GgaINT0070617 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000010081 | SH3D19
Description
SH3 domain containing 19 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30418]
Coordinates
chr4:32745534-32763496:-
Coord C1 exon
chr4:32763400-32763496
Coord A exon
chr4:32745574-32763399
Coord C2 exon
chr4:32745534-32745573
Length
17826 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGG
5' ss Score
10.07
3' ss Seq
CTGTGCCTCCTTTCTCACAGATC
3' ss Score
11.56
Exon sequences
Seq C1 exon
CCCTCGCCGATGGCCGAAGCCTGGAGGCTGGAGGAGGACGAGGAGGAGCTGCGGGAGCTCGGCAGGAGGCACCGCCGGGCCCTGGGCTCAGCAGCAG
Seq A exon
GTGAGGGGCGGGAGGGGGTCTGGGGAAGACGAGGCGTTGGGCTGAAGCATCGGCCGTTTGGGGACTGCCAGGCCGAGCAGCCATAGCCTCTCCGCTGGAAGGACGCGAGGGCTCCCGGCTGCGGGTTGCGAGGGGACCACTAGGGTGTTCCACGCTGAACAATTGATGCTGAGGACCTGGTGTCCCCTCTGTGACCAGCCCTAGCCTGGTTGGTAGGACTGGATTCCTGTGATGGGTTGGCTCGCGTTAGCAGCTCTGCTTAAGTGTGCTGACCCTGTCGGTTTCTCCCAAAATGAATTCGGTAGGGTGCATCTGTGCCTTGCCTTGTGTGAACTGAAAGCAAAAGCATGTGCTCTAAGGGTGGTGAAGTGCACTCCAAAAGGTTGCTCCTCCAACCTCATGGTAACCTAGGTATGTGTTGACCACCAAACACATCCAGGTATTTAACATACCATGAAATAAAATGCATGACTGGTTTGTCTTGTAAATCCCAGGGTGGAGGAACATCTAGATTTAAAAGTTGTCCACGTGTAACTATTTCCGTGTAGGTAAGGATGGCAAGCCTTGGCAAACAGAAGGTAAGAACTAGTGTGTGTACGAGAAAGCGTGGAGACAGGAGCTTGGGTGCAATCTTTATAGGTAGGTAGCTTTATAGGTAGGCTTAGTGACTGAAATAAGCTTTTATTTGATGTGGTGAAATCCATTGGACCCTGTCAGCGGTTGAAGTTATTTCTTTAATTCACTTTTCATTGTTAATTGACAAGCAATGCCTGTATCATGTTTTCCATGATCACTAAGGTGGTACATGTGGCTGCCTTCCTCTTCTCTGTAAAATTTCCTCCGGAGTGAATTGTTTTCACAAGGTTTGTTTCCAGAGAGAACACCGGTTAGTCTTCATATTTCCAATTGGATTCCAAATATACTGGCATTTAGTAATTATCATAGGACCTTAATGCTTTAACAACTTCTACAATTCATGTGGCTTTGCATCCATTTGAGCAGCAGGAACATTGTGTTGTAGATGAGAAGAACACAGCAATTTGAGGGATCTTGCTGCAGAGGAAAGCTCACAACGTGCTGACCGTGTGGCTCCCCACAGCCCCAGCTGTGTGAGTGCATTCCTGGGCAGGTGCTGGATTAGCAGCTGCCACTGTGGCTTGGCGCGTGTGCAGGGTTTTGCCTCGTTGAGGGCAGGGTGCAAAACCAGTGTTGGTTCCTGTACAACTTCTTCAGTAGCAAAACATGAAGTGCTAGTTCTGGTGTCTGTACCTTAAAGGTCCTTTTGGGGATTTTTATTGATTGGAAAACAGTTATTTCTGCAGTTGTCATATACATGCATATATACTCTTTGTTTTCTTGTTGTGAAACGAAGTTTGTTCCTAGAGTTTCTCTTGGGTAAAATGCTACTAATGAGTAGTAAATAACACTTCTCTTCTTTAGGGTTTTAAATTTTCATTATTATTTTGTCCTGACATCCCTCTCTGGATGCAGCCAGGCACTGTCTACCTTACTAGTGTAAAAGATGTGTAAATGATGAACATTCTGCTGTGGCTGTCGCTCCTCCCTTCCATCTGTTCAAAAGACTCTGCACTGGAAAGCAGACACAAAGCCTGCCAGCAGCCTTCTTAAGGCATCCAATATCTTGTGAGGTGGATGAGTTTGTCCTTCCCTTGCTTGATGATTCCCTGTACCTTTATCTACAAGCTTGTTGACAATAATTGTAACTGCACACAACACACAAACATACAATGACAAAATGTTAGCACAGTTCAGCATTAAATAACTTACTGGTGTTTTTACAGAGCTCAAAAGGAGTTGATGCATCTTAGCTGACTGTCAATTTAAGCATTTCAGTATGTTAAACTAATGTTGATTATGTGCAAGTTAAATTTCTGGTAGGCTCAGCGCGTGCATGAGAGTAGGGGCAGTTGCTCACCTTTGCCCTGTACAAACAAGACTTGTGTGCAAAGCAAGAGGTAGTTAGTTGAAAGGTGAAAGTTCGGAAATGCTTCAGACTTATAGAACACTCAAACACAATTAGCAGTGCTTTACTGAAGGACCAGAATACAGGGTGTCATTGAATGAAGGGATATTTTCCTAGGAATTTAGTCACAGTATTGCTACTCCAGACACAAGAGGGTGAAGCAGGCTAATCTAGCAGCTTGCTTCTGCCAGAGGGGTCACCACTTTCTTGGATTTGCAGTTCTGGTCTCTGGGGTGACAAGCTCTGCTACTTGTGTGACGTGCTGGTGAGCAAAGTCCCCAGTGTGCTTTTGTGGCAGCCTGGGCTGATCTCCCTGGTGGCTGTGGAGGCTGAGCTTGGAGCTCTGTGTTCACTAGGACCTGCACCAACCTGTTCCAGTGCACTGGCCCAGCAGAAAGCTGTTTTTCTTCTCTTTGGTGCATGACTTTCTGCTGATTCAGCTTGCTGGAGTGGTTCTGTACAGAATCTGATGAATGTTGAAGCTGGCACAAAAGAGAGAGTGGGAACATGCGGCCAGAGGGAGGTAAGATTCTATGCCAGCCAGGAGTTAATTTGGCTTAGATTGCTGTGAAACTAGCTTCAGCTGTTTGAGATCTACTTGTGTGTGTTTCTTTTTTTTCTTTCATGAATTAGTGTTTGGATTTATTTTTGCTGGTTTAATAAGCTGAAGAAGCTTGCTGAAGCAGTAGACAAGGGTCAGCACTTATTTCAAAGCAGGGAATGACTACTTGGAAATGTTGCTGGATGAGGTGGGATCAGAACCATGTTTGTCCATGACAATCATCTTAGCTTAACCACATTGTATGATGGCCTGTTTACACCATTGCATGTCATGCCAACAGGTGAGCTCTATGAATTTGAGAAACCTTTTTTTGATTACCATATTCTGGAAAAACTGGAAGAAAACAGGAGCAGAACACTTAGAGAATCTGCTTAATAGGATGATTTTCTCTTTGAAAGAATGTTGGTTGTCTAGTTTTTATTTCTTTTCACTGTCCAAGTAATAAGGAAGAAAACAAGGTTATATTCGTTAAAAATGGAAAAGAATAAAAATAGCTACACAGATTAATGAAATAGAATTGCCTGGCCACCTGCGGGAGACTTTTTTTTTAACTACAATGTATATAAATAAAATAATGTGGTTGGATTTTCCCCCTTTTGTTGCATATTTGTACTGTATGCATTCTTGTTCTGGGATGTCGTGGAGTACACTGAATTTTAACAGTATTTTTTTAATTTAGAATATTAGTATTTTTTTTAGATAAAGTGCTGTGAATATTAAAAAACTAAAACCAAATAAACTTAAAATTTTCTTTTCCTTCAGGCTTACAGACTTTATCCAGTTTAACTTTGGACCCTAATCTGGTATACCTTCCTGTTTCGACTAGCTTTTTATTTTGTGTGTACATAGTACAATAAGTGGACTTCCAGGAAACTTTGTAGTGAGTCCAGTAAATCTTCGTTATGAAGTGCATTGGTTCATTTGCGTCTGTGCACAAAAGGCTTGCCACGTTAGGAGTGAGAGAGAATCTCGGTATTCTGGTGTTACCTGAAGTACATATGAAACTTAAATACATCTAGCATCTATGTCATTTCACTTTGAATTGTAATTAGTGTTCCTACAGAAAGAATAGTCTGTAATGGATGTAGCAGCTGTTGCCTTACTTGAAAAAAGAAAAAGTAGAATTGTTGAATATAGGAGTCAGTAATGAAATTTAAGTTCATAATGAGGAGCTATTGTGACTTCTAATTTAATGTGCAGTTAAAACTACAGATGGTTAATGTCTTTCTGTATTACTGACCTAATTTAATATTACTGTTTCTATGGCAAATGTTTGTCTGTGGTTTGCACTGCATAGTGGCTGTATGTTTTGCTATGTAGACTCATGTTGACATCTGATTATCTTTTTTCCCCTGTTTCTTCACACAACATGAAGTGTTTTCTGAAACTTTTTCAGCTCTACTGAGCAAATTTAGGTTATGGGTGAAATTATCTACTTTTGGTCACTTGAATGAATGTTTTGGTTTTCAGCTAAAACAAGATCCAGTTCACAGTTTGATCAATTTCTTACACTCCCACAGCTCCCACATCAGACTGGTGCTGACTTGTTTTGGAAACTGAGAACAATGAGCTATGTCAAATGTGACAAATTAAGGGTGAACATTGCCCTTATTAACATACTGAGAAATTATGGAGGTATGTTTGTGTAGTGTGGCTGAAATGCAGAGAACAATACTTTGCAGGCATCAGGGACTTTTTTCAGATAATAATTTGATACAATATTGTTTTAGTTGTTCCCAATTACTATTTAAGATGTATTCAGTCTTTAGGATAAAAGAAGTTCTGAGACTCATGAGATTCAGCCTGAAACTGAGTGATGATCTCCCTTAGGGTTCACTGGATCATAATATGAACAGCTTGACCATAACACTCCCTTGGGGTACTGTGACCCTGGGATAGAGAGAAAATCTGATAGGGAAAAGGTGGCCTAGGAGTTAGGTGCTGTATTACTACAAGCTTAACTAAACCTTACTTTTATGAACTGGAAAGATCTGCTTCTGCTTACAAAAGTCAGAATTGTTGAACTGGAAGCTTTGTGTGATTTGCTTTCTTGTGTCCTTCAGTGCTAATCTGGAAGTCCTTCCACTTTTCTGTAGTGAGAGTAATGATTTATTCTCATACTCAGAAGGGAAGAAGATAATGGAACAGATCAACTGTGTTAAGTGTGTAAAGTATACCTGTGATCTGCTAACCTGTCCATGTGCACACAAGAAGTCCTTAAAAAGAGGAGGAAGTTCTGAGAGTGTTTATTTAATCAGACGGTTCACAAGTTCAAGAGGTGGAAGGGTTGGTTGCCACCTGGATTAAGAGCTCTTAATTCTTTCTCTTCGGGTTTGGTCTCTTCTAGGTTTTGCAGTCCCAGTTCAGGCTCAAGGACTTCCATCTTTGTAATTGAGGCACCACCACAGAAAAGCACTTAGTTCTTAGTTTAAAGAACATTAATAGTGTAATTCTTCTGTAGTAATCTCATGCTAGGGCTAGTATGTTATGTCATGTAAGGACTACCTGATTAGGTTGTTTCTATAGCTCATCGAAGTTATTGTACTTGTTTCCACTAAATTTAATGGTCTGTAAATCTAGTTTGATGGGGTAAGCATAAGACAGTAAGTTTTTTTTTGTGAAGATAATGTATCCTGTATGTGGAAATCCATTATCTTAAAATTCCAGTGTACTGTCAGTGGCAAGAAAAAAAACTACTTGCAGTTTAGGCAAGAGTGTCAACTGAACCAAAATGGAGGCTGTCTTCTGAAGAAGCAACCCTTCTAAAAATAAATGCTACTCTAAGGAAAATAACTGAATAATTTGTGATAGTCAACAGGGTGTAGTGTTTTCCTAGCTAAGGGAACTATAGAATGACAAATAACAATGAAGAGTTATGTGATGGGGTGAACCTTCTTCACTTAGATTACAGCTGAAGAGAGGCACAAAAATGAATCATTGCTTAAGGAGTGATGAGATTATAGCTGAAGAGAACAACCCACTGAGTTATGATTGTCCAAAGACCATGCTATTTACTGCATGTTGTAATCAATCATTTCCTGTCAAGGTAACAAATAATAAAACAGGACTGTTGCATAATGAAATGGTATGGACAGCAAAGGGCAGAGTGAGTCACAGTGTCATTGCAAAAACCTGAGCAACTTGCCTAGTGGGAGGTGTCCCTGCCCATGGCAGGGGCTGGAGTTTTAAGGTCCTTTCCAATCCAAACTGTTCTGTGATTCTTAATTAGTTTTTACCACAGCTGTTTTTGTTTATCGATGAAACAGGCTTAGTATTTGTAAATAACATTGTTAATTATTAACTTTTGACTGTATAGCCTTGACTTAAAATCTGGAAACAATGGAGAGGTGGTGTTGACCTTATCTCTGTATGTGCAGTATGAATTCCTATTTTGAAAGTATTTAAAACCATCTGACTGACTTATTCCACTGATGCTTATTATTTCTAGTTAAATACAATGCTTTACATATAGTAGTGTGTAGTTGCTTTCTTGTTGGTTTTTTTTTTGTGACCTAAAGTAGTGGCAGAGTTGGCTGGAAGTGAGCTCTGAGGGTGGCCTAGTCCAGCCTCTGAACTGGTGCAGGAATCTTGCTGAGACAGGATCTATCCAGCAAGGCTTTCTTTAGCCATGTTGTAAAAAATACCCACCAAAAAGGATTTGCAGCCTCTCCAGGCAACCTGTTCCAGTGCTGCACTACCTCCTAGCAAAGGAATTTTTCCTCACATTCATCCCCAACCACCTAAGCTTCAGTTGTGATCGTTGCCCCTTGGTATATTGTCTGCTAACAGACAAAGCTTGCGTTTGCGAGCTTTGTTACTGCCCTTCAGGCAGTTGTGTGCTGCTGTTAGGTAACTCGTTCACCTCCTCTGTACTGAACTGAAAAATTTAGTCCCTTCAGTATTCTCACTGGGCAGTTCTATTTCACATATCCAGTATTTTAAACTGTACAAAACCACAGATGAAGCATCAGCTGAATTGCTAGCTGAAGTTTTTGCTCTTCTCTTGAAAAACAACATGTACCAAAGTTACTGAAGCATTCCAACTGTGGATTAGAGAAGTCAATATATCATCTGTTTGTCTGTGTTTTATGCTTGGCAATCATCCTTCTCAGTGAAGGACAAAAATAAGTTTTCAGGGCAAGTGTAGATTTAGTGGATGATGGCATGTAGCAGGACAACTTCATTTATTTTCCCAATGCTTTGTGAATTCTGAAAGACAGAGTATTTTATGGAATCAATATCCTTAAGTTGATTATCTGATTTAGTGCTGTGTTACACTGATTCAGGTAGAGCTGTGAATCAGCAGTTTTCTATGGGTTGGATATGTTATTCTAAAAGCATCAATTTGACACTTTTTGAGTTGAGATCTGAGGACATTTGAATAAGATTTAATGGAATTCTAAATAACATGCTTCAAACATGAACTTTATTGGCCTCTGTTTTTTTTCTTGCTTACAGAACAACAAGGAAAAAAAACTATTTTTGCTTCTTGTGGCTGTATGTGGCTGTGTTTGGGACCAGCCTGAAGGGCTGGATGACAGTAAAGCTTGAAATTATTTGCCCCATTGTCCAAACTGAAAGAAATACAAGGTATACTTCTATAATCTTTATGTCCATAGGGAAGTTATGATGTATCAGGCAAAAGGTTAATTTTGTTTATAAATCTATTTCCTACAACTTACAGTTGCCTATAAGTGTCTTCAAGAAAGTACGCAAGAAACCTCTACTGGAATTTAACTTTTGATACCAAGAAGGGTTCCTTCTCCTTTGCAACTGGTATCCTAGAAACTTATTGGAAGCTGCAAATGAAAATCCCTGTTAAACTAATTCCTTTTTGAAACTACTTACACTTCTGACCTTCAAATATTACATTGTAGTTAGGAACGCAACTTAATTATGCATTATTTAAAATCAGTTACTACCTGTTACATGCTGGATGATATTTTTACTGGATATTCATTAGTTCTTGGGTTGTGATGATGTGTCCCACAAGTATTTTGCTTTTTTTAATGTGGCTTTGAACACGGTGATTTATATTCCAAAAGCTGTAAGTAAATTTCAGGTGCATTGTTTCCTACAAAGGTATTTCTGATGCATTCTCCTCCTAGACAGGATACTGTACGCATGAAATAAGCTATTAGTGGTTGTTTTTTCTTCAGCTATAGCATTTTATTTCTATATGTAGGAGACAAGCTAAAATTAAAGGTAAATTGTTTTCTTGAGGTGATAGATTTATATTCATCGTGCACTCTGTCTTGCATTAAAACCCAAGCAGTCAGTATCACAGATCAACACATGAAAATTGATTCAGGTTGTGCACATCTGTGTTAAATCATTTACAAGAATTTTTGAGTGAACAGAGTGCTGTGGTGTTATTTATTATTAAAATATTGTTTGCTCATCCTGTGTGAGTGATGGGACATAAAAGCCTGGGAACAAACTCAGCATTTTGATAACTTTCACATAATAAATTGTTCCCTCAGTGTGTTGTGTTCGTTTTATGATTGTCTGCACTGTAAATCTGCAGTATAGAAACCAGTAGAAATGATGGGATTTGGGATCAAAGTAAAAGTTTTGGAAAAACTTGTCTTTTTACCTAGTACTTGGAAAATGGCAATATCAGGTGTCACTATTATCTCATGACAAGTACTGCAAGCTTTGTGATTTGTCAAAAGCTTGTCAAAATTTTGGGTTGATGGTTGGACTTGGTGATCTTGATGGTCTCTTCCAAGACCTTTCTAGAACCTTCTTGAAGGTCTAGATGATTCAAAGTATGTCTTGAAAAACACTCGGTGATCTCCAAACTGGAATGATGAAGCTCACCAGAGAATAGAATACTGGAGCGGAAGGTGTCTGCTGTAGTCCACCACCTCTTTGTTTAAGCAGGTCAAGACAATGCTTGGAGAAATGGTATTGATGGTGTGGTATTGCTGAGAGATGAGATGGAAGAATACTGGTGCAGACCTCATGTTTCCAGCAGTAGTAGGCATACTGTCAAGAGGACCAAGTGTATTTTTCTGCACTTACTCCATATGCGAAACTTTTTGTAGCTCACCAGCATCTACTCAGGGAATGGCATAGTAGCTGCTACTATGACTCTTAAACACACTTCATTTCTCCATTTGCTGTCCAGTTGCTGTTGGTAGATCCATCATTAGGAACACTTAGTTGAGGTATGTTGTTATGCTCTTGGCAACAGAGCGAAGTTGAGGTGCTTAGTAGTGTGGGTTGGATGCCTCTGCTAAATCCTCTGATGCCTTTGGTGTAGGCACAGGAGCAGGACAGGGAAAAGGGGAGGTCTTGGTGTGCTTGGGAATAGAGCTGTTTCTCCAAGCAAAAATTGGAATGATCACTGGCAGCTTTGGATTCCTGGGCGAAGTGACCTGTTTTTTTTTTCTGTGGTAAACACGGGAACCTTGTTTTCACCTTTTGTGGTTGCTGATGGCTTTGCCTTCTCATCAGTTGTTTAAAGATGCCTTATGGCTTTTGAAGCCTTTCATTGGACAGTAGAGAGGAACTGCTACATGTTACCTTGAGTGGCAATAGAATAAGAGTGGAATTTTTATTTAGAAGACTGAATACTATACTCGGTAACCTGATGTCAAGGCTAGAAGCTCCTATAAAGGACTACTTGTAATAGCCTTTCTTTCCTTTTGTGTTTTTTCTGAAAGACTGAAGGAGTAAGTACAGTTGCTAAACATTCTGAAAAACACATGAGAGGGCTCTGTGAAGTACTGTAACTTCTCAGAAGCTCAGAGACAGGTGCAGTCAACTCTTACCTGAAGTACCAAGGCCACTAGTGAAGAATGAAAGGTGTATGCCTGTAATATGAATGCTTATTTTTAAGAGATGGTTAAAATTGTGACTTACAGCTTTCATTTTGTTCACAAAGAGACACAGTATTTTTGTTATATTTGTGTATGTTCACATTTTGCAAACTGATTAATCCATGTTTTTTGGGTTTTTTTTAAACAAACAACACACCAGCCTGTGTTGTGAACCATGGTAACTTTCTGAGTACACGTTTCTTACAAAGTGGTGTGGAGGCTCTGCGCTCCAAGAGGGTTGCCTGCCCCTCCCATCCCAGTGGATGGTGTTCATTTCTTCTGACATGCTATTTCCTTCTTACCCCCCTCTTTCATTTCCTATATTCCCTCTTTACAAATTGTTTTCTACTGTTTTGGGCCCTGGGAAGATATCTAAATGTTCCCCACTGGTTAGGCAAGTGGGCCTGTGATAAGAAGGTAATAGTTGGAGCTCTTCAGCCTGGAGAAGACTCCAGGGAGACCTTATGGCAGCTTTCCAGTACCTGAAGGGGGCCTACAGGAAAGCTGGGGAGGAACTTTTTACAAGGGCACATAGTGAGAGGATGAGGTGAAATGGCATTAAACTGGAAAAGGGTAGATATTAGACTAGGTATCAGGAAGAAATTCTTTACTGCGAGGGTGGTGGAACAGTTGAACACCGTTGGTGGAACACTGGAACAGGTTGCCCAGTGAGGTGCTCCCTGCCAGGAAGCATTCAAGGCTGGGATGGATGGGGCTGTGAGCAACCTGGTCTATGGGAGGTATCCCTGCCTATAGCAGGGGATTGGAACTGCACAATCTTACTGGTCCCTTCCAACCCAAACCATTCTGTGCTTTTTCAGGTATTCCTGTTCTTTTCATAGTCACTGAGGACCTATGGGATTCCTACATAACCAACCCGGTGCTCCAGGGACAGAATTTCTGATGTACTCGCACTGTTTGAAGTGGGCTTCTATTTCAGCTTCCTATCTCTAATTGTTATCAGGCTCTAAATTAGAGTTGGGCAGATTGGTTTGCACATTCTCACTTTCCCATGGACCATGCTTGAGACAGAAGTCTTGGTCACTTGATCAAATTTCCTGCTCAGATGCAGGTTGTGAAATCGCAGTGCGTGGAATCCAGCTCTGTGCTATCTGAGAGCGTAGTGACTTCTTGGCAAGATGGTCCTTGAAGACCAAATGATATTTACTGATCCTTTAATCCTTGTGGTGAAGTGAAAGAGACCTTTTTGGGAATAATCTATTTTGTGGTATTTTCCAAAAAAAAAAAAAATCCATCCACGTGAGAAGCAATTGTCATACTTTCAGATAATCTTTAACTTCCATTTCACTGTTTGGACAGAAGCACCGATGTCAGTGGAAGAAAATGTTTGATTAATAGAATCATAGAATGGTTTGGGTTGGAAGGGACCTTTAAGATCATCTCGTACCAACCCCTCTGCTGTAGGCAGGGATACCTCCCATAGACCAGATTGCTCACAGCCCCATCCAGCCTGGCCTTGGATGCTTCCAGACGGGGCATCCCCAGCCTCACTGGGCAACCTGTTCCAGTGTCTTACCAGCCTCACAGTTTAAAAAAAAAAAAATTCCTCCTGATATCTACTCTAATTTCTGGACTAATTTCAAATGTACTTTTGTAGGAAATACTTGCCACAAAATAACAGGTTCAAGATTTTTCTCATTAGGTGTCTTTATTTGGAGTGGGTAAACAGTTTTAACAAGGAATTAAAAAGTATTTGATAAACATCTGAGTATTCCAGTAGTATCTTAAGGGAAGTGAATATTGTTACTTGCCTGGTGTAGTTGTCTTAGATTTTTTTTCTTTTATGATCGAGTCTGTTGCAATCTTTCATTGTAGCGTTGTTCTTTCTATGTCTTTTCACCCCCCCCCCATTCTTCAAATTCCTCCCCAAATATAGAGCTTTGCATTTCCTTCTGCTAACAATAATGCCTAAATTCCAGATTAATAAATTAAGGTTTTGGAAGCTGAGCTGTCAGCATTGCTGTCAGTGAGTACTCAGCAAAGATTTTTTTTTTTCTCTTAGTTTATTTTAAAGCTGAATTAGTTGCTGCTGCTACAGAAATGCTGCTACAGAAGTGGGAATATCTTTAGCTGATAGTGCTCAACAGCACCTTATTGTGAATTCATGTCTCACTCATATTAAATGAGACTTAACTTACAAGCGCGTAATGCATTAGATTATCCTGGAGAAATGGGTTGTTGAGGTTTGCCTCAAAAATGGAAACATTTTGAGTAAGCAAATTCAGAAAACTTTTAATTAGCCTTAAATGAGGGTGGGATTAGGGGAGGTTTGTTGGGTTTTGGAGGAAAGTGAAATTTGCTAAGTGTTTTGCATCCTAAAATAGATAATTTTACTATGTAGTATCAGTCCTTCACAAATGAAGTTTACATCTTTTCCAAGTTATAAAGAAAGATATGATTTCACAGAAGTTATGAACAATTAGCTGAAATATATACAAAGACTGCTTCTACGACACAAAGGGGTATGTTGTGTGGATAGGCACGCTCACCTGTCACATATTCAAAGCTTGTGGCTTCTGATGCTGGATGTGCTGGTCCACAAACCCCCAAGAAGAGAAATTACTCAATACCTTTAGATATTGGATGCAGTATATGGATGCTTATAGAATGTTCTGTTTATAGGGTGTAGAAACTAGGAATTTATTCACATGTCTGTCTGCATTGCACTTATTGCATGTTGTGTATCAGCACCTTATGACAGGCAGACCTGGTGTAAGACTGTGCTCTGTTGTCGTCTTGAGGACTAAACAGAACCTATGCAGGCATCATACGTCTATGGGAAGTAAATGGTAGTACCATCCTCTTGAAAGATAATTTCCTTTTATTGCTAATGGTAGCAACATCAGCAAAATATTTTTCAGAAATGTAAGCCTAATATATTTTCCGGTATTTTGTGGTTATAAATCTTGATCAAAAAGGTGAATCAATTTCTACTGTACTTTATGAAAGGATCAAGATTAGGTAGGAGGGTTCTTCATAGCTTCCACCATGATACTGAGGGTATGTAGATAGCTGTGTCTGCCTTAGTGCTGTGTACCTGAGGTACATCATCATTGCACTGGCCAGCTGTAACGTCATGTCTGAACTCGTGCTGATTTGTACCTTTGGAAGTTACTCTGCTCTTGAAAACAGAGCTTTGGAAATGTATTGTGAATTTCCTGATTAAAGTTTAGAAGGTAGAAGTGTTTTAACATATGCATCTGTTGCATATACTTGATTGCTCACATAGTTCTATTGTTCATGTCCTCAGCACAAGTAACCAGTGCTGAGCATGGTCAAGTTTCTTACAACATGAACAGCTTTGAGGAGCAGTGAGATCTTACGCAGTGTCTCTTTCCTTCTGTTTCTGTATCTGCCCCTCTCTTCTAGCTGGCATGCATGTTCACACCGGTGCACGCACAATTTTGCTGTTGCAATGCAGGCGTAACCTCCCACATAAACAAATAAGAAGCAAATGTAGCACTAGCAAATATGTACATCATTTTTTTGTTTATATACTGCGCAAGTGCACAAAAAGCTTTAAAGGTGACTGTAGCTTATTGATAATCTCTTTAGCAAGTTAAAAATATGGTCTTTGGATAATTAGAGGCTTTATTGCGGTCAGTAGGTCTCAAGGTTAAAGACTCACCTGGAGAGGTTCAGTGTATTCTTATGGCTGTGTTTGTTTGTTTTCCCCTCAGCCATTTATCAGTCCAGCATTATTTCCAAGAATAAACTGTGTGCTTACAAGACTCAGTTTGGTATTATAGTGCCACTGCCATTTCATTGCAGGGAGCAGTGGGGTATGTAATTCCTTTTTTCCCCAGTTTACTGCTCTGGAATTTAGTAGTGTACTGTAGAATTTAAAGCTGGTATAAAAACTGGCTGCCCTTACTATTGTAAACTTTGTGTCCTGCTTTTGTGGCCTTCTGGGGGAAGGGGAAAGCTATGCATCAAACTTAATGAGAAAAGTTTCTTCCATGTTTCTCATTAATTCCTCCTCATGCTTTCTGCCTCTTAAACAACTGATAAGGGACTCTGGTGTTACAATGCTAAAATATATAGATAAATACTTGGTCTTGCGGTTTTTATTGTATAGCTGCTTCTAATCAAATTGAATGAAATTCACAGATTCTATATAGTGGAATTAATTTGCATCGTTATGACTTCTTATCTGCAAGAAGTGCTAAAAGGAGCAGGAGCTGCCATGAGACACATCCTGCCGTAACAAAGTGGAAGACAGAAACATAGCAATGCTAGTGGCTGCTAAAGCTTATCTCGGTGCAAATAAAACAGCTAGCATGGAAGATTGTGCACAAAGGCAGATCTTTTTCCCCAGAAAATGTTTAGTTTTGTTTGATAGGGCCCCGGGTATAAGTACAATTTGAAATGGAGATTTGGGGCTCTTTTGATCTAATGTGTTTGTCTAAGGGGGACTGTTGCAACATTTATCTATGACTAACTGCATAGTAGTCAAGACTATGAAAATTATGTTGCTAATATAAAGGTAGTATTTATCACATTTTTTTCACTGGCAACAAGGTTGCTTAAGTGCCCACTGCTCCTGTTGTGTAGTTCAAACAGAGGCTAGACATTGCTGCAGAAGAGTTGTTAGAAACATCTCCTACTTCTGTCCTTTATGAAATTACTGTGATGCCAACATGGGCCAAAACCAAGAGCAACACAAGTGGGCTTGCTGTAATGGTAGCCATCTCCAGGAAGAGGCTTCCATGTCCTGCCCACTATGGTAGATGCTCTACTCAAGCCATGCTAAGGATAAAGAATATAGAATTTCCTCGGAGTGGAAGTAGTACGTCCCACCCTTTGTCCTTCAGCTAATTCAGCTTTGTAAAAGCAGGTAGAGCTGGGGGGAGGGATTAAGAGTAGGAGGTTGTAACTCAAGAGGTAACTGTGTTGTAAGCTCCCCACTCTCTGCAGGTTTGAAGCAGCAGAACGTCTGTCAACTTTCCACTCCTTTTTGAACAGCATTTCATGTTTATACTTAAATTTTTTTCTAATGAGAGCACACTCCTCAGTTGAAGCCACTCTTAGCAACAGGATAGCTTGGAGAATCTTGCAAAATAAACAGAGAAAAAGCGTCTCTCCTTGGTGAAATTCTTTTCCCTTTCCTTTGCTTGTCTTCCAAAAGCAAGAGAACATGGCTTAAAAGCCATGTTTGTCTGATTTGGTGGTCTTTTTGGCAAGAACTTAAGCTATTCTGGGTTTACCGAAGAACTGAAATAAAGTGCTGTCGCTTATTTTTATCCTGATCATGTTTATATTTTCTTTGGGAATAAAAACCAAGAGGATAACTTCCCCATTTTTGAAAGCTAAGGAAGCTGCCAGTTAAAGAAATCTGTCCCTTTCTAAAAGCTACTGGAATATGATATTTGTCTGCTGCTGAAAGAAGGTGTAATATGTCCATGGAATATCTGCAGCATGATTTTGCATATAAACACTACATTTTGCTGAGCAGCTGTGGTACCAAAGCACACCTTTGTGTCCCAGTGTCTTCCTTGATCCTTCTGTGTTTAAAATTTGGCAGTGGTCTTCCCAACCTCAGCCAGGAGTCCCTGACTTCTTTCTGCCTCATCTGCTCCACCTGCCAGCTCCTTGACATTTTGTGCTGCATCCTACTGCTGAACAAGGATAATGCACTCATCCCATGCAGGCTGTATTTGTTTAAGGGCAGCAAAGGTTTAGGAATTCCTGGCACATTTGGCTGTAACCCCACACACAGTAAGGAATTGCATTACTTAAACAGCGTAAGGAAAGTAGAATATAATACAAGCACCTCATCTGTCCAAGTTTATTTTTGGAAGGTAACATCTGTCACTGGAAGTGGATTTGTTTTGCAAATAAATTTCCTATATGTGCGTGTGGACTACCCTACTAACTTTATGCTAGCCCAGTTTGCGTTCAGTGTTTGCTGTAATCTGATGTGTGGCTTTTACTTTGAGTTTAGAATTGAAGGGCATACACTGTCAAGCTAGAAAGGCATTGTATCCTCTAGTGTTTTATAGCAGTTTATTTCTTTGATGTGGAGGAAAATCCACTGTGCAAGTTTTGATTTTTGGATCTTTGTCACTAATTGCTTACTTCTGATGGAGAAAATTATAGAGGTTTCAGTTGAAATAACATACAGAATTAATAGGGAGGCAACTGTGGGTGTGCAGTTTGGGTTCTGTGTGTGTTTATATGTAATATATACCTGTGTGTATGAATATGTCTCTAACATGCAACATACGTGAAGATTTGTGTGTTTATTCTGTGTATGCATGTCCTAATGGTGTATGGCATTATTTGATTTGGTGCTTGTATATAATACCAACACAGCATCTAGAATAGCAAAGTTTAGGTACTGAATTGAAAGTCAACTCTTTGAGTCTCCTGTTACACATGATATTTCAAAAAAAGAAACAAAATATTAAATTCGAAGTAACTATAAGTGTGTATAGATCTTATTTTCTTCTATGAAGAACTAACTAAATGCTTCTGAGATTGTTTCTCTTTATTCTTATTAGTAAGGTCAGTTGTACATGTGAATGATGTTCTTTCTCTAAATTCAACTGTAAACAAAATGCGTAAAAGCAACAGTAATGCTTCCCGTTTCAGTGTGGGAAGGAGAGGAAAGAGAATTGCAGTGATTTCCTGATCTATCAGGCTTATAGTGGTGTGCTGTGGTGGATCTGCTGCTGAGATGTGGGCTGAGTGGGAGAGCCTGCAGACCCTGTGTTCACATCTCCTGTGACTCCCTTGCTTCCTTCTCACCGGTACACCTACTGCATCTGATTAGAAGTAGGAACGTTTCCCTTGAATTCTCTTGGACTGTGGCTGCGTAAATAGCAGGGAACACTCCTAACAAGCACCAGATGGCAAGCAGATTTCAGTGGGAAGTGCTGACTGCTTGTTGTTGTTTGGTTTTTTTTAATTTTTTTGCATACTCACAGATAAGGAAGTTGCATGAACAAATAACGAAGATGGAAAGAGCTTTTCTGTGTGTCTTTGAACTGCTGCTGTAACTCCGGTTTGAGCTATTGCATGCTGTTTCTAGCTAAGAGAGTAGTATGCGGTGTGATGAAATGGAGAGTGCTGTGAGTCAGAAACACAATAAATTATGTACTGTATGGCTATGACAGCTCAATAGGAGCACTTGTGGGTGGAAAAAGCATTAGATATTTCTTAGAGCACTACTGACATGATTTTTTTTTTTCCATTTTAATCAAAACTTAATCACATGAGTGCATAAAACTTTGTAGGGGAAAATATTCCTCCTGTACGTGAGATAAAGCTATACAAACAAACATGCTAATAAAAGAAAAATATAGCTCAGTGTAGAGCTTTATGGCTCAAAATATAGCTTGTATGTTATTTTTTTTTTCTAGGAAGACTCTTATTCTTCTGTATAAAGAAGTATTTCAATAAACTGTTTACTAATGGGGAAAGCAGCTTTTGAGTAGTCACGCAGAATCAGAAGCAAAGTCACCATGGCCAGAGTAGGTGCATGTAGGTGTAAGAATATCCTTCCAGTGGTACAGTAGGTATTTTTGGTACAAATGATTAAACAAACATCTCTTTAATTTGAGAATATATGTATTTTAGGAGGACACAAATCTAATTTTCTCTTTCAGGTAGGCCAAAATCTTTTGGTAAGAGGTATTTTGGACTTTATAAGCACATAACTTATAGTGCATGAATGATAGGTGTTTATAATGTTTATTTGATACATCTTACCCTTGGGAGTGTTTTATATTTTCTTTGTATATTAGAGCCTTCAGAAATCAATCAAAACAAAGAAATGTATCTAGGACTGATAAATTGTTTGGAGGAAGATGTTTATGTGAGTTTGTGCGATTGTACTGTATAGACTTTTATTGCCAGTCCATCTCATTAACGCAAATAAGCCACTCAACGTACTCACTGAATGAACAAAACCCTTTCTGAAAGCACAGAAAGGTTCGGTATGTAGAACTTCCAGAAGTGAAAGAGTTAATGACGGGCTGCACTGCATTCAGTGTATTTGCAGATGTTGCTGCAACCAGCTGCTGATTTTTCTCCCATCCTGTTAGGGAATTCTGCCAGCTGTGATTCATGGAATGATTTTTTTGCGCTGAGTAATCTGTGGTTTTTCTTTTTTCCTCTTCTCCCTCCCTTATTTTTACCGTAAACTAAAATCCTATTCATTTTAGCTAAAGGGAGGGAAGGCTTCTAAAGCACTTATGTAAAACATTAAGTGCGCTCTGTTTTGGATAGAGGAATTTTAGCAAACATTAAATTTGCCGTGATTTTACTTTCTCTCCAACTGAATAGACCAGTTTAGAGAAAGTTTTATGACAGAACCAGCTTTTGTTTTTTGCTAGTCATATGGTGTGACAGTTCTTGTAAGACTTTTGTGCTTGTACTGCTAAAGAACATCCAAGTTTTGTGCTGATACTGTGCCTCCTTTCTCACAG
Seq C2 exon
ATCGCTCTGAAAGAAATAAACCAGACTGCCGCTCTTCAGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000010081:ENSGALT00000016385:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NA
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]