HsaINT0188209 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000140548 | ZNF710
Description
zinc finger protein 710 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25352]
Coordinates
chr15:90001392-90068595:+
Coord C1 exon
chr15:90001392-90001614
Coord A exon
chr15:90001615-90067109
Coord C2 exon
chr15:90067110-90068595
Length
65495 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGT
5' ss Score
9.25
3' ss Seq
CTTCCCTTCTCCACCCACAGCGA
3' ss Score
11.04
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
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C1:
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A:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains