GgaINT1011791 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000013753 | DOK6
Description
docking protein 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28301]
Coordinates
chr2:93737182-93781169:-
Coord C1 exon
chr2:93781052-93781169
Coord A exon
chr2:93737322-93781051
Coord C2 exon
chr2:93737182-93737321
Length
43730 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGCAAGT
5' ss Score
3.24
3' ss Seq
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3' ss Score
9.69
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]