HsaINT0188599 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000146757 | ZNF92
Description
zinc finger protein 92 [Source:HGNC Symbol;Acc:13168]
Coordinates
chr7:64853719-64865998:+
Coord C1 exon
chr7:64853719-64853814
Coord A exon
chr7:64853815-64863253
Coord C2 exon
chr7:64863254-64865998
Length
9439 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
GTTATTTTTATTTTTTTCAGTTA
3' ss Score
7.85
Exon sequences
Seq C1 exon
GTATTGCTGTCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGGCTGGAGCAAGGAAAAGAGCCCTGGAATCTGAAGAGACATGAGATGGTAGACAAAACCCCAG
Seq A exon
GTAGGTGACAGTTAATACAACAGACAACACAAATGAGAGGTCCAAAAGTCAAGGAGAAGGCCAGTCATTTTTTCTTAGTCGGAGTTTTGACCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAAGGGTGTGATCTTGGCTTACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTGTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGAACTCTCGACTTCAGGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTCAGTCTTTAAAATGTAATTTGGGAAGCTGTTTCCAAAAAAAATAGTTTCTGGGAAGCCTGAAACTTTTATTTTGCTCTCACATAGGGGCATCTTCTGTCTAATGCTTTTAAATTTTCTAAGGTGATCTTCTTCAAGTTTACAGTGAGAGCCAAAGTCCTTTTCATGGGAGGAAGAGACTGCACAATCTGACTACTTTTCCATTGCTTTTGAGGACACACAAATAGCTGCATAATTTTGAGAAACTCTGTTAAACTACTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGAGCTTGGCTCACAGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCGAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCACGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGTGCCTAGCCCAGAAATTTATTATTAATATTACTATTATTTTTCTGAGACGGAGTCTTACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGATCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGAGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGAACCACCATCCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGAGAAATGTATTATTTTAATGGTATTACAAATAAGATTGTTTTTTTCCTCTTTTATATCATGTAGCTTATTTTAAGTGTATGGAACCATAACTTGTATGTTAATTTCATATTGTGCTGATTTATTATTAGTTTAGACATGTTTAAATGTTTATGATTTTCTCTATATAAGATTATGTGATCTACAAACAGCAACTTTTTACCTATCTGTCTTCAATGTCAATGGCTTTTTAAATTTTTTAAATTCTTTTGCCACATAATTCCAGTGCTATGTTAAAATGGAAGCATTGACATTGGCACAATATAGTTTTGCATTGGTGTCTGTAAATTTGAAGGAGCAAACAGCTCTTCAGGTTTTTATAAACTGGTTTTAGAAGGTAAAGATCTTTTGTTGGGTTCCCACGGTGATGGGATGCCCTCTGGGTTTGTAGTGGAGAGGGGTGTAGCTTGGTCACAAGGCTGCTGGGTCTACACTAGGGTCCACCTTTACTGGCTTATTACAAGGGGCTTGGGTATTTGTAATTTCCATTTTATTTTTAGACAGACTGAATATCCTCCAGGACTTTGCTCTGTCGGGCAGACACTAGGGCAGGTTTCTGTAGTCGGGTCTGCATATAATGGACCTTGTATCAGGATGTGGATGAGTGTGGCTTTCACTGAGTACCAGAGAGGATTTCCCCAGGCCACTGTGTAGGTTTCTGTGTAGATATAACTGGCCATAAACTGTGGCTCAGAGAGTTGGAACTGAGTCATTAAACTGCTTCAGAGACCACAGTAAAGGCCAAGGTCTGCAAGCCGGCCTGCCTGCATGGCTATAAATGGTTGTCTTCCTCCAGGCCGCTGGAAGGGCAGGACCTTTTCCAGACTGTGGCTGGGAGAAGTTTGGGATGGTTGCAGAGTAAGTTCAGAATTCTCAGTGGGACCAAGTTTGGTGGGCCATTTTCTGGTCTGTAGCCAAGAACAGGAGTCCTTTAGTTTGCCGCCTGAATGAGGGCCTGCCTTCTAAAAACAACACTCCTCAATCTTGGGTTTAGCATTTCACAACTCCCTCCCTGGATCTCAAAGCTCTCTTAAAGGCGCTTATTTTTGAGATGGGGTCTTGCTTCATAACCCATTCTGGTCTTGAAATCCTGGCCTGAAGCAATCTCCAACCTCAATGTATGATAAAGCTTTCATTACAGGTGTGAGCCATGATGCCTGGCTCTCTCAAAAGGCCTTTTTATGAGGGATGGCTGACAAATTTTCTTGCTGTTGGAGGATAACAAAATAAGGCAACTTTTATTGTCCTATCTTCCTGATGTCACTCTTCCTATACATTTTTACTTTCTATTTTCTATTTCAAATTTGTCTGTAACTTTAGAATCAGACCTTTGGGACAATATGCTAGAATTTACATGTTATGCCTGAAGTAAATTAGATAATTTACTCCATAATTACTAAAATAGTTACTTATAAATTTAAGTTTGCGGCAGGCAAAAAGGAATAGTATTTTCACCCACTTTTTAGCCTATATCTAAGTAATAACATAATGTATCCCCCAAATATTTGTTTTATCTATCAGAGGCACTAACCATATTCAGCAAAATAAAAATTTTTTCTTTATTTGGCAACGTAAGGCTATTCTTTGCTTCTATAGTTGGATTGCAGCAGTTTCATCTAGTGTAAGAATAGCATATATTTAAAACATAAAAATTATCTCAATTTTTAAAAATGCTTACTTATTAAGTTTTTTATTAGAATCTTCTATGTATGGTTATACTGCATTTTCTCTGAAATTTTACTGCCATACAGTGCATGCCAGTGATTCAAATACTTGCCTTCCATGAGTACACAGTTACACTCAAATATTGCAGTTATCTAGACAAATTCTTTTTAATGGTACATCAATATTGCAAACCAGGTTTTATGAGTAAACATTTCTTTTAATGTTTTACAGTTCCATATTAGTGTTTTTTGTTTAGTGTAGGTTTCTTATCAGTTTTTGTTTCTTGTTTTTACGGTTTTAGCAATTTGCACTTCTGTTTGTACACTTTAAGTGAATGTTGGGTTTAACTGGGAAATAAGTCAGCCATATGTCCATCATAGTCTGATTATATATGTGTGTGTTTTTATCTATTAATATGACTTTAATTTTGGTTATGGCATATCTTGTGTATATTCTTTCTTAGCTGATTTTCAATGGTTGTTTTGTCTAAGTGAGTAGTCATGGAAATAGTCTTTCTACCATGTGTTTAATGATAAATATTGTATAATTTCCTTTGGGTAAGAGAAACATTTTTGTAATTTGAAGGTAATTTTTGGAAATATTTGTAATTCTATTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTCTTTTAAAAAATAATTGTTGTAAAAACACATAACCTAAAATTTACCATCTTAAATCTATTTAAGTTTACATTTCATTGCCAGGCATGGTGGTGGCTCACATCTGTAATCCTCAGATTTTGGGAGGCCAAGACAGGAGCATCACTTGAGCCCACATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTCATCTCAGCTCACCGTAACCTCCGCCTCCTGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGATTACAGGCATGTGCTACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCCACCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAGAGCCCAAATGTTTGAGGCCAGCTTGGACAGCATGTGGAGACCCTCTCTCTACAACTTTTCAAAAAAATAGCCTGACATGGTGGTTGTCACCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGAGATTGAGGGGAGAGGATTACTTAAGCCTGGAAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCTTAATTGTGCCACTGCACTGCAGCTTGGGTGACAAGTGGGACCCTGTCTCCAAAAAGCTGTACATTTCAGGCATGTTGACTATATTCACATCATTATGCAAAAGACTTCTTGAAATTTTACATCTTGTAAAACTAAAACTCAGTACCCGTTAAGCAATAACTGCCCATTTTACCTTCTCTCCAGCCCTTGACAAACACCCTTCCACTTACTATTTTTATGAGTGTGACTGTTTAAGATATCTCATATAAGTGGGATCACACAGTATCCATCATTTTGTTACTGGCTTATGTCAGGTGACAAAATATTCTCAAAGTTTATCTTAAAATGTGACAATTTTCTTTTTTAAGGCTGAAAAATATTCCACTGTATTTGTATGTTATATTTTTTGATGTGTTTATAAATCAAGAAGACAGTTGGGTTGCTTCAGCCTTTTGGCTTTTGTGAATACTGGTACAATAAACATAGATGTTCAAATATATTTTTAAGATCCTATGTTGCATAGTTTGGATATAGATTCATAAATGGGATACAGTAATAACAATTCCATCTTTAATTATTTGAGAAACATGTATATAATATTTTAAAATAATGGCTACATCCTTGTTTTTCACCAAAAAATAACATGGGTTTTATTTTCATTGCATCAACAGATTTGGTGCCTTTTAAAAAATGTATAGTGGCTATTCTAACTGGTATGAGGTGATTTTGTTTTTCATTGTGCTTTTTATGCATTTCTCTATAAGTTAGTAATTTTGTCTGTCCTTTCAAATGCTTTTTCCCATGTATATATATCTCTTGATAAAGATTCAATTATTTAAAATTCAATATTATTGAACTTTATATGATACTTTATATGATAAACTTTATATGATAAAGTTCAATTATTTCTTCATTTCTGTTCTTCATATCTTCATTTCTCATCAAGTTATTCAACTTTATTGTTCAGTTTGAAGAGTTGTTTATATATTCTGAATATTAGCTCCTATCACATGTGATTTGCAAACATTTTCACTTATTTCCTAGGGGACGTTGTCACTCTCTTGAATGTTTTCTTTGATGTGTAAAAATTTTGAAGTATAGCGTAATTCAGTTTTTCTGTTCTTTTCTTTGTTGCTCATGCATTAATATCATAAGTGGTGCCAAGACCAATGTAATGTCTTTCCTCTATATTGTTCCTAAGAGATTTGTTAGTTTTTTTTATGTCTAAGTATTTTATTTAAAATATTTTTTGTATATGGTTCAAGGAAAGGATCAAACTTTATAAGTGTTAATGTCCAGTTTCACCATTATTTTTTGAAGAGACTATCTTTCCTCTATTGTGTGCTCATGGCAACTTTGGAAGATCATTTGATCATATATAGAAGGGTTCATTTCTAGGCTCTCTATTCTGTTCTTTCATCTCTTTATCTGTCTTTGTGTCAGTACCACATTGTTTTTGTTATTGTAGATTTTAATATGTTGTGAAATCAGGAAGTATAATGGCTGTTTGTTCTTTTTCATGGGTGTTTGGATAGTTATAGATTTTAATCAAATTTTAAAAATTTAGACAATATTTCTGTTAAAAACTGTGCTATAGTATTTTTATAGAGATTATGTTGAATTTCTTTACCACTGTAGGTTGTATTGACATCTTAACAAAATGAAGTTTTTTTGTTTGTTTTTTGAGACGTTGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCCAGAATGCAATGGCTGGTGCGATCTGGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCAATTACAGGTGCCTGACTCCACGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTGCAGGCATGAGCCACTGTGCCTGGCCCAAAATGAAGTTTTTTGACCCTTGAGCAAAAATATGTTGAAGAATGTGTTTTATTTTCACATTTCTTTTAATTCCTAGTTTCTTTCAGTTTTGGTCAGAAAACATACCATTTATTATTTTGGTCTTAAGTTTATTTATTGTTGTTTCTGAGACAGGCTGGAGTGCAGTGGCATAATTTTGTCTCACTGCAGCCTCAGTCTCCTGTGCTCAAGTGATCCTTTTCCTCAGCCTCCTGAACAGCTGGGACTACAGACATGCACTACCATGCCTGGCTAATATTTTGATCATTTGTAGGGACAGATTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGCCTCAAACTTCTGGCTTTAAGTCATCCTCCCACCTTGAAATCCCAGAGTGTTGGGTTATAGGCATGAGCCCCTGCACCCAGCTGGTATTCTTATATTAATAAGACTTGGTATGTGTCCTAACAGAATACACCAGCTGCAAATAAGAATATTGTGTATTCCCTTGCTTTTGACTAGAAAGTTTTGTACATGTCTGTTAAGCCTAGTTGGTCTATGATATTGTTTGGATGTTCATGTTCTTCAAACCTCATGCTGCGATGTAATCCTCAATGTTTGATGTGGGACCTGGAGGAAGGTGCTTGGGTCATGGGGGCAAATTCCTTATGAATGGCTTGGCACTATCCTCTTGGTAATCAAAAAGTTTACACTCCATCAATTCAAGTGAGAGCTAGTTTATTAAAAGAGTAGACAGTTATGGTAGTTATAGATTCCTGGTAAATTGACCCGTTTTACAATTATATAATATCAGTCTTTATCTCATGCTGGTACTTGACTTAAAGCATATATGTCTGATATAATTATGACTGCCTCACCCAATTGTGGTTGCAATTTGTATAGATATAGATCTTTTTCATTCTGTTACTTTCAGCCTATTTGACTTAGTGCCAAAATGGATCTCTTTTAGGCAGTATATTGTATGCTTTCTTATTTATTTATTTTTGAGATAGGGTCTCACTCTGTCAACCAGGCTGGTTTGCAGTGGTGTGATCATGGCAATGAGCTGCAGCCTCAACCTCCCAAACTCAGATGATCTTCTCATTTCAGCCTGTCAAGTAGCTGGTTACAGGCATGTGCCATCATACCCAGCTAGTTTTTTGTATTTTCTGTAAAGACGGTTTTGCCATGTTGCTGAGGCTGGTCTCAAACTCCTGCAGTCAAGTGATCAGCTCACCTTGACCTCCCAAAGTCCTGGGATTACATTTCTTTTTATTAACTAGTTTATATTTAAAATGATTTTTTAAAGAAATGATGTTACTATTACCAGTTTCATTGTTATTGTTTCTTGTGTTTTTTAGATATGTTTTTTCTCATTTCCTGTTTTACTCCTTGAATTTTTGTTTAATCTCATAGTGACCTGCTTTATTTTTTGTTTTGCATAGTTTCTATAAATATTATCTTTGTAATCATCTTGAAAAATGAAGATTATATAAAACATCTTAAAGTTAAAACATTTTCTAGTTTGTTACTAATACTACAAATTATATTGTGTTTCTATTAACAGATTTATTCAGATTTATATTTTGTTTCTCATATTCTATAGGAGAACTTTAAGGGTTTGATGCTCCATCATTATGATAGTAAAGAATTCTGTGTGTGTCTATATTTACATTTAATAGAGAGCTTTATATTTATATATGGTTTTATGATGCTGTGCAGCATTATTTTATTTTTCAACATAATGGAGTCATTTTAGCATTTCTCTTTTTGTATATGCAATGTCTCACTATGTTGCTCAGGCTGATCTTGAACTCCTGGTCTCAAGTGATTGATTGCCTTGGCCTCCTAAAGCTGTAGGATTACAGGCATGAGCCATGGTGCCTGCTCACCATGTAGCATTTCCTGTAGGACTGTGCAAGGGATAATAAACACCCTTACCTTTTATTTTGGAAAATCTATTTTTTTCTTGTTTTTAAAGTAAAACAATTTCTAACCAAGTTATTGGTTAGGAATATTTTTTCTCTTATTACGTCAAAATTTGAAAGTTCTCAGCCTTTTTTATCTTCAAGTATCCTCTGTACTACTTTTTTTTTTCTATATTCTTCTAAGATTTCTCCCATGAATATATTGATTTAATTGATGGTGGCCAGTAAGTTTTACCTTCTGTGTTATAATTTTGTTTTGGACTTTGACTACATCACACAGTTTCTTTATGGCCTGCAAAATTTTTGTTGACAGTTCACTGGTTATCTCGTAAGAGTATGCACATAAATGATGCATTACTTTTATCTTGCAGCTCCCAAGACTCTCTTCTTGTCTGTAACTTCTGAAATTGTGCTTATATATGTGTTTGTTATAAGTATCTTTTTGTGTATCCTAGTTTGTCTAGCTTCTTCATGTTTTATTTTTCAGTTTCTTTTTGTATTTTTTACCTCCACAATTTCTGAGGGGGTGTCGATATTTTGAATATTTTTGTTATCCTCATTTATCTGATTTTCAGAAATCGTCTGTGTTTCTGTTTCACTCATTGAATATTATTCAGTTTATTTTCAATTTCTTTATAACTTTATTTTTTATGGTTGCTTTCTAAAAATTTTATATTTTTTTGACAGGGCCATGTTGCCCTAATATTTTGTATACATTGTAATGTTTGATTGAGATTTGGACATTAAAAAAAAGCTGCCTATTACAATCTTTATTATGTAGCCTTGTCCTGGCATAGTCTTAAACCAATTGTCTTGGCTAGAGATTCCGGGAGTCTCTCAAACATGTTCTTAGGATGTGCCTTGTCTGAAATTTTGTGTTTACTTTTTAGTTAAAGGAGTTCATTTGTGTTTTTTGTTAAGTCGGTAATCAGTTGCTACACGTGTTCGCTGTCTGTGGTGCTGCTGCATTCTCTCTGCTGCTGTAATGTTTACCTTTGGTCTCAGCAGACAAACTGTCATTCCAAAGTATACCACCATTTCCTTCAGCACTTTATGGCATGGGAGACAGAAACCAGTGTCTTGAAAGGCCCCTAGAGGCCAAAAATAAAGATGTATGTGCCAGTATTTTTCTTGTCTTTTAAAAAGAAACCGGGAGTTGGCAATTTGTTGCTGAAGACACTAGGTTATTGAGGAGCAGGAAGAGCTGTGTTGGGTAAATGTAACACAGTTTTCTTTTCCTTCTATGTAGCTCTTTGCATTGTTCTCACCTGGGGCACTGTACACATTTAACTCATTTATAGCTTTTCCACAAATGTATTTTGGTCAGTATATTTTTGTTACATTTATATTTCTGTAAGGAATTAGGGCTTGCATTTTGCTATGCCATCTTGCTTATGTTGTAGTTTGTACAATTTTATAGGTTAAATTTGTAAAGTATATTCATCTGAGTCTAGTAAGTGAAGTAACTTGTTATTTTTATTTTTTTCAG
Seq C2 exon
TTATGTGTTCTCATTTTGCCCAAGATGTTTGGCCAGAGCACAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAAGTGATACTGAGAACATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAGCTAAGAAAAGACCATAAAAGTGTGGATGCATGTAAGGTGTACAAAGGAGGTTATAATGGACTTAACCAGTGTTTGACAACTACTGACAGCAAGATATTTCAGTGTGATAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTCCAAATGTAAATAGAAATAAGATAAGACATACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAAACCGTGGCAAATCATTTTGCATGCTTTCACAATTAACTCAACATAAGAAAATTCATACTAGAGAGTATTCTTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAACTGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAAATCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACAGAAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAACCAGTTCTCGATTCTTAATAAACATAAGAGAATTCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGAGTATTCTCAATTCTTAAAAAACATAAGATAATCCATACTGGGGAAAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTTCTCAAACCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGATGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACGGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAACAGTCCTCAACCCTTACTGAACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAGGCCTTTAGCTGGTCCTCAGCTTTTACTAAACATAAGAGAAATCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTGTATTCTCAACCCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTAGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAATTTTTACTAAACATAAGATAATTCACACTGAAGGGAAATCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAATGCTTTTAACCAGTCCTCAAACCTTACTGCACGTAAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGCCTTTAACAAGTTCTCAACCCTTATTACACATCAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTGCAAACATGAATGTGGCAGAGCCTTTAACAAATCCTCAAATTATACTAAAGAGAAACTACAAACCTGAAAGATGTGACAATGATTTTCACTACACCTCAAACTTTTCTAAACATAAACCATATTGGTGCCCTAGAAATGTGAGGAATATGACAAGGACTTTAAATGGTTGTCACGCTTGATTGTAGGTAAGATAATTTATATTGGAGAAAAATCCTCCAAGTATGAAGAATGTGGCAAACTTTTAACCAATCCTCACACCTTATTGCACAGGAAAGCATTTATACTTGAGAAAAATTGTATAAAGAATATGGAAAAGCCATTTATATCTGCTCACATGTAAAAACATCAGTTCATACTTAATAAAATGCAATTACCGTCAAATCTTTCAGAAAATATAAGCCTTTAATACGAGGAAGAGTATTCTTAAGATGAACATTACAAATAGAAAGAGGGTTGTAGTACCTTTAGTTTTATGATAGATCTTATTGTACACATTTTGTACCAGAGGAAAACCCTAAAGCATTAGTTGCTCAAACTTTGTTCGACATCAGGGAATTTGTATTGGAGAAAAACCCTGCAAATGTAATAAATATGGAAAAACATTTTTTCAAAAACTACAGCTTGGAAAACATCAGAGAGTTCATACTAAAATATATTTTTGCAGATGCAGTAAATATGAAAAATATTTAATCCCAAATTAAGTCTATGTAAATATCAGAATTCACAGTAGAAATCATAAGGCATAAGGCACTGATACTTCAGACATTACACTAAATTAGAGTGTTGAGTATAGGAGATCCAAAACTAAAATTGTTAGGTAAGTTATTTATATATAACTTTAAAAGAAGTAGAAGATTTTTTGGAGATTTATAATTACATTCAAAGTATACTTTTTTCTTGAAAAAAATTACAGATTTTTTGAAAAGCAATTGATGTAATTTAACTCTCAAATTCATGTTTTTCTTCATTCCTATTATATTCACATGTGAAAGCAAGTGATCTGTTGTTGCTGAATCAGAGATATGAGAGATTCTTTTTTATAGGTGGGCATTATTTATGCCCCTTTCTGTGGAAGAGTAAGAAAATTAAAATACAAGATGCATGAGGAAAATGTAGAGATGCTCTTTGTGATTAACTTAGAATATTAAGTGCTACTTGAGGTACATGTTCAGACTAACATTCTTTTGCAGTATAGTGAGAAAAAAACATTTTAAAATTAATTATCATTTTGTTGATTGTGCTTTTATGTAATAAAATGCAGTACTTTAAAACATTTA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000146757-ZNF92:NM_007139:2
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.011
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)