Special

HsaINT1003770 @ hg38

Intron Retention

Gene
ENSG00000196912 | ANKRD36B
Description
ankyrin repeat domain 36B [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29333]
Coordinates
chr2:97492663-97507065:-
Coord C1 exon
chr2:97507036-97507065
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr2:97492663-97492855
Length
14180 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATGT
5' ss Score
9.79
3' ss Seq
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3' ss Score
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000196912:ENST00000359901:43
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

3' UTR

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.000 A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):

C1:
NO
A:
NA
C2:
NA


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:
NA


Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Autistic and control brains