HsaINT0149320 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000109686 | SH3D19
Description
SH3 domain containing 19 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30418]
Coordinates
chr4:151165589-151175674:-
Coord C1 exon
chr4:151174670-151175674
Coord A exon
chr4:151165697-151174669
Coord C2 exon
chr4:151165589-151165696
Length
8973 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTGAGT
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8.83
3' ss Seq
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3' ss Score
6.33
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
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Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
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No suggested primer sequences
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- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains