HsaINT0188599 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000146757 | ZNF92
Description
zinc finger protein 92 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13168]
Coordinates
chr7:65388806-65401125:+
Coord C1 exon
chr7:65388806-65388901
Coord A exon
chr7:65388902-65398340
Coord C2 exon
chr7:65398341-65401125
Length
9439 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
GTTATTTTTATTTTTTTCAGTTA
3' ss Score
7.85
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
GTAGGTGACAGTTAATACAACAGACAACACAAATGAGAGGTCCAAAAGTCAAGGAGAAGGCCAGTCATTTTTTCTTAGTCGGAGTTTTGACCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTGCAAGGGTGTGATCTTGGCTTACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTGTCTCCATGTTGGTCAGGCTAGTCTCGAACTCTCGACTTCAGGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTCAGTCTTTAAAATGTAATTTGGGAAGCTGTTTCCAAAAAAAATAGTTTCTGGGAAGCCTGAAACTTTTATTTTGCTCTCACATAGGGGCATCTTCTGTCTAATGCTTTTAAATTTTCTAAGGTGATCTTCTTCAAGTTTACAGTGAGAGCCAAAGTCCTTTTCATGGGAGGAAGAGACTGCACAATCTGACTACTTTTCCATTGCTTTTGAGGACACACAAATAGCTGCATAATTTTGAGAAACTCTGTTAAACTACTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGAGCTTGGCTCACAGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCGAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTATAGGCATGCACCACCACGTCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCACGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCTACTGTGCCTAGCCCAGAAATTTATTATTAATATTACTATTATTTTTCTGAGACGGAGTCTTACTCTGCTGCCCAGGCTGGAGATCAGTGGTGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGAGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGAACCACCATCCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGAGAAATGTATTATTTTAATGGTATTACAAATAAGATTGTTTTTTTCCTCTTTTATATCATGTAGCTTATTTTAAGTGTATGGAACCATAACTTGTATGTTAATTTCATATTGTGCTGATTTATTATTAGTTTAGACATGTTTAAATGTTTATGATTTTCTCTATATAAGATTATGTGATCTACAAACAGCAACTTTTTACCTATCTGTCTTCAATGTCAATGGCTTTTTAAATTTTTTAAATTCTTTTGCCACATAATTCCAGTGCTATGTTAAAATGGAAGCATTGACATTGGCACAATATAGTTTTGCATTGGTGTCTGTAAATTTGAAGGAGCAAACAGCTCTTCAGGTTTTTATAAACTGGTTTTAGAAGGTAAAGATCTTTTGTTGGGTTCCCACGGTGATGGGATGCCCTCTGGGTTTGTAGTGGAGAGGGGTGTAGCTTGGTCACAAGGCTGCTGGGTCTACACTAGGGTCCACCTTTACTGGCTTATTACAAGGGGCTTGGGTATTTGTAATTTCCATTTTATTTTTAGACAGACTGAATATCCTCCAGGACTTTGCTCTGTCGGGCAGACACTAGGGCAGGTTTCTGTAGTCGGGTCTGCATATAATGGACCTTGTATCAGGATGTGGATGAGTGTGGCTTTCACTGAGTACCAGAGAGGATTTCCCCAGGCCACTGTGTAGGTTTCTGTGTAGATATAACTGGCCATAAACTGTGGCTCAGAGAGTTGGAACTGAGTCATTAAACTGCTTCAGAGACCACAGTAAAGGCCAAGGTCTGCAAGCCGGCCTGCCTGCATGGCTATAAATGGTTGTCTTCCTCCAGGCCGCTGGAAGGGCAGGACCTTTTCCAGACTGTGGCTGGGAGAAGTTTGGGATGGTTGCAGAGTAAGTTCAGAATTCTCAGTGGGACCAAGTTTGGTGGGCCATTTTCTGGTCTGTAGCCAAGAACAGGAGTCCTTTAGTTTGCCGCCTGAATGAGGGCCTGCCTTCTAAAAACAACACTCCTCAATCTTGGGTTTAGCATTTCACAACTCCCTCCCTGGATCTCAAAGCTCTCTTAAAGGCGCTTATTTTTGAGATGGGGTCTTGCTTCATAACCCATTCTGGTCTTGAAATCCTGGCCTGAAGCAATCTCCAACCTCAATGTATGATAAAGCTTTCATTACAGGTGTGAGCCATGATGCCTGGCTCTCTCAAAAGGCCTTTTTATGAGGGATGGCTGACAAATTTTCTTGCTGTTGGAGGATAACAAAATAAGGCAACTTTTATTGTCCTATCTTCCTGATGTCACTCTTCCTATACATTTTTACTTTCTATTTTCTATTTCAAATTTGTCTGTAACTTTAGAATCAGACCTTTGGGACAATATGCTAGAATTTACATGTTATGCCTGAAGTAAATTAGATAATTTACTCCATAATTACTAAAATAGTTACTTATAAATTTAAGTTTGCGGCAGGCAAAAAGGAATAGTATTTTCACCCACTTTTTAGCCTATATCTAAGTAATAACATAATGTATCCCCCAAATATTTGTTTTATCTATCAGAGGCACTAACCATATTCAGCAAAATAAAAATTTTTTCTTTATTTGGCAACGTAAGGCTATTCTTTGCTTCTATAGTTGGATTGCAGCAGTTTCATCTAGTGTAAGAATAGCATATATTTAAAACATAAAAATTATCTCAATTTTTAAAAATGCTTACTTATTAAGTTTTTTATTAGAATCTTCTATGTATGGTTATACTGCATTTTCTCTGAAATTTTACTGCCATACAGTGCATGCCAGTGATTCAAATACTTGCCTTCCATGAGTACACAGTTACACTCAAATATTGCAGTTATCTAGACAAATTCTTTTTAATGGTACATCAATATTGCAAACCAGGTTTTATGAGTAAACATTTCTTTTAATGTTTTACAGTTCCATATTAGTGTTTTTTGTTTAGTGTAGGTTTCTTATCAGTTTTTGTTTCTTGTTTTTACGGTTTTAGCAATTTGCACTTCTGTTTGTACACTTTAAGTGAATGTTGGGTTTAACTGGGAAATAAGTCAGCCATATGTCCATCATAGTCTGATTATATATGTGTGTGTTTTTATCTATTAATATGACTTTAATTTTGGTTATGGCATATCTTGTGTATATTCTTTCTTAGCTGATTTTCAATGGTTGTTTTGTCTAAGTGAGTAGTCATGGAAATAGTCTTTCTACCATGTGTTTAATGATAAATATTGTATAATTTCCTTTGGGTAAGAGAAACATTTTTGTAATTTGAAGGTAATTTTTGGAAATATTTGTAATTCTATTTTTTTTTTTTTTAGTTTTTCTTTTAAAAAATAATTGTTGTAAAAACACATAACCTAAAATTTACCATCTTAAATCTATTTAAGTTTACATTTCATTGCCAGGCATGGTGGTGGCTCACATCTGTAATCCTCAGATTTTGGGAGGCCAAGACAGGAGCATCACTTGAGCCCACATTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGTGTCATCTCAGCTCACCGTAACCTCCGCCTCCTGAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGATGGGATTACAGGCATGTGCTACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCCACCTCCCGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAGAGCCCAAATGTTTGAGGCCAGCTTGGACAGCATGTGGAGACCCTCTCTCTACAACTTTTCAAAAAAATAGCCTGACATGGTGGTTGTCACCTGTGGTCCCAGCTACTTGGGAGATTGAGGGGAGAGGATTACTTAAGCCTGGAAGTTTGAGGCTGCAGTGAGCCTTAATTGTGCCACTGCACTGCAGCTTGGGTGACAAGTGGGACCCTGTCTCCAAAAAGCTGTACATTTCAGGCATGTTGACTATATTCACATCATTATGCAAAAGACTTCTTGAAATTTTACATCTTGTAAAACTAAAACTCAGTACCCGTTAAGCAATAACTGCCCATTTTACCTTCTCTCCAGCCCTTGACAAACACCCTTCCACTTACTATTTTTATGAGTGTGACTGTTTAAGATATCTCATATAAGTGGGATCACACAGTATCCATCATTTTGTTACTGGCTTATGTCAGGTGACAAAATATTCTCAAAGTTTATCTTAAAATGTGACAATTTTCTTTTTTAAGGCTGAAAAATATTCCACTGTATTTGTATGTTATATTTTTTGATGTGTTTATAAATCAAGAAGACAGTTGGGTTGCTTCAGCCTTTTGGCTTTTGTGAATACTGGTACAATAAACATAGATGTTCAAATATATTTTTAAGATCCTATGTTGCATAGTTTGGATATAGATTCATAAATGGGATACAGTAATAACAATTCCATCTTTAATTATTTGAGAAACATGTATATAATATTTTAAAATAATGGCTACATCCTTGTTTTTCACCAAAAAATAACATGGGTTTTATTTTCATTGCATCAACAGATTTGGTGCCTTTTAAAAAATGTATAGTGGCTATTCTAACTGGTATGAGGTGATTTTGTTTTTCATTGTGCTTTTTATGCATTTCTCTATAAGTTAGTAATTTTGTCTGTCCTTTCAAATGCTTTTTCCCATGTATATATATCTCTTGATAAAGATTCAATTATTTAAAATTCAATATTATTGAACTTTATATGATACTTTATATGATAAACTTTATATGATAAAGTTCAATTATTTCTTCATTTCTG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Seq C2 exon
TTATGTGTTCTCATTTTGCCCAAGATGTTTGGCCAGAGCACAGCATAAAAGATTCTTTCCAAAAAGTGATACTGAGAACATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAGCTAAGAAAAGACCATAAAAGTGTGGATGCATGTAAGGTGTACAAAGGAGGTTATAATGGACTTAACCAGTGTTTGACAACTACTGACAGCAAGATATTTCAGTGTGATAAATATGTGAAAGTCTTTCATAAATTTCCAAATGTAAATAGAAATAAGATAAGACATACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAAACCGTGGCAAATCATTTTGCATGCTTTCACAATTAACTCAACATAAGAAAATTCATACTAGAGAGTATTCTTACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCCTTTAACTGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAAATCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCGGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACAGAAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCCTTTAACCAGTTCTCGATTCTTAATAAACATAAGAGAATTCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGAGTATTCTCAATTCTTAAAAAACATAAGATAATCCATACTGGGGAAAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTTCTCAAACCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGATGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAACCCTTACTAAACATAAAAGAATTCATACGGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAACAGTCCTCAACCCTTACTGAACATAAGATAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAGGCCTTTAGCTGGTCCTCAGCTTTTACTAAACATAAGAGAAATCATATGGAAGATAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTGTATTCTCAACCCTTACTAAACATAAAATAATTCATACTAGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAATTTTTACTAAACATAAGATAATTCACACTGAAGGGAAATCCTACAAATGTGAAAAATGTGGCAATGCTTTTAACCAGTCCTCAAACCTTACTGCACGTAAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTACAAATATGAAGAATGTGACAAAGCCTTTAACAAGTTCTCAACCCTTATTACACATCAGATAATTTATACTGGAGAGAAACCCTGCAAACATGAATGTGGCAGAGCCTTTAACAAATCCTCAAATTATACTAAAGAGAAACTACAAACCTGAAAGATGTGACAATGATTTTCACTACACCTCAAACTTTTCTAAACATAAACCATATTGGTGCCCTAGAAATGTGAGGAATATGACAAGGACTTTAAATGGTTGTCACGCTTGATTGTAGGTAAGATAATTTATATTGGAGAAAAATCCTCCAAGTATGAAGAATGTGGCAAACTTTTAACCAATCCTCACACCTTATTGCACAGGAAAGCATTTATACTTGAGAAAAATTGTATAAAGAATATGGAAAAGCCATTTATATCTGCTCACATGTAAAAACATCAGTTCATACTTAATAAAATGCAATTACCGTCAAATCTTTCAGAAAATATAAGCCTTTAATACGAGGAAGAGTATTCTTAAGATGAACATTACAAATAGAAAGAGGGTTGTAGTACCTTTAGTTTTATGATAGATCTTATTGTACACATTTTGTACCAGAGGAAAACCCTAAAGCATTAGTTGCTCAAACTTTGTTCGACATCAGGGAATTTGTATTGGAGAAAAACCCTGCAAATGTAATAAATATGGAAAAACATTTTTTCAAAAACTACAGCTTGGAAAACATCAGAGAGTTCATACTAAAATATATTTTTGCAGATGCAGTAAATATGAAAAATATTTAATCCCAAATTAAGTCTATGTAAATATCAGAATTCACAGTAGAAATCATAAGGCATAAGGCACTGATACTTCAGACATTACACTAAATTAGAGTGTTGAGTATAGGAGATCCAAAACTAAAATTGTTAGGTAAGTTATTTATATATAACTTTAAAAGAAGTAGAAGATTTTTTGGAGATTTATAATTACATTCAAAGTATACTTTTTTCTTGAAAAAAATTACAGATTTTTTGAAAAGCAATTGATGTAATTTAACTCTCAAATTCATGTTTTTCTTCATTCCTATTATATTCACATGTGAAAGCAAGTGATCTGTTGTTGCTGAATCAGAGATATGAGAGATTCTTTTTTATAGGTGGGCATTATTTATGCCCCTTTCTGTGGAAGAGTAAGAAAATTAAAATACAAGATGCATGAGGAAAATGTAGAGATGCTCTTTGTGATTAACTTAGAATATTAAGTGCTACTTGAGGTACATGTTCAGACTAACATTCTTTTGCAGTATAGTGAGAAAAAAACATTTTAAAATTAATTATCATTTTGTTGATTGTGCTTTTATGTAATAAAATGCAGTACTTTAAAACATTTAGATTGTGTGTGAACTTAATTTTGTAATTAAACATTTTTTT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000146757:ENST00000328747:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.011
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains