GgaINT0125756 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000008984 | C9orf86
Description
NA
Coordinates
chr17:978395-988892:-
Coord C1 exon
chr17:988789-988892
Coord A exon
chr17:978754-988788
Coord C2 exon
chr17:978395-978753
Length
10035 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ACTGTATGT
5' ss Score
5.19
3' ss Seq
GCATTTTCTCTTCCCTGCAGGTT
3' ss Score
12.91
Exon sequences
Seq C1 exon
AGGGAGACATTGCTACGGCAGCTGGAGACGAATCAGCTGGATATTGATGCGACTTTGGAGGAACTGTCAGTGCAGCAAGAGACAGAAGATCAAAACTACGAACT
Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000008984:ENSGALT00000014614:9
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.357 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
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Human
(hg38)
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Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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INCLUSION PATTERN[edit]