Special

DmeINT0034436 @ dm6

Intron Retention

Gene
FBgn0015519 | nAChRalpha3
Description
The gene nicotinic Acetylcholine Receptor alpha3 is referred to in FlyBase by the symbol Dmel AChRalpha3 (CG2302, FBgn0015519). It is a protein_coding_gene from Dmel. It has 3 annotated transcripts and 3 polypeptides (1 unique). Gene sequence location is X:8276200..8367169. Its molecular function is described by: acetylcholine-gated cation-selective channel activity; neurotransmitter receptor activity; acetylcholine receptor activity. It is involved in the biological process described with 6 unique terms, many of which group under: transport; localization; biological regulation; signaling; system process. 25 alleles are reported. No phenotypic data is available. The phenotypic classes of alleles include: sleep defective; viable. Summary of modENCODE Temporal Expression Profile: Temporal profile ranges from a peak of low expression to a trough of extremely low expression. Peak expression observed within 18-24 hour embryonic stages, during early larval stages, during late pupal stages, in adult male stages.
Coordinates
chrX:8329349-8365746:-
Coord C1 exon
chrX:8365490-8365746
Coord A exon
chrX:8330142-8365489
Coord C2 exon
chrX:8329349-8330141
Length
35348 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGA
5' ss Score
10.57
3' ss Seq
AATGTGTCCTTTCCTTCCAGGAC
3' ss Score
12.27
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTGAAACTTCAAAACAAATATTGGAAAATTCCGAATAAAAAAAGGTGTGCCAGTTAGCCGAAGGAACCGAATGCAGATTGAAAGCTAAAGTTCGAGGAAGCCAACAGGAACCAAAACAAGGAAGCGAGCCCCTGTCCGTGCGAAGGACCTCCTGGGTCTGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGGGTGCGGCGACACCACTACCACTACCGCTATCACTACCACTATAGCAGCATCGGGCGAAATACTTTTTGTGCCAAG
Seq A exon
GTAAGATTAGCATTAGGATCAAAGTTAATGTCTTGTTTCTTGGGCTAGGCAAATATGCGCCTTTTGCAACGAGGCAGCCAAATGTGGGCTAAGCCACGTTGCAAAGAGTTGAAAAAGGGGATAAAAACATATGTGTAGATTTCTAAATATGCATACTATAAATATTTAAGATCGGGATAGGTCAGTTCAACTATTCAGTGCCATTATTACATTATTTTCTATCGATTATTGATCCCAGAGAATCAATTAAACAATTTTTTTTTTTTTTTTACTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAAAAATTAAACAATGCATTTAGAGTACAAGTGTAGTGTTTGTAATCATCAACTACCTTTCTTTTGAACACGTATCATTTCAATTCAATCCTCATACAAAACAACTAAAATGAATATTTTCTTCGAAAACAATGACCACGCCCAGGCTTTTCAATTGAATTAGCCCACACGTAGCGTTTATTCCTATTTTATGGGAAAACTTTTAAGAATTGCCCCTGTGCGTATGCAATAGAAAATATTTAAAATGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGCGTGTGCGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGTTTGTGCGAGGCAAAATAAGTGTCGGTGTGTGCGTGTTTACGCGCTTGTGTGTGACATGAATGGCTCCAGTGGGAGTGGAAATGCCATTGTTGCTGTTGTTATTGCTACACTAACAAAAATTAGCTGCTCTTCAAAGCGAATTCGTTTTCAAGTTAATGGTTAATAATATTCGAACAGTATAAATTAAAGAATAGTGTTGAATCGCAATGAGCTATGGTTCTACCCTTTGTTGTTATTTTCATGATAAATACATTTTGAAATATCTAAACAATCGTTTACCCTGCATTCCTGCTGCTGTTGTGGCCAAAACAGCGAATGCGCCTATATTTATTCATTTCAGCCAGTTTGTTGCTATTGTTCGCCATTCGGCGTTCTACATCCGCCACTCTTCGCCATGAAATCTCTGAAATATCTGAATTCTCCATTCTACATTTGCCACTCCGACCATCTTCAATCTACATTCGGGGCTTTTAATTAAATGCAACAACAATAACAACGATGGCAATGCCAAACGGAATCAAACAAAAGCCATTCGCACACTAAAACATGGTGTCGTGGGAAAAGCGAGGGAAAATCGGGTTAAATGCGGGGGAAAATGTCGAGCGAAAATGCGGATGATTGGCAGTGGGTGGAGAGGGGGGATGGTAAAAGTCAAGGGCCAAACGAAAGCTCCCGAACTGTGACCAACTAACAACAAATAGCGATTTGTGCATGGAAATTAAACGAACTGATTAAATGTTGAATTAGTGCCCGAATGCCAAAATCCAGCGCCACTTTTCGCACCCTTCATTTGACATGAAAACGAAAACGAAATTGATGTTTATTATTCGTTTGGTAAGATGGAAAAGCCGAGCGAAAAGTAATTAAGCCAAGTTTACTTAAGTGAGTGAAGTGTTCTTTCGCAGCTCTTTGCCTTTGTGGGTTTTTTTTTTGGTTAGCAGTGAATGAAGGCGCAACGATTTTATCTCTTTAAATAATAATAATCATAAGTTAACAAGTCATACCAAAATACTTGCTACTACGCATTAATGCGTTAAAATAAGAATCATATTTTATATAGACTCAATTTTATTGAGCATTGCTTACGATTGCCTAGCACTAAATGAGCCGGACTTTGTTTTATTGAATACATTCCGGTGTTCTAATCAACTGAGATGCATTGCGATCTATGTATTTTCAATGCTGGTCCAACTGCATTAGCCAGTTGACTTTTGTGCTATGGCCATTCCTTTTCCATATCGAGGGCAATCGTGGCGCTACAGGACTACAGAAATGCAGAAATACAGATATGCAGAAATTGGCTAATACAGTGTCGGCCAGCAGATGACCCACTTGGGGCTGTGCTCTTCTGGCGTTGACTGTTTTGCATTTAAATCGTTTTAATTGTTGCCGAAAAACAAGCGAATGTGTGTCGGTGTCTGTGTTTCTCTGTGCAGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAATGAGTGAATGAATGAATGAATGAACTTAGCATTTAGAATGTGGCTCTCGTTTCGCCATTGTTATGGTTTTCGGTCCGAGTTTCAGCACAATGGGGCGTATGAGCAACGTGGATGGGGGTGGATTCGATGGCCACGTTGCTCATACGCCCCATTGTGTCAGGCGAATAAAATGTTAACATGGAAAAAATCGTTGTGGCCCCGGCCAAATGAAGAGATTATTGAAATGGCCAAGAGCAGGACCCTTCCTGACAACTCGCTGAAAATTTTGTGCTCAAAACAAAGCCCAAGGGTGGCCTAGAAATGCCAAAAGGCCAGGCTATCAAACGTAGGCAAAAAACACTGGCGCAAAAATTAGCAAAATAGTAATCAATGCAATCAATGGCAATTACATTTTTGCTTAATTAAATATATAACATCCAGTAAGTGCAGACATTTTCACTTGCACACACATTTGGTATTTAAGCTGATTTAATCAGAGAGAATTCCTCACTTAACTTAATTAATTAATTTAATCAAAAAGCCAGTCGTTTACATTCTACATTTGTCACAAACAAAATACAATAACATTATTAATCTACTTTCATTTATACTATGTATGCAATCTGCAATCCGCTGTGCTTTCCTCTTTGAATTGAAAGACAATTGACATCGCATTTTCGCTCAGTGTGGCGACCTGGGCGAGTGGTCTAATGTCCTTCTTCTTCTTGTTCTTCTTCGGCCCGCTCCTTGTGCTATCTCCATCTCACCGCTATCCTTGTCGTCCTTGTCGTTTGCCTCGTTGCTTTTTATGGCCCATGTCAAACATTGCAAATCAGTTTAAACTAACAAGCGCCACTTGGATCTGGATCCGGATCCGGGGATCTGGCTGTGGGCGTGGCCCTGTTTTGTCTGCATTGCAGCTGGCGCCTTTCGAAGCGCAAAAAGGATTAAAAAAGAAACAAGCGAACGAACGAACGAACAAACGAACGGGAAATATACACAGGACGACAACTTTAAATTGTAGACAAATTTTTTAAGTGCCTCAGTCCTTTTATTTTTTATATTTTGTATTGCTCCCCTTTGTGCGGCGGTCAATTTAAGGATCTGAATTATTGAGCGCGAAACTGAAACTTACACACACACACACACACACAAAAGCACATCACGAATACAGGTGCACCGGTTTTCCTCGCTCACACACACAATTAACCAATTAGCACTTTTTCGCTTGTTTCTTGCTTCCTGGCGCCGGCCATTTTATGATTTTTTATTACCGCTTTATTGTTGTTTGTTGTAAACAAAAATTTTTGTTTGCTCATAAAAAAAAACAATTTTTAATTGCTGCCGCACAAAACAATGCAAAAAACAGCAACAACAGCAACAAAAAAAAAAAAAAAATAGAAATAAAACGTGGCAAAAGTAAAAGGAGCGAAGTGAAAAATGTGTGAAAACTGTGAAAAACTGTGCGATGGCAAAACAAAGAGTGGCTGGCTAATAAAAATAAATATGAATGCCTAGAAGGAGAGATAAGGAGTGAGGGGCAGGAGGCCTATTTGTGGCGCCAATTAGCTTACAGCGAGGGTCCATTCAGCAGTTTTCCGATTAGATTCTAAATAACTTTTCCCAGGAACTTTAATAGCTGTCTTTATATTTGTATTTGATGAGCTAATATTTGTTTACTTTTCGCATATCTGTGCTATTAGTTTATATTGTACCATTTAAATATTATATATTTTTTAATTTATCTCTTACTTGAAACTTTTCCATCGACCCTGGCAGCTGTGCCCTTGTCCTTCTTCCGTTCGTCCTGCTTTTCCCACTCCTCCTGCTTCTTCCTGCTCAAATTTCGCACTTTCCGTGCGGTTTTCAATGTGTTTTCCTCATTTTACTCTCCTGCTGGTTGGGGGAAGAATTTTCCCCACCATTCCCTTCTCTTTCATTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTGGCCTACCACAGTCAACGCACAAAATGCGTAAAATAAAAAATTATAATAAATATATATAAATTCATTTTTTTGTTACTTCCTGCCTGGCTGCTGGCACCCATCCCAACCCCTCCCCCTCCCCACTCATTCGCTAGCATTTTCACTTCCCTTTTGCTGCTTCGTTGGCCGTTTTTCCTGATTCGCGTAAACTTTTTAATAGCACTGAAAATTCCTCGAAAAAAGCCGCAGGAAGCATTTTGAGATTTGCGATGATGACGATGGTTCCCTTAGTCTTTGTATGTGTGTGAGTGGCTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGGACGTGCGTGTGTATTTTCTTCATTTTTTAAGGGGAAAATTTTAAATAATAAGCTTGGCGCATTTTCCACTTGCGTAAGTTGCTTCTTTTTGCAAAAACGCAAAAAAAAAAAGTCGAGAAGAACCCATTGAAAAAGCTAATTTAACTCAACGGATTAAGTATTTTTATGGTACAGAGATTTTACATGATGAAAATTCGAAAATATCGGAGTAAGGCCCAAATGTTATTTCCTTATTGCGAAAATCCCCGTTTGAAAATTACAACAATTTTTATGTCTTAGTAAAAGCAATCAGAATTTCGTTGCTGGTTGCGCTTGAACTATTTGCAATGTATTTGATTTTAAATTAAATATATAAAACTGTTCAAATATTTGAAC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ATAATCTCGAACAAGATAATCAATTCTCCGGCTCGTAATTTGTCACTCGAACTCGAGCAGGCCGCAGTCGGGAAAGCCTGCTGGCAGCGCTTTAAACAGCTTATAAATACAAAAGAAATGAAACATGGTCTCGGCACACAGTGCGTATGAGCAATAAATCTCTTTGGCGAGTGCCAAAAGGAAAAATCCAAAATAAGTAGGCAGCGGCAGCAGTGGCAAAGACAAAGGGCGAAATGCGAGATGCGAAATGGGAAATGGGAAATGGGAAATGGAAAATGGAGGTAGAAAGCACAAATCACAGACGGCAGCTGTGACAGAAATCAACTGCCAAGGCGAAGGCGAACTTGAGCGCGGTTGGGTGGGCGAAAATTGGGGCCTGGGGAAAAGCCCAGTGTTTTCCCGTTCCTTTTAGAAACGCAAAAACCAAACAGAAATAGGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACCAGCAAGGGCACGCTGCAGGTTGACGACTGTCACCTGCGAGTGTAAGTGTGCGAATTGCAGGCCACCGAAATGCAAAACCAGCGACAAGGACATTCGAGTGGGTGGGAAAACCCAAGGCGAGCGAGCACAGGACACCCAGCCATAAGTAGACAATGAGTTAAAAGCGAAAATCTAGCATCGGTCGGTGGCTGCGGGAACGGGGACGCCATGGCGGCGGTGGTGGTGGCGTCGGGGTTACCAGATCCTAACCCGCAGATATATATGCGCACATATATCCTGGCCACAAACAACGGCAAAAAAAAAGAAGGCAAAACGGAGCGCAAAAAAGTAGGCAACATTAAAGATGCCAACGCAAGGACAAAGCTCAGCTGGTGGGCGTTTAGTAAGGGAATGGGGGCGTGGTTTGAGGAAAGTGGCCATAAAAAAAAAGGGCCCCAGAAATGTGTGCGGCTGAGAGCGATTGAAATGGCTGAAATGCGACTGCAAATCGTACATATACACCGTAAAAACATTAAGAAAATATCCATTGAAAAGAACATTAAATGGATAAAATTAAAATAAGCAGTGTAAAAATATAGTTAAAAACATTTATAAAAAGATTAAACGTTATTGTTCAAATTATTTCAACCCAAAATAGTTAAAGATTAACCAAAAAATCGTAAAGCATGTTTGTGATATTTCAGTTATATACATGATATTTTCTAGTGTAATTAACTTTCGCAATCAGCCATTTCCTCCAGTGTTGTCAATTCATAAATATGCTTGGCAATTGATCAAATGCAGCGACTGTTTATGTGGGCATGTGTGACCAGACTATGTGTACATATATCGTTGGATATCGGGGCAAACCAGTATATAGTTTGATGCCACTGCCGGCGGGCCAATAATGCCGCTCAATTTGAAATGTTGATGCCCGATGATTATGTTGATGACGCAGCATCATTTGGAGCAGAGCAGCCAGAGAGAAAGGGAGAGAGAATGAAATAGATTTCTGGCGGGGATCTCAGTCAGTTCAGTGGCAGCAGCAGCAGTATTTGAGTGCCAGTGGGTGAAAGTTGCGAGAGAGATAGGGAGAGATAGAGAGTGGGAGAAAGCGGGGCGAATCAACTAGAAATGCAAGGCACATTGTTAACCCCACTTCATTGAAAATGCTAATCGCACTCATTACACGAAATATGCATGTAATAATAGCAAAATCAGCAACAAGCAGACAACGAGCGATGCGACAGAGATGGCGATACTGAAAAGAAAGAAACGGCGACGAGAGCTAGTCAAACGAAAGAGATAGACAAGCAGCTGCTGCTGCTGCTGAGCATGCGAATGAGTAGCCCAGATGATAATGATGATGTTTCTGTTGATGGGAATAAAATTGTTGCCTTAGCCTTTGTTATTCCACTCCAGACTTTTGACATATACCATATTATAAAAGCCAGAAATATTAAGAAATTATAGTGTTGCGGGGAACTAAGTGGATATGACACAAAATTGTCCAAATGTCATTTTAATTGGAAGAGAAGTACGCACATTTAATTCAAGGATTTTCAAAGTTTAATACTACAAAGTTTATCACAAACAGGGATATATGGAAATATTTTATTGTAGTTTTGCAGTTCTTGTAAAGTACAAAGTACAAACAAATTCGAATTATAATTGTGAAAAGTAACATTCAAGTTGGCTTTACAAATTATTTATAAACTATATAATAACTTGCACATTAAATTTTACTGATTTATGCGTATGGCTTCATTCCAGACCTTGGCCATAACTTAGTCAACTAACTTAGTCAGACTGTATAATATAGTTATTACGCCCTTTTATCCTCGGTCGCGGCTTCGCATGATTAGGGGTTAAGGGTCAGGGGTCAGGGGCTCCAGCTCACCCCTCATTTCCCATCTCACCCCAACTCATTTCAACTCAACTCATTTCATTTTTTTTCGCAGACTTGACATGCCGCTAGCGCCGCCTAATGAGCGCCCATAATGAGCGACAAATGTGGTGGGGGTGGTTCAGTTTTTCTTTTTTGGGGGAGGGGGTAAGTGGGTGGTGGTGCGAAGTGGGTGGCTTGACTTCTGGGGGGGCAAAGGCCGTGGCAGTGGCAACTATCGCGTGATGACGGGGCAAATTGGGCGGGCAGACAAACGGATGTTGACGGCGAAAAATCGAATTTCTCTCGCGCTTTTTGACTTAAGTTCCATCATTTACCCTCGCTGCGGGGTATTCTAAATTTAATCACCTTTTTGCTTCTAATATTTAAATTATTTAAGCTGATTTTCAGAAGGAAAACGGACACTATTTAGTGTTTAAAGCCAATATAAAGTTTTTTAAATAAAAGTAAATAATTGTGCTTATATTAGAACACTTTCAAAGTGAATTAAAGATACTTAAAGCATAGAGAAATGTAAAAAAAAAACGCAAACAATTTTGTTACCGAATTTAAGCCATTTTGCTGTAGGTAAATATAATTATTTTTAAGTCCATCCAATGTACAGATTCGATGTATAATAATGCACTCCTTTGGCTTTTGTCGTCCTGTCGTTTCGCTCGTATATATACATCTTTTTTTTTTTTGTTTTTTGTACATTTCGCCATGCATTTAATATGAAAGGACAACAGGCGAGGACAGGCAGGTCCTGGCAGGACGAAAAGGACGCAAAGGACGACGTCGGCTTTGCCTTGCCCTGTCAAACCATCAAGGCGCTGGCAAGGACAATGGGGAAAGTCTTAAACGCTGTCAACGTTGGCTTTTTCAAGCTTCAAGTGGCAGGACGGGCCGAGACTGCGAGTGCGAATGCGATGGCATGATGCCCATGGCACATTTTTTTTTTTTTTTGGGTAGCCCCCCCCCGAAAAGTCGCCGTCTCTTTCAGTCGTGCGGCTGTTTAAATTGACACTTGGCATCTTTTGTTGCATCAAAAACGTGTCGTCCTCGAGCCATCCTTGCATCGCATCGCATCGCATCGCTTTATCCTGCCATGTCCTGCCATCTGCCATTCGCCACCTGCCGCTGCAGGCGACCCTTAACCCTCTAATTGAGATTCATTCGATTTATCACTACGAATTAATAAAGAAATTTCGACAAAGATTTCCTACGAATTTATTGTAGAATACATATATATATGTTTATTAACTTTTAATGGTAATCTATGTCTAAGAAAATTCTAAAAATATTTTTGAAAGCTATGTAAGGAAAATGCCAAACGTCTTTGAATGGATCATTAAAAATGCATAGCGCTCGCTTAAGCTGCGAAAATGTTTGGAATTATGCGTAATTTTCTGCAAAATTACAGATATGTCACTTGGGCATTAAGAGGGTTAAATATTTGACAGCATGAGGTGAGCACTCTTCATGGCAAAGTGGGCGGTGGGCGGTGGGCGGTGGGCGTTGAAAATGGGGGGTGGTAAGGTCATGCACACTCTTATGACATTTTCTTAAATTACTTCCGAAAACCTTTTCACGCCCTCGCTGAATTGCTCATTCATGCCACTCCCACACTTGGCACCATATTTTCCCACGCCCCCATTCACATTTTCCCACGCCCCCATTCACAAAATGTACCCCTCAACGTCTCCCACCTTTGGGTGAAAAAGCCAAGCCCACCCCACCGCCGTATACCCTTCATTTTACTCAAGTGGCGACTTAAAGTCGCCCTAATTGAATTGCGCAATAATGTAGCAACTTTTCAGGGGCACTGAATTGCTGCTATTTCTTTTTAATTCGCCATAACTTTGGAGTACATTTTGCCCTGAATAAAATTAGGAAAATGCGCTTGCCAGCACAATTTCAACGTGTAATTTTCGTAGCCAATATCCTAAATGGAGAATAATGTCAAATAATTTTGCTTCACATTGCAAGCCTTCAATGTCATGTCATGTTTACTTATTCTAAGCACCGCATGACAACTTGGCTTCTTGCAGATAAATCAAGTTCAAAGGTGACAGCCGGATGTTTCAAGGACAAGAACGTATCGATTTTCCTCGGCCATAATTGTGATTAAAATTTACATAATGAGTTCGGGCAAGATTCGTCTTAAATGTATATAAAACGCTCATCATGCTTAGTGATTTCATTAAAATATTAGTTATGCTTTCGGATTTAAACAGTCACAGTTTAGCAATCACTCAGCCGCTCAAAGGACTTTCGAGATTATCCCAAGACAATGGAAAACGGGAAAAAGGGACAAGTCTCGCTCGTCAAGTCTCTTCCAGAGTTATTAATTAAATTAACAGACCCAACGGCGCCCCATTGCCAGGAACAAAAACTTTGGTATACCTTTGGTAACGGGCGTAAATGAATTACGCAAAATTAGCAATTAAAATTCACAAATTGTTTGCGGCCCAAGACTCAAAAACAAAAACAAGAAGAAAAACAAAAAAAAAAAAAAACGAATTGCCCTATTCTAAAATATACATATCTACATTTCAAACAATCCAATTTGGGTCAGCGGTCTGAGCAGAAAATTATAATTAAAATCAATTTGCATAAACAGAAAAATAAGAAAAGTCCTGGAAGGGCAAATATATTTCAGATTTTCCGCTCGGC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Seq C2 exon
GACTCGCCCTTTGTCTATCTATACCACTCCCCTTGCACTCTTCGCGGAATAACGTGGAACAAATGAAGGAGGAAGCGCAGGAATGAGGCGATGTGAAGCAAAAGGACAACGAGGACAGCAAGGAACACAACAAAGGCAAAACCGGAAGAAGGCCACCAAATTGAAGAACACACACATTTGAAGAATTTTAATCGAAAACTGCCAAGAAACAAGTATATTTACAAATATATTTATATACCTTGTAAGCCAAAAAAAAAAAACAAAAATAAGAAAAAAACGACCGTACATTAATAGATCTAAAATATATAGATACATATATAGAGAAATATGTTATATTTACTATGAAATCGAGGAGCATGGAAGCGATACCCAGAATAATAATCGATGTAAATAAATGCTGCCAATTCGATTACACTGCGAATTAAGAACTGCAACTGAGATGCATAGAACGCACAACAACAATCCCAGAAATACCAGGAATCCACAATCCATGAAGAGAAAGTTCACTTTTCCCGCGACAGCTGCGCCTGCGCCTTAAAAACTAGACATAAACATATATATATATATATATCGTATCGATCTTGGAACTATTAAATTGAAAGGATTGGAGCCGCCAGAGCCGAGGATTATATATATATATATAGTCATATATATATATATATATATAGAGCGAGAGAGAGAGACGGGGCAGATCCACCACCGCAGCACAGGCAAAAAAAGCGTGCAGAGGGAAATGAGATGAAGTGGTTTCAAGTGACCATAGATATGATTCTTGTGCTTTCATTTATATCAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
FBgn0015519:FBtr0289988:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact





	

	
5' UTR





No structure available

		

			
Features


			

				
Disorder rate (Iupred):
  C1=NA A=NA C2=0.000
 
                        

				
Domain overlap (PFAM):

					





						

							
C1:
NA

							
A:
NA

							
C2:
NO

						

					

				








    
Main Inclusion Isoform:
NA





     
                   









    
Main Skipping Isoform:
NA





     
      









    
Other Inclusion Isoforms:
NA
          









    
Other Skipping Isoforms:
FBpp0288426, FBpp0308714
  



Associated events






Conservation


Human
(hg38)
No conservation detected
Human
(hg19)
No conservation detected
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected




Primers PCR

	

		

			
Suggestions for RT-PCR validation

			

				
F: 
No suggested primer sequences

				
R: 
No suggested primer sequences

				
Band lengths: 

			

		

	





	
Functional annotations
(Submit an annotation)

	


There are 0 annotated functions for this event 


		










GENOMIC CONTEXT[edit]












INCLUSION PATTERN[edit]






SPECIAL DATASETS
  • Neural diversity
  • Neurogenesis
  • Neuronal activity
  • Splicing factor regulation (brain)
  • Splicing factor regulation (SL2)





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