HsaINT0188146 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000197472 | ZNF695
Description
zinc finger protein 695 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30954]
Coordinates
chr1:246999912-247008056:-
Coord C1 exon
chr1:247007906-247008056
Coord A exon
chr1:247000075-247007905
Coord C2 exon
chr1:246999912-247000074
Length
7831 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTGAGT
5' ss Score
10.13
3' ss Seq
AAATATGTTTTCTTTTTCAGGGA
3' ss Score
11.38
Exon sequences
Seq C1 exon
TTTGTCTCCTTGCGGCCGGCGGGGTGCTGGGTTCCCGTCTGCTGCCTCTCGGAGAGTCCCGGGTGACTGCCGCAGGCTCCATCGCCCTGTGGCCTGCAGGTATTGCGAGATTTATAGGGAGGACGCTGGGACCCCCAAAAGCTGGGAAATG
Seq A exon
GTGAGTGTGCGGAGCAGGGTGTCCCGAGAAGGGAGAGGGGGTGGTTGGAATCGGTTGGAATTGGCTGGAACCAGCGCTGGCGGCCCCGGGCCTCCCGGCGGTCGGCTCCGGAGTGTGCGGCCGAGTCCCGCTGGCGCAGCTCGGCCCTCAGTCCCGTCCCGCGCAGGTGGGGGCCGGGCCGGCAGCGGGATCCCGGCCGCTGGGTGACTGTCCGGTCTCTGCCTGGTGACTTCGGCACGGCCCAGAGCCCTCCCGGGGCAGCCCCGCGCCCGCAGCGCCGCGTCTTCCCTGGATTGTGCTGTGATGACGGAGGGGTTGTCGGGAGAGTCCCGACTCCCGTGAAAGGTTCCTGGGTGGGAGGAGCTGTGGTCTGTGGGTTCCTTTCTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCCCTGTCGCCAGGCTGGAGTTCGGTGGCTCGATCTCGGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGAATTACAGGCGCCCACCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTATTAGAAACGGAGATTTCACCATGTTGGTGTCGATCTCTTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGTCTCCTTTCTCCTCTTAAAAAAATAAACTGAAGCACCTTTGAAATGTTAAGGAGTTTATTCCAGCAAACAGTGATTTATGAATCTGGAAGCCCCTAGCCCTGGTTTGGGGCTAAACTTGAAGGGAAGGTCTTCATAAGGTGCACGAGGAAGCAACCACGTTTAATAATTGATCGGTTGCCATTATGCAGTCACCTTATTTGGACTGTCCAGGATGAAATTTCCTGATTATGTAATAAGAGATTTATTAGCATTTAGTGGTTGGTTAAGCCTACGTTTTGTTTTTCTCCAAGTTTGCAATTTACAAGAAATTCATCTAAGTTAGCTAGGATTCCTTAGATAGAATCCCAGGACATCAAAGCCACTCAGTCTAATTGTCTGCCATTTAAGTATTCTAACACTCCACAGGGGAACTGGTTTTCCCAGCATTTTTCAAATGTATGGCAAGCAGGACCTCAAATCCAGGACTCTGTTCCCCCAGCCTAACTGTTTTAGGGCCTGAAGGAAATCTTGTTTCCAGTTTCTTTTCTACATTCCCAAATGCTAACTTTGTCTCTCCAAACACAACATTATCAACTATTTGTTCTTTTTATTTATTTATTTTTTTTGAGACGAAGTCTCACTCTGTTGCCCAATGGCAGGTAAGCTGAAGTGCAGTGGCACAATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCGTCAGCCTCCTGGTAGCTGGGAATACAGGCAGGCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATTATGTTGGCCAGGCTGCCCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAACCACCGCGCCCGGCTTATTTGTCCTTTATTTGCTTTTCAAACAGATGCAAGATTTTAACGGTTCTTTTTTGTTTTTTTCACAGTGCAATGAATGGGCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACAGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATACTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGCGTGTGCCACTATGCCTGGCTAATTTTTGGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCCTGTTAGCCAGGATGATCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCTCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGTGCCCAGCCATGAGTGGCTTTTTAAAAAATATTTTCTTTCTGTTCTGAACATTTCACATGAGAAGAAAGCAGAGAATAATCACTTGACACTCTGCTGTAAAATCTTTACTCAGCCAGTGTCCTGGATAGTTTCCTTGATGTTTTCTGTTCATAGTTTGAGGTCTTAGATTTACGTCTTTAATCCATTTTGATTTGATTTTTTGTATATGCCTAGAGACGGGGGCCAAGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTATCGTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACAGTCTCACTCTGTCATCCCCTGGGCTCAGGCTATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAAACTGGGACCACAGGTGCAGGCCACCACAGCTAGCTAACTTTTGTATTTTAATAGAGACAGGGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCGGACTCCTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGACCCTGCTGCTTTGGCCTCCCACAGTGCTGAGATTACATGCATGAGCCACCACACCCGGCCAAGGGGTCAAGTTTTATTCTTCTGCATATGAATATCCATTTTTCCCAGCACAACTTATTGAGAGACTGTTGTTTCCCCCAAAGTATGTTCTTGGTGCCTCTGTCACAGATTAATTTGCTGTAGATGTATGGATTTTTTTCTTGGTTCTTTATTTTGTTCCATAGAGCTATGTGTCTTGTTTTATGCTAGTACCATGCTGTTTTTGTTGCTATAGCTCTGTAATATAATCTGAAGTCAAGTAGAGTAATTCTTCCAGTTTTTTCCTTTTTGTTCAGGATGGCTTTGGCTATTCTTAGTCTTTTGTGGTTCCAAAAAAATTTTAGGCTTAGTTTTTCTATTTCTCTGAAGAATGTCATTGGTATTTTGGTAGGTATTACACAGAGTTTATAGATTGCTTTGTGGAGTTACGGACATTTTAACAGTAACATTTTAACAGTCTTCCAATCCATGAACACAGAATATATTTCTGTTATTTTGTGTGCTCTTCAGTTTCTTTCATCAATGGTTTATAGTTTCTGTTGTTGAAATCTTTCACTTCTTTGGTTAAGTTTATTCCTAGGTATTTTATTTGTTGCTATCGTAAGTGGGATTACTTTCTTCATTTCTTTTTCAGATTGTTTGCTGTTGGCATATAAAAATGCTACTGATTATCGTATGTTAGTATTGTATCCTACCACTTTACCAAATTTGCTTTTCAGTTTGAATAGTTTTTTGGTAGAGTCTTTAGGTTTTTTCAAGTGGAAGATCATATCATTTGCAAACAAGGATAATTTGACTTCTTCCTTTTGAATTTGGAGAGCTTCATTTTGTTCTCTTGTCTGTTCTAGTTAGGACTTACAGTACTAAGTTGAGTAACTGGTGAAAGTTGGCATCCTTTTCTTGTTCCACATCTTAGAGGTATAGCTGTCAGTTTTTCCTCCTTCAGTATACTAGCTGTGGGTCTGTCATGTATGATTTTACTGTGTATGCTCCTTTTATACTCAGTTTTTCGAGGGTTTTTTTTTTAAATCAATGAAGGATGTTGAATTTTATGAAATTCTTTTTCGGCATCAGTTGAAATGATCATATGGTTTTTCTCCTTCATTCTGTTAATATGATGTGTTACATGGGTTGATTTACATATGTTGAACCATCCTTGCATCCCTGGGATAAATCCCACTTGGTCATCATGAGTGATCTTTTTTGTTGTTGTTCTTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTCTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCCTCTGGGTTCAATGATTTTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGATGCCTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGATCTCAAACTCCTAACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACATGCCCGGCCCTAAGAAAAAATTTTTACTGTCATTCAAATACTAAGAATTTATGAATACACATTTTTAGAAATATAGTTCTAATGAAACAGTGTTTCAGTGTGGAACATAATGTATTTACCAACATCTAAATGTATTTTGTTTTTCTGAAATAAAAAGCCCAAAGTATGTAAGATGAACTCAAATTTAGTAACTAAATGTCTTAGCATTACATCTTATTTGGAAATGATCTGGATATTTAATGAATATCCATCACTGAATTTAGTTTACCAAAACTATAAAGATAGAGAAACTTTTTCCCCTATAATTTATTTACAATTTATTTATTTTTTCTTTTCCAATGTTTATTTTAGATTCAGGGAGTATGTGTGCAGGTTTGTTATATTGGCAAATTTTGTTTCATGGTTGTTTGGTGCACAAATTATTTATTTCATTACGCAGATAATGAGCATAATATCCAACAGGTAGTTTCTACTCTTGCCTTCCTTCTACTCTAAAGTCGGCCCTAGTGTCTTTTGTTCCCTCTTTGTGTCCATGTTTACTCAATATTTAGCTCCCACATATAAGAGAGAACATGCAGTATTTGGTTCTCTGTTCTGTATTAATTAAATTATCCAGCAGCATTCATGTTGCTGCAAAGAACATGATTTTGTGTTTGTTATAGCTGCATAGCATTCCCTGGTGTTCATGTATGTCATTTTATTTATTTAGTCCATTGTTGATGGGCAGGTAGGTTGACTCCATGTCTTTGCTATTGTGAAAAGGCTACAGTGAACATACACATGCATGTGTCTTTATTGGAGAATGATATATACTCCTTTGGGTATATACCCTGTAATGGGATTGCTGGGTCGAATGGCAGCCCTGTTTTAAGTTCTTTCAGAAATCTCCAAAATGCTTTCCACAGTGGCTAATTTATGTTTTCACCAGCAGTGTATAGGCATTCCTTTGTTTCTGCAACCTCGTTGGCATCTGTTATTTTTTGACTTTCTAATTATAACCATTTTGAATGGTGTAATAGAGCATCATTGTGGTTTTGTGTTGCATTTCTCTGATGATTAGTGATGTCGAACTTTTTTCCATATGCATGTTGGCCATGTGCATATCTTCTTTTGAGAAATGTCCCTTCAAGTCCTTTGCTGCCCCCCCCTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTTTCACCCAGGCTGTAGTGCAGTGACACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCTGCCCCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCTTCAGCTTCCCAAGCTGGGATCACAGGCATGCACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCCGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGTATCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACATGCGGGAGCCACCACGCCCGGCCTTGGTTATTTCTTTTCTTCTGCTAGCTTTGAGGTTGGTATGCTCTTGGTTTTCTAGTTCATCTAGGTCTGACCTTAGGTGGTTAATATGAGATTTTTCTAACTTTTTGAACTGGGCATTTAGCACTATAAACTTTTCTCTTAACATTGCTTTAGCTCTGTCCAAGAGATTCTGGGATGCGGTATCTTTTTTTTTATTAGTTTCAAATAATTTCTTCATTTCTGCCTTAATTTCTTCATTTCTGCCTTAATTTCATTATTTACCCAGTCATTCAGAAGCAGGTTATTTAATTTCCTTGTAACTGTATGGTTTTCAGAGATATTCTTGATATTGAGTTCTGTTTTTATTTAACTGTGGTCTTGAGAGTGTGGTTGGTGTGATAACAGTTTTTTTTTTAATTTGTTGGTAATTGTTTTATGGCCAAGCATGTGGTTGATTTGAAAATATATGCCATGTGCAGGTGAGAAGAATGGGCATTGTGTTGTTGAATGGAGTGTTCTGTAGATGTGTATTACGTCCGTTTGTTGAGGTGTTGAGTTCAGGTCCCTATCTTTGTTAGTTTTCTGCTTTGATGATCTAATACTGTCAGTGGAATGTTAAAGTCTTCTACTAATATTGTATGGTTATCTGTGTCTGTTCATAGGTCTCTAAGAAATAGTTTTATGAATCTGGGTGCTTCAATGTTGGTTGCATATATATTTAGAATAGTTAAGTTTTCTGATTTTATTGAACATTTTATCACTATGCAATGCCCTTCTTTGTCTTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGAAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTTACTGCAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCACGTGTAGCTAATTTTTTGTAGTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAGCTGTGAGCCACCACGCCCGGCTCCTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTAAAACAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCTGAGGCTGGTCTTGAAATCCTAGGTTCAAGTGAGTCTCCCACTTTGGCCTCCCAGTGCTGATTACAGGCATTAGCCTCTGCTCCTGGCCTGTCTTTTTTCATTATTGTTGGTTTAAAGTTTGTTTTGTCTGAAATAAGAATAGTTCGTTTTTCTTTTCTGATTGCTCGACAGATTTTTCTCCTTCTGGTTACTTTTAGCCTATGGGTGTCACTGTATGTGACATGAGTTTCTGGAAGACCATAGAGTTGGGTCTTCTTTCTTTATGCAACTTGCACTCTGCTTTTTAAGTGGGGCATTTAGCCTGTTTACATTCAAAGTTAATACTGATATGTGGTGTTTTTGGTAGAAACAGGGTCTCACTATTTTGCCTAGGCTGGCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCATGCCTCATCCTCCCAAAGTGCTGGAGTTGATATGTGTGAGCCACCATACCTGGCCTTGATATGTGTGGATTTGATCCTGTCATTGCGTTGTTAGCTGGTTGTTATGTAGACTTGTTTGTGTGGTTGCTTTATAGTGTAAATGGTCTGTGTACTAGTCACTGCACCCGGCCCGTGCCTGCATTTTAACAAGATTCCTACTTCACTGACATACTTGTTAAAATTTGAGAAGTACCTTCTAACTCACCCTGACTTCTCCATATGAGAACAATACACAGTTTATCCTGTGTGATGTGAATATACCAGTGCTTGAGTTGATGCCCTTAATTTTATACTATATTATGCACAAAAGTAGACTACCTACACTGGTTTCATGGATCTTAAGCCATCTTCTTTCCTCAGAGAGAATACATTAGAGTGTGTGTATATATATATATTTTTTATTTATTTGTTTGTTTATTTATTTATTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGTAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAGCTTGGCTTCAAGCAACTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTGGTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCGCCGCGCCCGGCCTAGAGTATATTTCTGTGTTAAAAATTATCTTATTTGATAATTCTAGTCACTCATATAAGTCAGAGCCAGTTCTCTTCACTGTCTCTCCTTGCCTGTAGTCAAATTAAGAACTCTGCCGTGACCACTTGGTAAATATGTTTTCTTTTTCAG
Seq C2 exon
GGACTATTGGCATTCAGGGATGTGGCTCTAGAATTCTCTCCAGAGGAGTGGGAATGCCTGGACCCAGCTCAGCGGAGTTTGTATAGGGATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGATCTCCCTTGGTGAGGATAGCTTCAATATGCAATTCCTATTTCACA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000197472:ENST00000339986:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0135222=KRAB=WD(100=74.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains