RnoINT0008297 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000053999 | AABR07071851.2
Description
NA
Coordinates
chr1:21405802-21434888:-
Coord C1 exon
chr1:21434771-21434888
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr1:21405802-21405974
Length
28796 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGA
5' ss Score
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3' ss Seq
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Human
(hg19)
No conservation detected
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]