HsaINT1011361 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000174844 | DNAH12
Description
dynein axonemal heavy chain 12 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2943]
Coordinates
chr3:57510790-57523609:-
Coord C1 exon
chr3:57523583-57523609
Coord A exon
chr3:57510980-57523582
Coord C2 exon
chr3:57510790-57510979
Length
12603 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GGAGTGAGT
5' ss Score
6.05
3' ss Seq
ATTTTTTCTTATGTTCTCAGTTC
3' ss Score
8.55
Exon sequences
Seq C1 exon
ATGACCAGTGAAATGAAAAAAAAAGGA
Seq A exon
GTGAGTTCAAGTTTTTATATTTCTTGTTTGAAAATGTTCAAAGAAATTATTGCAAAGTAGTTTCATCTAAGACCACCTGCTAAGTCCCATTCTAGAAAATAAATAAATTTAGAAACTGAGGTTTTTATTTTCTCTTCCCAAGGGAGCAAACATGTCATGAACAACAATATGGCAATATAGATTTTTTTGTTTTTTTGTTTTAAACAAGGTCTTGCTCTGTCACCAAGGCTGGAGGGCAGTGGTGCGATCTCGGGTCACTGCAGCCCCACCACTCAGGCTCAAGCAGTCCTCCCACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTGCAATCACATGCCACCATGCTTGGATAATTTTTAAAATTATTTGTAGAAATGAGATCTCACTATATTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGACTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTATCAAATTGCTAGAAATACAGGTTTGAGCCACTGTGCCCGGCCAATATGGGTTTTAAGAATTACATTTTTGTTGGCATTCACTATTTGCAGATTAATTACGTAAATATTTTCATTCTTATTCCAAACAACTGAAAAAAAACTCAAAGTGGCAGTTATAAAGGAACTCCATCTCTCTTTTTCATTAGGGTAATAATTGAGTATTCTAATATTGATATAATGATATAGTAGCCACTCAGCAAATATGTATTTAGAATCTGTTATGTGCTTGCCAAATGCTAGGTGCTAGAGATTAAAAAAAAAAAAGACACTGACTGCATGAGTGGCAACAGGGGACTTATGATATGATTGGTGGAAAGACAAAAACATCTAAAATTTCTTTACTAGCAAAGGATAACAGAAACGTATGGAACTGGAGACGTGAAAGAGGAAATCATGCAGCATGTTTTCAGATGGGGTATAAGCTTCTCAAGTCCCTTAAAATTCACTTTGGGGGATAGAGGCTGAAGATGTGAATTCAACCTCTATGAATTCAGGATATTTGGAAGAAACTCTTTTTAGCTTTTCCTTGTTTTGGTTTTGGTTTTTAAAATGCTCTTCTTCCTCCTTACCTGGCCACCCGTTTCTGGAGAATTTGGATGTGGATCTTTCTTTTTACTAGGTATAATTACTGATACACAACATTCCCAAAACATTAATAAATATTTAATGTACAAATTGCCAAATGTATTTAATATTTGCGTGTATGTGTTTAGTATCCTCATTGTTCCTAGCCAGGCATACAGTCATTCACTCCTGAGCCCACTGCTCTTGGCAATATGGCTTCTAGGAATTCCATCACTTCATCATGAATGTCATCAATAACTACTAACTGCCAAATTCAAAGGATATTTTTTCTTTTATTTATTTATTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGTGATCCTGGCTCACTGCAAACTCCATCTCCCAAGTTCTAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGACATGTGCCACCACACCCACCTAAATTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGCCTCGAGCTCCTGACCTCAGGTAATAAACCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGATGGGATTACAGGTGTGAGACATCTCGCCTGGCCAAAAGATATTTTTTCTATACTTCTCTCTCTTGGACCTCCACCTGTCTCTTTTTTGAGACACAGTCTCCCTCTTGTCAGCTAGGCTGGCGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCTACCTCTGTCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAAGATTACAGGCGCCTGCCACCATGCCGAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGGAGCCACCGCACCCAGCCTCTACCTGTCTTTTTTAAAAAACTTTGATTAGTGGAACAGAATAGATGACCTAGAAATAGACGCACACAAGTATAGCCAGCTGATTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTAGAGACAGGGGTCTCTCTTTGCTGCCCAGACTGGTCTTGAGCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACTACAAGAGCATGCCACCATCCCCCTGATTTTTGACTAAGTTGCGAAAATCATTCAGTGGAGGAAGAATAGTCTTTTCAATGAATGGCGGAAAGCAATTGGATATCCATAAAATAAAAAAAACCTCAGCCTAAAGCTCCCACCTTGTACAAAAATTAACTAAAAATTGATCATAGGTGTAAATGTAAAACATAAAACTATAAAAAAATTTAGAAAAAGGCATAGGATAAACATAAACTATAAAACTTTTAGAAAAATCTAGCCTAGGCAAAGAGTTCTTAGGTATGTCCTCGAAAGCACAATCCAGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCCAGATCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCAGAAAATTTTTTAAAACTCAGTAAATTAGACTTCATCAAAATTAAAAGCTATTGCTCAGTGAAAGACCCTGTTAAGAGGATGAAAAAACAAGCTACACACTGGGAGAAAATATTCACGAATTGGCTATCCAACAAAGGACTTGTATCTAGAATATATAAATAACTCTTTAAACTCAGCAGTATGAAAGCAAAAAATCTGATTAGAAAATGGGTAAAAACGGGCCGGGTGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGGGGTGGGCGGATCATGAGCTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTCAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATGGTGCCACTTCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAATAATAATAATAAATAAAATAATAAAATAAAAATAAAAAGGAAAAGAAAATGGGTAAAAACGGTCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGTTCGAGACTAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCGTCGCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGAGTGTGGTGGCACACACCTGTAATCTCAGCTACTAGGGGTGCTGAGGCAGGAGATCGCTTGAACTCCGGAGGCAGACGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGTCTGGGCGACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAGAAAGGAAAAGAAAATAGGTAGAAGAAAGATAAGGTAACGCTGTAGCCACAGAGCCGCCACAGCCTCCGGCTTTCCCCAACCCAACGTCGGCCATCGGCTCCGCGGCGCTACCATGGCCGACGTGGAAGACGGCGAGGAACCCTACGCCCTGACCTCTCACTCCAGGAGCGCAGGCTCCAAGTCGGGAGGCGACAAGATGTTCTAGCTCAAGAAGTGGAACGTGGTGGCCATGTGGAGCTGGGCCGTGGAGTGAGATATGTGCGCCATCTGCAGAGTCCAGGTGATGGATGCCTGTCTCAGATGTCAAGCTGAAAACAAACAAGAGGACTGTGTTGTGGTCTTGGGAGAATGTAATCATTCCTTCCGCAACTGCTGCATGTCCCTGTGGGTGAAACAGAACAATCGCTGCCCTCTCTGCCAGCAGGACTGGGTGGCCCAAAGAATCGGCAAATGAGAGCGGTTAGAAGGCTTCTTAGTGCAGTTGTTCAGAGCCTTGGTGGATCTTGTTATCAAGTGCCCTTCAAAGGCTAGAACACTCCAGGGGATTACTTCTTCAAATAGGAGTCGATGGATCTGTGGTCCTTTGGGACACATCAAAGGCTTGGTTTAGCATTTTGTCAGTTTTATTTTCAGAAATTCTCTACAATTAAGAAGATAATTTATTAAAGATGATCCTTTCTACCTCTGTGGTATGTGTCGCACACATAGCTTAGGAGTGCTATAAAAAAGGAGAGAACTCCAAACTGAATCACCTTTATAATTTACCCATTTCTATACAACAGGCTGTGGAATCAGTTTCATTCAGAGGAGAACTTTTTGCATGCTTACGGTTGATCAGTTAAAAAAGAATGTTATGGTAACAAATAAAGTGCAGTTTAAACCCCCTCCTCCCAAAAAGAAAGATATGAACAGACATTTTACCATAGAGGATACACGGATGGCAAATAAGCACGCGAAAGATGTTCAACATCATTAGCCGTTATGGTAATACAAATTAAAACCTTGATTCGTTTTCACTACATACCTATTAGGATGGCTGAAATAAAAATCAGTGACAATTTCAGCTGACTTTTGACACCACTGACCATTTATTTCCTTTCTAACATTCCTTTATGTTTATTCATCTGGTTCTCTATTATTTCTCTGTCATCTCCACAGGTTCCTCTTTCTTGACTGGCTGTAGCCACTCTTCTCTTTCCTTGAATCTCCATGGATGATTCTCTCCTTTTCTGATTTCAGCTACCTTTCATATATTGATGACTCCCAGAGACTTTTTTGCACAAATACCTCAGAATCAACGTGTCAAAAAAATGAGACCACAAGCTTCCTCCATAAGACTCCTCTTGCACATTTTCTATTCTAGTTGTTATCACCATCAATCCGGTTACTCATGCTTAAAATATCTGAATCTGAACTTCTTGTTCCCCTTCCCCAACTACCTCCCTCCCATATGCTTAGTTCCCAAGAGCTCTATATAGTTCTCAAAACAGTCATTTTCTTGTCCTAGCCTTAGATCAGAGCTTCATCTCTTATCTTGACC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TTGTGATAAAATACACATAACATAAAACCATCTTAACCATTTTTAAGGGTACAGTTTAGTAGTATTTTTTTTATTATAAGTTTTTAAATTTTACTTTATGTTCCGGGATACATGTGCAGAACGTGCAGGTTTGTTACATAGGTATACGTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTATTGACCCACTCTCTAGGATCCCTCTCCTTGCCCTCCATCCCCCAGTGGGCTTTGTTTTGTGTTACTCCCTTCCCTGTGTCCATGTGTTCTCATTGTTCACCTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCCATTTCTATGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCCAGCTTCATCTATGTCCCTGCAAAGGACATGATCTCATTCCTTTTTATGCCTGTGTAGTATTCCATGGTGTATATGTACCACATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGAAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAATCTCCGCTTCCTGGATTCAAGCAATTCTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGTGCCTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATCTTGACCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCATGTACCACATTTTATTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTATAAGTAGTGCTGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATAATTTATATTTCTTTGGGTGTATTCCCAGTAATGGGATTGCTGGGTCAAAAGGTATTTCTGGTTCTAGATACTTGAAGAATCGCCATACTGTCTTCCACAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCACCAACAGCGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACAGCCTCGCCAGCATCTACTGTTTCAAAAATATGGAATGCTTCACGAATTTGTGTCCATCCTTGCACAGGGGCCATGCTGATCTTCTCTGTATCATTCCAATTTTAGTATATGTGCTGCCAAAGCAAGCACTGTTTAGTAGTATTTTCACATTCTTGTGCAGCGAATCTCCAGAACATTTTCATCTTCAAAACTGAAACTCTATACTTATTAAATAACAACTCCTCATTTCCTCTTCCCTGTAGCCCCTGGCAACTACTATTTTGTTTTCTGTTTCTATAAATTTAACTGCTCTATTTACTTTATATAAGTGGAATAATGCAATACTTGTTTTCTTGTGATTGGCTTATTTCACTTAGCATAATGTCCTTAAGGTTCACCCATCCCCTAAATTTTAAAGCATTCTTTACACTTTGTCTGAGATGTATGTTGCAAATATTTTCTGCCAGATTGTCAATTGTCTTTTGACATTTTAAATTGTTTTTGTTATGCAAACATTTATGTTTTTATGTAGTAAAAATTAATCTATTACTTGTTTCCTTTTTTGTATCTAGTATTTGAATCATAGCTAGGAAGGTTTTTCCTATACTCAAGTTATAAAAGACTTCATCTATGTTTTTCTTCCTGATCCTTGTATAGTTTCATTGTTTAAGTTAAATCCTGGAGTTTGTTCTTATGTATGGTGGAAGGTATGAATTATTTTATCTTTTTCCAAATGGCTAACCAGTTGTTCCAGAAATAGTTATTAAAACCTTCATATTTTTCCCAGTGATTTGAGATGCCATGTTTATCATATGCTAAATTTTCTGATATACTGGTGTATTTTTGGACTTTCTGTTGTTTTCTACTGGTCTGTCTATCCATACACCTGTGCTACACCAGGCTTTCTGGTATGTTCTAATGTCTCCTAGGGCTAGCCCTCCATTGCAGATTTTCTTTCTCAGGGTTTTCTTGGCTATTCTTGCATGTTTATTTTTCCACATGAACTTTAGGATCAACTTATCTAATTCCATAAAAATGTATGTAGATAATTTTATTGGTATTGTGTTAAATCAATTTTGGGAAAAGTGAAATTTTCATGATGTTAAAATGTCTTTACTAAGATCAAGTGTCTTTTCATTCATTCGTGTCTATTTTTAGTGAGACTATTCATTCTTATGGGAGAATTTATGAAATTATATTATACTACTATTGTACTGGAATATAATCTCAAGAGAGCATGGGCTTTGTCTGTTTTGTTCAGCTACTATATACCCAGCATTTAGAACAATGTCTGAATATTTGTTGAATCGGTGGATATATTATAATAATAAGTTAGATAATAAGGAATAATAAGTTAGGTAAAGAATCTTCATTTTGCCTTGAGAAAATGAAAACCATACTAAGAATATTAATTTGGCAAGAATTCATCATAAATAAAGAAAAAGATAAAATGGTTTCTTTGTGGGATGTACTTTTGGATTAAATGGTTTTTATTCTGAAAATGTTATTTTTCAGAATATTTTTAATCTGAAAAAATGTTGTCTTAGGAAGGGAGAGTTCAGGAGTTACACTGAAATGATACAACCATGCAGAACATTTAATTTTTTCTTATGTTCTCAG
Seq C2 exon
TTCAACTATATTTATATGAAGCAATGTGTAGAAAGTAGTCCTTTAGTACCTATTCAGCAGGAATGGCTGGATCACATGTTAAGGCTGATACCTGAGTCTTTAAAGGAAGGGAAAGAAAGAGAAGAACTTCTTGAAAGTCTCATAAATGAGGTGTCAAGTGACTTTGAAAACAGCATGAAGAGATATTTGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000174844:ENST00000613504:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.333 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains