DreINT0098347 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000007198 | mta1
Description
metastasis associated 1 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-131121-353]
Coordinates
chr17:37601521-37623333:+
Coord C1 exon
chr17:37601521-37601614
Coord A exon
chr17:37601615-37623206
Coord C2 exon
chr17:37623207-37623333
Length
21592 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CACGTGAGT
5' ss Score
9.3
3' ss Seq
TTTGACTTTGACTTTTCCAGGAG
3' ss Score
9.22
Exon sequences
Seq C1 exon
ACGGCGAATGGGAACGTGGAGGCCAAAGTGGTGTGTTTCTACCGCCGCAGAGACATTTCCGCAACACTCATCGCCCTCGCTGACAAACATGCAC
Seq A exon
GTGAGTAGCTGTCAGAGACCACTTTGAACACAATGCTTATCGCTGCCAATGACTGAATACCCATTTGAATGTACTTTTGGAACACTTCAAAAATTGGTTTTGACCATAATTTGCTAGGCATATGTTTGTTTGAATGCTAGATTGAGCATGTATTGAATTAAAGCAGATTGAAATGGTAACGGATTGTTTTAAGCATTCAGACAAACATCGTTTTTAGTAAAATGGATATCTGAATTGTCAATATCAACATCAATTCATTGCGTATTTAAGTAACTGTTGATCAGCTGTGGTTATGTTAACACTTATGGTTTCGTAGTCTAAAACAAAAAGAAATACGATACTTTTAGGCTGCATTTACACTGCATGGTTCAACTGACCCAATTCCCTTTTTTATTTCTCCTATGTGGAACACATGGGATATGGCCCATGTATGTGTAAGCTGGAAAACAATTTCCATGGATTCAATTAATTAAAATCAGATTCAGGCCTTGTTAATATGTGGAAATGTATCCAATATGAATCGGATCTGTGCTCTCACGTCTGCAGTGTGAGCAGGTATATCAGATTTTCACCTGATAGAGTCCCAAACCTTAAGTCTTACACGCTCACCGGCCACTTTATTAGGTACACCGGTCCAACTGCTCGTTAACGCACATTTCTAATTAGCCAATCACATGGCAGCAACTTAATGCATTTAAGCATGTAGACATGATCAAGACGGTTGCTGCAGTTCACACTGAGCATCAGAATGGCGTAGAAAGGTGGTTGAAGAGACTTTCAAATGTGGCATGGTTGTTCGTGCCAGATGGACTGGTCTGAGTATTTCAGAAACTTCTGATCTGTTGGGATTTTCACGCACAACCATCTTTAGGGTTTACAGAGAATGGTCTGAGAAAGAAAAAAAATATCCAATTAGTGGCAGTTCTGTGGGCATAAATGCCTTGTTGATGTCAGAGGAGAATGGCCAGACATTTTGCTGATAGTAAGGATAGTAACTCAAATAACCACTCGTTACAACTGAGGTATGCACAACACATCGAATCTTGAACCACACCGAACCACACATCGAACCACACCGCGTGCTACTCTTGACAGCTAAGAACAGGCAACAGGCTACAATTCACACAGGCTCACCAAAATTGGACAATAGAAGATTGAAAGAACATTGCTTGATTTGATGAGTCTCGATTTCTGCTGCAACATTCGGATGGTAAGTTCAGAACTTAGTTTCGACAACATGAAAGCATGGATCCATCCTGCCTTGTATCAACGGTTCAGGCTGCTGGTGGTGTAATGGTGTTGGGGATATTTACTTGGCACACTTTGGGCTCATTAGTACCAATTGAGCATCGTGTCAACACCACAGCCTACCTGAGTACTGTTGCTGATCATGTCCATCCCTTTATGACCACAGTGTACCAATATTCTGATGGCTACTTCCAGCAGGATAACGCACAATGTAATAAAGCGTGAATCATCTCTGACTGGTTTCTTGAACATGACAATGAGTTCACTGTTGTCAAAAGGCCTCCACAGCCACCAGATCCCAATCCAATAGAGCACCTTTGGGAAGTGGTGGAACGTGAAATTCCCATCATGAATGTGCAGCTGACAAATCTGCAGCAACATGATGCTATCATGCCAATATGGACCAAAAATCTCTAAGGAATATTTCTAGTACCTTGTTGAATCTACGCCACAAAGGACTAACGCAGTTCGGAAGTGTCCGGTGAGTGTATACTAGGACAAAAAAAGCTTTTATACTGTCATGTTGCACAAGTATTTAAGGATGCTAATGAGAGAGCACAACATCTGCCATGTAAACAATATGAATTAATATAAATCTATTGCATACAAGAGTAAAATCACGCTATGGACATGACATTAAAATCCCTACTGGTTTAAAAAAAGCCTCACTTAAAATAATATTGACAAAGCATAACCTTTCTGTCATAAACTATAGCTAAACAAGTTGTTAAAAAGAAAATAAAAAAAAAATGAAACCCTAATCTTTTTTTCCCCCTGCTCTTTCGGCCCTTTGCCTTGTGCAGTATAAATGCAGACAATTGGATGCACGTCAGGTTGTCAAAAAAATTAGATACAGTCACGAAATCGGAATTGACCATCAAGATCTGCAGTGTAAATGCAGCCTTAATCTGTAAGTCCTGCATTTTGAGGCAAGCTTTTTCAGCTGTTTTTAATGAGAGCGATATGTATTTTGTAAACATTGATGTTTTTTTTTTCCCCCATCTGTGAAATCAGGTAATTGTAATGTGGATATTTCATCTCAACATTAAAATATTTTGCACAACTACAAAACATGTTTCACTTTTGTCATTTTTAAGACCAAAACTAAACTTTCTAACAGAATCTAATTGGTCTTATTTAGGCCTGTCACAATAATCAACATATGTACTTTTTAGTAGTTTACTTTATTATATTTGACAACTGAAAATAGATCTGGTAGCAGGTATCGCAGACACTTTTTTGCTAACATTTATTATTATTTATTCATTTAGGATATACGTTTTCACATTCTGATTCCTAATTATGCCTAATAATGCCTAATTATTAAATTGTGAAAATCACTGTAATTAAATGAAATTTTCTTAAGAATAAAATGTTATGTGTTCTTTGGAGGAGTGTACATTTGGACATTATATAATGAGTGGTCTTAAAATGACAATAATAGCAATATATTTTGGTGCGACATATCGTACAAGAAAAAATAGATACCATGACAGGCCTAGTCTTCAAACATATATTTTATATCTAAACATACCATAAATACTGTGCACTGTGCAAAATGTGCTTATTGTATGTGCGTGATTTATAAGTTTAGAATCCATTTAGATTGTCAAGAGACAAAACGGTAACAGGAATTCCTCAGGTTCACAAACAAACGAAGATCTGTTGAGTGATGCTTCTCTGACACCTTTACCATCCGAAAAATCACACTTCTGCTTTCTGCTCCCTTTTATGGGCATGTGTTGTCCTGATTATGGTTCGTTTAAATCTCTTTGTAGTTGCGTGAGAATTTTATTTGAACTGTGCACTATCATTTGTTTGAAATTGGACATAGACCCATCTTTTTCAGTGGTTTCAGCAGAGCAATAGTGCAATCGTTTTTAATCAAACCAACCCTGCCATACGTGAACACACTACCCTATATAATTGGTAGAAGTCTGACATGAGAAGTCTGTATATTTTCCATTTTTAGTTCATGCTGACTCTAAACTCATTGTTTTTTATTTACTTTACTTACTTTAATGTACTTTATGCACATGATTCTTTTTATGTAGTGTTGATGTGGCTGTTATGCGAACATAAAATGTCTCTGAAGTTTAAAAAGATTTATATTGTTTGTTATTGAAAGTATAAAGTTTAAAGATCAGTGTGCACAATAAATGGAGGTACTGTTTTTCAAAAGAAGGAAACATTTCTAGACTGCCTGAAACAAGTTGTCAGTAATTGTAGTCTTACGTTCCGCACAAACCTGTGTGTGTTTGTATAATAAACTGTGACAATGTCAGCCTATGGTGTTAACTGGTTTGCTATTGAACACTATGCCTGTAGCTGAGGCCTGGACATTTTAGGTTTGTGTTGTCAACATGTCTAGAGGACACTGTTTTCTTTGGTGCAAAGCAAATCCCACCTGCAAAAATGAGGATGTGGGCTTGAATATATGAAAAAATTACTGCTTTGTTGGTACAAGCACTGGGGAAAGCTATGGTTGTAAAATGTAGACATGAGAATTGGTGTTTCCTTTCCAAACTGTGTTGTAAATAGTGAAACAATCACAGTAGACTTGGACCAATCAAAAATTTGTAAGCTCTGAGGTAGAAGTTTAGAGAGAATCAATTTCTGAGTGAATGAGCCTAGGCATTATACATATCATATGTTTATTAAATATGGCATATTATACATAAATAATTTAGATATATATCTTGTGCAAGAGGTTTGGCTAGAGGACAAATGGTCATGGCCTACTGGGTTCTCTGAAGTTTGTTCCTCACCATTGTCACCCCTGGCTTGCTTGGTTTGCGACTTGCATAGCTGCGCATCAATGGATTTGCTCTACTGTGTTTGGACTTTCAGCAGTGAAAATGAAACCACACTGAACTAAACTGAACTTCAACTCTGAAAACTGGACTCACACAGTTTCTTTTTACTAGAACTTTGAGGTTAAGCTGCTTTGACACCATCTATATTTAAATATTACACATATATAATTGACATATTTTAATAAATAGTTTATTTTGAGGTTAATATAAGGTTCCTATTCATATTGTGGTCACTTCAAAGTGCCGTGAATAAATATTTTTATTTAAACTTTGAGTAAATTTACAAGAATATTTAAATTGTTGTAAATATTTGAAAACTTAATAGGACATTTATTTCAGACAATGTTTCCTTATGTAAACATGACTTCTGTGATTATTTAAAGGGCTTTTGGTTTAACTCTGTGCAGCCAGTAAGTGAATTATTTATTCATTTTTTGGCTTAGTCCCTTTATTAATCAGGGGTCGCCACAGTGGAATGAATAGGCAGTAGGGCTGTGCTATTAATCGAAATTGAATCGCAATCGTGATTTGAAACATTGTGATTAGCTAATTGCAAGAGGCTGTGATATGAAATATATATTATTTAACTTCCCCCGCTCTGAGCAAATGCATGACTGCCGTCTGTGTGACAGTCCTGCTAGCCAATTGAGTGAGCACACTTTCGTTCTGCTCAATCAGAATTGCGCAACTTAACTATGCTGACCGCCAACAATAAAACAAACAGGAAAGCGTGAACGAGTGAGATGATGGCATTTGCTGCTTTAGAAGCATTAAAAGACTAATTGATATTAAACAAAAACAGCACATCAGTAATATGGGAATATCTTGGTTTCAAAGTCACAGACACCAAACAAAACCACCATTTGTAAGAGCTGTCGTATAATTGTTGCCACAGCATGACGAAATACAACAACCAGCACCTAAAAAAGCAAAACAGGCATCTAAATGAGGAGTGCCTTGCAAAAAAGCAGGGGTGTAGAATTAGCGTGGATGGAGGGTTCGCGGAGGGGGACCAACTATTGAAATGTCCCCATCAATAATTTAATTCACTTAATAAAATTGCGCTGTCAATAATAACCTAGACATGCAGAAAAGCTTAAATCTTGTCTCTCCTTGAGTCGCACCGCCTCAAAACACATATGAACACTGTAATTGGCTGAGCCTTTCCCTGCTGTCATGTGAGAGGCTGTAACTGTGTTCAGATGTAGCAGCGCCAAAACAGCGCAGGGGAATTTCCCAGTAAATTTAAATAAAGTTTAATGAAAACTACAAAATCTTTATTTAATCTTGGGTGATCTTAATTTCTTGGTTAAAATTTAAAATACACTTTATAACTATAATATGGCTATTTCTCATGGTTGATTTGAACAGAATAACATTTACCAATGGCACTATATTGTAAAGAGTTACCTACTGTATTTTACTTTATCATCTTTGTGAAGTTGAATTTGTATAAAAATTATTTTGTATTGGTTATACCTGTTAAAGAAATCTTTTTTTTGTGCAGCTTGGTTCAATATCACAATATTACTGTACCTCATGATTAAAGCTTCAGCAAGAAAATGTAATATCGTGATAAGCCTAATGTAAACATTTTGTAGGAGACCAAAAAAAAAAAGGCATAGTAGCTGCACTTATAGCATTTTGATGAATAATTAACTAAAAACAAATCAAATCTACCTACACAAATGCAACCTCCATCACATCAAATGCATTCTTGGCCAAGGGTTTTAAATGTATTAAGCAGCAAATTTTCTTTCAGGAACCTTTGCATTGTGTGTGGATCTGATGTTTCCTAGACAGCTGTCTTTCAAGTTTGTTTGCAGCCCACAATGGCCACCCACAGCCAGCTCACCAGACCTGAAATGTAGAAATTTAGAGACATTCGCCTGGTATCTGTTAACATAACTAGAATGAAGCTAATCTCAAATGATTGTCCACAATATTTTCAAGTAATTCTGTAGAATTAATGTTACATATTCAGCTTTATTTCAAATAGAAGCATGTGTTTGCTTGAAACATTTTCATTCAGCACATTTAAATGTTGCCTTTTTTCATATTTTTTCATGTTTAAATGAGGTAAAACAATAATATTTGGGAAATAATGAAGATGGAGCTTGATTGATCCATAGTTCAGACAGGCTATATAATCTTGATTAATTTTGCTACTTCTAATTAAAGGTGCAGTAGGTGATTGTCTTCAGAAACATTTTTGTTGTGCTGGTTGAAAGTCTCTTCACATTCCAATAGTAATGATTAAAGTAAATATGTGTATATGTGTCCCACACTGCTAAAAACACTATTAGGACACCTATATTTCACTAAAACGTGTAAATTGGTTGTTTTTGCGTTATTTCAAGCAAATTCGTACTTCCGGTTTGAAACAAATTTTTTAAGCTGCATCACGGCTATGACATAATAGCGTTGTTTTCCAGCGTGCAGACTGGGCGTCTGTGCCAGAGTGTGTCTTATTACGTCTTACAGTGTGCTGCATTAATGCATGAGTAAGGCTTGGTTCAAACCAATCAGCGCGCTCTATTGTGCAACTTCATTAATATTCATTACTGTCATAGTGTTTACACAACATAGACGCCACGTTGTGTTGGCAAAACAAGCTTGAAGTGTTGCTTTTATAGTTTGCTGCCATTAAGTTTTGTTTTCATTTTCTCTCTGTGAGAGCGCAGCTGGCGTCACGTGTGAATTAACAGTGTACGCGACGCTCGACAACAATAACTTACGTGTCTAAGGAGGATTATTGTTTACCTGAGAGCTGTTCTCATCTGCAAACGCTGAGATCCGGATTCGCTTGTAGTCTCCTCTAAATAAAGACACAGTTCTAGTTGCTGGTGATTGTCCTGTCTCTACACATTTGGTAAGTGAGCGACCAGTGCTCTTTGTTTATTCAGTTTGTTCGTATCGAACAAACTATTGCACAGAGTGTAAACATGTTAGCACTACAACCAAACTTTAACCTCGTGTAGGATTTTTACCGCATTTTGTGACCGGAATAACACACACGACTTTCTCACGCTACCTGTCGTGTGCATCTAAGTTTCCGGGAAATGCTGAGTTTTTTTTTCTCTCATTTGCTGTGCGGTATCAAACATTGCATGAAAAATACACGCTTACAGCAGTTCCTCGAATCAAATATGTCGTTTGTCGCGAGGGACATGAATGAATTCTCTGAATGAAAGAGCCAAACTGCAGTTAAAGTCCACCATTTAATAATTTGGCAAATAATTCGACTACAGATGTCGATGTAAACACAGTCGCGTGCCCAAATAGACACTCCCACACCGTGCCTCTTTTATTCCTTCGACTCTCCCCCCTAAACAGAGCTGGCTTTTTCCAAAGTAGAGGTGTGAAAACACCCTGCTGAAACGAGGGGGTTTCATGGCCCTTTAAATGTATTCATATGTATTTTTATATTTTGCATAAGGCATAAAACTAAAAAAAATGTTTATCCAATTAAATAGAGTCGGGCCGACATCTCTCATAATTCAGATAAGTAGTCCAATCTGTCTGTCAGCAAATGCAGATTTGAACAACTGAGCAGCCGTTTGTGCTGCGCGTTCACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAGAGAGCACACGCACACACGATCGGTAAAAACCTGCTCAATCAAAATTTTTTAAAAACCTGAATCAATATTGGAGTTACTTTTGCACGCGGGAGAAAGGACGACACAATGGCTGAAGGATTTATCTTAGACAGGTAATGTTCTGTTTTAAAACAGTTTTAGCTTCACGCAAAGCTGATTTAACAATTGATGTTGTTGTTACAAATGGATTATAACTTCACAGAAGTGTTGTTCAGCCACTAAAATCTTTTGATGAAAGAGTAATAAGACTATTTTCAGTTTCATAAGGGACCTTCTACAGCAGGGGTGTCAAACTCAGTTCCTGGAGGGCCGCAGCCCTGCACAGTTTAGTTCCAACCCTGCTCAACACACTTACCTGTAGGTTTCAAACCAGCCTGATAGACACAATTTGTTTGATCAGGTGTGTTTAATTAGGGTTGGAACTAAACTGTGCCAAGCTGCGGCCCTCCAGGAATTGAGTTTGACACCTGTGTTCTACAGCATCGATAATGTAGATTTTAGTTAGTTTCACAACAAAACACAAGAAAATACGGCTATCCCGCCTAGTCTCTCCCTTTATTGTTTAAGATGCAACTCTAAATATTCTCTCTGAAATAGCATGTCAGTTTGGCTTGCACGCCGCCGGAATAGCACTAGTCGCTTTTAACACATGAGAGAGAGAGGATTCTTTTGCTGTGCTGCTGTTTCAGGAGGCGTGGCTCTAGACAGCAGGGGAGGGACTGTGAGTCAGAGATTTATGCTAAGCTGTTAGCATTGAGGAAGATCACCTACTGCACCTTTAAATGAACAAAAATAAGATATTATGAAGAATGCTGGTTGCTGGCACACAGCATTCAGTCTATAGTAGGGTAGTCAATGGTTACAACTACTTGCATTTTTCAAAATATCTTCTTTCGTATCCAACAGAAGAGGCTCGAATAGGTTTTGAACAGGTGAAGAGCGAGTAAAAGATGACAGAATTTTTTTTTGTAAACCGTCCCTTTAAAATTTATTTTTATTAGTTTTTTTGGAATAAAGTTAATTATTTCGTGGTATTATATTAATTTTGGACTGTTTTTTTAATGTTAATTAAAAATTTATGTGTTTTTGTAGTTGTAGAAAATACATTTTATTCAAATCAAACGCTTAAATGCTAATACAAATGTTTAACTGATCTCTATTAATTAACAGAATATTCATTAGGTTCAGTTAAAAAAAAATCTTTGTTAGGCACGTTATCATGTGTAGTTAGAAGGAGGATTCGTGTATGTGTGTGTGTGGGAAAGAGGGTAGGTTTGCTTCTCTAAATCTGCTCATTATCATCTGACACCATCAAAAGTGCTGACTGTGCACGAGTCTTCAATTCGGTCTCGTCCTAATTTGATTTTTAAACACATTTGGTGCCATTTCCTCATTCAGATTCATTAAGCAGAACAATTTTAAAGCTTTTGTTTTTGGCTCAGTGTCTCTGGTGTAATGGAAGAGTGCACCTAAAATTTAAAATCATTCAATTTAAAGTCATTTGCAAACCTTCAGACTTGTTAGCTGCATGAAACAGATAAGGAGGTATTTTGTCAAATGTTTCAGCTGCTCATATAATGAAGGATAAGTAGATGACTGGTGCTCCAGACAGCATAAATGTACTCTCTACAACATGAGAAGTCATTCTCGCATATCACAACTCAATGGTTAGTAAATGATGGACTGATTTGGATTTTTGAGTGAACTATTCCTTTAATGACTTGATAAATTATTAAGGTTAAGGTTTAGAATCAATTTAGTGTAAATCAATAGCAATAAGAAGCAGGAATGATTCATTCATTCATATTTACATAAAAAGAACCAAAAAGATGAATTAATGTATGCTTCATAATACTGTATGAATTGGTTTCAGAGCTGCTGCGATGTATGAGAAAGAGCAGCAAAAACATTCTTCAAAATATCTTCTTTTATGCTCCATGGATTTAATGATTAGGAAAAACTTGAGACTTACTTAATGAGACAATTTTGATTTTCAGTGAACTAATCCCTACATTTCATCCAGCTTTTTGCCAGAAACTATATCAAGATTTCAGCGTCGTCCATCATTGAGCTGATTGACAGCACTAAAGTTGCGAGTCTTTTAAAAAGTGATTCTTTTCCTGCTGTGAGGAGAACCTTCCAAAATGGCTGCAGTAGAGATTTATTAGCAGAAGGGGCATCAGAGGAGTTTGTCAGAACGAGGGTTAGACATGCTGCTTATGCGTATTAAAGAGATTTCGGATTCGGTTCGCGACACACAAGTCTGAATCTGGAGAGCGCGAAGCTTATTTGTTCGTGTGGACCACACAGATGCAGCGAAGAGGAACTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTATGGAGTTCTCCTCGATGCCCACAGCCTCTCCGTGGACCTTCAGACATTTGCAATATGTGAAAAATGCATGGCAGGAATGGCCGCTCACCGCATGGGTGTGGGCTGCATCCTGTCTGTGCCTTTGGAAAAGGGGAAGGGAGTTGGAGAATGAGTGGAAGAGCGAAAGGAAAAAGAAAAGTGAGGGAGAGTGAGGTAAAAGCATTGAGCGGGACGACAGAAGTTAAGGGTTTGGTCTCGTGTGTCTTCATGAAAGAGCTCGCAGCAGCAGCGCGGCCCATTGTGCATTATTAGTGCTGCTCGCGAACAACCCTTTTACTGCTGGACATAGTTTGAGGATTGTGTGTTCAAACAGATGACCATATGCAGACAAGGAATAGGAAAGAATTCTTTCTTCTGTTCAGTTTAGTTCTGTTCTTTATTTATATTGAATTATTTTATTTAATTAATTAATTGATTTTTTTTATTTAGTTCATTTTTCTTTCCTATTTTATTAAATTAATTAATTGATTTTTTTATTTAGTTTATTCTTCCTTCCTTCCTTCTTTCTTTATTTCTTTATTTCTTTCTTTCCCTCCTTCAATTTTTCTTTCTGCTTTCCTTTTAGTTTTGTTTGTAAAATTGTATTAAGTACATTTATGCACCGGTCTTATAGTTTATTATTTTTCCTTTCTTGCTTTCTTCCCTCCCTCCCTCCTTTTTTCTTTCTGCTTTCTTTTGTTTTGTTTTTAAAATTGTATTAAGTAAATTTTTTCGCTGGTGTTATATCATGATCTTACAATCTTTTTTACACTTCTTTCCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTACTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCCTTCCTTGCTTCCTTCCTTCCTTGCTTCCTTCCTTTCTTGCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTTTCGGCTTTCTTTCTACTGTATGTTCACACCAAAAGCGGGGGAGCGTCAAAATAGCTGGAAGTCATTTATTTTCAATAGGAGCAGGTGGCAATAAGCAGTGAGGAGCGGCGCATCTTGTCTTCACCTGTGTGGGCATCAGGGAGAGTTGAAATCAAGTCAACTTTATAGTAATGAGCAATGACGCGGTTTGGCGGCAAGCAGAATGCAGAAGTCCACTACTTAAGCTTTGGTTCTGACCACACTTGTTCCCAAGGGTTTGATCATAGGGGGTTTATTATCGCCGGATTTCCAATTATTTATGTTTTCTTACTGGGATGTTCAAAAAAAGTTACCAGCGAGTTACTGATGCGCAATAATGTTGTATTCTTTTACTTTAAAAAAGCAAGAATCTCAAGCTCACTATAAGGAGTGTACAAAACAGTATTGTTGCTTTAGAATATTTGAGACCAATATTTCCATTTTGGATAAGTGGAGCAATGCCACACCACACGCAACAACTAGATCTTCCATTGTTAAATGAATTTGATAAAAAGTGTGCAGCATTTTTATGCTAGAAAGCATGTTTTTATGTTGGAGTGTAGCTGATTTGCTGATATGCTGCAATGGCTCCTTTAAATACAAGATCAGTGTATTGAATTTTGATGCTCTTGCTGCCAGAGCTGTAAAGGCAGGCAACATTGTCGTCAGGCTTGTGTGAACGCAGAGTTAGTTCTATCTTTTAAATTGTATTAAGTACATATATTCACTAATCTAATATTGTATATATTTTTCTTACCCTTCCTTCCTTCCTTGCTTCCTTTCTTTTTCTTGCTTGCTTGGTTCCTTCCGTTCTTTTCTCTTTCTTTTTTTCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTATCATTCTTTCTTTCTATCATTCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTCTTATTAATAAATTCATTCTCTTCCTTATGTATATTTCTTAATTTATTATATATATATATTTTTATTCAATACTAAATTAGTTCTAAACTTCTTAATATTTTATCTATTCATTGTCATTTTTAATTATCCATTCTTTTTATTTATTTATCATTTTTGCTGTAATTTATATATTATTTATTTGCTTGTGTTTGTCCTTTCCTTGCTTTCCATTTGACTTTTGTTCTTTTTAAATGATTATTTTCTTTATTTTTCTATTCATTAAATCAGTTAAGTACAGATCTCCTTTTTCTCCAGGAAGTAAAGAAATCTTGTATAAAGTGTCTAGTGCACTTTGACCCTTTGCTTCTAACCTAAAAGAGCGTGTGTGATGTGCGCTTGAGTTCTCCAGCGTGTGCGGGTGCTGTGACTCACAGATGAAGTATTTTTCTGTCTATGATGCCTGGCTCCTCCTCGCCGGGCCCCGAGAGCATGAGGCAGCGATGAGGCGCCATGAGACCTGGCCCCGCTGTGAACTACTCCCTGGAATCACCTCACTCGTCGGCCTCAGTCACTTCACTTGTTTTCGCTTTCTGCTCGACCTCTGCTGTGCCGATCGCTACGGCTTTGAGTCGCAGCCTTCAGATTGAGCTGTGTTTGTGTGTTTTACATTTCTTCCTGAACTGTAAGGGCAAAATAAACAAGCAGCGGTCGGAAAAAAAGCACCGGAATTTAGCTCTGCATCCTCTCATGTCCTTATCAACAAAAAGGTTGTGCCTGGTGTGGGTTTTATGTGAACACATGGGACATAAAAGACGAAAGTGTGCGTATTTGAGGTTTTAAAGTGTGGTTTTGGCGGCAGTAGCTTTTATATCTGGTGTCTGTGAATGTGAGAGGTGAATGAATGAAAATACCTCTGACCTCCAGATTTGGCTGGGATCAGTATAGGCTTACACTATTTAGGGAGGTGAATTAAAAGGATTTGATTCTGTTTCTGTAAGTGTTTTTTTTTATATATATATATATTTAAAAAATAGGTTTTATTTATTGGAACTTTTTTGTGCTTTATTCATATATCTACCTTGTTAGTTACCAATTGTTTGTAGAATAAATCGTTATTCTTTTTGGTGTAGACTCAACAAGGTTCGGGTTAGGGCTAGGGGGAAATATTCTTAAAAGATTTATTTTTCCTCTCTGCTTTTCTTTTAGTTTTTTTTTTTAAAAATTTGTATTAAGTACATTATTACATTTACATTGATCTTATAGTTTCTTTCTTTCAGATCTATTTTTAAAATATTGAGTAATATTCATCGATCTTATTCTTATCTTTTTGTTAGTTTGTTTCTTCCTTTATTCCTTCTTTTTTTCCTTTCTGCTTTCCTTTTAGTTCTATTTTTAAAATTATTTTGTACTTTAAATTTACTTTGTTCATTACAAATCATTAGTAGAATAAATCATTGTTTTATTTGGCATAGACTTGATAAGGTTCAGGTTAGGACTAGGATAAAGGGGAAACATTCCTTTTTTTCTGTAGTGACCTGATTGATTCTTACCATTTGCTGCAGATTTTTTTGCTGCACATACATTATGTGTATCATCCACTCCATCACATTTCAAACTTGCTCTATTAGATTGAGACCTAGAGACCTAGTGTGGTGACCATTTAAGTATGGTGAACTCATTGGTGCTGTTTATACCTGCTCACTTCATATCGGTGAGGACTTGAGCTCCAGTTGCGCAGTACAAACCTCCTGGGTCTTTTTTAATGTCTTGTACATGACACAGAGTCCGACCTATTGTGTTTTTATTAAAAACATATATACATTTGATCGCTCAAACCACTTCAGGGGGTGGTCTGGGATGCATCCCAGAGGAAACTGGTCAGTTCTAAAAAGATCTGGTTGTTAAAATTGATTTAAATGTATTAATATAAAATTTTCTCCATAAAATAAAAAATAAATACACTTGAGAGAGTGTGTTATGGGCTGTATGACATAGGCAGTTATACTGTAACAGAGCTAATGCAACACTACAAAACGCCACAGATGACAATTGTTTGGATGTTTTCTTGTTTTATTGAATTATTTTCATTTCATTCTATTTTTGACCAGTGAGTAATTAGTTAATTATTAATAACATAAACTAGCAGTTTGTTAGGTAAATACTGTCTGGCTGAGTTAGACCCTATTCTGAAGTTAGATCTAATTTAGTTTCTCCAAAAGGCTTCCTGTGATTAAAATCGTTTTCCGTTACTGCCAAATCTCAACAGCTTTCACACCTGACTTACCTGGCCAGGCAATCTTTTCCCAATCTTCTGTTGTCCAATTTTGGTAAGAGGATATAAACGGTTGATTGTCTAGGGTGTGCTCTTCTTCTGTTGCTGTTGCTCATTTGCTTCAAGGTTAAATCACGTATTGTGTTCAGAGATGCTCTTTAACATACCTGGAGTTGCAGTTGTTTTTTATCAGCTCAACCAGTCTGCTCATTTCTTCTCTGAACCAGGCGTTTTCACACACACAACTGTGACTTACAGATTTTTATTTCTATTTTGAACCACTGTAAATTCAAGATTTCAGCCTGCCTGGCGTCAACTTGCAATTCCATCAACAAAATCATCTAAATAGTCTTTCTTTCCTATTCTTATGCTTTGTTTGAACTTCAGTTGATCATCTTGACCACGTCTACAGCACTTGCCTAAATACAATGTTATTCATTGAGCAGATGAACAAGTTTACCTTAAAAAAACAACATGCGAGTGTATATTTTAATGTGTTTCTTTGCCGCAGGAAGGATAACTCGTTTGAAAAGTATTAAAATAGAATTTTATTTTGCGCCGTTTCAACTTTCTCCCACACCAAATTCCCCTCAGACTGCAAATTCACATCTCTTGTTAAAATGCAGTTTGCTTTAGTGCTAGTGGATTCAGTAGTGCTGCAGTGCCACTGTAGTTCAATAGTTGTGCAGGAAACACTGTCAAAGTCTTTTAACACAACATTCTGTCTTCATCAGTGCAAGGATCCAGACACTAAATAACTATTAACTAAAGCTAATGACAAGAAAATCTAGAATTAAAACAAATACATAAGCAGAACTGTATAAGAAGTTTCTCCAAACCCTAACTCTTTTCATTTGTGCTTTTATAGATGAGCAGCCGACAAATCTGCAGCAACTGCTTGATGCTATCATGTCAACATGGACCAAAATCTCTGAGAAATATTTCCAGTACCTTGTTGAATCTATGCCATGAAGGATTAAGGCAGTTCTGAAGGCAAAAGGGGGTCCAAAACAGTAGTAATAAGGTGTAGCTAATAAAGTGTGCATCGCGATATCGATGCTGAAACTATATGAAGAGTTCAGATGCAAAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATAAGCATTTTATCTCAACCTCTTATGTTTATCTTGAGTTTATTCATGTCAAAGCCAATGAAAATAATGTATTGTAATGTATGTAATCAGGGCTTTACATTAACACCCGTCAACCCGCCAAATGCGGGTAGATTTCAGCTTTGGCGGGTTAGACAGACACCTCCACTAGCCACTTTGGCTGGTTGAAAATCATTTTTAATTTGGAGTTTTCCTAAAAGCAGGGTTCGACAACATAAGGATGACCCAACATGCGTGCAAATGTGATCTTAGAATCGAGAAGTAAAATAATTGTGATCACGGAAACAGAAGTAAGGCAAATGAATACCGAATGAGAGGATGATGATCGCTCGCGCTAACAGCTGACGTGATGCGCGCAACTGCTTAAAACGCGTGCGCGCTCCCGACAACCGTGACAAGCAACCGTGTCTGGAACAGGTTCTGGAAACGCAACCGTCATCGGTTCTCTTTCAAATAAACTAGACAAATAGTGATGAACATGCACCCACAGTCCTGCTGCTTTTAAGAGCTCAAAATGTGTCTTTTTGTAAGCAGCACCGGTTGCTTTCACTTTAAACAGATTATTAAATGGCTTAAAGTACCGTGAGCACGTGATCATTCTTTCATTATCACACACGGTATGTTTCATTTACTTACGGTTTTATTTGCTTTTATTTTTGTTAAAATGGTTTAATTATAATTTTTTTTACAACGTTGCTTTAATGGGAGATGAACTGTCCATTTATGTGCAGTCAACTGGTGATCTGAGAGTTCTTTAGCCACGACAGATTACTGTGCATATTTTTGATACATGACAATAGTTTTTTTTTTTAAAGTCAGTTGCTTTTCTTTCTTTTTTAAGAAATGTTTTGTTAAATAAAATGTATATACAGCTATATTTTGCTTGTTTTGACAATCAAAATTTGTGGCTAAGAAATAATTATTGTTTAGTGTGGTTATAGAGATAAATTTGGTACATTACATTACGTTAATTTTGAGCTCTAAAAAAAGTAATGTGAAATAAAAACTAATTATATAACAATATAACACTATGAAACAATGAACCATTTGCTCATGCTCAGTGATTAAACTCATACTGACACACAAAAAGTGAAATGAATGAGGACGCATGTGGACAACACAAAATTGAAATCAAGTAATTTTAGCATGTCAACGTCAAATTTATGCATATAAAATATATTTTCCCAACAACAAAATTGTAGCTAGTCAAAATGCAAAGTGGCTAGTAACATTGGAAAACTACTAGCCACAGTGGCCGGTGATTAAAAACAGTAATGTATGTAATGTTATAATGTAATCTATTACCATACAATCAAAATTACTGAACCTAGACATAAGAGCCTGAAAGAAATGCTCATTTTAGAAGTAAATTTCAGATGACATTTAGAGGTTTTTATATCTGAACTCTTTATATATTGGGCAGGCCTAGTTGGCACATAACTACAGAGAGATTTTGTATCAAATTTTGTATTATTTAGTTATAAATTAAGTGGTTTAATGCATTTTTGTGATTATCAAGATATATTTCACAGCCACAGTTTTAACCTAGACAATCAAGAGCTGCCAATTAAGCCAAAAACAGCCATAGCTACGCTTTAAATCATCGTGACCAAAAAGTGTTTTGTGATTCGCAACCCTCACCACCCTTCACCCCTCGGCTCTCCTCCACCTGGTAAGGCGATTCATTCATCAATAATTGATAATTGGTTAAGACGGGTGAAATGGAGAGGTAATTTGTTGAGTACAGGCAGGGTGCAGGGCCAGATGATTGGCTTCTTTCGCTCTTTTTCTCCCCCCTCAGAACTACACTTGGAGTTTACCGAGTTCAGCTTCTTCTCTTCTCTCCGGCTCTCAAGGACGCGGCAGGCTGCTCGTAGCCACAGGGCTCTTCCTCTCTTACCCTCTCTCTCTCTTTTTTTCTCGTCATCTTATCCCATTCACTCTCTTTGTTTCAGTCTCTATCCCCCGCTCCATGTGCATCCCAGCAGGGGTTGTCGATACTCCGTGCGCAGCTGTAACACAACGGTTACTGATGTGCAGCACTAGTAAAGTGACCATTCACTCGTGTTCAGCGTAGTTTCACATTGCAAGATAGCATGTGAACCGGATAGCATGTGAGCAGCGGCATTTGTGTACGCTCAATGCCAGAGGAGGGAATACATATTGATTTCAGACAAACATCATTCTTTTTTTTCTCCCCCCCCATTGGAAATCCCTAGATTCTTTTTGTTCTGCTGCCTTTTCCCTGCATCTCTGTGTTTCTCCATCTGTCTCTATCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTAATGAAACTCCAAATGAATTGGAGCACGCTCGATGGTTTCTCTCCCTCCCTTTCTGACTCTCTCCCACTTATCATTCTCCGCCGCACTCTGCCTCCATACAGCACATATATGTGGGGTTTGTCAAGAGAGACGTTTGCTTGCTTTCTCTGTACCTCCCTGGTAATCCTTTTGAGAGAAGGGTGATAATGTGTTTGCGTAAACTAAATTAAAAGAAGTGGTCCATGCTGTCGTGCTCTCTTTTTGTCGTTCGCGCTCATTTTCATGTTTGCGCACAGTACGTTTGATCAGGCGCTGTTAAAAAAGGTGTAGTTTTAGCACTTGGGTGAATAGCCATCACAAACTCATATGCACTTCACTTTGAACTTTGAAGTCTTGCGAAGATGGATTGATACAGTGATCAGAGTCTTTATAGGGCTTTTTGAAATGTTGTAGAATTACAGTCTGCAGATATGTATTCAGGTCGACTAATATACACAATGTCACTTTAAGCTGATGTTAAAAAGAAATTAATTAGTGAGCATGTGTTATACACGCATATATAGATGCATATCGATGAAAAACTTCAAAATTCATTTCTTTCATCGCCATTTTAAAGGCAATTTTCTGGAAATGAGATTTTTCTTCTGCACTGAGGCATGAATCACTTCTACAGCAGCTCTTACGTACACCAAACTACACCGTTTCATTCAAATCTGTATTCTGAAGGTTTTTTCTTGGGGATATATTCATACATATTTTGTGGATAATGTAAAACCTATTATTCTACTTAGAATTGTGAGCAGTTTTTGATTGCTTGCAGTATTTTTTTTTTAAATATGGAGTGATTAAAATGTAAAACAGCAATAATTTAATTAAAAAGATACATTGAAAATAAAATGTAAATTTATTATGAATTTACTTAACTGCTGGCCATTCAAGATGTAGGTTACTGTTTTTCTTTAAAAACTAAACTAATACAATGCACTGAACCGCTACCAGCAAGTTCGGAAGTTAGAAAGACTACAGATACATTCAAAACAAAAATGAATACTGTGGCTCCTTATGAAACATTGAGATTTTATTAAGTGAAATTCTAAGTCTTCAAAAAAAGTGAACATTATTTACCAGATTATTGCATCTAAACTAAAAAAGAACAGTTTCCACAGACCAATCAAATGGTTTTTCTTTAAAAGAGCTCAGGAGCATGCATCAGTTCGCTTGTAAATACATTATATTGCCAAAAGTTTTGAGGCAAGAGTTTTAATAACATCCTAATCTGTAGGGTTTAATATGGAGTCGACCCACCCTTTACAGCTAAATCGGCTTCAACTGTACTGGGAAAGCTTTCCACAAGGTTTAGTAGTGTGCTTATGGGAATTTTTGACCATTTGTGAGGACATTTGTAAGGTCAGGTACTAATGTTGGATGAGAAGGCCAGACTCGTAGTCTCTGCTCTAATTTAATGAAAGGTGTTCATTCAGGTTGAGGTCAGGACTCTGTGCAGGCTGGTCAAGTTTCTACACACCTCGATCATCCATGTCTTTATGAACCTTGCTTTGTGCACCTGTGTTCAGTCATGTTGGAACAGGAACATCACCAAACATTGTCCAAAATGTCTTGGTATGCTTAAGCATTAAGAATTAATTTCACTGAAATTAAGGGGCCAATCCCAAACCTGTTAAACAACACCACACTTTAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAGTAATAGTAGTAGTAATAATAATAGTAATAATAATAATAATAATCAAAGTTTTACACTTTGCAGTCTGGAAAGCGCTGTTCTCCCTGCAACTGCCAAATCCAGGCTCGTCCTTCCAGTTGCGGGATTCCAGTGAACACATCCCCACTGCTGTAGAGTCCGGTGGTGGCCTGCTTTACACTTCTGCATCCCACACTTTGCCTTGCACTTGGTGATGAAAGGCTTGGATGGGCGCTGCTCAGCCATGAATACTCTTTCCATGATGCTCTCTGTGCACTGTTATTTAGTAATCTGAAGGCCACATTAAGTTTGGACGTCTGTAGCTGTTGACTCTGCAGAAAGTTGGCAGATTCTGCACACTGTACGCCTCAGCATGCACTGACCAATCTCTGTGGTTTTACATGGCCTACAACTTAATGGCTGAGTTGCTGTGGTTCCAGTTTGATCCAGTTTGTTATAATAGCACTAACAGATGACGATGGAGTGTTTAGTGATGAGGAAGTTTATCTAGTGGACTTACTGCACAGGTTGAAACTTATCATGTTACCACTCTTAGGGCCCTATCATACACCCGGCGCAGTGTGTTGCAAGGCGTGGCGCAATGTTCTTTTGGTAGTTTCAGCTTGGCGCAAGAGTCATTTTGAAGCGTTGCGCTACGCTGTTTAAATAGCAAATGCATTAGCGCTCATTTGTGCGCCCATAGGCGTTCTGGTCTAAAAAGAAAGGCGTTCTGAGGCGGACCGCTGGCGCGTTGCTATTTTGAGGAACTATAATAGATTTTTCATTAGACCAAAACTAACCCGGTCTAAACTCCAGCGCAGAGTTGCGCCTCACTTACACACTGCTTAATACGCAAGAGGGCAATAGGCAAATATCTTTACATATGAAAAAATGTAAATATTAAGGATATATATAGGATATAATAAGAATAGATATAGGATATAAATATAAAGGATTAAAATATTACAAAACATATTATTTTCTAGCCTACATAAATATGAAAAATCACTGCTTTTATGTCTTCTTCATCTCGGGAGGCTTTTTCAGTTCATTCATAACAATTTGCTTTTGTATAATGTTATTATTATTAGCAGTATTATTTATTATATCTATATGTATATTTGTTTTATTAAAAACAAGCTTAGATTTGCCCACCTGTCAGGTTTTAGACCATATGGGGCACAGCATGTGTTTTAGGATATAAGACTCTAATTGGTTTATTCTCAAAACACACCTATAACTCATTAAGAAAATAAACTCAACCCTTTTAAACCATGCGCCATGGCGCAAAGCAGGTTTTCCCGTCCTTAAATTAGCAAAAACGCGTCCTGACATGCCCTGAAAGCGTTTGCGCCCTGCGTTTTGCGCTCTGCGCATGGACCGTCAAAAAAGAGCCTGTAAACTCACTGAGCTTCTAAGAGTGACCCATTCTTATACATGTGCTTGCAGAAGCAGTCTGATGTTGATACCTGAATTCAAGGATTTGGATGGCGATATCCCCAAACTTTTTCGAAATGTTGGTAGCCATTGATTAGAAAATACGAATCACCAGGGACTATGGTTTTAGCCACAAATCTTCTTTAATGTTCTACTGTAAAAATATACATATACTGTACAGTTGAAGTAAGAATTATTAGTGCCCCTTTGATTTTTATCTTCTTTTTTAAAATCTTCACAAATGATGTTTAACAGAGCAAGGAAATTTTCACAGTATGTCTGATTATATTTTTTCTTCAGGAAAAAGTCCTATTTGTTTTATTTCGGCTAGAATAAAAGCAGTTTTTCATTATTAAAAGCAATTTTAGTGACAATTATTAGTCCCTTTAAGCTATATTTTTTCCTGATAGTCTACAGAACAAACCATCGTTATACAATAACTTGCCTAACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGATGTGTTCTCTCTATTAAACAGAAATTGGGGAATAAACAGGGTTGCTAATAATTCAGGAATGAATTCTGACTTTAACTGTATATATTTAGATACTCTTTGTGTGAACTGTCCCGTTAAGTACCGACTTGGCTCTAAAAGCTCTGGTTCTTTAGACAACTCTAGCAGTTATTCCAAGAAATCAACAGCAGTTTCACATCTTTGATATTATTTTTAGGTGTATTAATAGGTTATCCTGAAAAAATATTTTCTTTTGACTTTGACTTTTCCAG
Seq C2 exon
GAGAGATGGAAGAGGAGATGGAGAACCCTGAGATGGTGGATCTCCCAGAGAAGCAGAAGCATCAGCTGAGACACAGAGAACTCTTTCTCTCCAGACAGTTGGAATCTCTGCCCGCGACACACATCAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000007198:ENSDART00000045583:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (disopred):
C1=0.344 A=NA C2=0.372
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0142613=BAH=FE(21.5=100)
A:
NA
C2:
PF0142613=BAH=FE(29.2=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]