GgaINT0077518 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000015597 | CPZ
Description
NA
Coordinates
chr4:84149795-84163734:+
Coord C1 exon
chr4:84149795-84149886
Coord A exon
chr4:84149887-84163348
Coord C2 exon
chr4:84163349-84163734
Length
13462 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACCACCCTA
5' ss Score
-31.91
3' ss Seq
CCATTTTTCTTATGTTCCCTTTT
3' ss Score
-7.2
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCCTGCTGCTCCTCCTCACCGGGCTGTTTAGGGCCACAGAGCCAGCACCCCGCTGTGAAACCGGCCAGGAGACCCTAGGTAAGGCTAACC
Seq A exon
ACCCTAAAAGCCCCTTTTCCCCTTTTTCCTTCTCCTGGAGATGAGCAGAGAAAAGGGCTCTGATCTCAGGGCATGGGAGGTCGATGTCACCCCCTCCTAGAGATGGGGAAATGGGCTCTTCGGGAGTCTGCAGATATCTCTGTGATGAAACTGGAGCTGGCTGAGAAAGCATGGATAGAAATTAAAAAAACAAGCTTGTGAAGTCAGGCAATGTAATGTTTCCCCACCACTATCTTTTTAGGGCCATGTGCAGATGTGTTTTTCTGTCAATTTTGAGTTCCCAGTCAGTAGGATCCCCTTTGGCATCTGGGGAATGCCGTGGGCTCTCCCCATCTATGGCCTTGCCTTCTAGGAATCCGGCAGTCAGATTGCATGAAGGTGAACTTTCGACCTTGTGTGTTTTTCTGCTTAATAAAATCTCCTTACGTTCAGCTTTAGGTCACTTTTTTTTCTCTTTTCTAAGTCCAAAGTATGAGAAGAATTATTAGGATGTGAGAGCTGGAGGGTGTGTCGTAGTTTGCTATAAGCAATATGGAATTTGTGTGCATTGATTGGCTGGAAGGACAGATTTGCTCATTAGAATAAAGGTAAGACAGGAACATGCTGCTGAATGGGTTGAAAGCTCTTGGTTCAGTAACTAGTTGACTAATAAATAAAATGTTGAGCGTCTTTTAAAAATATGTGGTGGCTTTTCTTTACCAAATGGACTTCGTTTAGATTTCTTTTATGTGGGGACGCCGGGGAGGTGAATGCAGAGCAATTCCAATGTAGTGACAAGCTCTAGTCTAGGAAAACAGTAAAGGAGAGGAAAACTGCTTTCAGAGAGCTCAAATTCAAAATGATTCAGAGCTATTTTACAAGAATACAGGAAAGGATAAAAAACCTGCAAGTGACCTTATCGTTACCCAAGGAAGTACAGCTATATTTTGGTTCTTAAATATAAGCCATAGTCTGTCAGTGACATTGAACTGCTACACAGCACAACCCGTGTGCCATGCAGTGTGTATAATTTGAGAGTGCTGTTCCCACGAACATCAAAGTGAGGTCTACCACAGCCTGAAGGGATTTTATTTTTGGATAAAGCTGCACAAAGAGAAATGTTGTAGACTATTTGCAGCCAATTACAGGAAGAGGCTGTGTGGTTTGCAGCATACCCATTCTCAGAGAGCTCTGGTTCTGCTCCAGCTGATCAAAGATGTGCTGTGAGGTGTTATTAATCCTGGCAACCATAAAAGCAGGGATAATTGAGGGGTAATTGTGGCAGGATCTGTTTGCAGTTGTGCTGTCTTTAGGGGAGGGCAGGTGGTAGAAATACACCTTGCATGTGGAAGGACTGGAAAATGGCCCTAAAGGATGACTGATGGCAGGGAAAGTGGGCTGTGGGCATTAAAATATGGTGTGCAGTGTGAGAATGGGGTACACTTAGCAGTAACCATTCTTGGACCAGGAATTAAGAGGCAACCTGAGCATCCAGAGACCTGCCAGGTTTCTTATTCCTTTTCTAAGGAACTAACATCATGTCAGGCAACATGAAAACAGAGGAAACTGCAGTGCTGAACACATTCATGTTCAATATCCAGCAAGGTTATGCCTTCAGCTGTAGTGCTGGGATTTTCTCTCTTCTTTTAGGATCCCTCACACCAACTGCAGATTTTGGCAGAACTCAATGGCCAGAGCCACAGTGCCCTGAGCTGCTGATGTAGGAGAGGAAGCCAGGGGAGCCAATATTGCTGCCTGGTTCTCAGCAAGGCTAGGGCTAGGTTTGGAGGATTCTCAGTAATGTTTATTCTTCTGCAACTCATTTTTTCTTTTCCAATAAGAAATCAAAACAAAGCTAAAAGTAAAAAGATCCTGATGAAATGCGGTGTGCCCTTGTGTTTAGTAAAATAAGGAGATGATTACTGACATCCTACACCAGGGCTGTCACCAACGTATGGCACAAGCATCAGCATCAGGCAGTGTGGGGAGCTTCCTGAGAAGCAGCTGAGAACCATGACATGGATTGAGGGCAGATTCATTCTCAGCTGTGTGCCATCACCACAAGGAGTCAGGAAGCCACTGCCTCTCTGAGCAATAGGGTGCTCTATGGCCCTGTTGAGAGACATCTCTTCCAGACTTTGATGTTTCACTTGCCATTGAGCTTGCAGTTTGGTTAAGCAAAGTACAGCTTGGCAAGTCGTCCTGAAAGGTAACCAGCCTTTGGTAGAGGGAGCTAATGGCGTAGGTTTCTGTTTTATCTGAGCACCATGCACTGAATACTGGTGTGTTCTGGTGGTAATGAGTTAAATGCAGCCTTGTGAGCAAAAAAAATAAAATAAAATAAATAAAAACAAGCAGCAGGCTGGAGTCACATGCCTCAAAGCACTGAAAGCAGCTGGCTTCCCTCACAGGGACAGGGACAGCTGGGAACAGGCCCCACGCTGAGGCCGGGTGTCGTGGGCTGCCGCCTGTGGGGCCTCTTTGTTGGCTCCAGGTGCAGCCTTCTGGGCAGGCAACGGGGCTGGGGGCTTTGGAAGAGAAAGGAGGTGCCTGCGCAGCTGGGTTTCAGCTCCCTGGCTGAAAGGTATTGTAGAATCATAGAATCACAAGGTTGGAAAGGACTTACAGGAGCATCTAGCCCAACCGTCCTCCCATCACCATTACTACCACAGCTACTAAACCTTATCTCATAGCTCCTCATCCAGACACCTCTTGAACACTGCCAGGGTTGCTTATAGATGAAGTTAGCCCACTGGATGTTGCTTGTGAGGACTGGAGCTGTTGTACCTGGTTGTTTCTCATCTGCTCCCAGCCTCTTCAGGAAGGTTCCTGATCCTAACCACTGGGATTGGAAGGTAGATCCTGTCTATGACCTTGAGTAAGAGTGATTGTTTTGTAGACATTCAGACTGAAAAAAAAGCTTTGCATGAAGCACTATGCTTTTCTCCTCCCCCTCTCCATCATTCTCATAGTTTGCTTTGCTTTACTGCTAAGTGACAAAGGGAGAAGTTATTGCATTTCACAAGCTTCAGGCTGGCCCTAGCTTTGTGAGGCCTGTGTTTAGTGTGTTCAGAGTGTTTTAGTTCAGCTGCTGTGCACATTTCTACTGCTTGTTTCCATGCCTGTGCGTGCACGTGAGGCAGAGCTTCTCCAGCTGCTCTCCATGGGACTGTACAGTTCCTTCTGCATTTCTTGTCCCGCAATGGGCAGGACCAGACCAGAAATGTGGCCATGGAACACGTGTGGGAGATCCCAAGGTCTTGGAGTCTCACTGTTGTGCCCAAAGTGGACGTGTCCAAGTCTTGTCAAAACAAAGGAATGCAGAACTACATCATGCATGCTCACAAGACAAGAAATTCCAGCTCTCGTAAACTTGGTTTTCATCACCAAGTCATGTGAGCTGTTTGGATTCCCACCAGTGGCTCTAGTATTTTTACACAATTATTATTTCTGCAACAATGGTTTTGGCAACATTTAACATGGGAAGTGGGTCAGAAATTGCCACTTATGAAGATGAAGTGAGTATACATTGAAAGTATACTTTGTGTGTATATTCTTTTACTGCTGAAACGACTTATGTATGATTTTAATCTGAATGCAAAGTTTTCTTCAGAATACTTGTTTATGTATTTTTAAAGTGTCTAAATACAAGTCAAAAGCCAAACAAAAATGTTCATTGCCATAAGATGTATCGCGGCTGTTAGACTCAGTAGCACTGATGATTGGTCTCCTTTAGAGTTTCTTGACACAGCCTTTCCCAGCACACAGTTAATTTGGGGTTGAATGGAGTGCCAGCTGGCTAACAGCAACCATGATTCCCTGTGGATGGCCCAGGCCATGTGAGAGCCATCCCATTCTCAAATCTGAAGTAAATACTACGTACGTTCTGTGAGTTCCTCTGAATCAGGAGAGGCTGTGTGCAGATGTGAGAGGAAGTCACCTGCCTTCTTGTGAACATGGTGCTTGATGCTGACAGGCTGCATCCTGGTCTATTTGCAGGGCTTCTCCTCACGATTTCTCTGACTGCTAAATCTTATTTGGACAAAGAACATTCTAGTTGGATGTAGATGTCACATCAGTGAAATTTAGTAACTTAAGGTTGTTCTGCCCATGAAATTTCAGTCCATTTGTTTATCCTATTGTAGTTCCATTGATTTAATTGGCGCTATTTCAGTTTTACAGGGTTATAAGAGGACAACCAATTTGGAAGACAATATGAGGCTAAACCATGGATTTAGAAATCCCAATGCTATTACGATTTTGGTCAAGAATGTTGAATTAACTATCCATCTTTTGTAGCATTAGAAAGTACCACATTTGGCTGAAGCTCAAATACTTGCAGAGGAGCCAGGTGTGATGTTAATTACAATGTCCCATGCATCTAAACTAATAAAGAGATGAGGCAGTTATAGACTGTGGTTAAAGAGGGTGAAATGACATCTTGGCAAATGCTTTGGAAAGATAAATTGAGGTTTTTATCTTGAGTTTTATCAGATGCGAGGCTCTGTCCTGCAGTATTCAACAGAGCTGAACTTACTGAAAGGTAAGCCTCTGACTCTGGTAGATCAAAGCACTGAGAGAGTACTGTATCATTAGAAAGTGGGAACTGAGCTTTAGAGAAAATACATTCACAAAGTAAAGCTATGGAGATGTCATGGATCCGCATTACCAGCCTAGTAGCTGGTTTCACCTTTCTCCAGTCACTCTGATGATAATTTGATCCCTTAGAAGGTAGTAGATTTCCTGACCTCTTCAACCTTCTCACCTTATCAGTTGTTTTTACACCAGCATCTTCCAGATCCGAACAGTTTCCTCCAACTTTCACTAGCCATACACAGAGAAACAGTCCCTATATATGGTCAGATAATCTTGGAACAGCAAGTGCATGTTCAGCATCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTTTCTTGTGTTTTCTTTTCCCAGCTGTAGATTTTGCCTTGCAACAAGGAAAACATCTCAGCTGAGGCCAAAAGAAGGTATTTAGCAGGTTTTCTTCTGGGGTTATTTTTCTGCTTAGGATTTTCAGCTCGGAGGACTCTCTGGAGATGCAGCTGGGATGGCATATGAAATTCGATTGCCAGAAGCACAGAGACAGTCCGTGGGGTTGGTCAGCCAGCCAGCAGCTAGCTATAATAATAATCCTCCTCAGCTTGTTTAAGTCTCCTAAAATCAAAGCCTTCATCAGGACAACTCCTGAGGTTGATTTTGAGTTGTTGCTGAGTGGCAAGTCTCTGTATGCATCTTCACAGATTTTGTGTGATGGTCTGCAGATTGTATGAGCTCCCATCTCCCGTGGGAAACCTTTGGCATCATGTCACACATCCTAGCCCTATGAGGGAAGCAGGCCTGGAGAAGCTAGTTGCAGCGTCATTGCTGTATGGACACCCCCAATAGCTCAATAAAAACGGTTGCTTAACTGAACTCTAAGAAGCAGGTGGATTAGAAGGGAGGTGGGTTAATTACAAACATTGGCTTGACTTTTCCTGCTGTGATCTTTTACATTCAAAGTGAATGCAGATTAGTCATTAATCTCGTTCAAGTACTTTCAGGCTTGTTCATGTGGGGGTTGAAAATAGGCTTGTATCACCTCACACTCACTGAGATCCTAGGAAGCATGTCTGCCCATTTCTCCCTGGGACTCCCTCTGAGCCAGAGGAGTTGGCTTTGAATTTTAGTTAATTTGCATTTGCCGGTAGAGGTAATGCACTGGATGTGTTTGAATGCAAACTAGACAATTTGAGGAAGCAAGTAAGGAAAAGGGCTAGTATTTTCACACAGTTTTTCTCAGACAGCATCCAGATATTAGCTTAGATGCACCATTTTGTAGAAATGCAGGTGCATTGATTGACTAGAAAGACAGCACTTACAAAATGGGCAAAGAAAGACGAGTAAAGAAAGAGTGATCTTATCTGTCTGCCTGCTTATTTAAGGGGAACTAATGAATTTCAGTCTCCTGAACTGTCTACCTAGGCATTTGTGACACACTGTCAATGATATCTGACTACGATTCAGGGAGTTCACATGATGCAGAGCAAGCATTACAGGCCTGGTATTCTCCTTCCTCAATACAGCTCAACCCTCTCCATCTTAAATCCTAATGCTGCTGGGTTCGGTTTAGCGCTCCCTAGGGGCCGCCTCAGGTACATCACAGAATCGTCATCAGATTCGAGTTGGAAGGGACCTTTGAAGGTCATCTAGTCCAATTTCCCTGCAGTGAACAGAGACACCCACAGCTCAGTCAACTTGCTCAGAGCCTGGTCCAGCCTGACCTTGAATGTCTCCAAGGACAGGGCATCTTGCCACATCTGGACAATCTGTTCTAGTGCCTCCCCACCCTTATTTCCAATCTAAGTCTCCCCTCTTTTTGTTTGAAACCGTTTCTCCTTGTCTTGTCAGAACAGATCATGATAAGGAGTCTGTCCTGTTCTTTCTTATAGCCCCCCCTTAGATACTGAAAGGAGCAAATACATCTCTCCCCTGGGGAAATTACAGTAATTGCTGGAGTGGAAGATAAATGTTAGGAACAAAGTCGTCCCCACACAAAGGCTCTGATGTATCCAGAAAAAGGAATTAACCACGTGGGCTGCTTTTTTTCTTCCAACTCCTTCAGTTTTCCTGGAAATCCTTTTTTGTGGCTTGGGATCTTCACTTTTGCTCCTGTACATGAGCCTTAGATATGCAGTTACATTCCTTCTGTGCTTTCTGCTTGACCATTTACACCCTAGCCGTGCTATTCAGCTGCCTCATTTCACTGCCATTAGTTTAGTTCTCCAAAGTATCCTCCACCCATTCATACCTTACTGTGTTTCCTGCTTTTTCTTTTTGCTGTAGCCAGGAGTGAGCTCTGGAGGTCGTCAGTCCTTTGCTGTTAGCAGGTGGTATTGCAAAATGATACAGCCCAGCAGTGTTTGCATGTTACCACTGATATTAAGTTTTGCATCTTTAGTGTTAAAAGGTAGTTAAAAGGTAATCATTGCAAGGATTGACTCAATCAGCCATGTAAAAGCACAGAGAAAGCAATTCTAACATGATCTGAAATTGAAATACTCTATTTGGAAAAGGAGAATTTTGACTATAAACAGGCTAAAATGAATACATATGTCTTCCTATTTATAATAGTAAGAAACCCAGAAAAGTGGTAGTGGGTGTGCAGCTCTGTACAAAATAAATCATGTAATCTTGTTCAGTCTGTCAGTCATTACAATGCAGTTGTGTAAGCCTTACTGAATGATTTAGATATTTTGAATTTATGCTCACCCTTGGGCTTATTCCTCTAGTGCCTAAGTCTCCTATTGGCTTTGCTTTTGAAAAGGCAACCGGCCAAGCCATGGCACTGGAGGTAGCTATTGAGATCTATTGTCTGTGTTAGGGTTAATCACAGCAGCTTGCTGCTTTCAGTGCTGAATCATCAAGGGGAAAAAATGTAATCTTGGCAGTAAAATATGTATGTGCTGCATTGTAGATTTTCAAGCTTGCTTTTGCAAATTAAAACCAGAAGTGTATGTTGTAGAGAGGGCTCAGAAAGCTTGAAATGGCTTTTCTGCTCTTCAGTAAGTGACTTTATCCATAATCTTAAATAGCAACCGTGCTACTGAGAAGGTTTTTATACCTCTGGTGGAAAAGCTAAAGCAGAAAAATGGTCATAAAAAATTGAAAAGACTGTTCTGAATCAGGAAGAAAAAGGTCTCTTTGTAGCAACCTGTCCACAAATGGGACTATGAGGAGGCTGCACTGTCTTCCTCTGAGCCCAGGAAAGGTTCTGCTCAAAGAACGGAAAAGCATTAGGCTTTCTCAAGCACACAGGAATCAGCAACTGAAGTCTGCCAAGTTAATTTGGAGGCCTGAGAAAATATCTGTATATTATTGTCTTTTGTTACTCACAAGAAAAAGAGAAAGGGGGAGGCTGAGCTCTTCTGGCTGGCACTGCTGAAGCAAGCTGTAATAGATTTATTTGCCGGTCATTTCTGTGCACGGGGACACGGAGCTCATGGGTGCTGGGCTGCAGGAGGGAGTGTGCAGTTCTAGGGTTGGCCTCTGGAGACAGTCAGGAGGCTGTGACCCGGCTACGTGCATCCACACTTCTTTGTATAAGTACAGGCACTGGAGAATTATCTTTGGCCCTTGCAGAGCCACACCCTCCCAAACAGATGTAAGCATTGGCATTAGGAAACGTAGGAAATGTCCAAACACCACATCAGCATACATACACATTTAAAACTTGCTTTATACCAGACCTTTTCTCTCTTGTTTGTATGTATAGTAACTCCTAATAACCTGGAAGATCAGGCTGCTCACCTGCGTGTGTTTACATGACAGAGCCTTGGCTGATGTATGGTTCGCATGGCAGCTTGTATGGGGCTGTGGTGGACAGAAGAGCCATAGGCTGGGTAGAGCTGGCCTCTGAGATGACAGAAGCTGCACAGATGTCTCTGGCAGAGGGAGACAGGGAGAAAACATTGTGGTATAGTGCACATACATGGTGCTTAAGGTTGGAAAAGACTACAAAGATCATCTAGTGCAGTCATCAACCCACCCCCACCATGCCAACTAACCATGTCACTCAGTGCCACATCTCCATGTTTCTTGAACACCTCCAGGGATGGTGACTCCATCACCTCTCTGGGCAGCCTGTTACAATACCTCACTACTCTTATGAGAAGTTTCTCCTAACATCCAACCTGAATATCCGCTGGTGCAACTTAAAGCTATTACTTCTCATGCTGTTACTAGTTACCTGGGAAAAGAGGTAATGCCTGACCTGCACCTTGATATAACCTCCTTTCAGGTAGCTGTAAAGAGTGATAAGGTCTCTCCTGAGCATCCTCATCTTCTAGATCTAAGTTTAAGCTTAGTTCTAGGTTTAGGACCTAGGAGGAAAGAGTCAGTTTTGCTGCTTGTCAGTGATTGAGACTTGATAGTTTCAAGCTTGCAGGCCTAAAGTAGTGGGAAGCAGAATTTAAGCATGGATTTATCATAAGAAGCTTCATCTTTTATTGAAGAATTTCCCCTGCTTATCACATTCTGATATTAACAGCTTCACTTGCCACAGGTAAGGTACGCATTTACATGGATTTGGTTTCCTCATCTGAAAACTAAATTTATATTCTTCAATCAGTGTTTTTAATAATGGATAATAGCCATATTACTTTATAGATTTCCCCTCTGTATAAATATGGTAAAAACAACCAAGTGTAGAAACTAAATAGTAGACAACCTGAAACCAGAGCAATCTTTGTCTCTCCTGTATTAATGTCTATTCCTGCTCACAAAAAGATTCAGACCTCTCATGAACCCAGCTGCAGGATATGACTTAGCAGAGTTTAACACATCTGTTCCATCAGATATCCAGTCCTTTGCAGCACCTTTCTCTCTGGCCAGCTGGGCAGAATGCAGCATCTGCTAAAAGCAGTAAGGCTGCTTGGAGAGCAAGAGCTGGGGTAAGCAGAAGCAGCACCATGCCCAGACCCTGCCTGGCTGCATTTTCCTTTTGGTTTCCTCTACTTATTCCATCTTGTTGCCAGAATACCTTTCTGCTCCAGCTGAATAAGCACAATATTGGGATACCATTGAAAATATGTTTGTGCCACGTATGAAACTGACTGATGGGTATAGCACTCCTGCACAGTAATAGTGGTATGGAAAACTCTGTATGACTCAGTATCATTATTTGATCATCATACATCAGAGAGACAAACAAAAGGACATTTGTGGCAGGTCACAAAGCCTTCCAAGAGGGAAAGGGTGTTACTTTTGAGGAAATGTGAGGAGCCGTAGAAAGACCGTTCCTACTCCCCAGATGAATCTGTGAAGAACCACACTCAGTGAACACAATCTTCCAGTTTATAACAAGATCAGCTACAGTGCAGTCATTTCTTAGCCACCCTTCAATGTAGTGAAGGTTATTAATTTCACTGAGGAACATGAGTTGGTAAGCACGGTGATGATGAGTTGATGGTTTGACTTGGTGATCTTAGAGATGTTTTCCAACCTTAATGATTCTATGATTCTGAGTGGTCATTCCTTTCTCCTTCCCTTGTAGCATTATACAAAAAGCTCTTCTCTGATTATCCCCATGTGTAAGATTAAATGTAGGACCTCGCTGAGCTGAGGCTTTTTTAGGCGTGCCTTAACCTTAGTAAGGGATCATGCCAAAGTAGGGGAAGCATATTGAAATCCTATGACAGACAGCACTATTGATGAACCAGGTATTGTGTATTGCTCTAGCATAATGAACCAAGCCAGGAAAAGTGTTTTTATGGATAAAATTTATTCCAGCTTGCTAGTTACTAGAATTTGTTGTTGTTGGAGATGGGCTGTTTCTGCTTGGTCTGATCCCTCATTTATTTTATGAGGAAATGTGGATCAACGACAGTTCATAATATAGAACTAGACTCATTTCCAATTAAAAGTCTGCCTCCAACATAAAATTCCAGGCTTAATTTTGTTCTTGTTAGAATGATTTTATTTTGGCTAAGGAGTGATCAACTGATTAGCAACACGTATGCACATGGTTACATTTAAACATTTGCTGGACGGAGAGGTTTAAACTTCCCTTAGCAAGAAAATAGAAAACAAAGCTCAATTCACTGAGCAAAAAGCTAGGTGTCTATATTCAAAGTGACAGACAGAACAAATAGCAACATAGATTCCCCAGGATATTACAAGACCCTTCAGTGTTGGAAAAGCTCAGACATAATGGCTTGGCTTCTATGAGGCACTGATGAAAACAACTTTAGTAGCAGTTATTTTTCTTTAGTTGCCAGAAACAGAGAAGGACAGTATAGAATTGTTGGCTACAGGAACAAAAGAAGACTCCCCTGGGTCATCAAATAGAGTTACTCAGAATTAAAAGAGCTTGTTTATTTGACCTAGTAAATAGAAAGCTAAGAGGATCTGACTGCTCTCCATAAACACACAGAGAAGGCATGCACCAGGGAGTGCAGAGAGCTATTTAAGCTGAAGGACAATGCTGGCACAAAAATACATGGATATAAGCTGGCCATGACTACTTTTAGGCAGAAAATTAAAAGGCAATTTCTAGCTATTAGAGGAGTGAGCTTTTGGGAAAGCTTTCCTGGGAGAGTAGTTAGAAGGCAAATAATTAGCTTCAAGATATTATTAAATGGATCATAAAATGCAGTATCTAGAGATAGAATCAAGTCAGATGGGAAAGAAATATATTCTCTTACAACCAGTAAAAGCTTATTTTCTCCATGAGAACTTTATATACACAGGTTTATGTAGGACCAGTAGACTTGTTAGATGAAGATCCACAAAGCCTGTCAGTATTTACATGAAGACTCCTGTGGTATTTTAGACTAAACCAGGTTCCCGAATTTCCAAAGTTTCCTAGGCACATAACTTAGAGTTTTAAGCATGTCCAGAAATGTTGTCAGGTTGTCAAGATTGCACAGCTCAATGTCTTTTTTAAACTTAGGTCCTGTTTCTTACACAACTACACTTATATGTATTGTCAAGTCTTCCGTCCTTAAATTGGGCCAAAGACTGGCTGGATGATGTTCTTGTTGGGTTATGCCTTCTGCCTGCTCACTGCAGCCTGTTCTGTCTTCTTATTAAACTCTATTTCCAATTATTTTCTTGTTTGAGATTCTCTTTTTTCTTTATTGATGTGGGTGAATGCGGCTCCACATTCCAGCAGCTGTTTTGGGAACACATGGCAGAGGGGTGCCTATGTCTGGGGAGCAGCAACTGAAGTGGACTGTGTGTGTTTGTGTGTACTGTTAACAGTGAACAGCAAGCTACATTAGCAGGACAACAGGACAAGAGGTCTGGGAAATGAGCATTTGAGAAATTGTGATCCTGGAATGGATACTGGAGAAACCAGAGGGTCTCAGATTTGGCTACTGAGAGACCAGAAGGTCTAAGCCAACTACTGAGGAGATCAGGGAGCTTGGGTCTTTGTACCAGTGAGACCCTAGATGTGGGCCAGCTACCAGATAGACTAGTGAGTGTGTCAATGTATGAGCCACTGATATACCAGTGGATTCAGGGGTCAGCTACTGGGTAGATCATGCCTAGCTACTGGGGAATCATATTTATGCTTGTGTGTATTTGTGTGTGCATGCGGAGATGCAGCAATCCCAGTAGGACTACCAGGTTGGGCAGTTCCTACTGTGAGATGAGATAGGTGCTGCTGTCCTGATGCTATTTTTATCTTCTTTATTTGCAGGTCAATGCCAAGCTGCACAGAAAGGTACGATGTGACGTTGCTTGCTCTCCTTGGAAAATCTCAGCATCTTAAGTATTTCTTTATTATGTCCTGAAAAGTTTTCTAACATGGATGCTGTAGTAGGTCTAGTTCTTAGAGAGATGATCTCTCTCACACAGAGAAGAATTTTACCACTCTGACAATTGTATCATATTTTACTATTCAGAGACATTAGCAAGATAAAGATGCTAAAACCTGGGTCTACTACTATAATATCCAGAAATTTTATGATGAGACATCTCTTTATTACTTCTTTTTTACCTCTGAGTTGACTGAAGGTGTTAGCAGCATTTTTCCTTCCTAACATCTCTTATCTTGATTTCTTAAAGTATATTAAATTGCGTGTCTGTAAGCCAAGTCACAGAATAACTTCTGAATGCTTTGGGCAATTTCAATCAAACTTCACAGAGAGGCTGAAGTTTCAGAGAGATTAAACTCTGTCAAATTTTGGTGGCCAGGCAAAAAAAGAGATGTTTTTTCCAATACCTCCCCTCACAGAAAAAAAGTCAATGTAATCTCACATGTTATTAGTGCATCCATACTCACAGGCAAGGACAGGGAAGAGAGCATATCATAAACATACCTTTTTCAGGATTCTGTGTTTTTACCATATTAGAACATGAGATAGTCTTTCCTTTGGAAACCAGATTTTGTAAATTTTGTAAGTATATTTGTTTCCAATGTATTTGTTAAATGAATACGTATATGGGCCAGGCACTCCTGTGTTGGTGAATGTCAGTGGATGTCATTTTTTCTGCATGGAGGAATTCAGTGACACACCTCTTCTTCGTACACACTTCCATGTTAGTCACCATTTTGTCAGACTGCTCCTCTGCTGACATCTGTCACACGGCAACAAAATTTAATGGAATATTGGTGGGAAGGTTCAACCTCTACTGTCATACCATCAGCATCTGCTTCTGGTGTTGTGTTGTGGGCCAACATAATAAACCAGAGGCATTACTTTTGGAGCATCCCTCAGTCCAAATACCATTTTAATTTTGAATGACATCTACTGGCATCAGATTGTTCACTGTCAATCTCTGGACTAAGTAAAATTCTTACCATTTTTTCTGTAAATGGTTTTAGATATTAATGCCTTTGAGAGTATTGCAAACTGCCTCCAGTCTACCTGTGAATAAGAACAGAAAAATGTTCAGTAAATGTGTTATTTGTTATATTGTTCTTGAACTCTTCAGAGCACTGATAATAGAAGCCATTTTTCTTATGTTCCCT
Seq C2 exon
TTTTTTCATAGCAAAATGCGTGGACATCTCCTTAAGCTCTTGTACAGATGTTACCTATACTCAAACGATGTATCCTAATTTCCTGGATCAGAAGTCTCGAGAAGTGATTGAGTACAGCTCTGAGTATATTCTCATAAGCGTGCTGCACAACTTGCTGCAAGGAGAATGCAATCCAGATCTGAGGCTCCTGGGGTGCTCAGTGCTGGCCCCACAGTGTGAAAAGGACAAAGTTATAAAGCCTTGCAGGCATGTATGTGAAAACCTGAAAAAAAATTGCCTCTCTGCTTTTGATGCAATAGACATGGCCTGGCCCTACTTCTTAGACTGTGATCGGTTTTTTGCTGGGGAAGAAGAAGGGTGTTTTGACCCACTGGCAAAGCTGCGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000015597:ENSGALT00000029738:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
PF0139217=Fz=WD(100=92.1),PF0115314=Glypican=WD(100=57.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg38)
No conservation detected
Human
(hg19)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]