAAAAATATATAAATGGCAAAAGTGACTTCAAGAATAATCCATCCATCACAGCAAGGGAAAATACATAGACTTTGGAACTATTTGCCACTGATCATAATACAGGCTTCTTCCGTGTTTTCATTTAAATTCATTTTATCTCATATTTTATATACTATTATGCTTATTTGGTTGTATATTTCTGTACAGCACTTTATTTCTGGCTCACTTCTGTGTTTTTAAGATGCTCTAAAAATATAGTTTGACTGGACTTGATTGTTTGGTAATCTTTCTCACGAGTCACAACACTTCTCTAAAACAATCAGGAATTAGGTCAATAAGTGATCTATTGTGGCAGTGTAGATGCATTCAACCACATGAGCGTTTACATGACAAAACCAATTTAATCAAATGTGACTACATCAAGAAGTGGTCAAGAGTGGACAGGCAGGGCCAGTGTCCCTCATATTTTAGTTCCAACCCCAATTAAACACACCTGAACCAGTTAATCGAGCTCTTTCTAGGTATACTAGAAACTTCCAGAGAGGTGTGTTGAAGGAAGTTGGGGCTAAACTAAGCAGGACACTGGCCTTCCAGGACCGAGTTTGGACACATCTGCTTTTGACCCTGATGCACCTGTATTTCGTAATGTCCTTGTGTGATCAGAATAATGAATGCACACTTAAATGACAGGTGTTAAGATGAAACTTGTTACACTCTTGGCCATACAAAATGCACTTCATGCTTTTTTTTTTTTCTGATTGGTGTGTTTTGTGTGAAAAGGATGTTGAAGGCAGTATTTCTATTTGAAATAGAAATCTAACATTATAAATTATATTACACAGACCATTTTGATCATAGAAACCTGTTTGTAACTTTAAAAACACTACATTTCACTATTTTTTTTTTAAAGAAGACTCTTCTGAAGACTCTCTCCCATTGTAATTTACCTGTATCACTTGTGCTAAACAGATTCACATGCTAGGGAGAGCTGATTTAACAATCTAAACACTTATGAAATGCCTAATTTATGGTAAGAACTACAGTATACACTTTTCTTCTATATTATGAACACTTTTTTATTATTTCCCTTTGTGTGTAACTTTCTAAGACTATTTTGACAGAGATTAAAGTAGTCTTATATATACAAAGTACAGACGGACTATTCATTTTCAGAAGATGTTAATTAAAGAAATTTATCTTATTGCTTTTAGTAATTTTCTAGAAACTACATTACATTTCTTTCATGATTTTTTTAATTGAACAGAATGTTAAAAAGGTAACATTTCTATTTGGAGTAGAAATCTTACATTATATATTATATTATACAGACAATTTTGATCTTAGAAACCTGGTTATAACTTTAAAAACACTACAATTCATTTTTTTAAGAAAGATTTCGAGAATCTCCCCCATTACAATTCTCCTGTATCACTTGTGCTCAACAGAATCACATGCAAGGGAGAGCTGATTTAACAACCTAAACATTTATAAAGTGCCTAATTTATGGTAAGAACTACAGTAGATACTCTTCTTTTTATGAACACTTTTTGGAAACACTTTATTTTGATGGTTCATTTGAGTATTAGTACTACACCTTGGAACTGTAAGGTTATATCTGCGTTCTGAATGATTTTGAGATATTGAGCTTTAAAGTTTTTGCATTCCAAAGCAAACAGTACAGTATGTGTGTAACAAAAAAAAGTCTTAAAATGTAAACAACTTATAAAAAACCATCCCATAATGTAAATAATTTGTCATTTAATAAGAGTTATTGTCAATAACTCAACTTTGACAGAAATGTCAGATAGAACCTTATAATTCTAAGGTGACGATTTAAATGACTATAAGAAACTTTGCAAGTACATGTCAAATTACACTAACCCTAACCTCAACCTAACAGTCTACTTATAATCTAATAAGAATTAGTTGCAATGTAACTTAAATTCGACAATTGGACCATCAAAATAAAGTGTATCCCACTTTAAATATTTCCCTTTGAGTGTAACTTTCTAAGGTTAGTTTGACATCGAGATTATAGTAGTCTTATATGTACAAAGTACAGGCGGTCTATTTATTTTCAGAAGACTGTTTAACTGTTGTTTAGTACAGCATAGCAGTAGGAAAAGCAATGCTTTGAATGCTACAGAATAACCATTTTGAGTCCAGGTGAGATGTCTGCTGTCCTATTGGGCTCGCCGAGTGTTTTCTGTCTGTTTTGAGTGCTATATTTAACCAACTTTTGTGACAAGTGGAAAGTGGATGCTACTCCCCGCTCAGGGAGCCTGTCCATTGCAGGCAACTGAGGCATAACAGCCTGTTAGGATCTCTGGAGGAAGCACAAAGCTTCACATTGCTCAGTGGAATGATGTTTTTTTGCTGCCTGGACCCGCAAAAAAAAAAAAAAAACACCTCTTTCTCTCAGTCATTCTGCGATCCTTTCAACAAGAACCCGCATCTCCCCCTTCTCCTCTTCAGAGCAGAGCACAGATGGCGTCAGAAAGAGGGGAAGAGTTTAGGAGGAGGCGGAAGAGTGACTGGAGGGCGGTGGTATTTGGCTGGCTGGCTGGTGGGAGGGACCCTTTGTGATGCAATGTTGCATAAATAATGCCAAAGGGGCTCTAAATTCACTGTTGCCATGACGACCTTTGTGCCTGACTGCACTCCACTTTCTGCTTTCCCGCTGGAAGGCAGTCACTACCACTCTTGTAGTTTCTCTAATGACTTTACTCTCTCGATAAGCGGAGACGAACACAGTCTTGTGGGATAGTGATGCGCCGACACGGCTTGTTCTCAGCGCAGACGTCCTCTGGAGTATGGTACATGTGCCAGTAAGTGTGCTGTTATTTTATTCGCAAAGTCAACAGGTGGTTTATTACCAGGTTGGAGGAGTTTTGCTGTTGATGGATAGATGTTTGCGGCTCAGTCGTGATCTCGTTCATGGGAAATAAGAAAAGGTCAGAGATTACGCCGGTTTGTTTTGTAAGGGACAGGTTGAAACAGGTGCAAAATAAGACCGTCTGCTGCAAATGCAATGAGATGCGACTGCCGTGAAGGCATTAATTGAGACCCTAGACATGTGTAATGATTGTTGAAAAGTGTTTGAATGCTGCGGTTAGCGCCTCTTTAGTCGTCATGGTCCATAGAGCTCCCTTCAACACTCTGAATGGGTATTTTTGTAGCCTTCATCTGGGTTCGTGCCCAAAATAGCAGGTGATGCGTTCTGGAGCCCTCTTAGCGTTAACCGCTCCGGGGAGAGAGTCTTTGACCTTGTGGCTGAGTGAACTCATTTCAGCCTTGTCACAAAAGAAGTGGGAACGTTGCATTGACTGTCGTAGCCCCGGGCGCAAGCACATAGTGCAATGTTTCCGAGTGGATTTTCACAGTGATTACTTTAAAGAGGAGCTCTGGGATTTCATCTCTGATTTAGCATCGACAAGTTTGTCATTAAATGTGAAGCAGTGCATATCTAATTAACAGAAGAGTGAGGTGGTGTATTAGTGTCAGAGTGGTCCAGTGACCATCAAAGTTCAGAACACAGCTTTTGGATGTGTGGACAAACTGTGTAGAGTATAGTTAAAGACAATGCACTGTTTCATTTGTTAATTATTGTACTGTTTGTGCACAGTTGACTTAAGTTACGGCTAGGTCAAAAATTATATTGATGAAAAGTTTGGGGTTGACAGATTTTTAGTCCCCTATGTTTCACCAAGATTGCATTTATTTAATAAAAAATACATCAATACAAAGCAGCAATAATGTGGGAAAAATTGATACTGTTAAAAAATGTATGCTACATATACTAAATAACAATTTTCTTTTTCATTTTTGTCGACAAAGCTGACTTTTTAGCAGCCATTTACTCATTATTCAGTGTCACATGATGCTTCATTCTTCAATGTCAAAAAGTTTTGCTGCTTAGTAATTTTCAGGAAACTACAATACATGTGTTTCAATTTTTTTAATAAACAATGTTAAAAAGGCAGCATTTCTATTCTTATTAAAATCTTTTTTTATATAGAAAACTTTCTTGGAGGATCTCTCTTATTAAAATGATCCTGTATCAATTGTGCTTAACAGATTTACATGCAAGGGAGAGCTGATTTAACCACCTAAACAGTTATGAAATGCCTAATTTATGGTAAGAACTACAGCAGACATGTTTCTTCTTCTATATTATGAACACTTTTTTATTATTTCTCTTTCTGCGATTAGTTTTACATGGAGATTATGGTGGTTTTATATGTACAAATTTTCAAAATATGTTAATTAAAGAAATTTATCTAGTAATTTTCTAGAAACTACAATACATTTCTTTCAGGATTTTTAAATGAACAGAATGTTAAAAAAGGAAACATTTCTATTTGGAATAGAAAATATAAATTATATTATACTGACAATTTTGATCATAAAAAGCTGGTTTTTTATGATCACTGGTTTTTTAAAACACTATTTTTTTAAAGAAGATTTGGAGAATCTCTCTCCCATTAAAATTCTCCTGTATCACTTGTGCTAAACAGAATCACATGCAAAGGAGAGCTAATTTAACAACCTAAACATTTATGAAATGGCAAAATTATGGTAAGAACTACAGTAGATACTTTTCTTCTTCTATATTATGAACACTTTTTTATCATTTTCCTTTGTGTGTAACTTTCTGAGATTAGTTTCACATAGAGATTATAGTAGTCCTATAGTAGATTATAGTAGTTTTTTTTTGTAGTCCATTTAAGACATTTTCTTAATGCTTTAAGTAGTTTTCTAGAAACTAACTACATTTTCAGGATTTTAAAATTAACAGAATGTTAAAAAAGGCAGCATTTCTATTTGAAATAGAAATATATTATTCTAAATTATGTTATACAGACCATTTTGATAATAAAAACCAGGTTAGATCTTTAAAATCACTACACTATCCTAATTTTTTAAAGAACGTTTTTTTTTCTTCCCAGCAAGGCTGTATAATATGATTAAAAATAATTTAAAAACATAAATATTAATTCAGTTTAAAACTACTTTTCTGTTTTAGTATATTTTATATTGTACCCTATTTAGGTTGCTCAAAAAACGGGATAAAAGTTTAATATTTTGAGCAGATATGTTTATTCATCAAGGACACAATAAATTTATGCAAAGGATTAATAATTTGTTTTAATCAGTTTAAAAAACATTTCATTCAAAGTAATTAAATACAATTAATCAAAGAATCAGGAAAAGTAACATTTATCACAGCTTTCACAATAATATGAAGCGAAAAAAGTTAATGCAATTTAAATAATAGCAAAAACCATTATTAATTATTGAAGAATAAGCACCAATGATAGCTGAGCATAATAGAGCAGCAAATCATCAAATCAGGATGAGTTATGAAGAATCGTGACAATTATGTCTAGACTAATTATGCATAAAATTTAGCTTTGAATGACAGGAATAACTCAGATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCATAATAATAATCATAATAATAATTCCTTACATTTATCTAGCGCCTAGACACTCAAAGCACTTTACACCATGGGGGGAATATCATCATCCACCACCAGTGTGCAGCATCCACCTGGATGATGCGACGGCAGCCATATTGCGCCAGACACACCACACACCAGCTGATTGGTGGAGTGGAGACAGAGTGACAAAGCCAATTATGTTATGGGGATTGTTAATAGCTAATTTCCATATTTTTGTGGGACTGTACCTTTCCCAAATGGTGTTAAGATGAACCCTCATGATTTTGTTGATAATAGTGGTTTTGGAGTGGCTTGAGGACTTGTTCTACATACAGTAGATTTCACCAAATGGATTTTAAGAAAAGTAGTCGGCAAACATTGTCAGAAGATGCAGACATTTGACAGATGCTTTCGTTAATGGATACTTTTGTACGCCTTGCTAGCATAAACAAGGAGTCTGACAGTTGGTCTAATAGCTTGAGTATTGCAAGATTTTATTAAAGGTATTGATCTACTGGAGACTAGATTTATATGCCAAAAGATGTCAAGAAATAAAATGCATTTCGTCAATATGAAATAAAGAAGAAGCTCTGAACCATTGCACAGCCACACAGTCTCTCTGCATCCCACACACACACACTGTATTAGTTACTGGAGCATGTGTAAGTGCAAATGTGATACATGCTATAGGCAGAATCAATTGTATAATTCCTTTAGGGCTTCACACATACACTCTGACTGCTCTATGTGTGCAG
Seq C2 exon
GAGCTGCAGTTTGAGCGACTGACGAGAGAGTTGGAGGCTGAGAGGCAGATTGTTGCCACCCAGCTGGAGAGATGCAAGCTGGGATCTGAGACCGGAAGCATGAGCAGCATCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000003779:ENSDART00000090292:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.907 A=NA C2=0.230
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF034419=FAD_binding_7=PU(32.5=93.0)
A:
NA
C2:
PF034419=FAD_binding_7=FE(30.1=100)
Main Inclusion Isoform:
ENSDART00000087270fB2132
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]