HsaINT0148855 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000144040 | SFXN5
Description
sideroflexin 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16073]
Coordinates
chr2:73001525-73020264:-
Coord C1 exon
chr2:73020239-73020264
Coord A exon
chr2:73001579-73020238
Coord C2 exon
chr2:73001525-73001578
Length
18660 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATTGTAAGT
5' ss Score
8.54
3' ss Seq
TTCTTCTCTCTTGCTCATAGGTA
3' ss Score
10.55
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTATATTCCTTTTGGGACGCCAATT
Seq A exon
GTAAGTGTTACCTTCAAAGGATTTCCTTTTCTAAAAAATTATTTTAAATGTCTAACTTTATGTTATTGCTCACGGGTATTTGACTGAATTGTTGATTTAGGATAAGTCAATTCCTGGAGGGAAATTACCAAATAAAATGATATGTATTTCTTACCACATCTCTTGATGCTGATTGGCAAACCTCTTTTCATAAAAAGCCTGATGACTTAAATCCAGCGTTGAGTTGAAAATTGCCTTCTTCCCTGCACGTTTTCTGTCCCCACTGTTGTCATTAGCACCTGCTAGTCATAGGGAAGTTTTCTCAAAGAACTTGGGAAGTAGGAGTAGAAGCATGCCTTCTGAAAAATCAAAGTTTAAAATTAATTCAGAAAGAATTTTCAGCATTCTTTTTGTTCAGTTTTAGAATCAGGATTATGTTTACTCCTTATTTTTATTGGAATAAAACATACAGAAAGGTGCATTCATCATAAATGTACAGCTTGGTAAATTTTCAAAAAGCAAGCATATCCAGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCAGATCATGAGGTCAGAAGATCGAGACCATCCTGGCCAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGAGAGTGGTGGCGGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGAATGACATGAACCCGGGAGGCGGAGCTTTCAGTGAGCCGAGATCGCGCCAGTGCACTCCAGGCTGGGCAACAGAGCGAGACTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAGCAAGCATATCCAGTAAACATCACTTAGGTAAGGAATCAGTATAACACCCTCCCAACTGAGCTACTTCGGCCAGCTCACTTAGATAAAGATTCAGAGCATCATTAGCATCTCAGAAACCTCACATGTGTCCTTCCCAATCACCACCCCGACAGAAAATCACTTTTCTGACTTTTATATTTTAGTTTTGCTTGTTATTGAACTTGATATAAATGTAATCATCAACATGTGCTCTTTTGTGTCTGGCTTCTTTTACTCCACATTGTGAGATTTGTTCATATTGTTATCTGTAACATTCGTTTGTTCTTTTCTGTTTGCTGTATAATATTCCATTGTCATAAATTATCAGAATTTCTTTATTCATACTACTGTTGGTGAACATTTGGGTTTTTCTAGTTTTGGGTTTACAACAAATAGTGCTGTTTTGAACATACTTGTACAAGTCTTTTAGTGGATATATGCCCTCATTCCTCTTGGATATAGACCTAGGAAGCTAAATTAAAACAGGTAACAACTATAATAAATGCAATGTGTGATCTGAGAATGGATCCTGGGTTGCAGCAGGTGGTGTGTAAACTGTATTGCAGTTTCTTATAAAGCTGAAGATGCACTTACTATATGACCACATAACACTATTTTAGGTATTTATCCAAGATAAATGAATATGTTTGTTTACACAAAGATCTGTATGTGAATGTTTATAGTAGCATTTTTCACATTAGTCTAAAACTGGAAGCAGACAAGAATGACCAACAGATGTTAAAACTATTGGGTAAAAAACTAATTGAGAACAGAATATTTGCATAGTCTCAAATTTTCCTATGGATATCATAGATACTATTCCTTCTATGTTAATTAGTTGGCATCCTCTCGAGTTTCCCTTCTGCCTCTTTCTTTAATGTTTTCTTAAAACTATCAGTATTTAGATACTGTTAATACAGTCTTTGTGGTTTTTTTTATTCAGTGGGTAAAAATGTACTCTTGTCATTATTTATTTTGATATGCAAATGGGGCCACTTTTGACCCAACCTTAAAGCAGTTTCTCTATTTGACATGCCCCGCTAGTCTTTGAGAGCTTCAGTACTCTCTGACACAACAGGATATTCTAGGTTCATCTTTTCTCTTTCTCTTTTTTTTTTCTTTTCCTTTCTCCTTTCCTTTTCTTCCTTTTCTGTTTTCCTTCCTTCCTTCCTTTTTCTTTCTTTTTTCTTTTATTTTGTCTCACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCAGGATCATGGCTCACTGGAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGGCTACAGACATGTGCCACAATGCCCAGCTAACTTCTCAAAAATTTTTTTATAGAGATAGAGTCTCATTATGTTGCCCAGGCTTGTCTTGAACTCCTAACTGAAAGCAGTCTTCCCACCTCAGCCTCCTAAAGTGCTGAGATTACAGTAGATTTGTCTGTACAGTACTCTCTTCACCCCCATCCTAGAATAATTGATTTCTCCAAGGAGCCCTATTTCCTTTTAGAGGGAAATGATACTTAGAAACCAAGATCTTGATGCTGGGTGTACTCATGGTTACTGGAGTGGCATTGCTTCTAGGTACTCTTGGGGGACAGAGCTAGGAGATACAACTTGTAAAAATTCATGAGTTTATACTGATACCTGTAATTCCCATCAAACATCTCGATGTTCATTTGTTCTCCCGTTTCATATTTGAATGTCCCTTCTCCCTGAATGAGACTCCAACAGTATATGTACTCACTTGCTAAATCTTATACATACAAATAAGAGTTTTCAGAATTGCTACATCAATACCACTCTCAAAATACGTAGTAACTAAAGCCCAAGATTTCTTTGAAGTTCTTTTTGTCCTTAGAAAGTATCCTATTGAGAGTACACAGAGAACCATGTTCAAAAGTTTCTTGAATTAATTTTTTTCTTATGTGTTTATGTTATCTACTTGATACACAGTTAGGTTTAACTGATTTCTGTTGGCATTCCATTTTAGTTGTTTCTCCATTCTTATTAATTTACTTTTTTTGATATTTAGGAGAGGGGAATAGTTTAAAAGTCAAAGCTATTAAAAAGATACACTCATAAAAGTTCCACTCCGCTTCCTATCCCTGCTACCTCCTTCTCACCCATCCTCTGAGGTAAACAACTTCTCCTTCTTATTTTTTTTGTAAGAATAAACAGATACAAATATCTGCTTTCCCCCTTTTTTCTTATATAAAATGTAGTATACTATATACCGATGTGTCTGACGTACGATGGTTCAATTTACAATTATTTGACTTTATCATATGTGACAGCAGTATACATTCACTGAAAACAATACTTGCAGTTTTGAATTTTGATCCTTTCCTAGGCTAGAGAAATGTGATATGATACTTTCACCATGCTGGGCAGTGCAGCTCCCAGTCAGCCATGTGATCACGGGGGTAAACAACCCATACTACAATGTACTCTGTTGCCAGTGTTTTTTTGAATATTGCCTTCTATGTTCCGCATCCCATCATGTCAACAAAATGCCCATTTTCAACTTACGATATGTTCAATTTATGATGGGTTTATCAGGCGTAACCACATCATAAGTTGAGAAGCATCCGTACACCCTTTTGCACAATGTTTTTTTCGCTCAGTATATCTGTTTTTTGTGGTTTCATTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAGACAGAGTCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCATGATCTCTGCTCACTGCAGCCTCGGATGCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCTGAATAGCTGGGATTACAGGCATGCACCTCCACACCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCACTCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCCCCAGCTCTTCCACTTGATATATCTTGAAAATCACTGTATATCGATTTATAGAGATCTTCCTCATTATTACTTTTTTACAGCTATATAGTATTCTACTAAGTGGAAGTACCATGATTTATTTAGATAATTTCTTACATTAGATTATTTGTAATACTTTGCCATCATGAATAATGCCAAAATGGTAATCTTGTGATATTGTTGGAATATATCTTCAGGGTAAATTCCTAGGTTCTATAGAAGGACTAATTAAATAGACATTTCTAGAAAGATTGATCAAGACAAAAGAGAGAAGATACAAATAAACAGCATTAGCAATAAGAAGTACAATAATTATAGATGCAGTAGCAGAATAAAAGATCAGAATGCATTGAACAACTCAAGGCAATACATTTAAAGACTTAGAAGAAATGAATACATTTCTGGGAAAATACAGCTTACCAAAACTGCCTAGAAAGACGAAATATAGAGTCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGGAGACAAGGTATCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGATGCGATCATGGCCCACTGCAGCCTCAAATTCCTGGGATCAAGTGATCCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCATCACACCTGGCCTTAAAATCTGAATAGACCTATAAATAAAAGGAAATTTAATTTGCAGTTTAAAATATTTGCACCAAAGAACAAACAAACCCAAAATTATCACTGGGCTCTGATCTTCCAGGTGACTGTTCCCAAAGGAAGAGCTGAACTTAATTTTATAAAGCTTTCAAAAGCAAAAAAAGTGCCAGGCATAGTGGTTCATGCCTCTTATCCCAGCACTTTGAGAGGCCAAGGCAGGGGAATCGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGCAAGACCTTGTCTCTATTGAAAAAAAACAAAAAAGAGAGAGGAAAAAAAGGAAATCTTCCCAGTTCATTTATGAGGCACTTTGAGACCAATACCAAAGTAAGTATAAGAAAGAAAAAGTATAAGCCAATATCACTTATGAAATTACATGTAAAAATTATGAAATAAAATAATAGCAATCTGATTCCAGCAATGCATCAAAGTACATCATAACGAAATGCTTTTTACCAAATATGATAACATTAGAGAATGTATTAATATTAGTTGATCACACTGAGAAACTGAAGGAGAAACATGATTTCCCCAGTAAATACAGAAAAAGTATTTGATAAAATAAAACATAACTCAATTTACGGTAATTATTATGATAAAAACAACAGATTAGGTCTAGAAGGAACTTTCTTAACTTGATAGTGTCTATAAAAAATGATTTAAACCAACCATAGCAAGCACCTGTCTTAAAGATGAAACAAAGGTAAATTCTTAATGTGTTGGACAGGGTAAGAATGACTGATAATGTTGCTTCTATCTAACATTTTCCTGGAAGACTAGCAAGTGCAGTAAGACATGAAAAAATAAACAATGGTATTAGAGTTGGAAAGAAAGAAAGAAAAACATTTATGAGAATAGACAAACTATTGGAACTATTTTAAAAGATTTCTGGATGTAAGACAAGTATACAAAAAAATTTTGTATGCCTATAAACCTAAAACAAACATCTAGAATATGATTTTTATAAAAGATGTCATTTACAATAGTATTTTAGACAATAAGGGATATAAAAATAAATTCAAGAAACAATATTCAAGACCTTAATAGAGAAACATATACAACTTTATTGAAGGACATTGGAGATCTAAATAAGTGGAGAGCTGTATCATTTTGTTTTCTTCAAATTAAAATCTATATTCAATGTAATTTCAGTCATAATCTCATCAGGATTTGTTATGGAACTTGACAGGTTGCTATGAAAAGTTACATGAATACAAGCTAGGGGATAAGAATAGTGAAGACAATTTTCAAGAATAAGGTGGTGGGAGAGGACTCACCCTACCAAATATTATAAGACAACTTGGTTTTGGTACAGTGATAAGCAAATATGTCAGTGGAACAGAACAGAGAACCTGGAGACATGCCCATATGGAAATTTAAGATTTGACTAAGGTGGCATTACAAATCAGTGGAGAAAAAGGACAAACCATCTAATAGTATTATATGGTGCTGGGACAGCTGGCTACCTATGTGGAAAAGAAAGAAAGTCAGATCTCTACATCACCTTATATGCAAAAGGACATTTAAATATGAAAAGAAAATATTTGCAGCAATGTTTATGATAGCAAAAAATTGGAAACCGCTGAAATTCCATCAACAAGAAAATGAATCAGTCATGGCTTAGTCACGCAGTGGAATACTTAACACAGGAAAGAAAACAATGAGCAAGGGCGACATTTATGAATATGGATAAATCTCAAAAACAATGTTGAATGAAAAAATAGTAGCAGAGTAGTAATGCTCTCTGTCATTTATATAATGTTAAAAAATATGCAAAGCAATATTATATATAGTTTATGAGTACATTTTTAATGCATCCTTAAAAACATCCATGGGAACAATAAGCACCGGCTTCGTGATACTGTTTACCTCTGGGGAGAGAAAGCAATGAAATTTAGCAGGAGAACAGGGGGTGCTTCATTTGTATTTATAGTGTTTCATCTTTTAAAAACATCTTCACAAAAAAATTGACGAAATAAGATTGGACATATATGGATGCTCGTTATCCTCTAGACTTTTCTGTATCCTTGAAATATTTCATTTTATACATATATTTAAAAATATATAAATATATCGAGAGAGGTATTATTCACATCTCTATTTTTATGTCGTTGCCCTGAAACTACTACATTGTTCTGAAATATTCTGAGAAAGGTTTATAAATTTCCCACCATAATTGTGTGTATGTGCAAGTGTGTGTTTCATTTCTTTGCATTTCTTGCGGTTGTCTTATAGATTTCAATGCAATGGTGTTTGGTGTGTTCAGACAGTTTTGTCTTCTTGATATCATCTCTATCTCTCAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAAATATCCCTGTTTCATTGATTATTCTTGCCTTGAATTTTCTCTTAATTTTTTTATTCCTGTTTTGCTTAAATGACTTGCATTATATATCATTGCCTGTACCTTTATGTCAGAGTCATTTAATTTCTGTGCCATTTTGTATTACACATCTCTTTTGGACAAAATATAGCTGAATTCTACTTTTGCTGCATAAAAAGGCTACTTACATTTAACTCAGTTTGAGAAACACTGCCTTTAATTTTAATGAGAAATGGAACCCATTCGTATTTATTCTGCCACTGATGGTTATGACTGCATATCCCAGCTGTCAAATGGGTTTTCTTGTGGCTGTTAGCTTTTTATTAAGCTTTGTTATTGTTTCCACTTCTTCTCCTGATTTATACTAGAGGATAAGTCCTTTAGTTTCTTTAGTTTGGAAGGGGAGCATCCTAATTTTCTCTACTTACCATTCATCTGTCATATTTTATAGTACAGAGAGGTTGCATTATATATACTTTATAATCAAGAGTCAAATAATAAATATGACTTACCTAACGCTACCCACATAGGAGGAGACCTGTAGCATGTAATTTCACTCTACTCTCTACTTGATCATTTTACCTCCCTCCACACACCTGCCAAGTTTTTGGAAATCATCTGGAATTTCATCAGATTTATAAAGCCTTTCTTAACACCTGTATTATACTTAACAATTATTTAGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTGGCTAGAATACCCTTTAGAACAATATTCAGAATATAGGGGTAATATGCCTTTCTGAATCTTTGCATATCTGGAGATCTTTTTTTCTCTTTCATACATGAACAATAGTTGGCCTGATTTTCTTTTCCTTTCTAGGTAAACTTCCCCCTTCCCCTGGAATCGTTTGATATTTTTTCTCTTTATCTTTGGAGTTCAGAAATATCTCCTAGGATTTAAAAAAAAATCTTCTCTGTATATTTTATAAAATTATACAAGTAATACATGAATATGTTCTTTGGGATTCAAAAATACCACCAAGAATGTTTTATAAAGAATATTTTAAAAGTTATACAAGTAATACATGAATGTTCTCTCAGCTCAGAATTTAAACAATACAACCAAAAGTAGAGGTCCTTGTGATGCTCCTCAACCCCGAATCTCTGCCCAGAGTAACCCCTGTAAGAAGTTTGGTGTGTGCCTCTAGGCTTTTTCTAGATATCTGCATACATTTAAGTCATTTAAAGTGTTTTTTTGTTTTGTGGAGTTTTCCATTAAAATATAACAATATACTTATTTATCTATGGTTAGCTTATGACACTTAGCAGTTTGCCTCCATAACAATTGGCTTCATTTATTTATTTGTTTGTTTTCTCTGCTGAATGGCACCCTCTCCTCCAGTGTGATGGGTTGAGGTTATGTCCGATTATTTGCTATTAGAAACGATTGTGCTGTGAAAAATCTTTGTAAAGCCATTTTTGCACAAGGATAAGGGTTTCTCAAGGGCACTTCCAGAAAGTGAATTTGCTGCATAAAAAGCTACACACATTTACATCTTTAACAGATATGGCTGAATTTCCCTTCAAAAAGACTATATTTCTCCATGCTTTTGTAACACTAGTATTCATTCATCTTTTTAACGTTTTTGCCAATCTGATGGGAGAAGGGGTAGATTCTCATTATACTTTAAATTTTTGTTTCCATAAACACCAAAAAGATGTTGGTGCTTTTTAAATCTATTTATTGGTGATTTGTATTCCCCCTTCTCTGAATTACCTGTTCACACTCTTTGTCCATTCTTCCATGGGCCATATTTTTCTAGTTGATTTGTAAGAGCTCTTTATGTATTTTGGACATTAATCCTTTGGATTATATATATGGCACGTCTCTTCTCCAGCTGTTTCTCCCTTATTCTCTGGTGTCTTTGTTATAGAAAAGTTTTAAATATTGATGTCTTTAAATATAATGATCTCTCTTTTGATTGATTTGAGTCTTTTTCCACTCCACACCTCCATCTCCTTTATTAAAATAACTGAGGCCAGGAGTGGTGGCTCACACGTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGTCTGGGCAACATAGGGAGATCCCATCTCTACAAAAAAGTTTAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGTGCGCCTGTGGTCTCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTACTTGAGCTGAGGAGTTTGAGGCTTCAGTGAGTTTTGATTGTGCCACTGCACAATTGATTGATTTGTGAAAGCTATGTCGTGGAATCAGCTCTTGGATGTATTTATCAATTCTGTATTCTAATTATTCTTTTATGCTTTTGTTTTTATAATATCCTTTTTCCCTCCTTTCTTTGTTTGTGGTTGGTTTTCTTACTTTTTGCCTTGAATGCTTAGTTTATTTATTTTCCTTCTAATGAAAGTGTTTAGTGCTGTGAATTTGCCTCTGAATATATCTAAAACATGGCTATATCTGATATGTTTTCATATATAGTGATCTTATGTTGTTATTTTCTAAATAAGCTTGGAATTATAATTTCAAATCCTCTTTAGTCAATTAGAAGAACACATTTTAAATTCTAAGTGGTTGGGTTTTAAAAAATGTGTTCTTTTGTTATGTTCTAGCTTATCTTATTTTCAGAGAAAGTGACCTCTACAATTTTGCCAAATTTTGCCATTTGGGATTTATTGTGGTTTTCTTTGTAGCATGGTATCTGAATATGTCAGTTAGGATCAGGGTCATCTGCATGTAACAAAGTCCAAAATAACAGTGGCTTAAACAAAATAGTTTATTTCTCTCTTATGTCAAAGAAGTTTGGAGATAAGGAGGACCCCCACAATATCATCAGGAACCCAGACTTCCATTTTTCTACACCACCATTTTCAGTACTGGCTTCTATTGTAAAAAGTCACCCCATAGCCCGAGATGGCTGCTGGAGTTCCAGCCATCACATTCACATTCCAGAGAGGAGAAAGAAAAGAAGAATAGTAGGCTATATCTCCCAACCGAAATACATTTATCTTTAAGATACAGCCTCTCTTTAAGGAGCCTTTTGGGAATTTCCATGCAACATTCCATGTTCTGCATATATTTCATTCAGAATTTAGCTGGGTATATACATTTCATTTAGAATTTAGCTGGGTATATAGTTGATCCCCAATTATATAAGGATTCTATTAGTAAGAAAGAAGGGAAGAATGGTGATAGGCAAACAAGAATGCCATAATAACTTTTATAAATATTCCATCAACACTTTAAAAGATATACAATTTGGTGGTATCATCACTTTGTTAAACTGGGTAACTGGGTATTTGAAATGGCAAAAGTTGAATGTGGGGCTCATTTTTCCCTGAGAAGCCAAATGGACCCTTACACAATTATCAGCTGCCATCAAGTGGGAAGAACTGGCCAACCCAGCAGATGCCAGCACTGTCTTCCATTCACAAGGAGTTACTGAGGCTCACCCCATACGTTTCCACTCTCTCCTTACCCTACCCTAGACAAGCCCATCATTGCAGGGTCACTATGGCCCTGTAGGCAGGTGGGAGACTTGGATGCTGATCCACTCCCCTGCCATTCAGGGGTTCATTGCTGAAGCAGATGCTGTGAATGTCCTAACAGGACCGATCCTTTCCCAGCCTGGAGCAAGCATCCTTCTGTGAATAAACGCATGTGGTGTAAGAAGAGGATGCCCTGGCCCCCAAGATCCTGTGTGAATACTTGATGGAGGCGAAATGGGGAGCATGGCCTGGGATACCTCCCAGCAGCTCTACGAGGCAGCCAGAACTGAAATGACAATGCTCACCTATCCCCACTTCCTAGCCCCAGATATCTGTATCCTGAGGTTCAGAACAGTCAAGCCAGAGGCTGAGTCTCCAGAGGAACCACTGGATTTGAAGAACCTGGGCCTCCCACCTTGGCACTTTCACATGGACAAGCAACATGGTCCGTCACCACTCCTCCCCACCCCTGGGCCACTGCCTCGTCTTGTGTGGAAAGAGCATGCTGGCTGCTCCAGTGCTTCCTGCAGCCCCATCAGCTTCTCCAAGGCCCTGCTGTCGCCTGGTAGCACTGAACATTTAAGCAAATGCCTGGTCTGAAGGGGAGTGAAGGTTCCAGTCCACACCTTAGGAAAGCCCCTGGTCTGATGGAGTGGGTAAGAAAATATACGCATGCAGAAGCCACTAAAAATGCTTACCAAAATAGAAACGAGGGTGCCAGCGAATGTGCTAGGAACTGGGTCCCTGAGTGATGAAGGGAAGGGGCGAGTAAGGCTGGCAGGTGCCTCAACTGAGAAGCTTCTGGAAACCACAGTCAAGCTGCCTTCTGCCCAGGTGCACATCCCCAGCTTGACCCCTACGCTGTTTCCACTTTGCCCGGGAGTCACCTCGCCCTACCCTGCTCGCCCCCCAGAGCTCAGGAGAAACGAGCTGGTTTTCTCCCAGAGGCTGGTGCCAGTTTAGTCAGCAGATTTCACAGATCCACTGGCAACCATGTAGTGTCTTATTTTAAGCTTAACATTTGAAGATGGGAACTTTTTCCCCCTTCGGTGTGTGGCAAAGAGATCCCAATTTATACATAAGCACCGCGGCTATGCCGGTGCACTGAGGCTGTCCCTGAGGCTCTGCGGTTCGTCACTCCCTTTCTTCAGGTATCTTTCCAGAAAAAACCCGCCAGCGTGGTTGCTTCTTATACACGGCCTCTCCCTTCCCAGGTTTCCCCTAAGCACAGCACTGCCGCTTCCATGCACGTGGCCTGGGAGAGGCAGGGCCCGGCTTGGCCCTGGTGGTCCGGCCCTCGTCCTGCCTGCCCTCTCCATTTCTCCTCTGCTCCTGCGCCCTCTTCCCTTGGCTGCTGCGGAATGCCTCGGATGCCAGGGCCTGGGTTTCCCTCATGGGCCTGGGGCTCTCCCAGAGAGCATTTGTGCCTCTCTCAGCCCTGAGCTCCCCACAGCACTGCTTCCCTCCCCTCTCCTTCTCCCCGCTCCATGTCATGTCGAACTCTCAAAACTTAGGGACCAAATGCCTCATTTCCAGCCCAGGGTGCTAAGGAGGGCAGACCATGAACACCTAGTTATTGGGTCTGGTGGCCTTAGGTTAAGTCTAAATCCGATTTCTGTCTTGAGACATTAAGAACTTGGACTCTGTACTTTGCACTCCTTCATTTTAACACACAGGTGATCACATGGGCTTAGAGACTCTAAGTATCAGAAGATGCTGGTGTCGGCCACTTCATCTCCAGGGGTGTTTCCCAGGGCCCTCCTGACATCTCCCAAGCCGCCTCATCCCTCCTCTGCTTTTTTGCACATTTAAATCCCAATCCCAATGTTCTCCCTGGCCTTCCTCCAGCATTACCAGACCCCAGCCATGTTGACCTAGCTCACCACACAGGAGGTGTCGCTCCAGTGAAGCTAGAATTGACCGGTCTGGGGTAAACATTCATTTGACAGAGATTTTCTTTAACTGGCTGACATCCTTTAAGTAGCAACACCCCTTATACACTGAAGTGTAACTTTCAGATCATTAGCCACATAAATCAGAAGATGGAGACACAGTAGAAGGAAAAAACAGGACAATTGTTGTGTGTTGGGGTACTGCGGCCCATGGTGGATGACAAAGAGGAACATTTTGGAGTTGAGCGAGTCAGTGTGGCGGAAGGGGATGAGATGTAAAGACACTTGCTCTACCTGGGAGGCTCCCGGGTATGTGGGGAGGCAGCGTGGAGGGGCCTCATTTCTCTGAAGCTTATAGAAGCTCTCGAGGAAGATAAACTTTCCACAGCTTTTTGCTGATGAGGTGAATGGTACAGAGAAGGCATGCAGGGTGCCGGAGAGCGCGTGACAGACCTAACCTCACTGTGAGGGTCAGAGGAGACATCCTGGAGGAAGTGACGCCTAAACTGAAACCTGAAGGATGAGGAGGGAGGGATTAGCCAAGCAGAAATGGGGTGAAGGGTGAGAGGGATGATTATTTCCATTATCTTGGCGAACAAGACAGTTCGCCCTAGTCTTCCCCTGGCTTCAGTTTTACCACCCAATTGTTTTGACGCATACCCCATTTCCTCTCCAGGTTTCCCACGCTTTTAAAAAAACCTTTCTCCTGTAGTTTGAGTCAGTTTTGTATGGGAGGTGGCCAAGGGGGTGGGGGCTTGCTCAGTTCTGAGTCCTGATATCATCGTACACAGAACTGTGGCAGTGGCCTTACCCCTCCTGCCTTTATCTTCAGCTGTTCATGTTCCACTTCTGGCCAAGCAGACTGAGATATTTGGGGGTGCCTCTCTCCCAGATTGAGACCTCATCTCTCTGCAGCAGTTAGAATACTCTGAAGGAGGAGGCCCAAAGTGAAGATGTGATTTTTCTTGTAGCAAGTTACCATATGGGTGCCATTGGCCCCATTCCTTACTCTGTCTTGAGACTAGGCTCAAGCACAAACTGCCCCTCTTCCTGGGCCTGTCAGGGCAGCCCTAGAGATGGGCTGATGGCCCCTGGATTGGGTGGGTTTGATAAGCAGGGCTGCTTAGGAGCCAGCATCCCTGGTGAAGACTTAATTCAAGGCATATTCATAATGGTACAGAATTTTGGACTAGAAAGAACAGCATAGTCACTCCGCATATGTAGTAAGCTGTGTATTAGCTAGCTATTGCTACCATAGTGTTGTGTAGAAAACATCCACAACACTTCAGTGGCATACGTGAGCATTTTTTTTTTTTTTGAGATAATCTCGCTCTTTGGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCTTCTCCTGGGTTTAAGCAGTTCGTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGTCACCTGCCACCACCCTCAGCTAGTTTTTGCATTTTTACTAGAGATGGGGTTTCGCCACGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTGCAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGTAAGCATTCATTCTTAGGGATCTGCGGTTGGCTGGGGTTTGCCCGGTCTAGACAAAGCTTGACTGAGGCAGTTCTGCATCTCACTATGGTCAACTGAGGGTGACCTGACCTGGGATGGACTGTACCCTCCTGTCTCTCCTGTCTGTCCTCCTCCTTGGACCAGGGATTTGTCAGGGATGTCTTCTCGTGGCAACCTCAGATGCTCAGCAGGGCAAGCAGGAAGGCATGAGGCCTCTGAGCCAGGGCTCAGAACTGACACGCTGCCACGTCCTCCCACGTGCTGTCAGTCAGAGCAAGTTAGATGACCAAGCAGAGCCAAAAAGTGAGGAAATAAATTCCTTCTGTGATGAGGCCGTGGCAAGGGTATGGGTGCAGGGAGTGGGAAATAATCTGGACCAAAGACTCAATCTCCCACCCCCACCCCCTGCAATTAGGACTTAATAAAAGGAGTCAGGAGTGCATTGTCCCAGTCCAGCAGAGATCTTTCCCTGGCCAATAATTATCTAATAATTAGGAGTGTTATTCCACCCTGGGGTGTGGGCCCAGCTTTGTGCTGAATGCCATGGCGGGGGCATCAGAAGAAGAGGGAAAAGCCCCAATTTTGCCTTCCAGAGCTCTGTTCTCTGAGGGATAAGACTTGTGTTCCCGAGATGGAGATGAGACGATGTTCAGTGGTGTAATGCTGACTATGGAGCTCAGAGAAAGAAACCAGCAAAGGCCAGGAAAGAACTACATGGGAGGAGAAGAATGGCACTGGCAACCGGCATCCAGGGAGCGCTTGCTGCAGGCTGCATGCTGAGGCGAATTTCCTCCACACCTTACTTCCTCTCATAACCATCCTGAGAGGTACTGGGATTGTCCTTCACTTAACAGGTGAAGAAACAGAGGCACAAAGAGCTCCAGTGACTTGCCTGTGGTCACATAGCTGGTAAATGCTGGCACCAGCATTTGACAACCAGAGCCTGAGCGTTAATCACTAGGTCCATGGTAGGACACCCAAAATGAAGGGGAGCAGCAAAGGTACAGACGGATGTGCAGAGAGCACAGCTGCCAGGGGGCTGGAGCGGCAGAGGGGACTTCAGCCATGTTATGAACTATAAATGGGAGCAGAGATAGGATGTGTGATTTGGCCAAGGTCCTGCAGCGCGATAGGGTGGAGGCTGGGCTAGAAATCATAGCTGTTGGCTCCTGTTTCCCTCTCCTTCCACTTTCCTTGGTACCAGCCACATTCTGGGCGCTCTCCACCCGTCTGCGTGGCCACGCCTGAATCGTTTCCCTCTTGGAAGAGGTGCAATCCACTGGCATTGAAGCTGGGTGGACTGGCTCCCTCTCTCTATCCATCTCTTTCTTCCTTTCCCCTGCCATGTTCTGGAAAGGGCAGCGGGAGGGAATGTGGGCAGGTTGCACCAGAGATATACATCTGAGAGCTGAAGGGAACATTTATTTTTAATTTAGACTTAAAAAGAAAAAAGGAAGTTATAAAATATCTGCTCTTGCTCCTGGGATTGTGCAGATGGTGCTGCGTTTTGCCTAATAGGGAATTGGGCTGGCATCCTCGTGCTTTTGGTCCCCGCCTGACTGTAAGGACCTGGAGGGCAGGATCCCTGCTTCCCTGCCTCAGCCTCACATGGCCCCCTAAGGCTCCATTTGGCCGATGCAGCTCGGTGTTCCTGTCTTCTAACCTCACCCTCTCCACACTCCCTCTGGTCTCCCAGACCTCCTCTGCAGTCAGACCAGTCTCTCTGCTGTCTCGGCTGTCCCTGCTCCTGTGTCGGCGCCCCCTCGGCTCACTCCTACCTCCGCCTTCGTTAGATAGCCGGGACACACTCACCCCTCCCTTCCTAAACTCCTGTTTGGATGTTAAAATTTATCAACTTTACACATAACCAAATACCTCATTAAACCATCTTGTCATTTTCAAGCCTCGGTGTTATAAAGGATGTCATCCTCCATTTTCTTGTCTGGTTTTTGTTTTTATTGTGGTTAAGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCACTCATTCCTCTCCTCTGGCTTTCTCCATTGGGAGCAGCAAGGAACTTGGTACGTAGAAGCAGCTCCTCATAAATGGATGCAGAGTGCTGATTGGATCTCCCCTCTCTCTGCGCTCAAGGGGATGAGCTGGAGAAGGAGTACCCTAAAATCAGAGTCCGGGCCCCCAAGCCAGGAACCAGGAGACCTGATTCTCTAGCTTGCTATGAAGCTATGGACAGATTACTGAATTTCTCTAAGCCTCAGTTGTCCCGTTTGCAAAATATCAAAAGTAATCTCTGCTTTGATCCCCAGGGTTAGTATGAGGATTATGATAAGTGAAATGCGTGGCAAAATCAAATCAGTCAATCCATCTCTTTAAGAAAGAATGAGGAGACTCATAGCAGTCAGAGGTGCCAGCATGGACTCCAGACCCATGTTAGGGTAGGAGGTTGGGATGCAAAGTGGGGATTGTCTAACAAAGTAAAAAGCTTGCTGGTCACAGAGCCATGGGCAGTGTGTATGTGTGTGGTACATAGCCCAAATACTAGTTTGGTTTGTTCTGGAAAAGACTTGATGTCACTTTTAAAAATGCTTGCCACTAAAGATAAATCAAGTGAAGATGAAAATGAGACAAAGGGAAGGTTAGGGAAGGGAAGATAAAATGAAGCCAGAAGTGAGGTTTGGGCACAGAATCCATGCAGTGTGGGTCTGTACACTTGGCAGATGGGGCTGTGGAGAGCTGGCCTGAGCTTCTGACGGTGCAAAGAGACTCAGTTGAATGGCTCAGTGTCTGCAAGGCACATGCACACCAGTTATTCAGAGGCACAGTTCCTGACCCTGAGACTGGAAAATATTTCCCCCAAGAGGATTATAAAGGGAACCCTGTGGTGTCACGGGCAGTGTCCTGGACAGCAGTTGTCTGGTAAATGCAGTGAGTGCTATTGGGCTGTATCTTACGATGTTCCTGGTGGTCCAAGTACAGTTCGAGGGGTAAGTGGGGATTCAGAGGAGAAGACAGTGTAGTCCATAAGACACCGTGTTCAGTAGACTCCAGATCAGGGGATGACGTGCTGGGCTCCAAACAGTGAACAGCCTTATTAACTTCCTCCGGTGGTAGAAGGCAGTCAGGCATGCATACGTGTACACATAGGAGCACATGTACTCTTCACCCACCCCCCTGTCCCATCCCCACCCCCGCTAGGCTCAGCTCCCTCCCTCTGGTCTGGCTTCTAACTGGGGGCCCCAACTACGAGGAGGTCCTCAGTTTCCTGGGATACTCCTTAGCAGATGGGATCCCATTACAGAAAAGACCGTCTCTGTTGACTTGACACCTACTACCCAGAATTTGGAAGTAGAATTTTAAACTGAGGTCAGCCCCTTCACTTTCATAGTTTAAGAAAGTTAGTGCCCCAAAGGGGATCATTTTCTGCCAGAGATCACATGGGGATGGAGCTGAATCTAAGACCCAGGTTCCCCTGATTCTCACTCTAATTCCCTAAGCTGCCACTGCAAAGAAAAAAAAAATCAAGTTGGGATCTCATTCTGGGGGAAAAATCTCATAATTCCTCGTTGGAGCTATGGAATAGCTTTATATTATATAATTTTATTCAAACTGATATGAGCCAATAAATATAGATTGTGTGTGTGTGTGTTAGCTGTTTTAAAACATTTTAATGTTTAAAACATGATTTACTAATGCTGCTGGGGATGTCTAGAATTTGATTTACTGCATATTATTGAGTGTTTATACTTGTTCCTTACAGAAATTCTTGCCAAAGAGCCATTTTATCTACAGGAATAATAAATAAGTCAATATGTGGATGGTTGTGCACATTTTTCCCATATGCAGTGGGACTTGGTAGATGTTACTTTGCACACAAACACTCAGAAGGTAAACTGGAGAGATGCACATGGATCCCTGAAGTCCAAGGCTTGGCCAGTGTCAAAATCAGACCATTCATCTTGACTTAAACCAAAAACACGGTCAGCAAGTCTAGGTCTTAGGTGATATTTGGGCTTTGGGAATAATGGATCTACATGTTCCCATACCTAGCCATATGTGTATATGTGTATATTTGTTCATTTCTTCATTCATTCCTTTCTTCACTCATTCAACAAATATTAGAAATCTATGTTTCATTCAGTTGCTTAAACCTGGTATAGGTTTTTGCTTCATGGAAATTCACAGATAACAGATACAAATTCCCCCAACTTGTATTTACAAAGCACTTAAGGCCTTTGAAATGATTTTTGTTTAATCCTCGCAAAAATCCTACGGGAAGGCTAGGGTGAGCAGTCAGGTAACCTGAGTGGAAACGAAGGTATTCCTTTTGTTTGCTTGTTTTTATTGCCCCCCTAATTGTGGAAATAATACATGTCTGTTGTTTAAAAGAATACAGAAATATTTAAGATTGTGCAAAAGTAATCTGCAACCCAACCTCCAGAGACATCCACACTACAGGTTTTTTCATGCTTGAAGATAATGTGTGTATGCATGTGTTTGTGTATATCGTTATATATAAAATGATTTTTCTTTAAATAAATAAGATTATGCTGTAATATAATTCTGCAACTTGGTTTTTTCCCATCACACAGCCTCTCCCTCAATGAACCTCAGTTTGTATGTACACGGCATACCACATCAGTTTGTACAGATCCAGCTCACTCATTTGTGGTAGCGTATTTTTTCTTTGCAAAAGCATAGGATGTTTCTTCTGCCTTTTTCAGCATTTCTTCTCTCTTGCTCATAG
Seq C2 exon
GTAGTCGGTCTTCTCTTGCCCAACCAGACACTGGCATCCACTGTCTTCTGGCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000144040:ENST00000272433:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0382012=Mtc=PD(4.6=33.3)
A:
NA
C2:
PF0382012=Mtc=FE(5.5=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains