HsaINT0185491 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000062370 | ZFP112
Description
zinc finger protein 112 homolog (mouse) [Source:HGNC Symbol;Acc:13021]
Coordinates
chr19:44847406-44860856:-
Coord C1 exon
chr19:44860778-44860856
Coord A exon
chr19:44847455-44860777
Coord C2 exon
chr19:44847406-44847454
Length
13323 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGC
5' ss Score
9.6
3' ss Seq
ACCCTGTTCTGCCTTCTCAGGTC
3' ss Score
11
Exon sequences
Seq C1 exon
GTAGTCCAGGAGGTCTCGGTAGGCAGAGCCACTTCCGCCCCAGGTACGCTAGGCCGCGGCCTTCGTTCCTCCCAGAAAG
Seq A exon
GTGAGCGCTCCCCGCCCTGCTTCCTGCTCCTTCCGTCCATACTGATGTTCGTTTTGTTGGGGTCCAGTAGCAACCGGGCAGTAGCTCTAGGGGAGGATAATCCACTTGCGGCGAAGGGCGGGATTTGTGTTATCTTTGAATGAGCCTTCTCCAGTGTGGGGCAGCTGGCGCATCCCCACTTAGCGCCGGGGGTCCAAGATCCTACATCGCAGGGACTGGGGATCTCCTGGGTTCTGTACTTCCCCAGCCCTTTCCCCTGACCATCAACCAGCTCTGCCACTTCCTAGCAGTATAATAACAGGCGAGTATCTTAATCTCTCTGCCTATGTTTCTTTTTCTTTAAAATGGTACTAGTATCTATCTAATGGAGTTCTTTTGAGAGTTAAATAAAAAGACTTGGAACAGAGCCTGACAGGTGGTAGAAGATGGGTCTCTTGTTATTAGCACTTTTTAATTTTCTGAGAAGGACTCAGTTCCCTGAAAGCTTCTGTGAACCCAGGATGGGGTCAGAGCTCCAGCTGCAGAGTATCCCTGGCCCTTTTCTGATCACTGAGAGATTTTTCTTTAGGACAGGATCACTCCTGGCTGTCTGGGTAGTCCATTGTAATTCATGCAGGAGTTCTGATTTCCCCCATCCTCCTTTCCTTCTTTAGCCTTGACTTCTTGAAAAAGGCTGCAGGGAGAAGGAGGGAATGACCCTTTGGCACTTGGCAGCGGAGTCTCACCTGAGTAGTACTTATCATCCTTTCTTTTCAGGGAAGACGATATTTCCATCATTCACTGGCAAATTCTGCTCGAAGATGCGCTGATATTTGTTCAATAAATGCAGAAACGGATGAGGGAGTACTTGGGCATGAGTAATAAAGATAGTATTTAAACATTTAGTGCTGATCATTCTAAGAGTTTGATATGAATTAACATCTTTAATCCTCACAAGAGCCCTTTGAGCCTGGGTTGGGTACCACCATTCCCATTTTAAAGATAAGCAAACAGACATAGAGCATAGGTGGTTTATCTTTAGGTCACCCAGGTGGTAAGAGCCTGAGCTGGGATTTGAATTCAAATAGTTTCCATCCATTGCCTTAGTTCTTGATGTGTTTAGTATCAGCTTCAGAACACATATTTGGATTTTACTAGAGGACCGTGAAAGCAAGGTTAATAAGCTTTGAATTTTTGATTTTTTAAAATTATCTGTAATTTAATTTTATTTGAAATATTTATAGTTCATATTCTGATTATATAAATTATTGCATATTGTAAAAGATTAAGAAAGTATAGAAAGTGTAAAAGAAAAAAATTATGCTAACCACAAGATATAACAGTAACAATATTAATATTTCAATGTTTTCCTCTTCCAGTAGACTTCTTTTTGGATTTTCACCCATGTTTAACCAAATAGGCTTCATAGCTTTTATTTTTCCCTTAAGTTTTTACTATGGAAATTTGTAAGCATAGCCAAATGTAATATGACTAAAATAATTCTGTGGAAGCGTCACCCAGCTTCAACCTTTGTTAACATTTGCCAGTCTTGTATCAACTCCCTGTCCCTTTTTTTTTTGTTTCAGTATTTTAAAGCAAATCTCTAACATCGACTTAGTATAATATCGTTTGATTGATTGTCATAATTGCCAAACGTTGATGATCATAAATTGCTTATATCCAAGACTTTGAAAGGGAAATGCCAGCAGCTACTCTAAGGTTTTCATTCGTTGAAGCTTACAGAATGGTCCTTACTTGAGGAAGCTAGGGGATGCAAGAGAATTGTACCTTGGAGAAGGATGGTGATGAATTTTGTGTTCCAGTATAGAGTTTGCCTTGCCTAAGTCTTATAGCTCTTTGTTTCTTATTTCTCTTTATCTAAATCCATACACTGAAAGTTCTTCTATTTCTGGGACCATGTCATACTTTTCTCCATGTGCCCAGCACATCGTACAAGGTTGTTAAGGGTTTATGGTTAGAGTAGCTACTCAACAGACAGCTGGCATCAAGGATTTGCAGTGTGGAATTGGAATTAGGTATCAAAATAGAATAGAAATAACCCCTGGATATATTCCTTAATCTCACTTAATATTGGTAGGTTATATAATCCACCAACTATTTCAGAGTATTGAAGAGTTGAAGAGCAATGATTGGTTATGTTTTGATAATCTAAAAAAATTCCTAAGAAACAAATTGTTAGAAATGGTAACAACATTTATAGACCATGCCTTATAACTGAGGTTGTGTTTCCAGGTTTTTAAAACAGGTTTTTAAAAAATGTTTTTACAGTGACATTGACTATTTTGTTATTTTTGGTATACAATTCTATTACAACACAGGCATAGTTTGTATAACGACTACCGTAGTCAGAAAAAGAACAGTTCCATCACCCCAAAAACTCCCCTCATGTCTTCCCTCATAATTACCCCTCACCATACCTGTAACCACTGGCAACTACCATAACCACTAAAACGCTATAGTTTTGTCTTTTTGAGAATGTCGTATAAATGAACTGATGCTATATGTTAACATTTGAGACCGGATTCTTTTACTCAGCAAATTGCTCTTGACATTCATCAAAGTTGTTATACGTATCAATACTTCATTTCTGTTTACTTCTGGTTAACAGAAGTGTCCACTTTATGGATGTATCACAGTTTATCTATTCTCTGGTTGATAGACTTTTTCCTCCACTTTTTGGCATTTATGAATAGAGCTGATATAAACATTCATGTACAGTTTTTTTTGTGCTTATTTCTGTAGGGTACGAAGCCAGGAGTGTGGTTACTGGATCATATGGGGAATGTATGTTTAACTTTATAAGATGCCAAACTGTAGTATCTGTACCATTTTGCATTCTCACTAATGATGTAGAAAGTTCCAGTTTATTTACATCTTCATCAGCACTTAGTATTTTCCTTATTTTTTTTTATTTTAGCCATTCTAAGCATTGTGACTTTAATTTACATTTCCCTAATGGCTAATGGTGTTCAGCAGATATTTCTTTTTTTGTTATTGTTTCTTTGCCATCCTTATATCTTCTTTGCGGAAGTGTCTGTATGCATGCTTTGCCCAGTTTTACATTGGGTTATATTTTTCCTATTGTTGATTTTTGAGAGCTATTTATATATTCTGGATATAAGTCCTTTGTTGGATGTGTGATTTGCAAATATTCCTTCTCAGCCTGTAGCTTGTCTTTTCATTCTCTTAATAGTGTCTTTTGCAGAACAAAATTTCTAATTTTAATTACATCTAATTTATCAATGTTATCTTTTTTGGATTGTGCTTTTGATGTCATATCTAAGAAGTCTGCCTAGCCCCAGGTCGTGAAGATTTTCTCTTGTTCTAGAAGTTTTATGGTTTTACACTTAAATCTGTGATCCATTTTAACTTTTTTTATAATATGTGATGGTTAAGTTGGGTTTTATTTCTTTACATATGAATGACCAACCATCCCAACACCACTTGTTTGGGTTTATTTCTGTACCATGTTCTGCTAAATTGATCTATGTGTGTATCTCTTCACCAGTACCAAGATATCATATTTACTGTAGCTTGATAGTAAATCTTAAGACTGGATAGTTTGATTCTTCCAAATTTATTCTTTTTTTCCAAAATTGCTTTTAGCTATTCTGGTTCCTTTGCCTTTCCATATGCATTTTAGAATCAGCTTATTTATATCTACCAAAAATTCAGCTGGTATTTTCATTGACATTATGTAAAATCAGTAGATCCGTCTTTATCACATTGAGTTTTCCAGTTCATTGATATAACATGTCCCTTCATTTAAGTGTTCTTTAATTTCTTGCATTAGTGTTTCATGATTTTCTGCATACAGATCTATACATGTTTTGTTTAGACATATGCCCGAGTATAATATATAATTTATTCTTCTAGAGCTATTTTAAATCATATTGTTTTAAAATTTTGGTTTCCAGTTGTACATTGTTAGTGTATAGAAATACACCTGATTTTTGTGCATTGACCTTGTATTCTCTGACTTTGCTATACTCACTAGAAATTTTTGTTTTTTGGTAGATTCCTTGGGATTTTCCACAGAGACACATGTTGTGTATTAATAGGGTCAGTTTTATTTCTTCCTTTCTAATCTGTATGCTTTTTATTTCTTTTCCTTGCCTCACTACACTGGCTGATTTTCAGTACAGTGTTGAATAGTTATGTCAAGAGTACACATCTCTGCCTTGTTCCTGATCATAGGGGAAAGCATTTTTATAAGTTCCATTATATTTTTAGTCTGCAAAAGTTCTGTCATGAGTGGATGTTGTATTTTGTCAAATGCTTTTTCTGCTTCACTTTTACTGGAGCTGGTGATTGCTGTGCACTTAAAAGTTTGACAAGTACCTGTAGAACAGCCTTATTTAATTTTTTAACATTTATTTTTTAACTTATCTACTTATAGTAGAAATTTATTCTTTTTGGTGTACATTTCTGAGTTTTGACAATTGCATTGTCATGTAGACTTCACCACCACAATCAAGATTCACAACAGTTCCATCGCCCAGAAACATCCCCTTGTGGTACCTTTTTGTAGTCAAACTCTTCCCCAACTCTTAACCCCAGGAAACCCCTGGTTCACTCCCCAACCCCATTGCCTTTTCCATAACATCACGTGAACAAATCAATGCAGTATGTAGAATTTTGAGTGATTTTTTTCATTTTTCTCTTTGATTTCTCACATCAGTATTTTGTGTTTTGTGTCTTTGAAGGAATTAAACCATTTCATCTATCACTTTGAATTCATTAATGTTAATTCATTTATATTTCTAATGCCTGTTAAGTCCGTAGTGATATCCCTTCTTTCATTCTTGATTTTGGTAATTTGTGTCTTTTCTCTTTTGTTCTTCATCAGGAGTTTAATTTTTACTAATCTTTGCAAAGAACCGCCTGTGGGTTGAATTAATTTTGTCCAGGAGCCAGCAAACCTATTTTTTTAGGCCCAGATTGTAAATATTTTAGTTTTTCCAGTTAACTAGAAATATCAGTACTATTATTTAGGTATTTATATAATGAGAGGAAACTTTAATTGACAAAATTTAAGATATAATGATTGAGTACAACTTAATTGAAGTTCAAGGTTGCTATTCCTTGTCATCAAAATTGACTGTAAATGTTCATCTGTTAATGCTGATTTGTAATGAGATTTTATGTATTTTATCTTTGAAAAGAAATTTTTTAAACAAATAGGTCCTATGAAATACTGATACTAATCCATAAGCAAATGATTTTAATTGTGAATATCAATGAGTTGAAAGATGTGGTAAACTGAATAGTGGCTCCCTAAAGATGTCCATATCCTAATTCCCAGAGCTTATGAATGTTACTTCACATGGTATGAGATATTTACTGGTGTGATTAAACTTAGGGAGTTTAAGATGTGTAGATTATCCTGGATTATCTGGTTGGGCCCAGTGTAATTACAAGGATTCTTATAAGAGAAAAGCAGAAGGATCAAAATTAGAAGAAAGTGACATGATAACAGAAGCAGAAATTGGAGTGCTGCAGCCATAAGCCAAGGAATTCCAGCAGCCTCTAGAAGTTAGAAAAGGCAAGGAAATGGATTCCTATGAGAAGCAACCAGCCCTGCTGACACCTTGACTTTAACCCAAGGAAACTGATTTTAGACTTCTGATCTCCATAACTAATAAAGAATAAATTGCATTATTTTAAGCCACCAAGTTTGTGGTAATTTATTATAGCAGCAATAGAAACTAATACAGAAGACATTTAAAGAATTACTGTAGACTCTTGATATTTACCTTTTAGTATGTCACTACATTTCAGAATAATCACTTTCAATGGAAGGTTAGGAGAATTATGCAGTGTACAATGAAATGGACTTTGAAATGCAGAAAGGTCCTTTGCGCTTGCATCAAGGTCTGAAAACACTGCTACAATTCTGAAGTTTGGGCTCAGATAACATATATACTACAAATTTGTGTGGGAATTGAGATATTACTTGTTTTAACTTTTGACAGCACTGGAAATTTGTAAAGTGGCTTAGCATTACCTGTGATTCAGACATTAACTGTCTTTGAAATAACTTTCCTACACTATAAGCTTCACAAATAAGTACTGTTTTGCCTTTTAATTTTAGGTCGAGTTCATTAAGAAGCATTATCAAGTCTGCAGCTAAAGCTAATTTCCAATGTCATTCAGTATTATATCAATAGTAATGCTTGAGGGAAGTTCTTATTCAGAAATATTTCAGTCTCAGCCCTGAGATTTAAAAAAAATCACAATAAAACTTCATTGCTGCTCAGACATTGAACTCTCATGTGGTAGGGCAAGTCAGAATTTTTCTGTTTCTCATGAAATTCATGCAACTGATGATGGTTAAATCTTTGAGTTTGAATGAAGTTCACTGTTGCCACTAGTGGTTCAATAGCACATGATAGATTAAAATATTCTCTGCAAAGTACCTGCTGATGAAGAATACAATGAGTAACCATAGGCTTTAAATACATGTTTTTATAAATCCAACCTCTGCCTTTTTCTGCTCCAACATATCTTTTACCACTATCAATTTTAACACTTCTTAGCAGATTGTACTGCCTCAGGTTTACTGAATTAGTATTTGTACCTTCTTTGGTAATATTTTCACCTGTGGTTGTTCCATATCGACTGTTCCTAGAGGCTAACCATTCAACCACTCAAACTTGGCATTGATTCCTTGAATACACAATATCTGAGCAACATTAGTAACATCTGTGAAATCAAGAGCCAAATAAATTTATCAGAATCATTTCCCTTGTATTTTAATGGACCATAATGTTGTTCCCATTGTCCTCAACTCTTAGAGCAGTTGGTCTTGCCCAAAGTCTACTAATCATAAACAAATTTATTTTATCTGGATACATTTCTTTGCCTTCTGCAATCAAACATGATTTAATTAATTCATCACTGGTAAATTACTTTCCTTGCTTGGGGCAGAAATAGAAGCTGAATATCTGAATATCAAAATGTACTGTAGTTGCTACCTCATTTTCATTATTTTTTTTGTGAAGAAATTCTGCTCTGATGAGACATTTTATTTAAAATTTTCTAATTTTTCGGACCATTTATTGTGAATTGAGAATATTGTGATGAGTGCTTAGCGTGACAGTGTTGACATAGGTTTGATTAGTTTAGCATAGATACGTTGTCACTGCATAGGAAGCACAATAAGCATGATAAGCTTTGCCATCTAATTCATTCACAAAATATTTCACCTCCATTGTGCCTTCAAAGTGTAACAAAGTCTGTTTTTCTGTTTTTTTTTCTTGTGTTTGGCTTGAAGAGTGTGTATTAGTAATACAAAAATTAAAATGTTGTGGTACAGCAATACATATGTTACTTGAAATGCTGTTCAATTAACAGCATTTAACCCAATTGAGTTAACCTAATGCTGAGTCACAGTGGTTTAAATTGTGCTTAGCAACAATATGAAGAAATGAGAGTGCCACCTATGAACTCTGTTATAACTACATAGCACTGCTGCTGTAATGCAAAAGCAGCCATAGGCCGTACGTAAACAAATGAGCATGGCTGTGTTACAGTAAAACTTTATGGACACTGAAATTTGAGTTTCATGTAATTGTCACATCACAAAATAATCTTTTCAGGATTTTTTTCAACCATTAAAAAGTAAAAGCCGTTCTTAGCTTACATCCTGTACAGAAACAAGCAGTGGGCTGGATTTGGCCCAGCCATATTTTGATAGGCTTGATTTTGTCTAGTGTTTTTGTGTTTTTAATTTCATTGATTTCTGTCTTAGGTTTACTACGTCCTTTTTTTCTGTTTGCCTTTAAGACCTCTTTTCTAATATATGCATCATTGCTATACATTTCCCTATAATATCTGCTTTAGCTGCATCTCTTACATTTTGATATGTTGCATTTAAGTCTTGATTCCATTTAAAATATGCTCTAATTTATTTTCTAAGAAGCATTTCCACTTCACTGCATCTAATTTCTTTTGTGACTAATTTCATTGGTTGCTTAGAAGTATGCTGCTTAATTTCCAAACATTTGGAGATTGTCCAGATATTTTTTCTTGTTCATTTCTACTTTAAATCTGTTATAGTTAGAGAAAATACTTTGATTTGAATTCTTAGGAAATTAAGATTTGTTTTATGAAAAAGATAACATCTGAAGTAAAAAAAAATTATTCGATGGGCTCAGTAGCAGACTGGAGATGACAGAAAAAAGAATCAGTGAACTTGAAGATAGGTTAGTATAAAAATGCAATTTGAGCAACAGAGAGAAAAAAAATTGAAAAATAAATGAGCAGAGCCTTCGGAACCTGTGGGACAATATCAGAAGTCTAATATTCCTGTCTTTGGAGTCTCAGGAGGAGAGGAGAGAAGTGTTTGTTTGGAAGTACTAGCTGAAAATTGCCCAAATTTGGTGAGAGACATAAATTTACAGATTCCAGAAACTCGTTGAATACCAAATACGATAAACTCAGAGAAAATCACTTCTGGATACATCATAATCAAACTTCTGAAAATTAAAAATAAACAAAAATTCTTGAATACAGCTAGAGAAAATGACATATTATATATCTGGTAGAACAATGATTCAGATATACGTGGATTTCTCATGGGAAGCCATGGAGGCCAGAAAACATTGGAAAAACATCTTTAATATTCTTAAAGGAGTTGTCAGTACAAAATTCTATATCCAGTGAAAATGTCCTTCAGGAATGAAATGAAAAAATGCCACATCTGTGCTAAAAGGAGCACTAAAGGAAGTTCTTTAGGCTGAATAGAAATGATATTAAATGGAAACTAGGAACTTCAGAAATGATGAAAGAGCACCAGAAATAGTAAGTTTTTTGGCAAATATAAAATACTGGTTTTCTACTCTTTAAAATATGCATGACTGTTTAAATAAAAATTATAACTTTCTTGGCTAGAGGTTTTTGTGTATATAGAGTAGTATATACAAATGAAACAAAGTGGGGAGATAAAGGAAACTATTTGTTGGTAAGGCATCTGCATTTTACAAAAAGTAGTAAAACAGTAATGCTAAATACACTGTGAAAGATTAGATATGTATATTACAACCCTAGAGCAACCACTGGAAAAAAAAAAAAAGGACATATAGCCAAAAGCTAATAGATACAATGAATGGAATAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAACCCAAAAGAAGGCAGAAAAAGGGGTAATAGAGGGACAAAATCAGGGAGGACAAACAGGAAAAAAGATAATAAAATGGTAGACAGAAACCCAGCTATATCAATAATTATAGGAAATGCTAATGGCCTGAATACATCAATTAAAATATATTGTAAGATTGGATAAAAAGCAAGAACCAAGTATATGTGGTCTAAAATAACTCCATTTAAATACAAGGACATAAATAGTTTGAAAGTGAAAAAGTGAAAAGGAGCTGTACTACGGAGTGGCTATATTAATATCAAAGTAGACTTCAGACCAAGGCCAGGGATGCCGAGGGACACCATGCCAAGGGTCAGTTCCCCGAGTAGACATAACAATCCTAAAAGTGTACCTACAAAACAACAGTTACATGAAGAAAAACTGATATAATTAAAAGAAAAAAATAGAGAAACCCACAGTTCTATGTAGAAATCTCAACACTCTTTTATCAGTAATCAGTAGAACAAGAAGACTGAAAACCAGTAAGGATTCAAAAGACCTGAATAATACTATTAACATCTTGACCTCGTTGACATTTGTAGAGCACTCTATCAACAACAGAATGCACATTGTTTTCATGTGCTTCAGGTTTGATTGTTTCTGTTGACCTGTCTTTGAGCTCGCAGATGCTTCTGCTGCTTATTTCTGATCTGTCTTTCCCATTTGGCTACAGATTTCTGTGCAGCGGGAACTGTGTCAAATTCTCCATTTGCTTATTACCAAACGTAGGGATTGGCAGAGAGGAATTATTTGGTAACTCTCTGTGGTTGGTGCAGCTTTCCAGCAGGCAGCAGGAATGGGGACCTTCAACTCAGTGAGAGTATATTCAAATTTTCTGAAAATAGATGTGGGAGAATAAAAGATGTGAATATTCCCTGTCCCTTATCTCTGATCAGTTTTGGTGGGATGCTGAAGCCAATAGATTTTTCAGAATGTTGAAAGGGTGATGTACACCTATATGGTTAATTACTGACCTAAAATAAACATACTTTGCAACAAACCAGAGCTAATGAGCAGCTTCTAGATTTATTTCATAGTGATGATAATGAAGATGGTAGTAACAATGGCTAACATTGATCAGATTTTATTACCACTCACACTGACTTTCTAATATTATGATGCATTGAACTCACATAACATAACATAACAACCCAACGTTTATCTCCATTTTACAGATGAAGAACAGAGGCATTGAGAGGTTAATTAATGTGTGTCAGTTTATGCTGCCAGTAAGTGGTAGAGTCAGGATTGAAGCTTGGCAGCTTGATTCTGTAGCCTGGGCTCTTGGCCAAAGCATTCCGCTTTCATTAGGCTGGCAAAATGGGTTTTAGGAGCTAATGAGGCTTCAGCGAAACCTTCTTAAAGGTATCACAGAGCGGGGCACATACAAGCTCAGTGTTAAAAGCTAAGAGGATCTGTGATGGGAGTGGGCAAATTGCCTGTGGCTTGTTTTTGTGTGTCTCTTCTTCAGCTAAGAATGATTTTTACATTTGAAGGGTTGTGAAAAGAAAGAACAATATTGGACAGAGACAGCATGTGACCCACAAAGCCTGAAATACTCACTATCTGTCCTTTTTATGAAAGCTTTCCAACCCCTGCTCTAAGTGAAAAGAGAAAGGAGTGCAGGAGGGGTGGCACATGCAAGGGCCTGGAGACTCTTTTATGAGATCAAGTGATTGACACGGCTGGAGATCAAAGGGGAGAGAAGATTTGCAGAGAAAATGAGCAGACAGACATGAAAGATTCCTGTGTGGCTTGCTAAGAATCTAGACTTTATCCCAAAGGCAGCTATGCACTTGTTTTAACCAAGAAAGGAACATAATCAGGCTTTAATTCTATCAAACATGAAGAAGCAACAATAGTCTATAGGATGACCACTGTGTGATTTCATATTTAACAGAAATTCCCTTTTCTTTTGAATTCTCAAAGTCCCTTGGCTGATTAGTGACCCCCTGCTTGATAAAGGTGATCAGAGAGGTCTAAACTGGAAGGCTGTCCTCACACGGAGTGCGTGACTGCAGACACCCACAGCGCATGTTACTGCTCCTTCCTCTTAGTGACAGCTCCAAGAACATCATTTAAAAGAGAGAAATGGGGATCTGGGAATCAAGAGGCCTGGCTCCCAGGCCCTTCTCTGTTCCTGGCTTGAGTGTTCTCTGACAATTTTCTTGAGAGGCCAAATGGCCTAGTGGTTAATTGCATGGGCTTATCCTGCAAACTGTCTCTATGTATGTCCTGGTCTGTGGTTTGCAATCCTCTCTGCACACTGTAGTCACCTGGGGGATTTCATAAAAACTCTTCTTCCACAGATCCTCATTTATAGAGCCTGGACTTGGGTCTGGGCATTGGTTTTTTTTAAAGCTCCCCATTGATACCGGTGAGCTGGCAGCTTAAGAGCCACTGTCCTAGTAACTGAGAACACAGACCCTGGACTAATAGTCCTGGCCATTCTGCTAGCTAAAATGACAAAGCAGCTTAAAATATTAATGCCTCAGTATTCTCAACTGTAAAAAGAGTTACAAATTGTCCCAACTTCTTGGGTGGTTGTGGGATTAAGTGAGGGAGTTCCTCTAAAGCATGTGAGTTGGTCTTCTTACATTTTCTGCCTTCTCTCTTGCCCTAGATACCCACTAACTCTCATTCTGTTTCAATAGTCTGATGACTCCTTTCTCTTTGAGTGGCAAATATAGGTCAGTCACCTTCCAACATTAAGATCAGCCCTCATTTTCTCCATCCTCATCCATCCTCCATCATCATGTATGGATTTGAGGGCCCTTCCATGCTCTCTCAAAGGACTCCGTGCACCCTCTACCCTGGCATCTATCTGGGCACTGTATCCCTTTTAGAAGGCAATCCATAAATATTGGATGAGTGAAAGAAAACTCAGCTCTTTTACTGCTGATTACGCAGCCAAGTTCATACTTGTTCTTGGTAGTTGTGCTTACATCCTGTGGATTCTACAGCAGAGGCCAGGTGGGGCAGGAGGGAGCAGGTGCCTACTGGAGTAGTGCACCTCTCTTTGAGGTGGTGCTAGAAGGCTCTGCCTTACCCACAGTTCATTTTCAGTTCCTTTTTTATTTTTTTCAGTTCTTTCTCTTCCACAGATAGCCTTAATGTTGCCTGAGAACAGTAAGTAAAGTAAAGTAACAAACCTTGAGGAAGAACCATGAAATTAAACTCCTGGTGTCCAGTCCTCCCCAGGGTCAAGCACTGAGCTGCTTTTCACAGAGGAGCACACGCAGCCCCACAAACAACCCTGCAGGCTAGGTGTTCTCATCACCAATGAGATTTTGTCATATCTAGACAGAGGATCACATTTTTGTTTAACATGAGAAATGTAGTAGTCTCACAGGTTTCATTAGTCTTTTGTTGTACCCTGTGGGAAGAGGGATGTACCACTGAACTTCCCCTGAGCTCAGGAAGAATATTTACTAGCCACTGCATTTTTCATAAGGGTGGTCTCGATGTATATAGTATATACTGTGGCAACAAAAGTAAGAAGCCAGAGCTACAGACATTCCGAAGTTACGGGTGACTTTCCCGGGACAGAGCAGTAATCTCTGCTGTCCAGATGTCTTACAAAATACATTCGCCAGGGCAATTTTGTGATACAGAATGGTATCTGCATCTCTATAGTTGCAAGGAAGTAGAGATCCCTGGTATAGTTATAATAGGTTTCCTCTATGCACACAGATAATCCTAATAACAATCATATATTGTTGGCACTGTGTGGTCTGGATTTTGCAGATGACAGAACTGAAACATTAGAAAGGTTCATGAATTTAACCATGGTTACTCAGCAAGTATATGGTAGCACCAGGTTTTGAACGTAGACATTTTGTCCCCAGAGTCCACTTTTAACCAGTACATGACATGCCACTACCTCTCCTTTCCCACCTCTCCCAGAATCAGAATGAGCATGCTGGGAGCTGTAAGGCATGTGAGGCTACTGGGTACAGCTGTGCAGGTTGCTCCGTGCATGCGGGCACCCTGCCAGGAGAGCCAAGTGGTAGCTAGAATCCAACCCATGCTACCTGCTCCTTAACGCCGGTGTGTGGCCACATCTGCTGGGGGAAGGGACACCTTTTTCTAATTTGCACAAAGATACGTTTCCCTTTTAATCATGGCTTCTTTCGTATTACCCTGTTCTGCCTTCTCAG
Seq C2 exon
GTCTCTGCCTTTCTCTAGAAAAAGAAAGAGAAAAATGACCAAATTCCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000062370-ZFP112:NM_001083335:1
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)