GgaINT0066273 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000015630 | EDIL3
Description
NA
Coordinates
chrZ:61038024-61075864:+
Coord C1 exon
chrZ:61038024-61038208
Coord A exon
chrZ:61038209-61075708
Coord C2 exon
chrZ:61075709-61075864
Length
37500 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAAC
5' ss Score
7.82
3' ss Seq
CTGTGTTATGTTTTGTTTAGGTT
3' ss Score
10
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
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NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]