HsaINT1047691 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000124203 | ZNF831
Description
zinc finger protein 831 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16167]
Coordinates
chr20:59159652-59194757:+
Coord C1 exon
chr20:59159652-59160895
Coord A exon
chr20:59160896-59190983
Coord C2 exon
chr20:59190984-59194757
Length
30088 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAAGTGAGT
5' ss Score
9.1
3' ss Seq
AGTTTGGTTGTTGTCTGCAGGTT
3' ss Score
7.71
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.851
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
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Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
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F:
No suggested primer sequences
R:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains