HsaINT1047658 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000234444 | ZNF736
Description
zinc finger protein 736 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:32467]
Coordinates
chr7:64336887-64349639:+
Coord C1 exon
chr7:64336887-64336982
Coord A exon
chr7:64336983-64348089
Coord C2 exon
chr7:64348090-64349639
Length
11107 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
ATTTTATTTTTTTTCTCCAGCTG
3' ss Score
10.1
Exon sequences
Seq C1 exon
GTCTTGCTATCTTTAAGCCAGACTTGATGACCTGTCTGGAGCAAAGAAAAGAGCCTTGGAAAGTGAAGAGACAGGAGGCAGTAGCCAAACACCCAG
Seq A exon
GTAGGTGGGAGTGAATGAAGCAGATGACACAAATGACGGATCCCAATGTCAAGGAGGAAGCCAAACCTTTAAACATGCTTCCAGAAGCTCTGCTCCAGTGGAAATGGTTTCTGAGAAACCTTCATTTCTTTCTCTTGCTTTAACATAGGGACATTTTTTGTCCCATTCTTGTGAATTTTCCAAGCACTGTACTTCCCCTTCAGTAATGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTAGTTTACAGCAATAATGAAAGTCTTTCATGGCTTGACAGAAAATGTGTGATTTGACTGCTTTTCCATTGCTTTGGGGAAACAGCAATATCTGTATTTTTGAGAAACTATATTAAACCATTTTTTTAAGTTCTGTTTTTGGATAATGTCTAAATATTTAAGTTTTGGTGATATTACAGTTTGGATCAGAAATCCCAGGAATACCACAAAAAGATGTGTGCTTCCTGCTTTATAATTTTCTATTCTATGGAACCTTCAAACGTGATTTTACAGAAATTTATACTCAGTAATTATATCAAAACACTAAGCATCTCCCTAAATGAAACAAACTCTAAAATTGTGTTACTTCAAATGTTATTCTTTTCATATAAACAAATGTTGGTAAATATGGCCAAATTCCTCAACTGTATGTATTATAGTTCATTGTATCTACTTCATACGTTTATTAAATATACTATGTCATTGGGGAGCTTAAAACATTGCTGAGTATTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAAGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCGGCTCCCTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTGTATTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAATGCTAGGATTATAGGTATGAGCCACTGTGCCCAGTCTGCTGAGTACATATTAAACTCTCAATTTTAACTTTATTTTAAACGACATCGTTTTGTGGTTTTATTTAGTATGAAGCTCACTGTGATTGTGTCATTCATATGTATATATATAAACACATTTATATACGCATGTGTATGACACACATATAATCCCAGTAAGGCGAATTTTTTCACAAATAATAATTGAATACCTATGTATTGTATACAGTGTATTGATTTTGTATGTGTATACATAAAGAAATGATTAATACAATCAAATTAATGAACAAACACATTTATGACCTTACAAGTTACCTTTTTTGTAGTGAAAACAATTAAGATCTCTCAGCAAATTTTCAGCATACATAACAGTATTACTTTCAGTAGTCATAAAGCTGTACCTTAGGTTACCATAACTTGTTTGTCTTTTAACTGAAAATTTGTACCATTTGAACAACATACTCCACTTTCTCCACCTCCAGGGCCTAGCACTCACCTCTATACTCTCTTCTTCTAGGAGTCCAACCTTATTATATTCTCCATAGAAGTGAGATCATACAGTATTTGTCTGTTTCTGTGATGTTTCACTCGGCATAACATCATCTAGGTCCATCCATGTTGTAGAATGTCAGGGTTTTATTATTTTTTATGGCTGAATAATATTCTATTTTGTATACATGCCATGTTTTTTTTTTGTGCAGTCAGTTTCCACAAACACTTTAGATTGCTTTTGTATCTTGACAATTGTGAAAAATGTTTCAATGAACATGGAGGTGCAGGTATTTCTTTGAGATAGTAAATTTATTGTATATGCAGAAATGAGATAGCTGAATTGTATAGCAGTACTATTAAAAAATTTTTAAAAGAACCTACATACTAGATTTCATAATGTCTCTAAAAAATTGTACGTCACTAAAATTGTACAGCATCTTTTCTTTAATATATTGTCAACACTTGTTATAAATCTTCTTGATATTAGCAGTCCTAACAGGTATAAAGTAATATCTCACAATGAATTTAATTTGCATCTGCCAGATTGGTGACATTGAGCACCTTTCTATATACCTGTTGCCCAACTGTATGTTTTCATTTGTAAACATTTATTTAGTCCTTGGCTTATTTTTAAATTTTGTTATTACTATTATAGTTGTTGCCTTTTATTTGCATGAGTTTCTTATATATTTTTGATACTAACCACTTATCAGATATGGTTTTCTTATTCTATTTTTTCTTGGTTCTACAGAAGTGTTTTAGTTTGATGCAGTTTAATTTGTTTATATTTGCTTTTATTGCTGTACTTTTGCTGTCGTATCCAAAAATTCACTTCAAGACCAATATTAAGGTTTCTTCATATGTTTTCTTTTAAGATTATTAAGAATTTATGTCATTCATTAGAGTCCTTATTTTATATTTAGTTAATTTTTAAATATTGTAAGAAAAGTGGTCTAATTTTATTCTTTTACTTGTGGATATTCAGTTTTCCCAGCCCCAAGTGTGGAAGAGACTATATTTTCTGCATTATGCATTCTCAGTGGCTCAGTGTCAAAGATGAGTTGATCTTACAAGGATGGATTTGTTTCCGGGCTCTCCATCCTGCTCCACTGATATCGGTGTGCATTTTTATGCACACATCATCCTGTTTTTATTACAGTAGCCTTCATATGTAGTTTAAAATCAGAAAGTATAATGCCCCTAGCTTTGTTTTTAATCCTCAAAACTGCTTTGGATATTCAGTGTTTCTTGTAATTCCATATAAATTTTAAGATTGAATTTTCTATTACTTCGAAAAATTGTACTAAAATTTTAATAGGGCATTTATTGAATCTAAATTTTCCAATTTTATAAACTGCTCTCAGTAGGTACAAATCTTCTCTTGGGTCAATTAGCTGATAGAATCTTCTTGGGTATGCAGTGGAGAGGGGTTATATGTGGGTCACATGGCTGTTTCTTGGTCTGTTGTGGAGTTTGCTTTTAGTGGGTTTGTTACCAGGAGCCTGGGTAGTTGTTAATCCTGTCTTATTTCTTGGCAGACGGAATTGCCTTTAGGACTTGGATCTGTAGGGCCAGCACTAGGGCAGTGTTCTGCAGTACGGCTGGTATATGGTGTGCCTGATGTGTGTTTCTTACTGAGTATGTGGCAAGATTTCCCCAAGTAACTCTTTGAGTACTTAAGTTGGCAGAACTTGCCACAAACTGTGACTATCAGTGCTGAAACTGAGTCACTGAACTGTTTCAGAGAGCACAGTAAAGGCCAAGGTCTGCAGACCTACTGCTGTAACCACAAACAGGCATCTTTCTCTGGGTCTCTGGATATGCAGAACCACTCCTAGGCTATGGCTGGAAGGAGCTGGAGATGGTTATGGAGTCACTACAGAATTTTAAGTCAAGTCAAAATAGTTGAACCATTTCTTGACCTGTAGCCAAAGAGCAAGGGTTTTCAAGTTTGCCACCTATATGAGGACCTGCCTTTTCAAAATGACTTCAATCAATCTTTAGTTCTAGCAGGTTTTAAAACCCTCTCCTTGAAAAACAAAATTATTATAAAGGTCTCTTCTTTGAGAAGGAGTCTCACTATATCACCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGGCCTAAAATGATTCTTTTTCTGCCTCAGCCTACAAAGTTGCTAGGATTACAGGTGTGAACCACCATGTCTGTCAACATAATGGACTCCATGTAGTAGTTCTTATAAGACTTTTCTAGGGGTAATGAACACCCTTACCTTTGGTTCATGTTAGAAAGTCTTTATTGTTGTCTTATTTTTAAAGTAAATTTCTCCCAGATTAAGTATCCTTGGTTGGTAGCATTTTTTTTCATCACTTCGAAATTTAGGAAGTTCTTAGTGAGTCCCTTTTTTCTTCAAATAACCTCTCTGTGACTTTTCTCCTGCATTCTTCTTCAAAGACTCCTTTCATGAATACATTGGTCTCCTTAATCATATCTAATAAATTAGTTACATATTCCGTGTTGATGTTTTTCAACTTTTTTTGTTTTATTTTTTCATGACTCAATGTTTATAAATGTCTTTAGTTTTCTGATTTTTGTTTTCTGATCATTAATTCTGTTGTGACTCTACAAAATTTTTCAACAATTATTTTTCTGCCACAATTTCTACTGGTTTCTTTTTTTAAAATCTTTGTTCTATTTTTGTTATTGAGCATACTTAGTATCATTATTTTGACATCTTTGTCAGATAATGCAAAGATCTTCTTAAGGATTGAGTTTTGGAAATTTATTTCTTCAAGTGGGGTATGTTTTCTGTCTTTTTTTTTTATGTTACGTGATCCTTTTATGAAATTTGAAAACTTAAAAACAGCCATCTAATCTAATATTTAAAGACTTGCTTAAAGAATGGCTGTAGCAATGAGCCACGCTATAGATTTTTTAGTGCTTCACAAACATGTTCTCAGTTATGTCTTTGAACTTTTGTGTGTAATTTCTAAGTTAAAGAGATTTTTTCCTCATTTTCTTGTCAGATTCTATAATCTTTTGCTTCCTTAGATGACTGTGGCATGGCAGTTCCTCTAGTATTATAACAACATTCACCTTCTAGCAGATACAAACTGTAATTCTCATTACTCCATCATTTTCATGTTAAGGGAGACAGACTCTATTAATCAGAACTTTAAACAGACCTGTTGTTTTAGATTTCTCTTGAGGATAATACTGGGAGTTGATTGTGTTTTACTTAGACCAATTGCTGTTGAAGGAAAGAAAGGTTGTGTTGGAAAGTCTTTAAGCTAGACCTGGTTACCTTCTGCAGCATAGAAAGTATTACTGGAATGTGAAACGAGTGGAAAGAATAGCCATACACTCAGATAGGTATGAATGATTTAGCAGATAACACATGTGAAAGGTCCAAAGGTGAAGGAGAAAACAAGAGTTTAAAATGTGGATTGGGAGGCTGTTCTCCAATGGAATTGATTCTTGAAA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Seq C2 exon
CTGGTTCTTTTCATTTTACTGCAGAGATATTGCCGGATCATGACATAAAAGATTCATTTCAAAAAGTGATTCTGAGAAAATATGGAAGCTGTGACCTTAATAATTTACATTTAAAGAAAGACTACCAAAGTGTGGGTAATTGCAAGGGGCAGAAAAGCAGTTATAATGGCCTTCATCAATGTTTGTCAGCTACCCATAGCAAAACCTGTCAATGTAATAAATGTGGCAGAGGTTTTCAGTTGTGCTCAATCTTCACTGAACATAAAGACATTTTTAGCAGAGAGAAATGCCACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGACTGTAGGTTGTTCTCAGATTTTACTAGACATAAGAAAATTCATACTGTAGAGAGATGCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCGTTTAAAAAGTTTTCAAACCTTACTGAACATAAGAGAGTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGGATGTGGCAAAACTTTTACCTGCTCCTCAACCCTTGTTAAACACAAGAGAAATCATACTGGAGACAGACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAAGTGCTTCTCAGACCTTACTAATCATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTAACAAAGCCTATAGGTGGTTCTCAGACCTTGCTAAACATAAGATAATTCATACTGGAGACAAACCCTACACATGTAATGAATGTGGAAAAGCTTTTAAGTGGTTCTCGGCCCTTAGTAAACATAAGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACATCTGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTACCCGCTCCTCAACCCTTTTTAACCACAAGAGAATTCATATGGAAGAGAGACCTTACAAATGTGAAGAATGCAGCAAAACCTTTAAGTGCTTCTCAGACCTGACTAATCATAAGAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCATCGAGCTGGTTCTCACACCTCATCAGACATAAGAGAATTCATACTAGAGAGAAGCTCCACAAGTGTTAAAAATGTGGAAAAGCCTTTACCAAGTCCTCATACTGTGTTCAACATCTGAAATTTAATACTGAACAAATGCAGTATAAATGTAATGACAGTGGAAGAACATTTATCATCTTAGAGGGTCTCTAAGAACTTACTTTATAATCTGGTTGCTTATATGTTGGGTACATATATAGCCCTTTGCTATTATGTAATGCCCTTTTTTTTTAAATCTATGTTAATTTCAAGTCTGTTTTGTCAGAAACTAGGATTGCAACCCCTGCTTCTTTTCCTGTTTTCTATTTGCTTGGTAGGCTTTTCTTTTTCCCTTTATTTTGAGCTTATTTGAGATGGGTGTCTTGATTAAAGCATACCATTAGATCTTGATTCTTTTTTCAGCTTGCCATCTGTGCTTTAATTTGGGTATTTAGCCCATTTACATTTAAGGTTAGTATTCATATGTGTGGATTGGATTCTGTTATTAGGATCTTAGCTGGCTATTTTGCACATTTGTTTCTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000234444:ENST00000355095:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.061 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains