HsaINT0149315 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000109686 | SH3D19
Description
SH3 domain containing 19 [Source:HGNC Symbol;Acc:30418]
Coordinates
chr4:152108575-152147238:-
Coord C1 exon
chr4:152147199-152147238
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr4:152108575-152108615
Length
38583 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATGA
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
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Zebrafish
(danRer10)
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
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DEU primates (Only for human)