HsaINT0036314 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000155962 | CLIC2
Description
chloride intracellular channel 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2063]
Coordinates
chrX:155279962-155298910:-
Coord C1 exon
chrX:155298785-155298910
Coord A exon
chrX:155280069-155298784
Coord C2 exon
chrX:155279962-155280068
Length
18716 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTACAG
5' ss Score
8.04
3' ss Seq
GACGCATGTTTCTTTTTAAGGTA
3' ss Score
10.19
Exon sequences
Seq C1 exon
AAAGCCTGAAGAACTAAAGGACTTAGCCCCAGGTACCAATCCTCCGTTCCTGGTGTATAACAAGGAGTTGAAAACAGACTTCATTAAAATTGAGGAGTTTTTAGAACAAACCCTGGCTCCTCCAAG
Seq A exon
GTACAGCATTTACAAGATACTATTTTGCTGAAGATAATCTATTTTACTGGCTTGTTTATTGCAGATTTAGTATTCTTACCAATTTAAGTACTTTTGGATTTCTGGGCCTACATGTCAAATGACACACATGCATAAACATACCCCTCCAACTTCAAATACAAAAAGATGATATGTGTAATATTTCAAATAATTTTTAAAAGCTGCATAACATACATAACACAAGAAGGTAAGTTCTCTGTGCTCTAGAAATAGAGTAGGAACATATAGTGAGATGGGAGTGAGGGAATGGGATACTAACACTATGTAATTCATAAGGATTGGTCATGACTGGTCCTTAACACCACTGACGAAATGACAGAACATACCCAACACGAGGGCTAGTGGCCAGGACATAGACTTCAAGCAGTTAACCAGAGGCCAGAACTGTACTGCCTACACTTGAATGACAACCGCACATCTCTGTCTACCCAGGATAGGTCTAGAAACAAGAAGCATGCTGTATTAATTTTCTATTGCTGTGTAACAAATTACCACAAACTTAGTATCTTAAAACAACAGCTATTTATTATCTCACAGCTTCCATTGGTCAGTTGTCTGGGCATAGCCTGCTAAGGTCCTCTGCTCAGGGTATCAAAAAGTGGCATTCAAGGTGTTGGTCGGGAACACAGTTATCATATGGGGCCCAGGTGACTCTTCCATCTTCATTCAAGTTTTTGGCAGAATTCAGTTCCTTGCAGCTATATGACTGAGGTCTTAGGTTATTGGGTAGCTGTTTGTTGGGGTTGGGTTGGCATTCAATTACTAGAGGCTGCCCCTCTGTATAGGCATTTCGCAACATGGCTGATTGTTCTCTTCCTCTAAAACCTGCAGGAGAATGTCTCTCTGATGGTTCACCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACCGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCACATGTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTCGGGTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGATGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAATTTTAGTAGAGATGAGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTGATGGTTCACTTTCTTTTAAATTTTTTTATCAGTACAAATTATGGGATACATATGAAATTCTATTATGTGTATGTAATGCATAGTGATAAAGTCAAGGTATCTACGGTGTCCATAACCCAAATACAATACATTTTTGTAACTATAGTCACCCTGCTCTTCTATCAAACATTGAATTTATTCCTTCTATCTTATTTATGTGTGTACTTTTTAACACACTTCTCTTCATCTTCCCTTCTCCTCCCAATCACCCTCCCCAGTCTCTGTTATCTCTCTTTCCATTCTCTATCTTCATGTGATCAACTTTTTTAACTCCCACATATAAGTGAGAACATGCTATTTTTGTCTTTTTGTGCCTGGCTTATTTCACTTGACATAACAACTCCAGTTCCATCCATGTTGTTCCAAATGACAGGATTTCATTCTCTTTTATGGCTGAATACTATTTCATTGTGTATGTATACCACACTTTCTTTATCCATTTATCTGTTGATGGACACTTAGATCGATTCCATACCTTGTCTATTGTGAATAATGCAATAATAAACATGAGAGTGCAGGTATCCCTTTGACATACTGATTTCTCGTGCTTTGGATAAATGCCAATTAGTGAGATTTTTGGATCTTATGGTAGTGCTACTTTTGGTTTTTTCAGAAATCTCCATGCTGTTTTCCATAGTGGCTATATTTATACTCCCAAAAACAGTGTATAAGAGTTCCTTTTTCTCCACATCCTTGCCAACGTCTGTTAATTTTTTTTTTGTCTTTTTAATAATAGCAATTCTGACTGAGGTGAGATGATATCTCATTTTGGTTTTGGTTTGCATTTCTCTGTTGATTAGTAAAGTTGAGCATTTCTTTATGTACATTTTGGCCATGCCCTTTGCCCATATTTTATGAGATTTTTTTTATTGTTGAGTTGTTTGATTTCCTTGTATATTCTGGATATTAGTCCCCTGTTGAAGTTTGCAAACATTTCCTCTCATTCAAAAGGTTGTCTCTTCACTCATTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTTTTTAGTTTACTTGAGTCCTATTTGTCTATTTTTGTTTCTATTGCCTGTGCTTTTGACATCTCAATCATAAATTATTTGTCTAGAACAATGTCCAGAAGAATTTTCCCTAGGTTTTCTCTTATTATTTTTATAGTTTTGAGTATTATGTTTAAGTCTTCAGTCCATTTTGAGTTGATTTTTGTATACAGTGAGAGATAAGGATCAAGTTTCATTCTTCTGCATATGGCTGTCCAATTTTCCCAGTACCATTAATTGAAAAAGGTGTCCTTTCCCCAATGTTCTTGTGAACTTTGTCAAAGATCAGCTGGCAGTAAATATGTGAATTTATTTCTAGGTTCTCTATTCTGACCATTGCTCTGTGTGTCTATTTTTATACCATAACATGCTATTTTGGTTACTATAGCCTTGTAATATATTTCAAAGTCAGGTAATGTGATGCCTCTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAGAATTGCTTTGGCTATATGGAATCTTTTTTGGTTACATGTGAATTTTAGTATTCTTTTTTTGTAATTCTGTGAAAAATGACATTGGTATTTTGACAGGGATTGCATTGAATCTGTAGGTTACTTTGGGAAAATCACAATTTTAATAATATTCATTCTTCTGATCCATGAGCATGAGATGTTTTCCCATATATTTTTATCATTTTCAATTCCTTTCATTAGCATTTTGTAGTTTTCATTGTAAAGATCTTCCACCTCCTTGATTAAAATTATTCCTAGATATTTTAATTTTTAGCTATTGTAAATGGAATTGCCATCTTCATTTCTTTTGTGGGTAGATCATTATTGGTGTATAGAAATGCTACATATTTTTTAGTGTTGATGTTTTTAACCTGGAACTTTACTGAATTTACTTATCAAATCTAAGAATTTTTTGGTGGAGTTTTTAGGTTTTACTAGATACAAGATCATGGCACCAGTAAAAAGGGACAATTTTACTTCCTTTTTCCCAATTTGGATGCCTTTTATTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCCATACCTAGGACTTCCAATACTATGTTGAATAGGAGTGGTGAAAGTGGGCATTCTTGTTTTTTTTCCATTTCTTGGAGGAAAGGCTTTCAATTTTTCCCTATTCAGCATGATATCAGCTGTGGGTTTATCATATATAGCCTTTATTATTTTGACATATTTTCCTTCTATGCCCCATTTGTTGAGAGGTTTTATCATGAAGGGGTGTTGAATTTTATCAAATGCTTTTTCTGTATCTATTGAGATGATGATATGTTTTTTGTCCTTTATTCTATGGATGTCATATATTGAGGTTATTGATTTGCACATGTTGAACCATTCTTGTATCACTGGTATAAATCCCACTTGATCATGGTGTATTATCTTTCTGATATGCTATTGGATTCAGTTTGCTAGTATTTTGTCAAGAGTTTTTGTATCTATGTTCATCAGAAATATTGGCCTGTAGTTTTCTTCTATGTGTGTGTTCTTGTCTGGTTTTTGTATCAGGGTGGTGCTGGCCTCATAGAATGAGTTAAGGAGAGTTCTCTCCTCTTCCATTTTTTAGAATAGTTTCAGGAGAATTGGTATTAGTTCTTCTGGTAGAATTTGTCAGTGAATTTGTCCAGTCCTGTGCTTTTCTTCATTGGGAGACTTTTTTATTACTGACTCAATCTTGCTACTCATTATTGGTCTGTTCATGTTTTCTATTTCTTCCCAATTCAGTCTCAGCACATTGTATGTTTCCTGGAACTTATCCATTTCCTCTAGGTTTATCAGTTTGTCAGCATACAGTTGTACATAATGGTCTCTGGTAATCTTTTGTATTTCTTACATATATGACTTAATGTGTCCTTTTTCATTTCTAATTTGTTTGTTTGGGTCTTCTACTTTTTTGGTTAGTCTAGCTGGCAGTTTATCAATTTAACAAAAACCAACTTTTTCAATCATGATGCTTTGTATTTTTTAGTCTGTATTTCATTTAGTTCTGTTCTTTATTACTTCCTTTTTCTGCTAATTTGGTATTTGGTTTGTTCTTGCTTTTCTAGCAGCTTCACATACATTATTAGATTGTTAATTTGTCATTTTCCTACTTTTTTCATGTAGGCATTTATTGCTATAAGCTTGCCTCTTAGTGCTGCTTTTGCTGTATCCCACAGGTTTATGTATGTTATGTTTCAATTTTCATTTGTTTCAAGAATTTTTTTTCTTCTTAAATTCTTTATTGACCATTGGTTGTTCAGGAGCATGTTGGTTAATTTTTATGTATTTATGCAGTTTCTAAAGTTCCTCTTGGTGTTTATTTATAGTTGATTTGATTTCATTGTGGCCTGAGAATATCCTTGGTATGATTTTCATTGTGTTAAATTTATTGAGACATTTTGTGGCCTGACATATGGTCCATCCTGGAGAATATTCCATGTGCTGATGAATGTATATTCTGTAGTTGTTGGATAGAATGTTCTGTAAATGTCTGTTTGGTTCATTTGGTCTAAAGTCCAGTTTAAGTCTAATGTTTATTTGTTGATTTTCTGTCTAGATTATCTATCTAATGTTGACAGTGGGATGTTAAAGTTCCTTCCTATTATTGCACTGCAGTCTGTCTCTACCTTTAGATCTAGTAATGTTTGCTTTATGAATCTGGATGCTCCAGTATTGGGTGCATATATATTTAGGATTGTTATATCTTTTTTGCTGGGTTGATCTGTCATTATATAATGATAGTTTTAGTCCTTTTTTCACTTTTTTTGATTTAATGTCTGTTTTGTCTTATATGATTATAGCTAATCCTGCTCACTTTTGGTTTCCGTTTGTGTGAAATATCTTTATCAACCCATTTCAGTCTATATGTGTCTTTACTAGTGAGGTGAGTCTCTTGTAAGTACTATGTAGTTGGATTATGTTTTTTAAGTCTATTCATCCAGTGTATGTCTTTTAAGTGGAATATTTAATCTGTTTATGTTTACATGTGAAGACTTATTTCTGTCATTTTGTTATTTTTTTCTGGTTGTTTTGTATATTCTTTGTTTTTTTTCTCTCTCTCTTGTCATTTATCATTACAGTTTGGTGGTTTTGTGTAGTGGTAATATTTGAGTCCTTTATTTTCTTTATATCCAGGCAAGAAGGATGGCCACTATTCTCACACTGGGAGCAGTGTATAAGTGATTCAGCCTTTCCTTTCTTGTTGGACTCCTTACCCTTCAGACAAATTCCACATATAGCATTTGGAATGACTTTGGGCTTGTACCCAGGAACTGAGTTGGACAGTACAGAACGTTTGGGAGCATCTTTTCTTGGAGTGGCAGCTTTGTCTTTTGATTTCTGTCTTCCCTGGAAAGAGTCCTCCTGGCTGTCAGGAGAGCTTTCCCCTTCAGATACCTTGCCAGAGGAGCTGTCCGAAGTGCCTTTATTTTTCCGCTTCTCATCACCTCAACCATCTTCGCCGTCATCTGAATCACCGTCACTGTCTAGAGCAGGGAGCTCAGGATCCAGAGTGGCCTCGTACAGGGCTGTGTTTAATGGCAGATACCACAGCTCATCTGGTGAGTACCTCTTATAATATTCCTGGAACTGTCCGGGGATGAGAGCCACTGGGTAAGAACTGACCTTTGTTCGCCCTGTTGGCAAAACTTCCTACTTCCCTTGAGGCACCTGGATAACGTGTCTGCAAGTCAAAATAAGCTCTTCTTTCTTCCATGCGTTCCCGGTTTAAGTTGCTGCTTTTTTTGGCAGCTTTTTTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCAGCTTTCTTAATATACTCAGGCACTTTACTGGCTTCAACTTTCTGAGTATTCTGTTGTTACATTTGGGAATACTCTTTGTAATGGTCTGTAATTCGTTGACGTTCTTTTTCTTGTAGAATAACAGAATACTCAGCATGTTTGGCTGGATATTCCTTTATCGTTAAAACAATCACTTCATCACTGCTCAGTTAAACCTAGAGTGCATTGAGTTTCAGTAATGACATTTGGCTCTCTCAGGTAGAGTTTCTCCTTGTGAGACAAATCTCGTCTCTCTAAATCTGGATATTTCCTTTTAAAGGAGGTCACACCCAAATATTAACTGACTTGTTCTTGAAGCATATAGTATTCTCCTGTTTCATCAGGTGGCCATTTGTACTCTATCAAATTTTATGCTGGATAGTAACTAAAGCCAAGATCTTGACTTGAAGTTTCACAGCTCCTAGAACCATCTCCTGAGCCCATTCGCCTCTTTTTGGATGCCTGGGTCCGGTCATTTGAATTATCTTCAATTTCATCCTTCGAGGACTGCGCTCCGGGGGTGGCTGGGTCGCTGTCGCATGGCCGCGGGGCTGCGGGCGGGAATGGAGAAGGTCCTGCGGCGGCGGCAGCGCTCCTGACATCCGTCCGACCCCATTTTTTTAAATATCTGTTTTATTCAGCATACTCTTTCCCAACATATCTGTAATACTAGGCATTAGCACTCTTTTTACATCTGTGCCAATATAACAGGTGTAGTGACATCTCATTGATACTTAACTTGTATTTCCTTGAATGATAGATACATTTAAGCATCTTTACCTATGTTGTTTGATCATTTGGTTTTGTTCTCCTGTGAATCATCTTGTCAAATCCGTCTGATTTTCTATTAGCTTCATACTGAATAGGCAAAAGCTGGAAGCATTCCACTTTAAAAGAGGCACAAGACAAGGATGCCCTTCTTACCACTCTTATTTAAAATAGTATTGGAAGTTCTAGCCAGAGCAGTGAGGCAAGAGAAAGAAATAAAGGGCATCTAAATAGGAACATAGAAAGTCAAACTATCCCTGTTTGCAGACGACATGATTCCATATCTAGAAAACCCCATACTCGGCTGCACTCAGCATCGGAGCCAGGAGCTAGTGGCCGCCGCCACGTCCCACCAGACCTGCATCCAAGCAAGTGAAGATGTTAAAGAGATCTTGCCAGAGCCAGAAATGGAAAGTACAGACCTCTGAAAATATCTATTGAAAATGGGCAACTTATGATTGGATCATATATAGTCAGCCTTCAGATTCCTGGGATAACGATTATGATTCCTTTGTTTTACCCCTGTTGGAGGACAAACAACTGTGCTATATATTATTCAGGTTAGATTCTCAGAATGCCCAGGGATATGAATGGATATTCATTGCATGGTTTCCAGATCATTCTCATGTCCGTCAAAAAAGGTTATATGCAGCAACAAGAGCAACTCTGGAAAAGGAATCTGGAGGTGGCCACGTTAAAGATGAAGTATTTGGAACAGTAAAGGAAGATGTATCATTACATGGATATAAAAAATGTTTGCTCTCACAATCTTCCCCTGCCCCACTGACTGCAGCTGAGGAAGAATTATGACATTAAAATCAATGAGGTACAGACTGACGTGGGTGTGGACGCTAAGCATCAAACACTACAAGGAGTAGCATTTCCTATTTCTCGAGAAGCTTTTCAGGCTTTGGAAAAAATAAATAACAGCTGAACTATGTGCAGTTGGAAATAAACATAAAAAATGAAATTATAATTTTGGCCAACACAACAAATACAGAACTAAAAGATTTGCCAAAGAGGATTCCCAAGGATTCAGCTCGTTACCATTTCTTTCTGTATAAACATTCCCATGAAGGAGACTATTTAGAGTCCATAGTTTTTATCTATTCAATGCCCAGATACACATGCAGTATAAGAGAACGGATGCTGTATTCTAGCTGCAAGAGCCCTCTGCTAGAAATTGTAGAAAGACAACTATGGATGTTGTAATGGATGTAATTAGAAAGATTGAGATAGACAATGAGGATTAGTTGACTTCAGACTTCCTTTGTGAAGAAGAAGTACATCCCAAGCAGCATGCAGGAAAAAGAAGAATTCGAAGACTAATTAGGGGCCCAGCGGAAAATGAAGCTACTACTGATTCAAGTCATCACATTAAACATAGCAATACTAGTTTTTTAAAAGTCCAGCTTTCAATACAGGAGAACTGAAATCATTCCATGTTGATATAAAGTAGGGAAAAAATTGTACTTTTTGGAAAATAGCACTTGTCACTTCTATGTACTTTTTAAATTAATGTTACATAAGAGTCATGATTTCTATTTTTGACTTAAAGCTAGAAAAGAGTTCAACATAATGTTTAATTTTGTCACACTGTTTTTATAGTGTTGATTCTACACTTTCACATACTTGTTAAAATTTTATACAATTGAGCCAGTTCTAGAAAGTCTGATGTCTCGAAGGATAAACTTACTACTTTCATGTAGGACAGAAAGACCTTAAAATATTCTTATCACTTAATGAATATGTTAAAGACCAGGCTAGAGTATTTTCTAAGCTGGAAACTTAGTGTGCCTCGGAAAAGGCCAGAAGTTGCTTATTCTGAGTAGCTGTTCTAACTCTGTCAGACTATAGGATCATCTCTGCAACTTTTAGAAATAGTGCTTTATATTGCAGCAGTCTTTTATATTTGACTTTTTTTTAAACAGCATTAAAATTGCAGATCAGCTCACTCTGAAACTTTAAGGGTACCAGATATTTTCTATACTGCAGGATTTCTGATGACATTGAAAGACTTTAAACAGCCTTAGTAAATTATCTAAGGCTCTGTGAAGCCAAACATTTATGTTCAGATTGAAATTTAAATTAATATCATTCAAAAGGAAATAAAAAATGTTGAAAGAGTTTTAAAAATCAGGATTGACTTTTTTCTCCAAAACCATACATTTATAGGCAAATTGTGTTCTTTGTCACTTCTGAACAAATATTCAGATTTAAAATTACTTTAAAGTCCTAGTATTTAACAGGCTAGCACAGATAAACACCTTAATAATCTCCTTTCAATTAATATTGTATTTCAAACCACATTTAACTGTCTTCTAATGCTTTGCATTTTCAGTTACAACCTAGAGAGATTTTGAGCCTCATATTTCTTTGATACTTGAAATAGAGGAAGCTAGAATACTTCATGTTTAGTCTGTTAAACCTGCTACAAAAACCATAACTTTGAGGCATTTTCTAAATGAGCTGTGGGGATCCAGGATTTGTAATTTATTGATCTAAACTTTATGCTGCGTAAATCAGTTATCAGAAATGCACATTTCATAGGGTGAAACACTCATTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGAGCAATCGCACGATCTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCAGGGTTCAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGTATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTTGTGAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCCGCCTTGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCGGCCAAAGCACTTATTTCTAAACCTTATTATCTAAGGTAATATATGTACCTTTCAGAAATTTGTGTTCAAGTAAGTAAAGCATATTAGAATAATTATGGGTTGACAGATTTTTTATATAGAATTTAGAGTATTTGTGTGGGGTTTTGTTTGTTTACAAATAATCAGACTATAGTATTTAAACATGCAAAATAATTGACAATAATGTTGCACTTGTTTATTAAAGATATAAGTTGTTCCATGGGAGCACACATGGACAGACATACATACACCCAAACTATTGCATTAAGAATCCTGGAGCTGTGTTGCAGACCATAGCTGAAGCAGTTATTTTCAGTCAGGAAGACTACCTGTCATGAAGGTATAAAATAATTTAGAAGTGAATGTTTTTCTGTACCATCTATGTGCAATTATACTCTAAATTCCACTACACTACATTAAAGTAAATGGACATTCCAGAATATAGATGTGATTATAGTCTTAAACTAATTATTATTAAACCTATGATTGCTGAAAATCAGTGATGCATTTGTTATAGAGCATAACTCATCATTTACAGTATGTTTTAGGTGGCATTATCATACCTAGACAATGAATAACATATTCCCAATAAATTTATATAGCAGTGAAGAATTACATGCCTTCTGGTGGACATTTTATAAGTGCATTTTGTATCACAATAAAAAATTTTTCTCAAAGAAAACCCCATACTCTCAACCCAATAGGTCCTTCAGCTGATAAACAACTTTGGCAAAGTTTCAGGATGCAAAATCAATGTACAAAAATCACTTGCATTTCTATACATCAACATCAGCCAAGCTGAGAGCCCAATTGGGAAGGCAATCCCATTCACAATTGCCACACACAAAAAAATAAAATACCTGGGAATACAGCTAACTCAGGAGGTGAAGGATATCTACAATGAGAATTACAAAACACTGCTCAAAGAAATAAGAGAAGACACAAACAAATGGAAAAATATCCCATGCTCATGGATAGGAAGAATCAATATCAACAAAATGACCATACTGCCCAAAGCAATCTAAAGATTCAGTGTTATTTCTAACAAACTAACAATGACATTCTTCACAGAACTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCTTATGAAACCAAAAAAGAGCCCGAATAGCCAAGGCAATTCTAAGCAAAAATAACAAAGCTGGAAGTATCGCATTAGCCAACTTCGAACTATACTGCAAGGCTACAGTAAGCAAAACACAGCATGGTACTGATACAACACCTGTAATCCCTGCACTTTTGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGCTGTTCCAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAGTTAGCCAGGCTTGGTGACACACGCCTGTAATCCCACCTACTCAGGAGACCAAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGAGAGATGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACGTCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAGAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAACAGGCACATAGACCAATGGGACATAATAGAGAGCCCAGTAATAAGGCCGCACACCTACAACCATGTGATTTTTGACAAAGCTGACAAAAGCAATGGGGAAAGCACTCCCTGTTCAATAAATGGTGCTGGGCTGGCTAGCCCTATGCAGACGATTGAAGCTGGACCCGTTCCTTATACCATATACAAAAATCAAGATGGATTAAAGACTTAAGTGTAAAACCCAAAACTACAAAAACCCAGAAGACAACCTAGGCAATGCCATCCTAGACATAGGAACAGGCAAAGATTTCATGACAAAGATGTCAAAAGCAATTGCAACAAAAGCAAAAATTGACAAATGGGATTTAATTAAATGAAAGAGCTTCTACACAGCAAAAGAAACAATCAACAGAGTAAACAGACAACCTACAGAATGGAAGAAAATTTTTACAAACTATGCATCTAACAAAGGTCTAATATCCAGTGTCTATAAGGAGCTTAAATAAATTTACAAGAAAAAAATCGCATTCAAATGTGGGCAAAGGACATGAACAGATGAACAGACATACATGGGGCAAATTAGCATATGAAAAAAGCTCATTAGTGATCATTGGAGAAATGCAAATCAAAACCACAATGATATACCATCTCACACAAGTCAGAATGGCTAAAAATAAAAATAAAAAGTCAAGAAATAGCAGATGCTGGCAAGGTTGTGGAGAAAAGCAAACACTTATACACTGTCAGTGGGAGTGTAAACTAGTGCAACCATTGTGGAAGATAGTGTAGTGATTCTTCAAAGAGCTAACAGCAGAACTACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGATATATACCCAGAGGAATATAAATCATTCTACCATAAAGACACGTGCATGAGAATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAACAAAGACATGGAATCAACCCAAATGCCCATCAATGACAGACTGAATAAAGAAAAGGTGGTACATATATACCATGGAATAGTATGCAGCCATAGAAAAGAATGAGATCGTGTCTTTTGCAGGAACATGGATGGAGCTACAGGCTATTATTCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAATCCAATACTACATGTTCGCATATATAAGCGGGAGCTAAATGATGAGAACTCATGAACACAAAGAAGGGAACAATACACACTGGGGTGTTCTTGAGGGTGGAGGGTTGGAGGAGGGAAAGGAGCAGAAAAGATAACAACTGGGTACTGAGCTTAATACCTTGGTGATGAAATAATCTGTACAGCAAATTCCCATGACATGAGTTCACCTATGTAACAAACCTTCACATGTATCCGAAACTAAAATAAATTTTTTTAATGAAATAAATATGGTTTTTGGGGGGCCTCCTCTTTCGGCTTTGGAGCCCCCCTCCCTCTGTCTCGGTATGGGGGAGTTTCTTCCTTCTGTCTTCTCCCTTCCTTCTTGCCTATTAAACTCTCCGCTCCTTAAAACCAAAATAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAATATGGTTTTTATTTTTCTCACATAAGAAACTCAGAATGAACCTAGGATGATAGCTCCGTAATTTCATTAGGGATTTCAACTCCTAATCTTTCTTCTCTGCCATCCTTCAAGTGAGGCTTCCAGTCTCAAAGTTAACTCATGGTGACAATATGTCTGCTGGAACTCCAGGCAACAGATCTAATATACAAGCCAGCTCTAAGGAGTTTTCACAGAAGCCACACCCAAAAATTTCCATTTACAGCTCATTGTCCAGAGGTAATTCATGTGGTTAGATCTAAGTAGTGGTATATAAGTGTGTTATCTGCCATAGTTTGCCCCTCTGACCACCCAAATAAATGTATGTATCCCTCTTCTCACATATGGAACACACAGTTACTACAGTCGGCTTAAAGTCCAGTACCTTTGGATGATGTGCAATATCTCCATTAGATACTAATGGTCAGGCAGTCAAATATATTAAAAATTATCTCCACCCACTCTTTGACACACCCATTTTTAAAAGTGAAGATTCGATAACACACAACAACCACTGGTTCATACTAGTTCATAATAGTTACCATGACTTGAAAAAGGACTGAAATATTGTTTCTACGTTTTATTGTTACAAACACTGCTAAAAGGAATTGTCTTTTTACAAGGCCCTCCACAACGGTTAGTCTTCCATATTGCTGGATATGGGAACCCTTCCATATGAACTTTGTTTTATCTACTTTTTAAAAGCCTTGTAAACACCCACATTAATGGAAATGGTGGAGTAGGGAATTCCAGAACTCCATTCTTTCATAAAAGCAATGAATAGGCTGGCAAAACTGTCAGAAGCAACTTTTTCAGAACTCTGGAATCTAAGCAAAAATTACAGCAGCCAGGAGAACACTTAATGAATAAAAAATTTAAATTTCAGTGAGAGTTCTGTGGCATTTTTGGTTACCTTGAGACCATCCTCCAACCCTCAGCCCATCAATAGTCTTAAAAATGGCAGCTTATATTGCAGGTGCAGGTTACTGGTACCAGAGGAAGCGATATTGACCTTATTTTCAATGAACTGTGATTGTGTAGTTTGACCTATCTGGTGGTTCCCTGAAGGATTACCTCAATGGTTTACCTTTTTATCACCTGCACTAGAGCTTCCCCAGGGCTGAGGCACCTTCCCTGGTGCTGGTTGTGGAAAGAATTTTAAAGCAAATGTATTAGTCACAGCTACACAGAACAAGGAATAACATCTGGGAAAAGCAATAGACAAATGGAAAAATCCCAGGAAGGGCCAGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGGTCACCTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAACACAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCTAGCCTGGGCATGGACAACAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAATCCCAGGGAGAAAGAGGCTGAGATACTTGGGGGATGCTTAGGGAAATAATGGCTTCAAAACATTTTATGTATTCTGAGGACTATAGAAGACTATGCATGGACCCATTTCTAGATGTGTGCTCACAAAAGAACTGAGAAGACTAGGCTCTCAATTCTGGCTAAATTTCAGGCACTGCACAAGCAGAAAATGAAGGCAAAGGCAGAACTTTAAACTGTATAGCTAAGCAATGAAGGAGAGCCCCAACACAGAACCAACCCTCAAAAACTAAGAAAGCTTTTTGTTTTCATAGTTTGTTTCTTTGTTTTGCTTCCAGGAGTTTAATAAAATCTCTGTAAAATCAATAACTGACTAAAGCTAATGGAACAAATATTTCAGAGGCCACACATACCAAAAAAATATAGGCTTTACAAAATTAGTTAAGAAAATTAACTAAACCAACAACAACCACAATAAGCAGCAACAACAAGACCAGGGGACTGGGAGAATCAATCAGATTTCCAGAGTTTCTACATTATAACATTCAAAACATCTGGTTTTCAAGAAAAAAAAAAAACTGAGGCATGTGAGGAAACAAGAAAGTATGGCAAGGACAAAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTCATAGGTGGAAATTGAACAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGAACATCACACACCGGGGCCTGTCGGGGGGTGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGGGCGCAGCACACCAACATGGCACATGTATGCATATGTGACAAACCTGCATGTTGTGCACATGTACCCTAGAACTTAAAGTATAATAAAAAAAGAAATGAAAAAAATACATTGCATAGAAGAAATACGATCATACATTTATAGCATTTAGCACAATTCCTGACATAATAAAATACTCAATAAAACAACAACAACAAAAAGAAAAACCCACAGCTGACATTGTACTCAATAGTGAAGGACTGAAGTTTTTCCCCTTAAGATCAGAAACAAGACAAGGATGTTCATTGTGGTTGGAAAAAATAATTGATGTAATTTCAATCTTCTTAAGTGGTTAAGAATTGTTTTGTGGCCTAACATATGATCTATCCTGGTGAATATTCTGTATGCACTTGAAAATAATGTGTATTCTGCTACAGTTGCCCAAAATCTGGGGTTGAAGAAGCCAGCTTAGTTCTGGGTCGGGCCTGAAGCCTGGGGCTCTGTGGGTCAGCCTTTTTTGGACTCGGTTGGAGCCTGGTCTGGGCCTGAAGCCTGAGCTTGAATGGGCCAGCCTGAAATCTGGGGCCACCAGGGATGGCCTGGAGTCTGTACCCATGAGGGCTGTATTGGAGGCTGAATGTTTGGATGCTGACCTGGTACCTGTGGCCATGGGGGCCAGCCTGGAGCTGAGGTCCATGGGTGTCAACGTGGCACTGGGACAGACCCAAAGCCTGGGAGTGTGAAGGCCAGCCTGGAGCTGAGTTGGTCTGGATACTGGGTCTGTGGGTATTGGCCTTAAACTGGGGTCCAAAGGTGCTAGTCTTGTGATGGAGAGGGCCTGAAAGCTGAGTCTGGGGGTACAGTGGCTGTCCTGAAGCAAAGGGGCTGTCTTGGAGGGGTGCAAGCCTGGAGGTATGATCTGGTGCTGAAGGAAGTCTGGAGTCTGGGGCTACTGGCCCAGGGCTGGGAGACTACATCTGCAGGGATGGCCTGGACATTGGGGCTACAAGGGCTGGCCTACTGCCCAAGTCTGTGGGGACCAGCCTAAAGTCTGGGGTAATCATGGCCTGTCCAGGGCTAGACTTTACTGTGTTGGGCCCAGTGTTTGGGTCTGAGGCAAAGTCTGGTGTTCACTTACCTCTTCTTCTCCCAAGCAAAGGGCATCTCTCTCCATACTGTGGGTTGGAGAAGGCATAACACAGGTAATTTAAAACTGTCCTGCTAAGGTGAAAAATAAAGCAAAAAAGAGAAGTAGTGATGTTAGGGAAAGGAGTGATGTTGCAACGTTACAATTGAGCGTCCAGAGAAAGGCTTCACTTAGAAAGAGATACCCATGAAAAAGACCTGAAAGAAAAGTGGGAGCAAGGGATGTCCATGTGTCCCCCTCACCTACGGGCAGACCAAGTTAAAAGGCTCTGGGGTAGGAGCTTTCCAGGCCTATTTGAATGGTAGCAAGAAGGTCTGTGTCATAATTGAGCGAGTGAGGGATATGAGAGAAGAGAGGTAAGGTGGGATCACATCATGTGGATCCTTATAGGCTACTGTAATGAGTTAGGCTGTGACTCGGTAAGATGAGACGACTGCAGACTACTGAGTAGGGGAAAGCCATCACTCTGGCTTCTGGGTGGTTAATAGACTGGGTGGGAAAGAAGGTGGTTCATATCATGTGGGTCCTTGTAGACCACTATGAGCACTTGGGCTCTAACTCTGAGATGAGGACATTGCAGGCTAATGAGTAGGGGAAAGACATGACATGACTTACATTTTAACATGATTGCTCTGTCTATGGGTGGAGAATATTCCAGGTGTATGAGGGACAAGTATGGGAATAGGGAGAATAGTCAGGAGGCTGTTACAGTAATATAGGCTTTGGACTGGGCAGGGGCGCGGGGGTGGACAGATTCTGGATACATTTTGAAAGGTAAGCTGACCAGAGTTGCTAATAGATCAAATGTGGAGTTAGAAGGAAAGAGAGGAATCAAGGAAGATACCTAAGTTTTTGACCTGACCATTTCTAGCTTCCAGTGAATTTTTTTTTATGAAAAGGAATTGAGTGTTTTAGCCTTTGTTTGTATTGTATATATTTAAGGTATATCACATGATGTCTTGATATACATATATATAGTGAAATGATTACTACAGTCAAGTAAATTAACATATCCATCGCTTCATATAGTTATCTTTTTTATATGGTAAGAGCACCTAAAATCTACCCTTTGCAAATTTTCAGTATACAATATTATTAGTCCTCATATTATACATTATATCTCTAGACTTACTCATTCTACATAACTGCAACTTTGTACCCTTCGACCTACATCTCCCTCTTTCCTCCCCCCACTGCCCCGGTAATCACTGCTCTATTCTTTTTTCTATATATTTGACCTCTTAAAGATGCCACACATAAGTGAGATCATGGAGTATTTGTCTTTCTGTGCCTGGCTTATTTCACTTAACATAACGTCCTCCAGGCTCATCCACGTTGTTGCAAATGACAGGATTTCATTCTTTTTAAGGCTGATTAATATTCTATTACATATATATATATATATATATATATCTCACAATTTCTATATCCATTCATCTGTTGATGGGAACTTAGGTTGTTTCTATATGTTAGCTTTTGTGAATAATGCTGCAGTGAACATGGCAGCACAGATATCTCCATGAGGTGCTGATTTTTTATTGAATACTTTTCTGCATCTAGTCATTATCAAATGGGTTTTCTTATTTGATTTGTTAATGTGGTGAATTATATTGGCTACTTTTTTCCCATTTTCTCCATCCTATTTATTCCACCATTTGTTTTATAAGTTGTAATATTTGAAACCATATTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACTTCCCAGCTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCACAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCAAAACCATATTTTTCTACTACTCATGTCTGCAAATGTATTGTACTGACATTATATCTTCTGACAAATAGGCTTTTAGGAGCAAGTATGGAAACCACCATTTGAAACATTGTTTCTACAGATAAATGAGCTTTGGATTCCAGACAACTGATTACCCTGTGAACTTTAGAAACCAAAGTGTTCTGAGATTGGAAAAAATATAAACTTCTACTGAGAGACTTCTAAGGGTGTTTAGTTTCCAGCACAATGTTCCAGAACTTCCATTTTCAGTATAGTGCAAGCTAGGGCACCTGGTCTCTGTCATGTTATGTGCAAATGATAGTTGACGCATGTTTCTTTTTAAG
Seq C2 exon
GTACCCTCACCTGAGTCCCAAGTACAAGGAGTCTTTTGATGTGGGCTGTAACCTCTTTGCCAAGTTTTCTGCATACATTAAGAATACACAAAAGGAGGCAAATAAGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000155962:ENST00000369449:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.140 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF134171=GST_N_3=FE(57.5=100),PF134101=GST_C_2=PU(16.0=53.5)
A:
NA
C2:
PF134171=GST_N_3=PD(0.1=0.0),PF134101=GST_C_2=FE(25.0=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development