HsaINT0187964 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000075292 | ZNF638
Description
zinc finger protein 638 [Source:HGNC Symbol;Acc:17894]
Coordinates
chr2:71558889-71577401:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
16877 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTAGGA
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.702
Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
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C2:
NO
Main Skipping Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
ENSP00000264447, ENSP00000264447f1109A, ENSP00000264447f1110A, ENSP00000264447f1111A, ENSP00000264447f1113A, ENSP00000264447f1114A, ENSP00000264447f1115A, ENSP00000264447f1116A, ENSP00000348066, ENSP00000367033, ENSP00000367033f1112A, ENSP00000386669, ENSP00000388164, ENSP00000396909, ENSP00000402875, ENSP00000408557
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)