HsaINT0059025 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000188107 | EYS
Description
eyes shut homolog (Drosophila) [Source:HGNC Symbol;Acc:21555]
Coordinates
chr6:64472354-64488073:-
Coord C1 exon
chr6:64487899-64488073
Coord A exon
chr6:64472527-64487898
Coord C2 exon
chr6:64472354-64472526
Length
15372 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TTAGTAAGT
5' ss Score
7.79
3' ss Seq
GGCTTTCTCTCAACCCACAGCTG
3' ss Score
9.44
Exon sequences
Seq C1 exon
GCTGTATTTTCACTCTTCAAGTTCGCACTGAGAAGGATGGCCATTTCAGAGGACTGGGAAATCCTGAGGGCCACCCAAATGCTGGACGCAGTGTTGGCCAGTGTCATGCTTCTCCCTGCAGTTTAATGAAATGTGGCAATGGTGGGACATGCATAGAGAGTGGAACTAGTGTTTA
Seq A exon
GTAAGTATGACGTTATTAGGAATGAAAGTAGCAGGTTGTTTGCACTCTAACTGGTACTCCACTCTGTCATTCCACTTGTACAAACTAGGAACACAAACAGATGCACATATTTAAAATGTTCTTATGTAGACTTGTTACATGATGGGAGGACAGGTGAAGGCAACTAAAAATAGGATCAGCACAGCATTTATGCCATCTTAGTTCTGTGAAACAATGACAGTGAATCACTACATCTCATTCCAGGCACCATGAAAAATATCACTTAAATCCATACTATTGAGAGAGTAGACAGAAATGTTAACCACACAAAGGCTTACATATTGGGATTTGCTTTCATATGTAGGTTTGAGCCCCTTTAGAAAGGGCAATAGTAAAGCTACACAATTTGACTTCTGAACTACTTTAGTATGAAACCAACGTGGACCCATTGAGTGAGAAGGAAAAAAGAAAGGAGAATGTTTTTATATTAATTACTCCTTTTGCTGAGCATCTCGTCTATGCAAAAGTAGTATATGAGGGGTTCTGGGAATATGCTAAAGAAAGTGGAAGTAAGCACTATGTCATTTAATTTCTTACACTCTAGCTACTCATAAATTTCTTATGTCTCATACATGTATAAGACAGCTAAAGAGAGATTTGTCAAAATGCTCCTCACAGGACACAGTGTTCACCAGGAACACCGGCTCCCTGCAAAGCAGCTGGGAAAGAGGAGTGTCAGAGTTTCTCCTGAAAGACAGAGCCTACCCTGAAGAAAGCATAGTTTTAAAAGACATGAGTGAATCTCTTACTCTCCCTGAACAAATCCCCTCCACCTCCTCACTAGAAAATGATCAAAAGCAAAGCTCAAACAACTGCTAGTCACAGTAAAATTTGTGGAGAAAAAAAATGTATAGTTTGACTCAACCCATGGAATTCCTGAGGACAAAATGTAAGGCTTGGGATGCCACCATCACAGAGCAATAACTTTTGGCATTAGCTTTACCACTATAATTTTATCATTACTTCTCTACAATTTTTAATGAAACCTTTAGATTGCTTTACAAAGTATGCACTCTAATTTGCTCTACAACTAAACTTAATTAGAAGCACACGTTTACTTCACTTTATCTAAAGAGTTGTAGTCATTCTTCAGGGGTTACTACTAAGTATTTTGGGGGTTTTTTTATGTGATAATAAACAGGGATCTAGAAAGTTGCAATAGGAAAGCATATGAAGTTGAAGGTGAAGGTGGGGAATCCATCCCCACCCTACGTTATTCCATGTGGACCAAACAGCCTAACAGTTTGAACCTAAGAGCCATATATATTTATCTTGGAATATATAGTGCCAAGTATAGATAGGTACTTAGAACCATTTGCAGATTATTTTGATTAATATAGAAATTTTATTGAGTTCCGATATTAAACGTAATACCTTACAATTGCACAGGACTTTGTGTGTAACAAAGCATTTTTTAAAATATTATTTCCATTGCTCCTCACTAAAACCCTCTAAATTACTCAATGCCAGTATCCTAATTCCAATATTATAGGGGGAAAATAAGCCCCAGAGACTGTGAGTAATTCGAGAGGATGTATGAGCACCCTGTGAGTAGTACAGCAGGACCCAAAATCAGATCTTCCATTTCGAGGGTCAAGATTCTCTCCAGAATCTAAATAGCAAGAAATGAACTTAAAAACAGCAAATAATTTTAATGAGGTAACAAGAGTGTTAAGTCGCTCTTTATTTACTGGTTGTAACCTGTTCATTTCATCTTAATTTTAAAAAATAACGTTGAAATTATCTTCAGTTGGCACATTGTATTTTCTCCAAATTGAAAATACCTTTCTTTATAACACATATCCTGGGGATTTCATAGATTGCCGTGTGGGTGGAATGCAGTATCTCAAACATGAGGGCCTAAATTTGAGTAACAAATAGACAAGCAATAATGTACAGGGGGAAAGATACATCTGACAAATTTCCTTACAGGATTCTAAAAATTTTTCTTATCAAAATTGTGACCAGTTTGGGGATCCTCTTATTGACATAATTACAAAATAATTACTAACTATGAAGATATACTACAGAGCCAGAAGTAGCTCTTGTGACCATCATTTAATAACATTAAATTTACAGATCCCTGAACTTAAAACAAGTGAATTTTATGGTAAGTAAATTATACCTCAATAAAGCTGTTCAAAAATATTAAGTCTCCCATTCACAGACATTCAGATCCAGTGGCAGCAGCAGTTTAAAGAATTTTATTCCTTTTGACAGTTTTAAACAATTCTTTTCTAATCTCAATATAAGAATACCTCCTTTAAAGAAAAAAAAATTGTGCTTTGTAATATACTTTTCAAAAGTGTTTAAGAAGTTTATTTCTGTACTTATCCTAGTTACAGATTCTTAATTTTATATGGCTCTAAACTTTATTTTTCAACTGAAGCAGGGTAATATTAAATTGAATTTCTAGGTAGCCTTATAGACAGCTCAAAGCTAAAGTTTAATCTTTTCCTGAAAAATAACTAACACACCTTATGAAATATTTGTTAAATGCTCAAGAGGCAAGTACCAACACAGAAGCACCAATTTTATGGTGTTTAGAATCAATTGTAAAAGGAAAACCTCAAAGCTGATCAAAGGGTCTTAACAATGAACAGTTTAATGTTATAAATTTAAAACAACAACTCAAAATGCTCCCTTTAGCTCCCTTCCTCTTAGCTGAGATGGGAGGCATTGTTTTGGTACATAAGGGAAAGTCTTATTCCAAGTAAGGAGAGAGATGGGGCCTGATAAGGTTTCCAGTGTGTTCAGGACCCTGGTGAAGTGATGAAAGCCCTTCTCTCCTGCTCCGAGTTCATCACCACACACAGATCCATCTGTGTTCTAATGGAATTTCTCAAATGTGAGTATCATAAGGCAGAGTTCATTTCAGGCCTTTATGCTCCTGGGATGAGTTCTGATGCAACAAAGAAATGTAAAACTATTTCTGTTCTTAGTAGCCAAGGATAAAAAAGAAAAAAGGTTACATTAAAACAAAATTTTTAAGTGAAAAACAAAAAATGGGTTTAGTTCTTAGTTCTATGTGTGTATGTGCTTGGTAGGTGTCTTTTTTTTTTTTTTTAGGTAAATAAAATGCTTTAATTAAATGGCTATTTGATTCCAAACTAAAAATGTTTAGTGAGAAGAAAGATATTTTACATTTTTGCCAATTTCTTCCACCATGTCTAGCTTAATAGGTGTTTTTAAGCAAGTTTTATTTAAGTGGTACTTTTTTCCTTTATTTTCTTAATTGACAAATAAAAATTGGATATATTTATCATGTAGAACATGATGTTTCAAAATATATATACATTGTGGAATGGCTCAAATGAGCTAATTAACATATGCATTACCTCACATATTTATAATTTTTTCTGATTGGAATATTTAAAATCTACTCTCAGCAATTTTCAAAACACAAGACATTGTTACTAACCATAGTCACCATGTTGTATAGTAACCTGTGACTGAGGACAATATGCAGATGTGTCCCTTTAAGAAAAACACAGTGTAGCCCTGTCATCGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGATGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGTCAACATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAAATACAAAAATTAGCCAGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAAGGTGCAGAGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGATGACAAGAGGGGAACTCCATCTGAAAAAAAAAAAGAAAAGCAGTGTAGGAAAAACAAAACTTACAAAAACAAGTTAGATGTTAAAATGAGTGGCACAGACAATAAGTACAATAGGAGTTGGAAGAATGTGGTTGTAAAAATGTAAAATGCATCAAAGATTAAGTTCATAAATGAGGCTTATTTACAACATAAATCTATCAGTGATCACAAAATCTCATTGATTCAGGATTTCCTAATTATTTTTTGTCTTATAAATGCCTTTGAGCATCAGGTCAAAGCCAAAAACCCTTTCTCCTAAAAACTGAACATACTTGGAACACAAAAATGTGCTTATCATTTTAGAGGTTTACAAACCCCTAGAACCCAATAATAGATTCTCTAAGGTCTGCCAAAGTTCCCAAATTAAGCATCCTTTGCTCAGACTGTCTTCTTTTATATATTTTGTCCAACAATGCTTAATTCAGTCTTCTATTACTCCTCATCTGGACATGTAATTGTTTTCCAACTAGTGACCTGTTCCCTAAACACTCCTAACCTTAATCCAGGTTGAATCTTCCTAAAATCCTCTTTGCTCTTAATCATTTTCCTGCTCAAAATGTTTCCTGGTTTTCCACTGCCAATGCAGCAAAATGTAAATTTTTAATCTGTTGTCAAGCTATACATGACTGTTATCAACCTGCCTATTCCTGCTATTCTTTTTCTCTCTGCATTGCAATCAAATTAATTGTACTACTCTATCCCGCCTTCCAAGAAACCGCCTCTCCTTACCAAGCAATCAGCTGAGTTTCTTGTGAAGCTATGGCCAGCTTGGTAACTCATTACCTTGTACTGGTTCTCCTTTTTTCCTCCTCCCTTTGCTTTTCTCTCACTGTTGCTTCCTTGAGAGAGTACTCCCTACTTCCTTGGAATTACCTTTAACTCTGTCTTTTAGAGATTCCAATTTGAGGTAGATAATTTTTCTCACCTATGAGGTTGGCAAAAAGCTAAAAATATGACTAATCTATTAGTGAGGCTGTAGAGAATCAGACACTATTATGTATTAGAGCAAACTAATTTCTCTATTTGTTAAAACAAAGACTGGAAACTGCTCAAATGTTCATCACTAGGTATCTTGTTGAAAAAGCTAAGGAATGTTTATATAATGGAGGACTTCACATACATAAAAAAAAGACCTTTTATATGTTGCTATGGAGTGATCCTCAGGACTTATTAAGTGAAAAAAATCAGGGTAAAGAAACATGTAAGAAAAGGGGATAATAGATATAGATAAACAGATATAAATACATAAATATAGATACACATACAAATATGCTCATATTTTTCTAAGAAAAAAATGCAAGATTACACACACACAATTTATAAATAGTTATCTATAGGGTAAGGGAGAAAACAAGAAGTAGTAAAAGGATAAAAGCTAGACTTTCTAACTATAATTTGCTTTACAGTTTTTATTTGGAACCAGGTAAAATGTTTCACATGGTCAATTAAAAATGAAAAAGACCAATTTTTAAATACTGAAGAAAAATTAGGAAATGAACTGTACTTCAAGTTGGTAGCATAACCAAGCAGAAAAGATTTAGTTCAATTGATTTTAAAACACAATATTTTGACTATACAGTAGATTATAGCCTAAAGACAAAAAGAACCATAAAGAGATTCTATTGCATCCTGTAGTCTTGATGTTAGTGGTAACATTGATATTGTTATTTTAAAACTATATATAAAAATACCCAAATAGCATTATATTTATATAACACATAGATATATATAAACCAAATGAACAATTATATTAACATTAATCATTAGGAACTAGAATTTTCAGCATGAAAGAGATCTAGGCATAAAATCAAAGAAGTAAAAATCATTCTAATCCTTAATATGAACTGGAATTAATGTATGAACTCATTACTTAACTTTCTACTCAGGAGGCTGAGGAGGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCACCTCAAAAAAAAAAATCTTTCTTTTTTTTTAAAAAATTTCCCAGCTATATCTGCTAAAAAGATTTAGAAACAATAACTCAGTATCAATGAACACTTCTAGTGCCAAAATTGTCATCTCCAAATACCATTTTCCACTAAAATGAACCAAGACTTCTTGGAGAATTGTACACTCAGCTCTAGGACAGAAAATACATAAGCCTAGATATCTTTTTATGCCTAAAAGCAAGAATGTTAACAAAGACAACTATGGTTATATTAAAAGACAACAGGAGCCTACTTAAAGAGACTCCCACTGGCCAAAGATGAGACATTTTCAGAAAATTATCTTTCCATAGTCAGAAAATATGGAAAACTTATTTGAAGAGTGTAGATTTTAAAATAAGCTCACATTTTTTGTTTCTTTATTATTTAAGTAGCTGGAAAATAAGAGTCAGAGGTAAGAATTCACTGTGGATTTTCATCAAGCCTCCCTACACTGTGGCTTAAGAGTAACCTCTTTTCTCTCGTGGTCTTTTTATAACTCAGATGTCAGTTACTTTCTACCAGACCCTTGACATCTACATAAATTGTGAAGATTCCAAAAGGAATGTTTATCTTCTAAAGTCATCTCTAGCTCACCAGTCTTTCACCCATACTGTGTATTCCATATCACAGATGCCTAAAAGCTACAATCAACTTCTTTAATTTCTATCAAATTAACAAAGCCATTTACATTTTTAGATCAGATTGTTTAGATTGGTGCAGGGGGTGGGGAGAGGTGACAATGTTGAAGGAAGAGGTTTATATCATGGCCACCTAAATAACTTCCAACTTGTCTTTTGGTCACCCCACCACTGCAGTAAATACATGGCAATTCCACTCCAGTTTTTGTCTTCTGTCCTTTGCTTTGCTTTTTTCCAACTGATCTGTAGGTTAAAACAAACCACAAGTCCCTCCTGGTCTCAGGCAGAGTAATTTATCATCTTATTTTGTAGTCCAGGCTCATGTTCATCCCAATGCAACCAGGGTCCACTGTCTACTCCAAGCAGCTCATGTAGTTTCCCAAAGACAGTTCTCTCCTTAATAGGAATTCTGAGTGCAACTGTTAACATACTACAGTGTTCAAGCCCTTAAACCTGAAGAACTACAAAATAAGGCCTACAGACAACTGCCAGTATTTTCATTAGTATGTAAAGAGTCATTTCATCTCATCCTTCTTACACTCTGTGAGGTATCACCAAGGACCTAGGTGAGTATCTCACCAGCAAAGAAAGGAAGGCCATAGGGGAATGTCAGCAGGTGGAGTGATTATTATAGCAACCCGTCCTAGTAAACATGTCGAGTTTCAATATGCCATCACATTCCAGTGTACGATGAGGTTCATTTGTTTTAACACTTGATTGTATATTCTTCAAAGACTTCAAATTTTGAGCATGTCATTTAAAATCCAGCAAATTTTGGCAGGTAAAATGTTATACATCATATCACACTTACCTTATTCCCCCAACTTGTTACTCAAATGGAAATAAGCCATAAAGGAAAGCAATTTTATATGAATTAAGTCATCCACACAGGAGATGACCTGAGAAGATAATTCAGCTATGTTTTCCTTTTTCTTTAAAGAGCAGAGAAATAAGTTATATATGCAGAACTAGATTCCTTTAGGTCGTGTGATCGCCCATTGCTAAATTACATGCGTTTATTATATTATTCATTTGACTTTATCATCACACCACATAGATTTTGTGTCTGTGCTTTTGCTTATGCATAGAAAACCCACAAATCTATAACCAGAACTTTTTTACAGATCCAGCTCAAGGTAAATTTTCTCCAATAACTTTCATTCTCTGTTCTTATCTCAGCCTCAACATATACATAAGAATCTCTCTTGTCCAAAGCATCAAAATCCATATTTGATAGGTAAGCTGAAAAAGTAGGCTAAGCAGAGATTATATTTTTCTGTATTAGCTTCTCATCTGCAATCTGAGAGCTAATAATAGTATTTACTTTGTAGGTTTTATATGGTGATTAAACTTTGATTAAGTACTACATCAAAGTACTTAAAATGGTGCCTGGCACTAAGGTAAAGCCCTAAGAAACTGAATATTATATTTTATATATATCATATATTTCATACAAATACATTATTCTAAATAAAGTAGCAAGTCCTCAGGGTGGGGAACAAGACCATGTTTTCTATTTTGTACTCACCTTGGTAACGAAGTACAATGCTGCTCTATATTCCCTCTTTGGTAATGTTTAGTAAGTGAATGATATTTAACAAAAAACATTAAATCTTCTATTATCTCATTTTCAGTTAATTTTTTATATCCATGTTCATACTAAACTCTTACAGTCTTAGACTTGCCTAAGTACAAGAAAATTAAAATCTTCATGTTGAATTTCTATAGTAATGAGGAAAAATTAACCCATAGAAGTTCTAAGCTATAAAATTGACGGTCAGAACTAAACAATTTATCTGCAATTTAGGAATTCAAATGAGTTTCATTCTAAATGCACAGAAGTAAAATAATTAACTATATTAGTAAGAACATACTCTAATATTCATCTCTTGATTTACTATCATGATGAGCTATTAATCACATTTCCAAAGTGTTTAACATTTTATTCTCTGCTATCATCTGTTTATGTTTGGAGACAGAAGAACCCACAAATTTTTCCTTGTACTGACAATTAAGGATACATAACATTTTTTGAATGGTCTTGAAATAAGAAAACAGTGCTCTGTATAATGTTAATGATTCCTCAGTATAATTTAAGTAGTCTTAGGTATTGTATGCCAGGTGCATGTGTCCCAGCTCTTTGCCTGCTAGTCTATTTAATTAAATCTGCCTTATGTCCTGAACTATCATCAAATTTATGAGCCATGTCCCTAGATGCTTATAGAAAAAAAAAAGCTATTTTATCACCTACTCTTACCTTCAATGCAGTCTAGCTAAAAGTGGGGTTTTTTTCAACTTTTCTTTTAGGTTCAGGGTGTCCATGTGCAGGTTTGTTACGTAAGTGTGTGTTGCCGAGGTTTGGTGTACAAATAATTCCATCACCCAGATAGTGAGCATAGTACCCAATAGGTAGTTTTTCACCCCACATTCCCTCCCACCTTCCTACATCAAGTAGTCCCCAGTGCCTATCGTTCCCATTTGTTTGTGTCCATATGTACTCATTGTTCAGCTCCTACTTATAAATGAGAATATGCAGTATTTGGTTTTCTGTTCCTATGTTAGTTTGCTTAAGATAATGGCCTCCAGCTGCATTCATGTTTCTTCAAAGGACATGATTTCATTTTTTCAATGGCTGTGTAGTATTCCATGGTATATATGTACCACATTCTCTTTATCCAGTACCCTGTTGATGGGCATCTAGGTTGATTCCATGTCTTTGCTATTGTGTATAGTGCTGCGGTTAACATACAAATGCATATGTCTTTTTGATAGAATGATTTATATTCCTTTGGGTATATAGCCAGTAATGGTATTGCTGGGTTGAATGGTCGTTCTAAGTTCTTTAAGAAATCTCCACACTGCTTTCCACAATGGCTGAAGTAATTTACATTCCCACTAGCAATGTGTAAGTGTGCCCTTTTCATTGCAACCTCACCAATGGCTGTCATTTTTTTTACATTTTATAATAGCCATTCTGATTGGTGTGAGTTGGTTTCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAACGATTAGTGATGTTGAGCATTACTTAATCTATTTGTTGATTTCATGTATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATGTCATTTGCCCATTTTTTTAATGGGGTTGTCTGTTTTCTGCTTGTTGAATTGTTTAAGTTCCTTATAGATTCTGGACATTAGACCTTTTTTGTTGTGTAGTGTGTGAATATTTTCTCCCATTTTGTAGGTTGTCTGTTTACTCTGTTGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTGGTTTAATTAGGTCCCACTTGTCAATTTTTGTTTTTATGGAAATTGCTTCTGGGGACTTAGTCGTAAATTCTTTACCAAGCCTGATGTCCAGAATGGTATTTCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATAGGTTTAGATCTTAAAGTCTTTAGTCCATATTGAGTTAATTTTCATAACATATATAATGAAGGGAAGGGGTCCAGTTTCAGTCTTCTGCATATGGCTAGCCAGTTATCCCAGCACCATTTATCGAATAGGAAGCCCTTTCCCCAGTGCTTGTTATCATTGACTTTGTTGAAGATCAGGTGCTTTTAGGTGTATGACTTTATTTCTATGTTCTCTGTCCAGTTCCATTGGTCTGTGTGTCTGTTTCTGCACCAGTGCCATGCTATTTTGGTTACTGTAGGCTTGTAGTATAGTTTGAAGTTAGGGAGTGTGATGTCTCCGGCCTTGTTCTTTTTGCTTAGGATCATTTCAGCTATTTAGCCTCTTTTTTGTTTCCATATGAATTTTAGAATATTTTAATTCTGTGAAAAATTATGTTGGTAGTTTGATAGGAATAACATTGAATCTGTAAATTGTTTTTGTCAGTATAGCCATTTTAACCATATTGATTCTTCCTTTCCATGAGCAGGAAATCTTTTTTCATTTGTTTGTGTTATCTCTGATTTCCTTTATCAGTGTTTTGTAATTCTCATTGTAAAGATCTTTCACCTCCTTGGTTCCGTATTCCTAGGTACTTTATTCTTTTTGTGGCTACTGTAAATGGGATTTCATTCTTGCTTTGGTTCTCACCTTGGATGTAATTGGTGTATAGGCATGCTACTGATTTTTGTACAGCGATTTTATATTCTGAAATTTTACTGAAGTTATTTATGAGTTCTAAGAGCCTTTTGGCAGAGGCCATGGGATTTTCTCAGTATAGAATAGTATCATCTGCAAGGAGAGATAGCTTGAATTCCTCTCTTTCTATCTGGATATCTTTTCTTCTTTCTCTTGCCTGATTGCTTGGGCTAGCACTTCCATTACTGTGTTGAATAGGAGTGGTGAGAGTGGGCATCCTTGTCTTGTTGCAGTTCTCAAGGGGAATGGTTCGATCTTTCACCCGTTCAGGATGATGTTGGGCTGTGGATTTGTCATAGACTGCTCTCATTATTTTGAAGTATGTTCCTTCAATGCCTAATTGTTGAGGGTTTTTAACACAAAAGAAAGTTGAATTTTATCAAAGTCTTTTCTGCATCTATTGAGGACATGATATGGTTTTTGCTTTTAATTCTATTTATGTGGTGAATCAAATTTATCAATTTGTGTATGTTGAACCAGTCTCCATCCCAGGAATAAAGCTTATAAAAGTGGATTCTTTATGTTTTCCCTTTACTATATTGCTATCCAGTTGTCCCTATTTCACTAACAACACCATACTCTTTCATGGTCCCAACATTTCCACAGGATTGAGAGACATAAAATGGTGACTAAAAGGTGGATTTCCTCGCTCATTAGCAGACTTAACCTCTCTCTTCCTTAGATTCCTTCTCTGAAAAATGAGGATGATGCTAGTACCCTTCTTATAACATAATAGAGAAACTAGAAAGGTTAGAAGACTGCCTGGCACATGGTAAGTGACAAATAATGTTTGTCATTACTATAATTTTTCCTCTTTCATACTAACACACTTACCAAAGCCTTGAAAATGCCTCTCACATCTACTTCAACCTCTGCATCCCCACAGCAATTTTCCTATTCAGGACTTTTGCCTCCATCTGCTTTCTTATCCCAGCCATGACCTATTATATTTATTCATTTGTGTGTTTATTCCATGAATAGTCAATGAAAACTTACAATAAACCAAGAACTGTTTGGGGCCTTGAGACAATAATAAAAAACAAAACAGACCCTATCTCTGCTCTTACGGAATTAATGGTCTAGAGTGCCGGGGTCAGAAAACTATGGTAGATGGGCCAAATCTGGCCTACCACCTATTTGTGTAACTAAAATTCATTGGAATACAGCCACACCCATTTGTGTGTTTTCTGTGGCTGCTTTCAACAATGGCAGAGTTCGGTTATTGCAACAGTGTCTATATGGCCCACAAAGCAAAACTGTAAACTGCCTTGCCCTTTACAGAAAAAGGTTGCTGGCCCCTTTTCTAGTAGCAAAAAAAATATGCTAAGATCTCACTAAGATTAAAATTACGTCACCAGAGAGCTTATTGTTACACTATGCAGTCATCCTACACATAACAGATCAATATTCTTAAAATGTGCCTCCTCATTTGTGTCATTTTCTATACACCTGTCATGTCACTTGAAAGTTGAACTGAAGCCAGGCACAGAAAGGCAAACATCACATATTCTCACTTATTTGTGGGTTCTAAAAATCAAAACAGTTGAACTCATGGAGATAGAGAGCAGAAGGATGGTCACTAGAGGCTGAGAACGGTGGTAGGTAACAGGGAGGTGGGGATGGTTAATGGGTACAAAAAACTAGTGAGAATGAATGAGCAAGGACTAGTATTGGATAGCACAACAGGGTGACTATAGTCAATAATAATTTAATTGTACATTTTAAAATAACTAAGGAAGTATAATTGGATTGTTTGTAACACAAAGGATAAATGCTTGAGGGTATGGATACCCTATTTTCCATGATGTGATCATCACACATTGCCTGCCTATACCAAAACATGTCATGTACCCCAGAAATATGTACACCTACTATGTACCCACAAAAGTTAATAAATAGTTTTAAAAAAAAAAAAGTTGAACTGCCTGAGCCTGCTGTTCAAAGTCCTTTGACACCTCCTTTCAGTGCATACATTTATACGGGCAAATCTCACTCTGGCGGCCTTTCCTAAGCCTTCCCTAAGTAATTCACTAAAATTACTTAGATGCCCATCCACAGGATACCATAATACCCATTTTAGAACTTGTCCCATTTTATTAAAATTGTCTCCTTACTAATCTGATTTCTCCAAAATACAGAAGTCCATGAGGTCAAAAATGGAGCCTCCTGTGTTGTAGAATCTCAGTATCAAGCACAATACTATGCTCAATCCTAAGATAAGCACAGACAGCTAGCCTGTAAAAAATAATAAACATTCTTTAAATAGATACCTACCTCTGTTTTGTTTTTACATTGCCCATTATATAGACACCTCACCTCACACACATACTTCTACAAAATCTACTCCTCCTCAGGGCAGAGTAGTATATGTGGTTAAGGGAAGAAATATTAATGAATTAACATCAAGGGTTAGAAAAATATCACCCAAAGTAGAGAATAACTAATGAAGGCTTGAAATTTTTTTATTATCTCTATTTCACAGGGTGCTATAGAAACCAAGGAACAAAAAGAAAAATCTGACCTTGCACAAAATCATTCTCATTAGAATTATATAATAACTAATTATATATTAAACATATAGCTAATTGTTTCAGACCTAAAAATTCTGAGACAAACTATATGAGGCTCCGATTTGTTATTTTTTCAAATAAGATTTTGGCATCTATATTAAATTATGCTTAATGTGATTTATCTACTTTAATATCCAAGCAAGTGTTTTATTCCCATAACACTATGCTATATACCTTAAATATATACAATAAAGTGTAAGTGAATTAAATAAAATATTTTACCATTGTGAGCTCTGTCTATAAGGCAGTGAGAATAATTTTAAGCTTTTTTCAAGTAGATATAAAATGAACCACTAGATGGCGCAATCGTCACTTTAAAAAGTAATGACAGCATCACGTTTAAAAATTCTTTAATAAGAATTTTTACTATAGTTTTATTTCTTTTGTGAAATTAGTTACTGATTTCCTTTTTTGTGTATGAGGTCTTTGTACATTCTATACTCTTTGTGATCTTCAAAAATAATCTTCAAAATATGCAATTTTGTAGCAGATTAATTCTGTATTTTGTTTGTCTCCATTTTAGAGAACCCTATACAATTTTCCGTTTTTTGCACAACTATTAATTTAGGTGTAACAAGCATATAAAAGTCTATGACATAAATAAAAGGTCTGGGAAGGTGTGATCAGCTGCTGTCCTCCAGCTTAACAGATTCTGATCCCTATACCTCATACCCATTCTAGAATGCGCTTTTTAGACTGGCACGGTGGTTTATTGCTCTCTGGCTCTGACAGGAATTTTAAGTTAACCCTTTCTCTCATGTACTCTTTAGTGTAGTGTTTTCAGAAGAAAGAAAGGGGGATGGTGGGGAGAGAAAGGGAAGGAAGAAAGGGAGAAAGGGAGAAAGGCAGGCAGGGAGTGAGGGAGGGAGGGAGGCCGGAGGGGGCAAAATAAACACACGGTGCCCTGACAAACAACAGTTTATCAAATATATATATATATATATATATATATATATAACAAGATATAACAATAAAATCTCAAATATTATTTATTTAAAGTTCATATATTGCATGGGACATGTATTAGTCCGTTCTCAGGCTGCTAATAAAGACATACTTGAAACTGGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCAGCATGGCTGGGGAGGCCTCAGAAAACTTACATCATGGTGGAAGGGGAAGCAAACATGTCCTTCCTAACATGGTGGCAGGAAGGAGAAGAATGAGCGCCCATTGAAGAAGGAAGCCCCTTATAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTAACTCATTACCATGAGAACAGGATGGGGGAAACCTCCCCCATGAGTCAATTTTCTCCACCTGGTCCCTCCCACAACACATGGGGATTATGCCAACTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCAGGACATACTTCTACTAAGAAAAGTTATTATTTAACTTATGTTTAAATTTAACTAGATGCTCTGCATTTTATCTGACAACTCTGCCTTTGATGGGTCTATCAGAAAGTTTTCTGCTGGGCTCCTCCCAATATCACTCTCTAAACCCAGACAAGGTGTCTCTTTCAGCTGAGTATTCCCCATTACCCCTCAGCTTCTGCTCTAGCCAGAAACCACTTACTGCCACTGTATCTTTAGCTAGAGGGACACCTCTTGGTCAAGATTCATTTTTATATGTCCTCAAGCTATTGTTCCTGACTATGAACATCCCTTTCCTGGGATTCACTCACGTTTGACTTGTCTCCAGTATGTTTGCAGCTCTTTTGGCAACCCCAGGAGCTGAGCCTGTGAGTTTGCCAATGCCAGGGAAAAACACACCAAGCTCTCCAAGTGGTCCTGCTGAATCTCTTTTCACTAGGCTTGAAGTTAGGAGACAGCAACACCATGCACAGCTTTTTCTTTAGGTGGTGGTGTGGGAGTTGGGAGAGAGACTTACAATGCAATTTTGTCTGAAGAAACAATTCTCAAAAAATTCTCTTTCAATTTTTACACTCTGAATCGTTTAAAGTCTTTGGTGTGGAGTCCAGTAATCCTATAACCAGTTATTAACTCTTTCCTTTGACAATTTAGGGTTTGAATCACAATTCATTTTGATCTCTTGGAACTTCAGTTAAAATTGACAAGTTAGCATCAGGGCAATACATAGTATGTATCCATCTCTAAACAAGTGCTCAAACCATGCGGCTTTCTCTCAACCCACAG
Seq C2 exon
CTGCAATTGTACCACTGGGTGGAAAGGATCATTCTGCACAGAGACAGTTTCTACCTGTGATCCTGAACATGACCCTCCACACCACTGTAGCAGAGGAGCAACCTGCATTTCATTACCTCATGGATACACCTGTTTCTGTCCTCTAGGAACCACTGGAATCTACTGTGAACAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000188107-EYS:NM_001142800:40
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.169 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0221019=Laminin_G_2=PD(7.6=16.9),PF0000822=EGF=PU(61.3=32.2)
A:
NA
C2:
PF0000822=EGF=PD(35.5=18.6),PF0000822=EGF=WD(100=61.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Rat
(rn6)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)