HsaINT1047595 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000075292 | ZNF638
Description
zinc finger protein 638 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17894]
Coordinates
chr2:71331764-71350271:+
Coord C1 exon
chr2:71331764-71331875
Coord A exon
chr2:71331876-71348752
Coord C2 exon
chr2:71348753-71350271
Length
16877 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTAGGA
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7
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3' ss Score
10.03
Exon sequences
Seq C1 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.700
Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
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C2:
NO
Main Skipping Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains