HsaINT1047556 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000267470 | ZNF571-AS1
Description
ZNF571 antisense RNA 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:44324]
Coordinates
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Coord C1 exon
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Length
16875 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000267470:ENST00000585578:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
NonCoding
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=NA
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NA
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains