Special

HsaINT0085667 @ hg19

Intron Retention

Gene
ENSG00000170871 | KIAA0232
Description
KIAA0232 [Source:HGNC Symbol;Acc:28992]
Coordinates
chr4:6825912-6843931:+
Coord C1 exon
chr4:6825912-6826411
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr4:6843794-6843931
Length
17382 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTATTT
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000170871-KIAA0232:NM_001100590:2
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.013 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
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A:
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C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains
  • Pre-implantation embryo development