MmuINT0116778 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000075270 | Pde11a
Description
phosphodiesterase 11A [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:3036251]
Coordinates
chr2:76032946-76049220:-
Coord C1 exon
chr2:76049080-76049220
Coord A exon
chr2:76033011-76049079
Coord C2 exon
chr2:76032946-76033010
Length
16069 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCAGTAAGT
5' ss Score
9.09
3' ss Seq
TGTCTCTCTGTATGACACAGGTG
3' ss Score
8.72
Exon sequences
Seq C1 exon
GCCCTGCTGGAGGTGGTCAATGACCTCTTTGAAGAACAGACTGATCTGGAAAAGATTGTCAAGAAAATAATGCATCGGGCCCAAACTCTGCTGAAATGTGAACGCTGTTCCGTCTTACTTCTAGAAGACATTGAGTCCCCA
Seq A exon
GTAAGTTATTCTCCTCTCCGTGCGGGCGTCCAAGACTGAGCGGAAGGAAGCTGGGTGTATCTGCAGTTCAACTTGCAAACAGATCAGCAGCATTTACACCTTCAGCCCCCAAGGGAACAGTTTACATATGAGAGGTTCCTTCCTTTAAATGTATTTTCCTTAGGGAACATTTTATATATGAGAGGTTCCCTCCTTTAGATGTATTTTCCTTAGGGAACATTTTATATATGAGAGGTTCCCTCCTTTAGATGTATTTTCCTTAGGGAACGTTTTATATATGAGAGGTTCCCTCCTTTAGATGTATGTTCCTTCTTTTCTTGTCCTCACTCTAAAAAGTAGTCCTTTTAAGCGGGTGGGGAGCTTAGAGCCCCATTCAGCTCTGTGTAGCTAACAGATGATTGTGATTCTCAGTCATCACACAACTAAACTAGAGGGCCAAGTGCAGCTCCACCCACCCCATCTTGTTTGAACTTGTCTGCCCAGCAAGTCTGTAGTAGGAAAATGTCGTTCAACCCTCAGAAGAGGGCAGGAAAGCAAGCAAAGGAGCAGAGCAAAACCCCCTCAGACCCTGGGCAGATGGTTACTGAGCCCACTCAGTGAGTTCAAAGACCAAGATTAAGAGCTATTTCAACATCTCTGGGAACAGTGTTTAATGATACCCAACTTACAAAGATAGTGTCAAAAAAAAAATAAAGAATCTGGGGTTAAAACTGTAATGAGTATTGAAACTTTGCATAGATTGTTTAGGATGTATAGATACATATATGTGAACCCTGACAACATAATTTTTAGTTCTGAAAATTCATATAGGAGCATAAACATGTATTAATAGACATAAAACTTACTGAAAGGGCAACAAAGAAGAACAGTGAGTAAAATTCTGACTGAAAAGCTATTTAAATGTTCTTGAAACAGATTTTCTCCTTATTTTTAAAAAAATAGCTAAATAAGGGGCAAAGCAAAAAGGAAAAATATCTGCATGAAGGCCCCCTCTCACGACCCTATCTGACTCTACAGACACCTTGGCAAAAAAGCTTCAGGGATGAATTATATCAAATACAGAAAGTAATGGCTAAATTCTGGGCTTTTAGGCACACAAATGGGGCTTAAAATCTTGTAATTGTGTTTTTCTAAGACCTTAAAACTTGGGGCAAGGGAGAATGCTCGATCAGCAAAATGCTTCTCTTGAGAGAAGGAGAGCCTGAGTTTGATCCGCAGGACTTGCACCAAAAAGCCAGGGCTGCTAGCTCGAACTTGTCCTAAGCACTGGGGAGGCAGATGGGTAGATCCCTCAGGTCCACTGACCAGCCAGCCTGTTTGTCAAGCTCCGGGCCACTGAGAGATCCTGTCTCAAAAAACAAAGAGTATGAAAAGTGAGAGCTACTCCACATGCATGCACAATTCCTTGCCCCTTCCCGACATACACAGAAGTGTATGTACACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAGCAAACAACAATAACAACAAAACACTAAAAACTGTCATTTGGAAGAGCCAGGATTTTCTAATCTAAAGGCTAAATGAATCATAACTAAAAGTAATGAAGAAAGCAAGAGACTAGAAAAAGAACAGAGAAAGCCCTAGAAGATCTGACTCTTGAGTTAATCAGATTGGGGAGAGCAACATGTGTGGAACAGTTGGGTCCTCCTCACAGTGTCCCAGGCCCAGGTCTTCCTCACAGTGTCCCAGGCCCAGGTCTTCCTCACAGTGTCCCAGGCTCAGGTCTTCCTCATGTTGCCCCCTATTTAAGTGTCCATACAGTAGTGGTAGTGGAAGGGTCGGTAGATGATCGTAAACGTGTCTCTGAGCCAAGGGGCAGGGAATGTCCTACAGGCTCTCTAAAGCCTCTGAGAAGTAGGAAAGACAAATGTAGTTTTCTCCATACCTAAGAGAAGCTAACATGGAAGGCTGGCACCTGAAGAAGGCTCCTGGCCAGGCTGTAGGAGGTGGGGCACTACATCCTAGACTTGAGGACTAGGAAGGATGCTGCGGAGGCCAGTGAAGTCTCATACCCCATAGCAAGGAAGAAATGGAGGGCAACCATTTCTTTCCAGAGCACACAGGAGGCTACAGGTCACACCCTGAAGTTTCCATATCTCAGTTTAAATCTGAAATTACTGAGAAAACCTGGCATAGTACACTTAACTGAGGTGTTCTCTTTTGCCTTCTGTCAAAATAAGCAGAATTGAGGCTCAAGAAGAGATGTAGTTGACTTCTAGAAAAAAAAAATGTAAGTTCCTTTTTGTACAGTTGTATCTGTGACCTTAGATTTTTGTGATCAATATACCAATTTCCCTCTCTAGTTAATCATTCATTCTCTATTTAATTCACCTAATTGACAAAGGAAACATTTATAAACAAAGAGTGATTGATGGGTTGTTCTGTAAGTGCTGGCAACTTAGAAAAAAATTTTAAAGTTGGATTTCTAGGTTAAACCTGTTTTAATTTTATAACAGGTAGAATAGTTAATATCTCACAACATATTAAATGAATGCAGGATCACTTAAACTCGATGCAGAAGGGAACTGATACATTGCTAAAAGAGACCAGAGAAGCATTTGAGAAAACCAAATAAGATTTCAAGGTTACAACCAAAGCTTGTTACAAATCAAGACCGTAAACTGGGGGCTGAGAGGTTGTCTTTCACATTGGAGAGAAATGACTTATCTCTATAAGAGACAAAGCCATGGCACTAAAGCTGCACACTTTTGTCACTAATAACCAGTGAGCAGAACTGAGTTGGTTTCCCAGACCAGGAGCTGGCAGTTTTTTTCCTATAATACCTTGAGTTTTTCAGGGTAGGCATTCTCTGGTACAGTTACTCAACTCTGCCACTCTAGCAGAAAATCAGTCATAGACAATAAATTAGAATGTACATTGTTGTGTGCCAATAAAACTTGATTTATAAAAATAAGGGGTAATTCAAAACTTGGCTTGTACATGGTAGACTCTTATTTTAGAAAATCTCTCCCTCCATAATTAATAAAAAAATCAGCATATAATAAAAAGCATAGAATATGTGCAAAGAAGCCATAACAAGAGTGAGGAAACCAAAGGCTTGACACAGAGCACGTTCCAGAAACGTTGACTAAGGTTTTTCATGAAGTGAGATTAAGCAAACACCGTCTATCTGAAAAAAAAATATGCTGAAAAAGAAGCTGCAGAGAAGTCAGAAATATATTGAGGAGGAAGAGTAAGAGGAGGAGAGGGAGGAGATGGAGGAGGAGAAAAGGGAGGACGGAAGGAGAGGAGGGAGATAAGGGAGAGAAGGAAAGGAAGAAGAGGAGAGGCTGAAGAGGGAGAAGAGGAGGAGGAGACAGAACATGTCGTTGGTAGAACTTGGAAGAAGAAAATGTGAAATCATACAGGACTGAATATTACATTTTTAGAAAGCCAGAAAGAAAATCAAAGACAGCTCTAGATGCTTTAAGGAGCATGGAGAACAAAATTGAAAATGAAATGGAGAAAAGTAAATTATAAAAAGGAGAGAATGAAAAGAGCAGAGTCATAATGAAAGTTCAAAGTAAGGATAATTCGCTGCCTCTGAAGAGAACACGGCAAATGGAACAGGAGAAGGCTTTCAGAATTTATAACTCTAGGACATTTTATTGAAATAAAGTCAAAGTTGGATTTACAGATTGAAAGAATGCTATTCAGAAGTCAGCACTCACTGCTCAGCACTGAAATACATCTGATGCTAATGGAATTTAAAGATAGGGGGAAAAAAGGAATCCAATCTGTGGGCATCTAGGCAAAGACGGGACACTCTGGAAAAAACTTCACTCTGACGTTAGTTAGGCTTCTTAGATGAGGTCCCCCAGGGCTAGACCTAGAGCAAGACCTAACCAATCCTCCGGGGGAAGATGTGGCTCTGTAATTTAAAATCCATGCAAGTTCCTATTCAATTCTTTAATCACAGGTGGCCTCAAATATGCTTTCGAATATGCAGGTGAGATTCCATGGTGCTTTTAAATCTGCAAGCAAGAGTGTAAGAGGTATAGTTCCAAGAGCCTGGAGAAGACGGGTGGCTATAATATCACCATGCAAAAGGGGTGAATGACAGCAAGATAAATAAGAGCTGCATCAAGGGCTGGGTGTGCTTGAACATGCAAACTGTGGCTAAACCAAGGTCAATACTTGCAGGAGTAGAAGCCTTACGTTATCAACTGTAGCAGTGGTGTTGGTCCCTGAACTTGGGAAACACGACTAGTGGCAGTGGGCTGTGTTATGCAGCAGTGCACTGTCCAGTGGGATATAGTCCTTTTGTGCCTTGAATGTGAACTGTGAAACACAGGCCCATCTATTTGAACACTCAGTCTTCTGTCAGCTCTTGGCACTGCTTCGGAAGGTTGAGGAACCCTTAGGAAATCCAGCCTTCCTGGAGGGAGTTGGTCACTGGAAGTAGGTCTTGTGGTTCAGCCCCACTTCCTGTTCACCCTTCTTAACGGTGAATGCATTGTAACCTGTTGGCCTCTCTCTCCTGCCACCATGCCTTCTCTGCCTGATGCCAGGTCTTCCCACCGTGAGGGAATGTGTTCCTCAAACAAAGCCAAAGTAAACTCTTCTTCCTTTATGTCCCCTCTCATCACATATTTTTGTCACAATAAGAAAAAAAAATCAGTGGCACAGTCCCTTTTCTGCTAAGTGGCATTGTTGGGGGGTGGGGGAGGAGATGCTCCTATGTCTCAGCTGTGTTGTTCGTAAATCGGTTCTGAGAAGTGATATGGGATATTATAATAATGCTTGGCTTCAGTTTTTGAGCTCACTGCGCTGTTCTTTGTGGTTGTTTGTCTGTCTCTGCAATGAAAGCAACAGTCTTAATGTCTACCGTTTTACAATAGTTTTGTATTAGATAGGGTAAGTCTTCTATAGTCTTCAATTTTAAAATTGTAATCTCACTGTATCCCAAGAGAGGAAGAGGAAGCCCCTCTTCCCGTATTTCTCCTTTGTCAGGGAGGAAAGTTTCTCCTAAAAGGGCCTTCCAGAGTCTACAGTCATGATCTTTGGGCATTCAGGTATAAACTGATATTTACTGAGTTTCAAAAATAGAAACAATGAATGTCTTTATAGATAGTTCCATGCCAAGATTAAAATCCCACTCTCTTGCTTCTCTTAAGTGTTTCAGTCCATTGATTTTAAGTGACTTTGTCAATTAGAGAACAAAACAAACCCTTATCTGTACACTGCTGTCAACATGAGGAAATGCTTAGGCTGCTGAAGTGAATAGAGTCAGTTTAACCGTATTCCATCCTAGGGACCGTCAAAGTGACTCTGTCACTTTTCTTAGCTTCCAGTTCATGCACTTCCTATTACCCCTGTGTCTTGTGGAGCTTGGAGAAAAAAGTGAATGTAGAAATTGCAGCCTTAGAGTCCTCAGGCACCATCTGTTTTGTTATTTCCCAGGACTCTCTCTGTTCTGATCATCCTGATGGTGGCAGCTAGTTCCTCGTCCAGCATACTAACAGGCACTTCATAGCTAAGCCTATGACTTCCGGGCTCCTTTCTGGAGATCATTTACTGAATGTAACAGAGCTAGCCATGCACGCTGGCTTTCTATCATAAGTCCTAACTAACTCCTTGGCCTTTGTGTACATACACGCTCAGTGAAGCCAGTGGCTGAAGATATTCGCATGTCCTCATCTGAGGGGAAGTGACAGGCGATGAGTGTCATCCAGCAGTTCTTTGTTTTTTAATTTTTTATTAGATATTTTCCTCATTTACATTTCCAATGCTATCCCAAAATTTCCCCATACCCTCTCCCCCACTCCTTTACCCACCCACTCCCACTTCTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGAGGCATATAAAGTTTGCATGACCAATGGGCCTCTCTTTCCACTGATGGCCGACTAGGCCATCTTCTGATACATATGCAGCTAGAGACACGAGCTCCGGGGGGTACTGGTTAGTTCATATTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCCTTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAACTCTTCCATTGGAGGCCCTGTGGGATCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTATGTGTTTGCTAGGCCCTGGCATAGTCTCACAAGAGAGAGCTATATCAAGGTCCTTTCAAGCAAAATCTTGCTAGTGTATGCAATGGTGTCAGCTTTTGGAGGCTGATTATGGGATGGATCCCTGGATATGGCAGTCTCTAGATGGTCCATTCTTTTGTCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAACTCCCTCCATGGGTGTTTTGTCCCCAATTCTAAGAAGGGGCAAAGTGTCCACACTTTGGTCTTCGTTCTTCTTGAGTTTTATGTGTTTCGCAAATTGTATCTTTTATCTTGGGTATTCTAAGTTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAGTGAGTACATATCATGTGAGTTCTTTTGTGATTGGGTTACCTTACTCAGGATGATGTTCTAAACCTGTGTGTGATTCCAGCCCCTCATTCATAGGTAGATTACAAATACTGCTTCAGGCTTCCTTTTCCATCACCTTCTCCCTATTTTCCCGTTTTATTAAATTTCCCTTCTACAAGGGAGCCAACTTTTGTTTCATTTTTCTTTCAGGTGATGTTAGAGTACAAAACAAAGGGCATATTCTTTACATTCTCATGCACACACAGTCAACCTCTAATATTAACGCATCATACATTAAACATTATATAGTCATATATTAACTTTCCTTATTGGGACTCAAACATGCATTATTTTGAGCAACACACCACCTTAACTCACTTTGTTAATAAGTGTCTATTAATGTATCAACTCAACTCACACATTGGTCAAGTCCCTGCTGGCCGTCTCTGATGTGTTTGTCCTAAGTTTCTCATACTTCTAGATTCCTCTATAGCAGTTACAGAATCTTGTAACAGCTCATGTTGCAAACCACAGAGCAGTTTCCAGCCTTTTCCTCGCCTTCTATATCTGCACCTCTCTGCATTCTTTTGTGTCTGTGTTCACACATCATTCCTAGTTCTTCCGCCCTGGTGCTTCTATCACTGACTTTACTAATCTCTCACGTGGGATTGTCTCCGATTCCCGTCTTTGCTTGCAAACAGGGGATTCTCTTCAATCAACTCTCGATGTGGATGGCTTCTACTTGACTTCCTAATCACGCACCTGCTTTTTCCTAAGCTTCATGTAGTTTTGTAGCTTTCTGTTGGCTAGGCAGTAGTGTTCAACATTCAAGGCTCACCACTTCGGTTGCCAGGTTAACTTTCTGGTTTTCTCTCTCTCATACCTAGTCACCTCCCTATAATCGGTCTGGGAGGGTGTTTGGATCTGTTTTTGCATATAGGGTCTCTGCGGGAAAAATGAAGTCACTGCCAGTGAAGGAGATGGCTCTTCAGCCTATTGCAACAGGGAGGATGCGCATCACTGAGGAGTGTGTCAAAGAAAAGGAAAGATGCTTGAGACTTAAGGGAGCCATGAGGTTGGAGAGCAGTCATATTTTGGAATACAGAACTCTGCCTACAGGAATACAGTGCCTCCAGTAACATAGACACTGCTAGAACACTGGTTGGAGGTTTCTTTATCAGAACTATTTTGGGCTTAGGGTTCGGATAAAATTTAACACTGTCTGCATTGACTGTTCTCTTCGATGCCCCTTCCACACCATGTATTGCCGGTTTACTCTCCGGTTCAGTGCCCTTGAAGTCTGATCTCTACACAGCATGATTCTTAGGCTGCTTTATCCTCTGGCTTCCAGTTGAGTCCCACAGACTGAGAAGATCAGCACAGAGCTTATGAAACAGAGGTGTTGCTGTCTCGTCTCACCCTGTTGTAAAAGTAGTTGTGTTCTTCTACTGTCCTTCCGGTAATCTCAGCTCCCAGAGGAAACCAACAACGCCACTTCCTTCTTCCATTCTCTCTGGGTTGCCTCTGATTTAGAAGCTTAACTGTTTTCAGAGTCACTAGTCACTGGGCAGTTCCCCGTTCTCCATTATTTATTTTTAAAGGACACACTCCCATAATTAGTCTCTTTATTGAAATAGGTTCCATTAAACTCCTTTGGTTTATTTACCATCTCCTTACCGCCAGAATAGAGTGGTCTAGAGCCTCAGCCTGGAAAAACTACCTCTCTGCTTGGCTTAGAGCTGTCTACTCACTGCTAGGGCATAGTTCACATGGTGATCTGATCACCGCCCTGCATGCTTGGGTAGCCTTGGAGCATCTGTTAAGGTAGAATTATGCATCTGTAAATTGCTTCCTGATCTTTACTGTGGTATATTGTGAGTTACTTAGGACAGGGCATTTATATTCCTTTCTACTTCCAGAGCCCATCACAGTGCCTGGAGCACAAAATACTTCATAAAGGCTGACTGAGCAAACACATAAAAAGCTAATTAACATACGGGGAGAATTTTTGAAGAGAGAGGGTAGTGGATGAGCATTTTAGGCAGTCTTCAGCCTTTTTTAGTAGCCCTCTTATGAAAAAAATTAAAATTAAGAAAAAATGTTTGTTTTGTGTTTTAGTTTGGTTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGGGTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTTAAACAGGGTCTCTCTGTATAGCCTTGGCCATCCTGGAACTTGCTCTGTAGGCTAGGCTGACTTCAAATTCACAGTGATCCACCTGCCTCTACCTCCCAAGTGCTGGATCAAAGGTGCACACCACCACCACCTGGCAACAAAAATTTAAACTGATGATTACTTAGTTGTCATTTTCTTTTGGGTGCTGGAATATCTACTTGAGTATAGTTTTGGTTCTGAAAGTTGTTTTGAAGTGGGAAGAACAGAGGAAGCCGACTAAGTACCATCTGATAGATCTGATAGATACTTCTCTCCATGGAGCCGTTCCAAAGAGCAAGCAGGGGAATCTCAGGGGGATCTCACTCCCTTCGCTTGGCATCTCTGGTTTTCCCGGAGTGCAGTCACCAGGCTGATCAAGCCAAGAGGAACTTCACTGATCTGGAAGCGGCTGCTGGTACTTCCCTTGGGAAACCCTTCGGGTCTCTTTATATATGGGCGTGTCTGTGTTTCTTTCCTACTCGCATGTTAAAGTCAGAATTGAGTTCATGTACCAGATTTTATAAAATAAATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATTCAGAATTGCCTCAGATCATGAATACTGTCACCTTTACAATGTGACTTCTGCTATCTTTATACTTTCGTCTGTTGCTTCTTGGTTATGATTGCTGCAGCTTTGCAGACTTGATCCCAAACAGTTATCTATTCAAATGAATCTTTCTCTCCCTTGATCTGTCTCTCTCTCCTCTCCCTGTGTTGCCCATCACCACCAACTCTGTCTCTCGGGCCTGTCTCTAGGATCTAGATCTTCTGCCTCACTCTCCCTAGTGCTGAGATGACAGAGGTCTACCGCTAACTGTGCCCAGCTCAATTCATTATACTTTGTATAGATTCATTTTAAAGCATAAAGACATGAAATTGTTATTAGAGACACTTCTGAGAGTGAGAGTGAAAAAAAGCACTATTTTTGTCCCCGGATAGTATCCCTAATTAAATGGTGTTTGTTCTGTGACAGCCAGGACATGTGTGTGTCCCCAAATGTATCCCCTGCAGCTGGCCTTGGCACCTAAACTTTCTATCATTATAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGATTATAATTCCAGGAACACCCCTTTCTGAATTATAGATCAATTACATCTATTTATGTAATTATTTACACCATTAATTAATTTATCATTACCCTTTAACAATTCAGCAGTTAATAACCTGGCCCATAGAAAACTCTAGTGGTTCTCAACCTCTCTAATGCTGCGACCCTTTAATATAGTTCCTCATATTGTGATGACCCCAACCATGAAAGTATTTTTATCAATATTTTATAACTGGAATTTTGCTACTGCTATGAATCATAATGTAAATATTCATGTTTTCTGATGGTCTTTGGGGGTCACAACCCACATGTTGATAGCCATTGCTATAGATCAAACATTGCCAAATTTATTTTCTATAAAGGTTTATCTAGTAAATATTTGGGGCTCTGTTGCAATATAGTTTCATCTGAAACTATTTATCTCTATTGTTTTAGTAGAAAATGAACATGGCTCTGTTTTAATAAAACTTTATTTATAAAAACAGGTGGTGATAAGGATTTGTCCTACACCTGCTCTAAGTGATAGAAGACAAGCAGATGAGGTTACATCCCCAGGATTCTGCTACTTCTCTGTGAATTATTCATCTTGACTGTGCACAAAGGCCCAAGTATAAACTATGGCTTCCCAACAACTTGCTGAGGAAAATTTAGCTATGGTTTTAAGCTTCAGGTTGGCCATAGATGACAGACTGTATAAAGAGATTTTATTAGTAGGTCTGGATCCATGATTATGTGGCTTTGACTTAGATTTATGGCAGTAGTAGAATCTAAACTGCACCAGAAACCTTTAAAATCAGACAGCCTGAATCTAAAACAGCTTCAGGCACATAATGGGCCCAAGGGTGATGTCTCAATGCCTCCCTAACTTGTTTGGCGTACACCCATATGGTTTTGTCTCCAATAGTCTCATTGCTGTACTTACTTATTTTATTACTCTCTTGATGGGACTCAGGCCTGCTGCTTTTTTACTCTTACATTGTTTGCTGTTAGCTGTAAGCTAGTAAGTGTTGGATTCCTCTTCCTTGCCATTTCAGGTTTCTTGTCCTACCCCTGAATAATAATTCTACACAACCTAGTAGCCCACATAAAGCTTTCATATAAATATTTAATTTATGAAAACATTTCTATCCACATTTGTGTATCATTTCAAGATTTCAATACTTCATTGTTTCTAATCGTGTTCAATTCAGTACCAAAAGGACTTAAAACTTTTGAAACCCATGGATGGTACCACATACGTATAGTCTCAATTTAGGAGGCTGAAGCAGACAGATGGAGTTTGAAGATACCCTGGGCTACAGGGTAGAACACTTTCTCAAAACAACAGTGATAACAAACCAGAAAATGTAAAAATGTAAGTGAAGAAACATTGCAAGTGCTCATGACATGTTCTATATGTGCAATGCCATGAGAGGTTTTCCAGGCAAAAAAAAAAGGAAAAAGAGAAAGCAAAACCAAATCAACAAGTTTTAATCTGAAGTGTGTTGTATGGAGGTAAGACTTAGAATAAAGAGCTTTACTTTGAGTTTCTGAACAGCCAAAGTAAAGGGAAAAGTTTTATACATTTTATAATTCCCTTCATCTAGAAGAAGGAATCATATCAGGGCACCAAGAAAAAAAAAGTCTGATCCTGTATTTTAAAATTAAAATTATTTTATTGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCATTGGTCCCTGAGATTACTGAGCCTGAGAAGGTCATTGATCTGCCATCTACAAGCTGAAGGACAGGAAAAACTGGTGGTGTGCATCATTCTGAGTTCAGGAACCGCAGAGGCCAATAGTGCAAGTGATGGTCTGAGGCCAAAGACGGAACCAGCTGTACCAGTATCTCAGGGCAGAACAAAATAGACACCTGAGCTTAGAGCGAACTCACCCTTCTCCTTCCTGTCTGTCCAGACTCTCAGTGGTGGTGATGACCTTTGCTCAATGTACTGATTCAAATACTAGCCTCTGCCAGAAACATCCAGAAGTAATGTATTGTTAGCTATCTGGGCATCCTTAGGCCAACCAAGAAAACAAATTCATCATTCTAAATGGTGTTGAAGTTTAGCAGTTGTGTTTATCTCCCTGCTTTGTGTGGAACTTAATAATCACTAGATAATTAATGTTTAAATAAAGCACAGCCACTATTAATATTTGATTATGACTATTTTTTCCTAAAGACACAGGAACCTAAGAATTATGTAAATAAATTTTTATGTACATAGTTTACATTGTTTTAAAAAAATACAATCTACAATACTATCTTTGTTTTTCACACTGATTGCAACTTTAGGGGCTCCCAAGACCATTCTCTATTTTAAATGACTGGCTAGAAAGACTTAAAGAAAATAGTAGCAATGAAACGTGACAATACAAATAAAATTTTGTCCACCAAGGCCTGAGCTTTAGTGTATAGAATTTCAACTGGGGCTCTATCACAAAAACCTAGTTGGCCATCCATCTATTTAGCTAACTTTCACCTCTGTTCTTTGAGAGATCAGATGACACCATGCGGCCCCAAGACACTCTGCACATAGCCCCTAAATCATAGTTTGGTGTGTCTCAAAGCACCATTCTAAATCATGTTATTATCTAGCCATGCCAATGTCCCCTACATACACTTGTTTATCAGACATTTCAAGGATTTAGAGGTTTCTCTCCCAAGAGCCAGGGGCAAATGTGAAGATTACATTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCCCCCTTCTCTGTGTACACTCATGCATGTAGAGTACAATGTGAGCTTTTACACCTCAAATGTCACCCACCTTGATTTTAGAGACAGTGTCAGGGTCTCTCAATGATGTAGGACTCAACAGGTAGGCTATGCTGGCCGGCCAGTAAGCTGTAGGGAATTTGCCTGCCTCTGTCTCCACAGAGCTGGAATTACCAATGTTTGTCCCTTTACCCAGTATTTTTATTACACATTCTGGAGAGTCAAAAATAGGTCTTTATGCTTATGTGGCAAGCACTGAACTATCACCCTAGCCCTAAATTCTTTATTTATGAATCTTCTACCTGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGGGGAGGCAAGTTCTATATGTAGATCTGGCTGTCCTAGAACTTGCTATATAGACTAAGCTGGCCATAAACTCAGAGATCTGCCTGCTTTTGCCTCCAGAGTACTGGGACTAAAAGCATGTGCCACACCACCTTGCGCATTATAGCTGGTTGTTATCGTGGCTTCATGGGCTGTTTACTATGGGGTAACAGCCATTGGAAACTGTGTACCTTCTCTCTTACAAATGAAATAAAACTTGAACCTGTTTTACTTTTATTTTGTTTTAGGTTTTTAGGGTCTGATGTAGCTCAGGCTGGACTTAGACTCCTTGGTTGACCTCAGAATCTCTAGGACTTCTTGAACGTCTCACCCTTCCCCACACCTCCACTCCCAAGTGCTAGAATTCCAAGCATGTGCCATCAGGTTTAGTGTATGCAGAGCTAAAGATCCAACCCAGGGCTTCATGTTAGGCAAGTTCTCTACAAACCAAACAACAGTCTCCAGCCCTTGCCCTTGGTTTTTGTTTGTTTTGTTTTTCTTTATTTATTTCCTTTGGGATGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGGGGTTGTTGTTTTTCAGCTTGTTTTCATTTTAATATTTTTAAATGCTCATCATTTATATTTTAAGAATCAAATATTCTCAAGTTCTATCAAGAGTATTTATATGTCTTATATTCTTTGTGATCCTATGCCTATGCACTTATAGCTTAAAATTTCTCATTCTATCTTATAAAATGCTTCCAGATAGAAAATACACTTTTAAAATATCTTAATTCTCTTTATTCTTGGGACATTCTCTGGGACTGATTCTTAAAGTGTAAAACTAGTGCATACTTACATGCACATGCACGCACACACACGGGGGGGGGGGGTACTATAATTACAAATAAAAATACTTTTAAAAAGCCCTAACTTCCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCTGCACCAGGGGATCCATCCCATAATCAACCTCCAAATGCAGACACCATTGCATACACCAGCAAGATTTTGCTGAAAAGACCCTGATATAGCTGTCTCTTGTGAGGCTATGCCGAGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGAACACAGGGCCCCAAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAAGAGCTGAAGGGGTCTGTGACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTAGCCCTGGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAAGATGGCCTAGCTGGCCATCATTGGGAAGAAAGGTACATTGGTCATGCAAACTTTATCTGCCTCAGTACAGGGGAATGCCAGGGTCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGGAGAGCCGGGTGGGGGATTTTATGGGGGACTTTTGGGATAGCATTTGAAATGTAAATGAAGAAAATACCTAATAAAAATTGGGGAGAAAAAGCCCTAACTTTGCAAAAATATAAAGTAAATATGTTGAAAAATATATTGAATTCATTGATGAGAGTAACAGAAAGTTGGTGAGAATGATTCTAAAACAGAGACTATGCTGGCTAGTTGTTATGTCAGCCTGACACAAGCTAGATTCGTCTGGGAAGAGGGAACCTCAGTTGAAAAAAAATGCCTCTATCAGACTGGCCCTGGGTAGATGGTTTCAGGGTATATAAGAAAGCAGACTGAGCAAGCCTGTAAGCAACATTTCCCCATGATCTCTGCTTCAGTTCCTGCCTCCAGGTTCCTGCCTTGAGTTCCTGCCCTGACTTTCCTCAGTGATAGAGTGTAACTTATGTGTTGTAAGCTGAAATAAATCTTTTCCTCTCCAGGTGACTTTCAGTCATGATATTTTATAACAGGAATTGAAACCCTAAGACAGAAGTTGAAACAATGCTACCCCAAATGACTACATTATACAGATATTTTAAAATGATTATTGTCATCTGGGCCAATGCAGTCGGAAGCAGTGGGCTTTGGTTTTCTGCTGCACAGCAGTTATATGCTTTTCTTCATGCATAAAATCCATTTACATTGCTGTCAGTATTTCAAAAGTTAACACCTTCCCTGACAGAAATTTAAATGTTCTATAAATAGTAAAATTAAGTCATAAATTATTATTGCTGATATTAGAGAATTCAAACTTATTTACTGGGTTAAAAAATGAAATGATATATACTTCTTGATTTCTAAAACCAGAAACAACTGATGATATTATATCAATTTATTATTTGATTAATATTATATGGTGCCAAGCCAAGTGACTTTAAGTTCCTTTTAATCTGTTTATTCATATTTGAACACAACATATAGTTAACATAATTGTGAAATGAATTTTAAATTATTTATTTATTTATTTATTTATTCATTTATTTATTTATTTAGAGACATGGTCTTACTGTGTAGCACTAGCTGACATGGAAGTTGCTATGTAGGGCAGACCAGCTTTAGAACTCATTGAGATCTGCCTGCCTCTGTCTTAGGAGTATTGGGATGAAAGGTGTGTACTACCATGCTCAACATGGAATTAAAGTTTCTAATGGCAGAATATATCTGTCTATTTTGCTTTTGAGCACATCATGCATACATAATTAAGAGTTGCAACCCTACTTGCTCTTGCTGATGAAGGCAGTCTGGAGTAGTGGGTAAATGGACCATTGGAATCAAACCAACATGGTTTGAATCTCAGGTCTACATCTTCCTGTGTAACCACTTACCCTCTCTAAGCCCTGCTTTCCCTTCAATAGTCTGGGGATCATCTACTTGGCTTAACATCTTGTAAATATTTACCCATATGCAAGAATTGGCTCTAACTTGCACATGCCTCGTTTGCAATTAAATGGTAGGCTGATCCCTATAGCATTTTCTTTTTTTAGAAGAAAGAACTTGATGCACTTTAGGCCAAATAATGAAAAGAAATTACAAATAGTGAAAGACCGAGCTTGCCGGCCCAGGTACAAAATAGCTCTAGTCAAGTGGTGTTGGTGATGTTTGCTATAGAAGAAGTCAAGCATAAAATGTGCACTAGACCTTTCTCCTCTTCTCTTGGGACCTCCCCACTGAAATGGCTCTTTAATCCCCAATTATTGTAATGATCATCGCAGGGATGAAAACGGTTATTGCTTCATTTGGAACTGTGGGGAGCTTTAATTGACTTGGATTTGCTGTCTCTCTGTATGACACAG
Seq C2 exon
GTGGTGAAGTTTACCAAATCCTTTGAACTGATGTCCCCAAAGTGCAGCGCTGATGCTGAGAACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000075270-Pde11a:NM_001081033:4
Average complexity
IR-S
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0159021=GAF=PU(20.4=68.1)
A:
NA
C2:
PF0159021=GAF=FE(13.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: