Special

DreINT0106975 @ danRer10

Intron Retention

Gene
Description
netrin 2 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-050310-2]
Coordinates
chr24:38850209-38868747:-
Coord C1 exon
chr24:38867506-38868747
Coord A exon
chr24:38850398-38867505
Coord C2 exon
chr24:38850209-38850397
Length
17108 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TACGTAAGT
5' ss Score
9.27
3' ss Seq
CTGTGTGTGTTTCTTTATAGCGT
3' ss Score
11.13
Exon sequences
Seq C1 exon
ACGCACGCTGCCGAGGGTCGATTTTGGGAAAGTCGTCTATCTCCAAGACATTTTTCTGGCTGGATTGTCTTTCCTGAGATATCGCACATACGCCAGACTGTGTCAGTCTAAGGAGACTCCACAACCATATTTGTTTATTTGGCTTCCCTTCTCTCTCTGCCATCCATCTGCATACGTTCCTCCCCATCACATCCATCATCCCCTCCCGTGACACCATGTGGAGATTTCAGACTTTGCTTTCTATGCTCACTGTGTTCCAAGCCTCCAGCCACAGCCCCAATCCATTCAGCGGGCCTCAAGTGACTCCGACAGACCCCTGTTATGAGGAGACGGGTGCTGCCCGCCGGTGCATCCCAGAGTTCATAAACGCAGCATTTGGGCAGGAGGTCAGTGTGTCGAGTGTTTGTGGGCGACCAGTGTCTAGATCATGTAGTTTAGTGGAGCGTGATGACCGTCCCGCCGTTCGCACATGCCAAATCTGCGATGCATCTGATCCCCGCAATGCCCATCCCGCCAGCTACCTCACCGACCTCAACTCTGCCCATAACCTCACCTGCTGGCAGTCGGAGAACCTGCAGAGCTCGCCGCTCAACGTAACGCTCACATTATCCCTCGGTAAGAAGTTCGAGATCACTTATGTCAGCCTTCAGTTTTGTTCGCCACGTCCTGAATCGTTGGCCATATATAAAAGCATGGACTACGGACGCACTTGGACTCCTTACCAATTTTACTCATCGCAGTGCCGTCGCATGTATAACCGACCCAACAAAGCTGCAATCACTAAACAGAACGAGCAGGAGGCTTTATGCACAGACGGACACACTGATCTCTACCCGCTTTCTGGAGGTCTCATTGCGTTTAGTACATTGGACGGGCGCCCATCGGGGAAGGACTTTGACTCGAGTCCTGTGCTTCAGGATTGGGTGACGGTCACTGATATTCGGGTGGTGTTCAGTCGTCCGCAGCACACTAGAGCGCTGCCAATGTCAGGACGTGAAAGTGAAGACGCTCTCGGTGCGCCTGGAAGCTTGCCGACGTACTATTATGCGGTTGGTGACTTCCAAGTGGGCGGGAGGTGTAAATGCAATGGCCACGCCTCTAGGTGTGTCCGGGAGAAGGACGGGAAGCTGCTGTGTGAGTGCAAACACAACACTGAGGGTCCGGAGTGTGATCGATGTAAACCGTTTCATTATGACCGGCCCTGGCAGCGGGCGACAGGGAAAGAGGCCAACGAGTGCTTAC
Seq A exon
GTAAGTCACGAAATCTATTCTTCTTAAAGTGCAGATGACATCAAAACTAGTCATATTATTTTTGTGTTAGTTTTGTGGTGAACAATTAATCCGTGCATGAATTCTAATCTTAAATTTAAATTTGAATATCTGCTTCCTGTTTTTAGTTCAATTCTCAGATCAGGGGCCTCATGTATCAACGCTGCGTACGCACAAAAACTTTGCGTACGCCAGGTTTCACGCTCAGAATCGATCACGTTTGGATTTACTAACAATGAACTGAACGTGGGAATGTGCGCAGCTTCACGGCAGCTTTATGGCTGGCATACGCACATTTTTTGTGCGTGTCTGTTTTATTTCCATTGGCGACTCCTAGAGGCAGTTGTGTTAAATTCCTCCCTACAAAGTGTCTGAGCCTTGCAATGGCAGCTGTATGAGACGGGTTCATCTAGCAGGTATATAAGGTTTCCATACCATACAGTTGACCAGCTAAACATTAAAGCACAATTTGCAGCGGTCGCCTGTTTTCCCAATGTAATCTGAGCGATCTACTGCACGCACATTGCTATAAAGACACTATCTGAAGATGAATTTGCATGCGTGAATCAGAAACATTTCCATTCAATAAATGTGCAAATAAAATATGATGCTTATTGATATGAACTTATTGATGATTCCTACTTGTCTTTCTCGTGATAAATAGTTGGCAAAATCTGATATGTAGCGGGGGAAAAAATAAGATAGAGTTTATCAGACGCTGGATTCGAGCCGAGTTCATGCTCGAACGTGTCAATACATGATCACATGCGTCTTACGAGTTGCACCACTGAGACTGTTAAGGGTCCTGCAACATTTTTCAGATACAAACCACACTATTTCTTTTTTAATTCACTCTGTGCGATGTTCAGACCCAACTGTGTTAACCGCATCAGCTAAACTCTCCCACTCATTTTTTTCTTTTGTTGTTAATTCCGGAGAACAAACTTGCAAATAACACCGCTTTTCTCCGGTCTACCTCCGCAAGCTGCACCTCCAATTCACATTCTGTTCAAATTTTCTTTTCTTGCTTGCTTTTGCCTTTGCTTTTTCGTTAGGTTTTGCCATTAGCATGGTCATTAGCATATTCATACGGGGGAGGAGGCAGGGAGGGGTTTTGTGCTCGTGCATGTTGCGCTCAGTTTCACGTTCATTCGGATGTACAAAAGAATATGCGTGAGATTCGGCGTACGCAGTGTTTCATACATCTGAATTTTTTTCTGCGTACGCACATTTACAGCTTTGTGCGTAGGCAATGTTTTAGTAAGATTTCCACGCAAGTCTTCGTACATGAGGCCCCAGGTCTGTCTAGACGTGGTTAACGTAATTATTTTTTTATATATTTGATTGTTGAAAAACAGAGTAAATGGACATTTTGTGGGGAACTAATCCTTTAAAACCAAATTCTGTACACACATCTTGAAGCGGAGCGAAAGTCTGGGTTTTGGGTGCACGTTTGAACAGACATACACATTATTAATATTAATAATAATAATAATAAATAATAATCTAAAGATGTTTATCTTGATGGGTTTTTGTTTTCAAACACAACTAATTTTGTCCTAAATGAGCATAAAAAGTTAGAAAAAACTATCAAATGCTTTCATTATAACGATAGATGTGTGCATTTTTAAAGTGATGGGGGGTTATTGTGGGTATATCCCTTATTTTCACATCACAATGTTGTCAGGTATGGCGGGGGTACATTTTCCCAGTGAGCCTGTGCTGGATTTAATTATACATTTTTAAAACATTTCAGTATTAAATGAAACATTACATTAATAATACCATCAAATGTTGCTTGGATAAACAAATTAGACGTCTGACACTTTTTTTTTTTTTGACTAGAGATTGTTTCAGTTAATTCTGGAATTGCCTTTTTTTAATGTGAAATAAAAATAAGTCATTTAAAGCAGCGTAATTGTGCTGTCTAGATAGGCGGCTCAATGCACATTTCAACAGAGCTTCAGTGTGGTGTTACGCAAGCATCACCTGGCAGAAACGTGAAGGTTAATTCTCATGGCATCTCACGTCTGAACTTGATTTATTGGACTTGGATCTCTTAAGCTGTATCTGTATTAATTCTGGAAACATTCCACCGAACACATACAGACTGACACACGAGTGCGAGACGGAGATCTGTGTTTGTGTATGTCTGTCTTACAGTATGTTAATCTTTACATAAACTCTTCTCTTAGGACGTGTCTGAACAGCCCACATTACTGACAGCAGCGTCAGAGCTGTTTTACGCCACTCGGGAAAGCAGCGTTTGTTTATTTTGGCGTCCATATTAACAGTGATTTACACTGTGCAGTGCAGTGGTGTGAAGCAGAAATGCAGGACACTCAACACTTTAGGAGAATGTTGATGTGATATCAGTGTACTCAAATCTGCAGAGATCATAATGGTGCTGTTGCTTAAACCACATTTTCAGCCCTCTAAAACACTATTGTGTAATTAAAAATACAAAAGTGCGTTTATAAACCTTATTTTGTAAATGGTTTCAATTTAGGGTTTCAGAAGGCGACTATCTGTTATAAAGTAAGTAAATCAAAATCATTTGTAAAGCAGATTATCGGTCAAGTAGCATCATTAAAATGTTTAGCAAATGAAAATTTCAACCCAAGCTCAATCTGAAAACGTAGCCCTGCATACGTTTCTGGAGCCCGCGATTTACGTGGCTGGAGGTATGTATGGCCGCATTTGTTTTTTTCGAGCGAACGCTACGGGGCGGTGTGAGGCCGCTCCTCTTCTTCACGTTAGCCGGCTGTGACGGCTCACTCAGCTCCGTGTGGAGGGCTTTACCGCCGCAACCAGTTTGTCCGCTTAGCTCGTAGTGTTACGTCGGCAGAGCGGAGGCGCAGAGGAGAAGGAGCTGGCCGCGACAACGACCGGGTTCGAGTCCGGGGAAGAACGGTTCCAGAAATCAGGTAGGATGAAAAACAGAATCCAAAAATAAAAGCAAACGAGTTCGTGACGGGCGAAAACGCAGCGAGATCCGAAAACGTGGTCAAAATCGGACGAGGGCTTTTGCTTTTTTTTTTTGAATGGCTTTTGTAAATCGTCGTTTGGGTTTAGGGAAGGAGGAGGCTGGGTCGGCCGATCGTTCAGTCATTCAGTCCGTCAGTCGGACAGACGGTCGCTCGATAGTGGCCTCTGGCGTCTTTTCGCACGAGAACAGCGCGAGCGCGAATGGCGCGCGCTCCCGAGAGGCGTTCGAGATGCGAAAAAGCGCGGCACAGCCGCCTCTTGCGGATTCGCGAAAACAAAAACTGCACAAATACGTACCTCCCGACGTATTTCGTGGCCTCCAGAAACGTCCACGAGGCTACGTTTCCACAATGAGCCTGGGTTGGAAAATTTTCACTGTGCACAAAACTAGTGAAAAATAAATATTGAATGAGTCATAATTTCATGCTTTGATCTTGGATTCATACCTGCCAACGCTCACATTTTTCAAGGAAGTCTCCGGTACTTCAGACCCATCTCCCGCCACCCTCCCATTTTGTTATTTCTCCCAGAAAAACTCCTGTAGACTGTACAAATGAAGAATATCAGCAAGAAAGAGGGGGGCCAGGTTATGAAGAGCTTTGTATGTTAAGAGAAGGATTTTGTATTGTATACGATAGTGAACAGGGAGCCAGTGCAGGTGAAAGAGAATTGGAGTTATGTGATCAGAAGGATGTGAGCAGGTAGCTATCCTAGCCGCTACATTCTGAATTAACTGTAGTCTATGAATTTGTTTATCCGGGATGCCAGATAGGAGCGAGTTACAGTAATCAATCTGAGATGTAACCAAAGTATGAACAGTTTGACGACATAATTGTGTATATAAAAACAAAATCAAACATGGAGAGTCTCAACAACCCTTTTGTATGAGGAACTACTTTCTTCCAGATTCAAATCATAAGCTGACAGTTAAACAGCTGAGCGTGCCTCTTTTAAACTTTAGATCTGTAGTGTCTGCTTGTTGCTGGCTGTATGTGGGTGGAGTAATACACAAAGGGTAAAGAGGCTGTACGGGTGCTGATATTACTTAAATATATCACGGCTGTCACCCAATCAAATTCGAGAACCAGAGAGAACTGTTGTATGTATGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATTTTTTTTAAGTATATATATATTTTTTTTTTGAATATATATATATATATTTTTTTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGGTAATACTGTAATTACATTTCATACAAACATTTTAGAGAAAATGTCAGACAGGTGGGCCTTCAAAAATTAATCGGAGAAAGAAGTGGGCTCCGAAGTAAAAAAAACTTGAGAGCCCCTGATTTACAGTACATGCATTCGTATCCATATAGTCCACAGTATGTTATCCGTATTCGTATCCATAAGATCAGCGGCAGCTGCAGATACTCATCTTATCAGACAGCAGTGTTATCGCTGAACTAAAAATTAGCTGAATCCTGTGAATGTATTAATCTCTGAGTCAGGAAAGATATATCATGTCCGAATGGTCCAGTCGGGCAGTCCTGACACTCCGTTAGTATCACTAATGTCTCCCATAAATCTCTCTGCCTCGTCTAATTTCCCGTTCTTTTATACCAGCATTAGGTGAGTTACTTCAAAAATTTAGGTAATTGCTAATTATTAATACATACAGTTGCTTATTAACTTAATTACTAGACTAAATGCTTTTAGTTTAGTAAAACACTTACATTTAAACAATATTTCTGAATAAATGTCTATGGGGTTGCTAGGGTGTTATGAGGGGCTGTTAGTATGTTTCTACGAGGTTACTGTGGTGTTAGGATGCTGTTAGTGTGTTGCTATGGGGGTTGCTAGGGTATTATGAGTGACTGTTTGTGTAACTATGGTGTTAAGAGGCTGTTGTTAGTCTATAGCTATGGGGTTGCTTGGGTGTTGTGAGGGGCTATAAGCATGTTATCAAATGGTTACTATAGTGTTAGGAGGTTGTTGATAGTGTGTTGTTATGTGATTGCTAGGGTGTTATGAGTGACTGTCAGTATGTCAATATGTGGTACTATGTTGTTTGTTGTTAGTATGCTGCTATGAGGTTGCTAGGGTGTTTTGAGCTGTTGTTTAGTGTGTTGCTATGGGGTTGCTAAGATGTTATGAGTGTTTCTGTGTGTGTTGCAATGGGGTTACTATAGTGTTATGAGCTGTTGCTAGTGCTTTGCTATGATGTTGCTAGGGTGTTATAGGCTGTTGTTAGTGGGTTGTTATGTGGTTGCTCGGGTGTTATGATTGGCTGTTAGTATGTTTGTACAGTATGTGGTTACTATGATGTTAGGTGGTTGTTGTTAGTGTGTTGTTATGGAATTGCTGGGGTTTTATGTGGGTTGTTGCTGTGTTGCAATGCAGTTACTAGGGTGTTAGGAGCTGTTGTTAGTGCATTGCTATGCAGCTTCTAAGGTGTTGTAAGGGGCTGTTACTGTGTTCTTTTGGGGTTACTACAGTGTTATGAGCGGTTGTTAGTGCTTTGCTGTGTGGTTAGAGTAGATTGATTCATATAGGAGTTCAAAAAGTCCAAGAAATAATAAAGTTTGTGCCACCAAACAGGCAGTAAAAGTAGGCAGTATAGATATTTATGTTAAAAAAGGTGTAATGAGTAAAAGTAAGCAGTTATCAGAAAAATAAATAGTGACACAAAGTAATGGTACCTGAAAAACCGAAGTACTTGTACTAAGTTCCGTTCCATCTCTGCTCTGTAGCGAAACCAGAAGTTTACATACACTGTATAAAAAAACGTTTAAAAAAAGTCAGATGTTAATGTGACTAAACTTTTTCTCTTTCAGGTAAGTTAGGATGATCACATTTGCTTCTGTTATGCCTAATAGCAGAATAATGAGAGAGATATTGTTTGAGAAATTGTTAAAACTTTTTCTTAAAAGTCAAGTTTACATACAATAAGATTATTCTGCCTCTGATGAAGCTCAGATGATGATGTCAAGGTTTGGAAGTTTCTGATTGGCTAGTTGACAACATTTGAGTTCATTGGAGGCACAACTGTAGAATAGTATTTAAGGAGAACCTCAAACACACTGCTTCCTTCTGTGACAACAAGGAAAATCAACAAGTCAGAATCAACAAAAAAAAAAAAAAAACAAGATTACAGTTTGCAGAAAGGGAAAAAGACTAATCTTTAGAGATGTCCTGTGGTCTGATGGAGCTAAGATTGAACTGTTTGGCCATTATGACCAGTGTTACATTTGGAGGACAAAGGGGAAAGCTTACAAGCCTAGGAACCCCATCCCAACTGTGAAGTATAGGGGCGGCAGCATCATGTTGAGGGTCTGTTTTGCTGCAGGAGGGACTGGTCCACTTCACAGCATAGATGGCATCATGAAGAAAGAACATTATGTAGAAATACTGAAGCAACATCTCAAGACATCAGCCAGGAAATTAAAACTTGGCCACACATGGGTCTTCCAAACAGACCATGACCTTAAGCATACTGCCAAATTAGTTAAAACGTGCTTTAAGGACAACAGAGTGAATGTTTTGGAGTGGCCATCACAAAGCCCTGATCTCAATCCTATAGAAAATGAGTGGGTAGAGTTGAAAAAGCTTGTGCGAGCAAGACAGCCAACAAATCTGACAGTTACACCAATTCTGTCAGGAGGAATGGGCCAAAACTCCTGCAAACTATTATGACAAGCTTGTGGAAGGATACCCAAAACATTTGACCAAAGTTATACAGTTTAAAAGCAAAGCTAAAAATACGAAGGAAATGTGTGTAAACTTTTGACTGTCTAGAAATTAATAAAAAATTCTCCCCAAAAAAATCTCTTATTATTCTGGCATTTAGCTAATGTATATGATTTAGGTAATCCTAACAGACCTAAATAGTAAATGTTTAGTATGATTCACCATCAGACATTTAAAAAAAATGGTTATGCTCCTCATTTTAGAGAGTATGTAAACTTCTGGTTTCAACTGTATATGTATGCCACTCATGGCCACCTGCACAGGACACTGGAAGTACGAGTACTAACCATATCCTCATTAAACACACACACAAGCCCACTTTTACTGCCTTAGATTTCCTATACGTCACAAACCAAAACATGCTGTTTCCGAGGGAGAAAAAAAAAAACGCCACACAGAGCGTTAATGATATAAAGCTGTGACGCTGTGGAGGAACCTTGTAGAGATGTGTTTATCTTCCTGTTTATTTGTTAGTCTGCCAACGATTATGTGTTTTGGAACCAGCTTGTCGTTTTGTTTCTTTGCGTGCAGCAATTCAAAGGACACATTTGTCGGAGAACTTGTTAAAAAAAATTGTTTGTGTTTGCATAAAAACCAAAGCCATCTAAAAATTTGGACTCCATATTTCCTGTTAAGATACTGTAAACCCCCCCAAAAAAATACTAAATGCCACCTTTTATGTTTGGCTGGTCTAAACACATGTAACCAATTAAGTAAATTAATAAATAAAGCACTCTCAGCGCCCTATTACTCCGTTTTATGTGAGTGTAAGTATTTTGACATTTCAAAACAAATATAAAGCGTATAAAACGTAGCATTTAGTCGGAGATCTCCAGCTAGAAATAACGACGGCGTGTCTGTAACTCATCAACGTCGCTAGTTTTGCATACCGTCCCGTGCCAAACCTTGAGAGAAGAAACTTCCAGCTGTTGCCTGTTTCTGTGAGTTTCGCTGTGAGTCACTCTTCAGCAAGTGAAAGGCCTGTTCAGTTGAATACGAGTTGGAAAGATTAAAAATATGTCCGCTGAAGAGAGAGAGATTGACTTGACTAATCTAGCATTCTCCTGTTTTTTAGGGAGTTTGAATTCGAATAAGCATCCAGTTTTGTTTTTGAAGGGAATTCCAGCAAACCTGTCCGATTTTGTATACAGTTTTCTAGAGATTGTTGTTCGTTATGTATCAAACATCTGCATTTAAAGGTGCTCTATGTTAGTTTCTGACTCCTCTAAAGCATTGAAATATAATATGTCTGCATATATTTAAGAAACATGCTAAGTAAACATTCTTGTTTATCTGAAAAACAATTCTGAAGTCAGATATTCTGCTCTGAACATGTGTTTTCCGTGCTGGAATAGCTCTGTTTGTTTTGGTTTTGATTTAACCCGCCCAATGCCAGTTTATCCAATTATATTTCAGCACCCCAGGTTGCCTTGATAGAAAACAGCATATTTCATTTATTCAGTCAGGAAGGCTCTCAAAGTGTGTGTCCGTCACCGAAATGCGATCTCCAGTGGATAGTAGCAGACTCTGAATTGAGATGCAGATTCAGAGTTCCACATAGGGTTATTAATTAGCAAATAATATACATATTACCAATGTAAACGTTAGGTGAGCAGGTTAAATTGTAACCCTGTGTACTGACAACGTGCTACATGAAGAGATTTGCAGTGATACACAATTTGGCTGTTTGCACCAGACGAAACTCGACAGAAATTTAAATACAGCAATTCAAAAGCAAAGAATGGTGCATTCACTGCATTCCAGCGAAAGGGCTAGCATTGCATCAGACCCCCGTAAGTGGTTTCGTTTGAAAGTGTAGAATCTATATTTTATGCACATATGCATCACTTTGGTTTTTATTCTACTGTACAAAAGTTTTTTTACACTTTAATACACAGTATTTTGGATACTCGAGCTGGGTATTGAATATTTGTTAATGTTTATGTTTTTCATATGGTTCACATATGACACATGTACAAGTTATAGCTCAAATGAAAGCTCTTGCTAGTGCTCATACGGTTCTAGCATTCTTTCTACTGAATTATATTCACATATCAAACAATTGCTGAATGAATCGCGGTGTCTCCATGGTTCAAAAGTGAAAACATTACAATTATGATCAATAAGCAGCCCCAGATAGCACAGACAGCTGTCATCTCTTACCTTATGCTGTGCGTTTCATTCTCCCATTCTCCTCTGTTTTTGAGATGATGTGCATAAGTAAACACTGTGAAGTGATGTGCTTTTATATGTCTGACGTGGTACAAACACAGTGAATTATGTTTGATCAAACAAAAAAAAATTGGAAATATGAAAACAATGATCGCTCCCTGTGACTTGTACAGCACCTCTCGTCAGTTGGAATACAATAACTTTTACACAGATTATCGCTAGAGACATTTTTCTTTTTTCCTATGATTACAGACATGTGCAGGAACCACCAAAATTAATTACAGCAACCAAGACCGCACAGAACCTAAAAGGTACACTTTTCAAATTTGAGTTTATAAAAAAAAAAATACAAAAAGCGCCTCTTTTTTGGTGTTTATTATGACACAGACAACACATACAAATATTTTAAACACTTTCAATAGTGTTTTATGAAAATTCAAAGGGTTTTCTTTAAAATGATACTAAATTCTTGCATTTACACCTCTGCATGTGGATTTGGGAAGCTTTTAAATTTGGGTAGGAAAAATCCAGGCGGAAATCCCAAAATGACAGCAGAGTTTAACTGGTTAAACCTCTTTAAGGGTGCTTTCACATCTAGACATTTGTTTCGGAACCTGTCTCGTTTGCCCAGTTAGTGCGATTCGCTTGGAATATGTGAATTCAGCAATCGCGCTTGGATCCGCGCCAAAACAATCGGTCTGAGATCACTTAAATGAGGTGGTCTCGGCTCGATTGAAACCATGTCTGGAGTGGATTGATTGTTGTGAGAAAGCAATACGATCCGAGCCCGGTTATATCACAGTGTTTTATGGATATATAATAAGCATACAACTATATGAAGAGAGAATTATTAGTAGAGCATTCCAGACATCCCATGTCTCCAGAAGTTTCAGGATTTTACCGCAAATGCACAGAGACTTCCGGAGGCCCGCAAACGAGTGATAATATTCCGAAAATTGCATGTCTCCCTCCACATCGTGCATGCTTCTCACCTTTCACCACCGCATCCTTTCTCGCTCTTTAGACATGTCGCGCGCACCTTGTCAAACAACACTTAACCACCCCAGTTAAACTCTGTTGATCTGTTAAACTCCCTTTTTCTGTCAATGGAAAGGTTTTAAATCACACTTGTTCATACAGACATTTCACATACAGTTAACATCAGAATTATTGACCCTTTTTGAAATTTCAATTGAGGTTTAATGAAGATTTCAACACATTTTAAAGCATAATAACCAATTTTTAATAATGTCTTTTTAATTTGCCATGAGGAGAGTAATTTTTATTTTACTAGTTATTTTACAAGATACTATGGTAAAACTTTATTTTAAGGGTCCGAAAGAATGCATTAATTAAGGATTAGTTAATGGTTAATTTCTTCACCATTAAGCATTAGTTATAAATACAGTAGTAATTAATGGTTAAATAAACATTTTCAAGGTTCTTGAATTATGCATTAGTTAAGCTCAGTTTAATTAGTAAACCATGAATAACTTGTTCACAATTCTACATCAGTTAAGCATCAGCAAACACATGGATCATGATTAACTGCACATAAAGGCATTTTAACCATTATTTGCAATTTGATAAGCCATATAATATTTCTTTGATTCATTGTGTAAGTTAACCAACCCAGGCTCATTCTGGAAACATAGCCCCGCGGACATTTCTGGAGACCGCAAAATACCTCCTGGGAGGTACGTATTTGTCCAGTTTTTATTTTCGCGAATTTGCCAGAGGCCGCTGTGCGCGCTTTTTTTCCGCGTCTTGAACGCCTCTCGTTAGCGCAAGCTTTTCGCGCCCGCGCTGTTTTCGCGTGAAAAGCCGCCGGAGGCCGCTGTCGAGCGACCGTCTGTCTGACCGTCCGACTGACTGAATGACAGTACCATCGACTGGGCGGGCGACCCAGCCACCCTCCTCCTCCTCCTTCCCTAAACCCAAGCGAAGATTTGCAAAAGCCATCCGGAAAAGAAAAGCCCTCGTCCGATTTTGACCGCGTTTTCGAATCTCACTGCGTTCTCGCCGCATCGCTTTTATTTTTTAGATTCTGTTTTTTATCTTACCTGATTTCTGAAACCGATCTTACCCGGACTTGTCGCCGCCGGCTCCCCCTCCTCCGGGCCTCTGCTCTGCCGACGTAACGACACGAGCTAAGCAGACAAAATGATTGCTGCGGGAGAGCCCTCCACACGGAGGCGAGCCGTCAGCCGGCGAGCGCGGAGAAGAGGAGCAATGTCACAACGCCCCCTAGCGTTCGCTCGAAAAAAACGAAATGCGGCCATACGTAACTGCGGCCACGTAATTCGCTGTCTCTAGAAATGTCCGCTGGGCTACATTCCCAGAAAGAGCCTGGGTTGAAGTTAACTAAACAACAAGCTAGTAAGCTTCCTCACCCGGAGGAAACCCGAAAAGAACATGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGGCCCAGCCGGGACTCGAACCAGTGACCTTCTTTCTGTGAGGTGACAGTGCTAACCACTAAGCCTCCAGTCTATCTTGCAACTTCAAAAAAAGCTTAAATAATTTCAGACATTTCTTTGTAATTCAAATTATAAGTAGCTTGTAGCTCGGGCAGCTTTAGTTTCCAATTAGCTTCTCTGCCAAACGTCTGTTTTGACTACACCCAAACCCTCGTGTTATGACTTTTAAGCAAATTTCTTCGTTCTTCTGGCAACCGAACTCCACTTGCTTTTCTCTCACAGGCAAAACAAAAGACCTGAGCAGGATTAAGGGACTTCACCACGCTTTCATGTGTGAACAATCTACTCAACAGGAAACGCCTGATCAATTAAAAACACCTGTGAGCCAAATGTTCTGATATTTATGCTCACATAAAAACCAGGGACGGAATTTTAAATGAGCTGTTATTCTTAGTTGATAAAACATATGTGTGTGTTAAAGCGCGCAGGTGATGTTCTGTGGAAGGTGTTGTTCTGCGGTTTTTTATTAGGGGCGTTCACTAAGACAAGGATTACCATTACCTCTTTAGGCTAGTTATTTAATTAAACAGCACCATTATCCTTACCTTTTGTGCTGCAAATATGGTTGATGCCTCAAATTGTACTGCTAGTTTAGAAGAGTCTTTACATTAAGGTTTATTGCTTAATGCATTTACTAAAATTAAGTAATTATGAAGGATACTTGTGCAGCATTTATTAATCATAGTTCAACATTTACTAATGTATTATTAAAATACAAATTCATTAGTTAATGCACTGTGAGTTTACATGAACTAACAATGAACGACTTTATTTTCATTAACTAACGTGAGCAGATACTGTAATAAATGTGTTGTTCATTTTTTGTTTGTTAGTAAATGTATTCACTTACACAATCTTATTGTGAAGTCTTACAACGTCTTTTGCTACATAAAATGGTCATGTAACACTCAGAACATCCTGACATCATGCTGCATACAACAATACTTAGTGTATTCCAATTTTGATATACACTTACTGGCCACTTTATTAGGTACTGGAAAGATACTGGAAATATTCCTCTGAGAATTTGCTCCATATTTTTATGACAGCATCACACAGTTGCTGCAGATTTGTCGGCTGCACATTCATGATGCCAATCTCCCATTCCACCACATCCCAAAGGAGCTCTATTGGATTACGATCTGGTGACTGTGGAGGCCATTTGACTACAGTGAACTCATTGTCGTGTTCAAGAAACCAGTCTGAGATGATTCACGCTTTATGACATGGCGTACAAGTTGGGTACAATGTGCTCATAAAGGGATGGACATGGTCAGCAGCAATACTCATGTAGGCTGTGTCGTTGACACAATGCTTGATTGGTTCTAATGGGCCCAAAGTGTGCCAAGAAAATCTCCCCCACACCATTACACCACCACCAGCCTGAACCGCTTATAAAGGAACGATGGATCCATGCTTTCATGTTGTTGAGGCCAAATTCTGACCTGACCATCTGAATGTGGCAGCAGAAATGGAGACTCATCAGAGCAGGCAGCGTTTCTCCAATCTTCTATTGTCCAGTTTTGGTGAGGCTGTGTGAATTGCAGCCTCAGTTTCCTGTTCTTAGCTGAAAGGAGCGGCACACGGTGTGGTCTTCTGCTGCTGTAGCCCATCTGCCTCAAGGTTGGACGTGTTGTGTGTTCAGAGATGCTCTTCTGCAGACCTCGGTTGTATCGAGTGCTTATTTGAGTTACGAGTGCTTTTCTATCAGCTGGAACCAGTCTGGCCATTCTCCTCTGACCTCAGGCATCATCAAGGCATTTGCACCCACAGAACTGCGCTCACTGGATATTTCCTTTTTTTATGATCATTCTCTGTAAACCCTAGAGATGGTTGTGTGTGAAAATCGCAAGAGATAAGCAGTTTCTGAAATGCTCAGACCAGCCTGTCTGGCACCAACAACCATGCCACATTCAAAGTGACTTGAATGCTCTGTCCCGGAATGAAAAAGTTTGGGAACCCCTGCTCTACAGAACAAACCATCGTTATACAACTTGCCTTATTACTCTTTCCTGCCTAGTTAACCTAATCAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAAAATATCCAGTCAAATATTATTTACTGTCATCATGGCAAAGATAAATCAGTTATTAGAGATGAGTTATTAAAACTATTATGTTTAGAAATGTATTGAAGAAAATCTTCTCTCAATTAAACAGAAATTGGGGAAAAAATAAACAGCGGGGCTAATAATTCTGGCTGTATATCGAGTTAAACGTGTCCACATTCTAATCTGCACAAAAGGAGTTGTGAGACCCCAGTGTGGCGGGCCAGAAATGTGTTTTTGGGTGTAGTTCTGTGCATACCTGTAGCATGCGCTCCATCAAACTAGCGGTCCTGTTCTACATAAATGAATTTGGAGCTCTGGGTTTGCTCTAACCTCAGGTTAATAGGTTTGAGTGCTTTCAGCTGTGTTTGGAAAGCTCTTGTAATAGAGGAAGGGTGCCATTGAGAAAGACCCTTGGAACAACTTTAGATTAAGTACCGCGCTCAAGGCACAAACGCGGCGCTCAGAGATATCAGAAAAAGCTGCGCTCGCTTCCAGATCAGACCCCCATCTGGAGACGCCCTCAAAGTGCTCGCACTCAGACTGCGTGCTTTCATAATTCGCTCGCTTTTTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCTTTTTATTTGGGTGTGAATCTGTGTTCTTTCTGTCACATGTTTGGAATTTCATTTGGAGAAATGCACACACCCTTACAGCGCTCACACACACATATGCAAGCTCACACACTCTTACACACATGCTCTCACATGCAAGCTCACACACACAAACACATGCAGTACATATACACACACGCAAATATACACATGCACACACACACTCATACTCTTTCTCTCACAGACACACACACACACACACACACACACACACACATCGCCTGCAGACGTTTACCGAGCTGAATTCGCTGTAATCTCACCCTGTTGACTTTAGCCCAGAATCCGCCCGAAATTACACCCCCTCTTCATGAGCCCCAACACACACTCTCACACACACAGAGCGGCAGATGGTGTGTGTGAGGGAATGGCCCGAGCAGGTTTCATTAACCACAGAATTCCATACAAATTGGCCCTGTAATAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTAAATATGAAAGAACAGACAGGCATGTTAAATCTTAAAAATATTCATAAGAAATGTGGATGGAAAGCAGATATATGTAGACATAGATATAGAGAAAGATAAAAACAAAAGTGTGTATGAAAACACACTAGTGTTGTAGAAAGATTGATTGTGATTAATCGAATTTAAAATAGTTGTATTTACATAATAAATAAATATAATAAATCACATGAATACACACATACAGAACATTATATATTTTAGAAATGCATATTTATATTTACAAATTAAATATTACATCTGATGCAAACTATATATAAATACTTGTGTAAATATTTTGGTTTTGTATTTGTGTTGTATTTTATGTGTGTATCATTTATATACATACATAATACATGAAAACATTTATTTCGGTATTTAAGTGGTGATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAGAAATGATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAGTAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATGATAATGATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATACTGATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATGATACTGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGACAATAATACAAATAATAAAAATAATAATCATAACAATAATAATAGTACTAATAATAATAATGATGATGATAATAATAATAATAATAATGACAATAATAAAAATAATAATCATAACAATAATAATAGTACTAATAATGATGATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATGACAATAATAAAAATAATAATCATAACAACAATAATAGTACTAATAATAATAATGATGATGATAATAATAATAATAATGACAATAATGACAATAATAAAAATAATAATCATAACAATAATAATAGTACTACTACTAATAATGATGATGATAATAATAATAATAATAATAATAGCAATAATAATAATAATGTTAATAATAATAATAATTGATAATAACAATAATAATGATGATAATGCTAATAATAATAATATTAATAATAATAATAATGATAATAATAATGATAATGCTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGATAATAATAATGATAATAATAATAATAATGCTAATAATAATGCTAATAATACTACTACTACTACTACTAATAATAATAATAATGATAATGATGAAAATAATAATACTACTACTAATAATAATAATAATGTCAATTTTAATGACAATAATGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGACAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGTATATAATAATGTCGTCTCACAGCAAGAAGGTTGCTGGTTCGAGCCTCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCGTCCCTCTTTCGCGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCTGGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGTGGTACAGGTGAATTGGGTAGGCTAAATTTTCCGTAGTGTATGAGTGTGAATGATGTTTCCCAGAGATGGGTTGCAGCTGGTAGGGCATTCGCTGGGTGAAATATATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCACTGTGGTGACCCCGGATTAATAAAGCGACTAAGCCGAAAAACAAAATGAATGAATTAATAATAATAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGGGCGGCACGGTGGTGCAGTGGGTGGTGCTGTTGCTTCACAGCAAGAAGGTCGTTGGTTCGAGCTTCAGCTGTGTCAGTTGTCATTTTTTGTGGAGTTTGCATGTTCTTACTGTGTTGGCGTGGGTTCCAGGGTTCTTCCAGTTTCTCCACAGTCCAAACACATAAGCTAAATTGTCCATACACTCTCAGAAATCACTGCTGTCACTGGGGTGTTGTCTGACATTACAGAATATTCCTATAATGCAAAGGAAAGTGCAGTTATTTACAGTAAAATAATTTGCGGTATTATGCTGGGGAAATACAGTAAATATCTGTGCAAATTACAGAAATGTCTTACAGTGATGTTTGCTGTGTGTGTTTCTTTGCAGCGTGTAGCTGTAACCTTCACACGCTTTCTAACAGTGATGTTTGCTGTGTGTGTTTCTTTATAG
Seq C2 exon
CGTGTAACTGTAACCTTCATGCGCGGCGCTGTCGCTTTAACATGGAGTTGTACAAGCTGTCAGGCCGAAAGAGTGGAGGAGTGTGTATGAACTGCAGACACAACACTGCTGGACGCCACTGCCATTACTGCAAAGAGGGATTCTATAGGGACATGGGCAAAGCCATCACACACCGACGGGCATGCAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000076748:ENSDART00000154461:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact

ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)

No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
  C1=0.103 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):

C1:
PF0005512=Laminin_N=WD(100=70.6),PF0005319=Laminin_EGF=WD(100=15.7)
A:
NA
C2:
PF0005319=Laminin_EGF=WD(100=95.3)


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event


GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]