MmuINT0179235 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000059475 | Zfp426
Description
zinc finger protein 426 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1920248]
Coordinates
chr9:20478133-20492746:-
Coord C1 exon
chr9:20492386-20492746
Coord A exon
chr9:20478255-20492385
Coord C2 exon
chr9:20478133-20478254
Length
14131 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGC
5' ss Score
8.05
3' ss Seq
CTAACAGTTGTGTACAACAGGTG
3' ss Score
5.23
Exon sequences
Seq C1 exon
TCTTCCGGCTCTTATCTGCACTGAAGAGTTGCGGAGTTGCCTGGCATTCGTGAGTTCTGCGGTACAAGGACTACCTGGAGGCGGAGGGGGAGATAGAGAACGAGAGTGCAGAGCTCTGCTCCGCTTGCCACGGCGCCTCCGGGCGCGGCCAAGCCTGAGTCCTCTCTGGCTGTCAGTCGCCAGGCTGGGGAAGTGCCCAGAGGGCGGGCCTGGCGATGGCTGCGGCTACGATGCTGCTCTTCAAAAGCCGCCCAAGCAAATTCTGTGCGAAAGGCTCTTTTATTTTTCTCCTCAGAAATGAAATTTTGCCGGAGTAGTTGGAGTGATCAGCGCCATACACCTTGCGATTTCAGCGCCTCTG
Seq A exon
GTGAGCACTCAGTGAAAGGTCGCTTTTGGAAAAAGCCGTATTCCCTTTTAAAAAAATATTAGAGACGAATGTCGGGGTGAGAACTTAATTCATATTGTTAGATTGTACTTTATTTAGTGAGTGCGTGTTTTATTTTGACCATTAGTTTCAGATACAGAGACAAATTTCTTAGTTACTTCGAATGTACGTCTTTCTTGAGAGAATATAAACATTGGTAGACCTCCAGCCCATTCATAAAAACCTAGCGGGCAAGCCTTTACTCACGGCACACAGGTGGCAAAAGGATTTCTGTGAGTTCTTGGCTAGTCTGGTGTACAAAATGAGTTCCAGGCCAACCAGTGCTACGTGGTGAAATACTGTATTTATTAAAAAACAAACAAGCAAAAACCTAACAAACAATAATAGTGAGCTTTTTTCCACCTCCAAAGTTCCTAGGCCTGTGTTTGTTTCCTCATCCCTTTATCTCTCTGTGCTAGTGGTCCATTCAGGGCCTTGTGCGTGATACACATACTTTTCTCTTCGTTCTTAGATCTGTTCATCACTAAACTGCTTGGAGCTCACAGAAGAAATGTGGAAAGCTAGATTATTAAAAATCATAGAATTAACTATTAAGAAGATTGATAAATTAGTGTTCTCTCCCCAACAATCCCCCCCCCCCCATTTCTCTTTTTAAAAAAAACTTAGACGTACTAGCATATTTGATGGTCCAGTATCTGTTATGCTGCAGTCACCTCTTGCAGCAGTCCGTGTCTACTCTTTCCCCAGCAAGATATATTGTATGGTGACTTGTTTGCTAAGATGTAAACTGAAAATAAAGGGCAACATGGTAGCACATAGCAGTGATCTCAGGAGTTGGAGCAATAGGAACATGATTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTAGATTTATTTATTTTATATATGTGACCACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTGTAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGATATGAACTCAGGACCTCTGGAAAAGCAGCCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCAGAACATGATTTCTATGCCAGGATAGTTACATAGTTTCAGGCCAGTCCAGTCTGCATAGTTATACCCCTATCTCCGAATAAACAATAATAGATACAACACTTGACTGTTAAATACTTGGTAATGTACCACCTAGATTAGGACATTGTCTTACTGAAAGCAAAATATTATTAGATTCAATCAAGAAAATTAAAGAATAGAGTTATTTGGGTATTCAGCTCAGTTGATAGAGTGTTTGTGTGTTATCCACAGACCCCTAGGTTCAGTTCCTAGTACCACATAAACTGAGTGCAGTAGCTCACTTGATTTTGATCCCAGCTCTCTGCGGATAGAAGCTGGAGCATTAGGAGTTCAGGGTCAGCCTCGGTCACATAGTAGGTTGTAGGCCAGCCTGAACCACATGATCTTGTCTTTACAAAAGAAAAGAAGGAAATCAAGAACTGGCTGAGGATATAGCTCAGGAATAGAATACTTGCCTACCATGTATGAAGCCCCAGTTCAATTCCCAGCACCACAAAAATACATACATACATACATACATAAAATGATGCATGTGATATCTGATCTATAAACATTCAGAATTCTCCACATTGTTTTAAAAAGCGGCAACAAGCTTCTGGATGTTTGGAGGTATGTGATCCTTTCAAGCTTTCTATATTGTGCTGGGCTTGGTGGCAGATACCTGCAGTCCCAAGAACTGAGAGGTAAGGTCGTGTGCTCTAGGTTAGAGGACACGTGCATTTTATTTTGACATACACTAATTTTTTTTCTCTTTCCCCTGCTCTCTCAATTTCCCCTGGTCTAGCAATTTATTTACAACTTATTCTGGGGAAAATAAGAAACAGATTTTTAGTTGTAACTGCAAGGCATTTGTTTTGGAAAAGGGAAATCACTTGGCCACTTCATGGTAAATACTCAGCTGTATTCTCAGAAGCAGTAGTTGCATGGGTGACACACCTGGAATCCCAGGACTTGGGAACTGAGGCAGAGAAATCATTGAGTGATATAAATCTGTAATCCCAGTGCCTGGGAAAGTGAAGCAGACAACCACAAGTTGGAGGCCACCAGCATGACACAGTGAGAGTCTGTGTTTGAATTTATATTATTTTGGGGTGATATTTTATGAGTTATTTAAGTTTTTGCTTTGTCATCTTATTCTGGTAAATAGCTGTTTCTTTGTGCCTCTTCTCCCCTTTCCCTCTCTTCCTCCTCTCTCTTTCCCTCTCACCCTCCTCCTGTCCTTCTTAACCTCCTCCCCTGCCTGTCCTTACTCCCTCTCTCTCCCTCCTCCCCTCCCCTCTCCTTCCTCTCCCTGTCCCTTTCTCCCTCCTCCCCTTGCCTCTCTCTCCCTCCTCCCCCTGCCTCTCTCTCCCTCCTCCTCCTGCCTCTCTCCCTCCTCCCCTGTCCCTTTCTCCTTCCTTCCCTCCTGTTTCTTTCCCTAAGAATCATTTTTGCTGTCTCTGAACTCAAATGAATAAAATAAAGGAACTTTTAAGCTTCAATTTTTAGTTTTGTATTATTGTAGTTATGTTGTGGTTCGGCCTTGGACATTGTCCTCCTGCCTTAGACGTCCCAGCACTGTGACACACGTGGCTACCTTGAGTTAATGATTTCATCTTTGCTGTGTGATTTTTGTTGTTCAATCTGTAGATTGAACCAAGAGCCTTGTACATTCAAGGCAAATGCCCTACAGCTGAGCAACAGACCAACCGAGCTAATACTTTCAAAATGCCCTCCCCTTCAAGAGCTTGAAATACAATGTATCGTAATAGATTATGAGTATATATCAATCTTTACATTTTCATTTATGTTTTTTGTAATAGATTTTTACTGTGTAGTCCTAGATAGCCTGGAATCCACTATGTAACTCATGCTTTCTCTTGCTCCTGCCTTGGGACTCCTGAGATTTATATATTTCTATATGTCTGCATTTTAATGTAACTACTATAGAGTGAGTATGTCATAAATTTTTGTTGTGTATTAGAAAGCAATAAAACAAAGTTCTATATTTTGATCTAATTCAAAATCCAAAATGTATATAATTACTTGTCATATGTCAGATTCATCGGTAGTACCTTGCAGTGTATCACTCAGTATTATGGCTCCATAGTCAAAGCCCCCATGTACAAAACTAAATATTGCTACTGTATTCAGTCAACAACTGGTGTGTAGTGTTTACTTATATATTGGCTAATGTATTCCTTTTACTTAGTACCTGTTTCTTTTTATTTATTATTGTTGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCAGAGGTCAGAGGACAACTTGGTAGAGTTGGTTTTCTCCTTCCATCTTGATGTGAGTTCAGGGGTTGAACTCATGTCATCAGGCTTGCACGGCAAGCACTATACTCACTGAGCATCTCACCAGCCCCTCTGTGCCTATTTTAACAGCGTGTTAGCTGTAGTGTGCCTCAGTCTTTCAGCTTGAACACAGTATAGTCTTCCAGGCTGCCTTTGAAGTACCTCAGCAACTTTGTCATCACACACAGTCCATTGAGACGGCATCTTAACTGTATACGCTTCTCTAGGACCACAAGTATGACATTGATAGATAGCATCTTCCAGGATTCTCATTTGGCACACTTTATTCTTATATTTTGGGTGTGCGTAGGAGTACCATGGCACTTACGGAAATTAATTATCTGTTAGAAACCTCTGGGTTTCCAGAGAGAGAACTTAGTTTTTCAAGCTTAGCAGCAAGTTTACACACTGAACCATCTCACTGGCCTTGACACACTTTTTAAAATTTTAATTTATTTTTATTTATTCACTTTTCATCCCACTTACTGCCCTCCTTCCTGGTCACCCCTTCCACAATCCTCTCCATTCCCCTCCCCCTTCCCTTCTCCTCTGAGTGGGTGTTCCCCCCCCCCCCCCCCCATGCCCCCGGCACTTCAAGTTTCTGCAAGGCTAGGCACATCCTCTCTCACTGAGGCCAGACAAGGCAGCCTAGCTAGAAGAACATATCCTACATACAAGCAACAGTTTTTGAAATAGCCACCATTCCAGTTGTTCAAGACCCATATGAAGACCAAGCTGCACATCTGTTATATATATGTGAGGAGGTCTAGGTCTAGCCCATGTATATTCTTTGGTTGGTGGTTCAGTTTCTGAAAGCCCCAAGGGTCCAGGTTAGTTGACTCTGTTGGTTATCTTGTGGCGTTCCTATCCCCTTTGAGGCCCTGACACTTATTAATGACAGAAAAAAATGCAACATCTCACTCATCTTTCTTCCTTTCCCTTCCTTTCCCTCTTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCCTTCCCTCCCTCCCTCTCTCTCTATTTCTTTCTTCCTTTCTTTCTTTCCTTCCTTCTTTCTTTTGTTTTTCTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGGAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCACCACCACGCCCGGCCCCCTTCTTTATTTTTTTAAATTACGTTTGGGGTGGGCTTAGGCTGAGATCAGGGGCAACTTGGGAGAGTTGGTTCTCTTCTTCTGCTCTGAGGACTCGAATTGAACAGCACTCACCAGGCTTGGTGGTGAACCCTTTATCTACTGAGCCGTCTTGCTGGCCCTACTTTTTTATTTCTGGTGGGAGTACATCCTTTATTTTAAATTTTTACTGACAAATGGAAACCAATGGCTAATTTTGCTAGTGCCCTTTGACAATTCCTCAGTGAGGAGGGTTTATCCATATTTCTCATGCCTTGTGGAGTGCCTGTCTCAGGTGCTTTTGTTGCCTTAAGAAATTGCTCTCCTCAGCTTTGGGCCACACATCAGGCCAGCAAACAGCATAGCACCTACTGGGCTATCCAAGAACAGATTATCACAGATGCCAACTCCATACCCAGCTGCCCATAATATTCCAGGTCACGAATATCCCATTATAGCAGGATAAAGGATGTTTCCAGCGGTTAGGCCTATTGGTGGGCAGTTTCCTAGCTAGTTTATCTAACTTAACCCAACTACATCCCACCAAATGGCTACCTCTGTGCTCTAGTCTGGTCATTGTCTGTTCCCTTCCATGTGCATTCTCAGTGAGTGCTTTCTTCTCTCTGGGACATTCTGTCTGCCTGGAAGTTCCACCCTCTATTTTCTGCCCAGCTCCTGGCCCTCAGATCTTCATTATAACCAATCAGCAGCAAGACAACCTCTGATACATTTCAAGATTGCTTTTAGGCAGGTGTGGAAGGACCAATATTTACAAAATAGAAAACAGGGAGATGGACCATAGAAATGACAATACCAAAATATTGCCAGAACCTATAGCTCTCTGATGGTATAGAATTCACAATTGAAAATACAGAGACACACCTTCTCACAATGTGAAGAAAGCTTACTCCAATATCCCATAAACCTGGCATGATAAAATAAATCTGAGCCTTCTGATGAATTGCAGCTGTAGGGACAATGCAGTCCCTGTTCCCAGGCGGAGGTCTCTCAGACTCTGAGGCTTTGCAAGGAGCTCCTTGGGTTTGGTGTGTAAATAGCAATGTGAGTTTGTGTGCTGTAGGAGGGATGCTGCTGCAGCTGTGAACACGTGATGAAGCTCAATATGCTGCTGCTGCTTTTCATACCATAGTCTTAATTTCCTTCATAAAGGACAAGTGCAGGAGCTGGCACACTTGTTCAAACTTTATATTGTTCGGAGGAGCATTAAATGCTGTGGTCAACCAGTTGTCCTATTATCACGTGTTTGAAACTACTGAACGTCTGCTAAGCATGTTCTCCTTCGTTAACTCTAATGTCATATTCAGTCTTGTTTTCAGACTGGACTCAGGCTGGCCTTGAACTCCCAGTGTAGCTGAGGATGACCTTTCGCTCATGGACTTCCTGTTTCCACTTCCTAAGTGCTGGGATTCCAGGTCCGTATCACCTGTATGTATCTTACTCATATCACCGCATTCTCTGAGTACCCATCCCCTTTATAATAGCATCTTTGGCTTGGGCTGAGGCCCCAGTCAGCAGCATATCTATTTCTTTTTGCTTATCTTCCCATGTTTTCTGTATTGAAACTATTCCCAGTGTATAGTGTTCACATGAGTCCTTTTCTCACTTGGTACCTCCCTCCATCATCAAGTTGCTGAGTGAAATGAACAATATAACGGTCCCCTAATCTCCAGGAGGGACTTTTTAAATAAATGTGTTTTAAAATCATTTAATTATTTGTGTATTTTGTGTATATATGCATGTGTAGTTTGTGTGTTTAGATGCACATGTGGAACTCAGAGGCCGACATCTATGTCTTCTGCCTATCATGATTCCTGCGTTAGGGTTTCTCGTAAAACTGTGGCTCACCATTTTGGCTAGGCTAGCTGGCCAGCACGTGTCTGACGTCACATCCCTCCCAGCACTGGGGTTACAGACATGTGCTAAGTTACTGGATTTTATATGGGTGCCAGGAATCCACACCCAGTGTCTTCATGCTTACACAGCAAGAATGTTGTCACTGAGCCATCTCCTTGGGTCCTCTGGGAGATACTTCTTAAGAATGTCAGTAGATGCCTCAAACTGTAGAGAGTATAGAACCCTGTGGATACCACCTCCCAACAACATATGTATCTGTGATTTATAAATTCAGTACAGTAAGAGATGACCAGAAATAACTGAGATATTGAATGATTTCAACAATATACTATAAGTTAAGTGGATATGGTTTCTCTCAATTTTTAAAAAAAATTTTTTAAAGATTTTTTTAAAATTTATTTTACGTATGTGAGTACATTGTCAATCTCTTCAGGCACACCAGAAGAGGGAATCGGATCCCATCACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGATGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCATGTTTTATTGTCTCATAGTCACCTTATTTCTTCTGTACAAACTGATTGATCATGAATAGCATACTAGAATATAAATATGGGAGCAATTGATGAATTTAGTTCTGTGTTAATAGGATGTGCCATAAACACAAAGCCTCTAGTATTGACATTCATTCAGCGTGTTTTGTCAAAATCGTATCATACGTGCCAGCCAACACTTATAATTACTTTGAAATCACTCAGTGGCAGCATGACATATGACATCATAAACTGCCTTGATGGCTGTTTTTTTCCTTTAGAGTTTTGTACAGTGTATGTTTATCATATTCACTTTCCTCTCCACCTTCTCCCAGATCAGTTCCGTCCTCCCTTCCTACCCAGCTTTTATGCTGTTGCTTCCTCCTCCTTCTCCTTTCCTTCCTCCTCTTTTCTAGTATGGTTTGTGCTGCCCAGACACTCCATCCACTGACCACTGAGTTGTGGACAACCGACTCTCCTCCGCTAAGCAGAGGACCAGACATTCCTGTGCTAGGTGTTAAACTTTGTCTCCTTTCCCCTCTGTGCTGAGATTTTTGTCTAGCTTGAGCTTGCAGAGGTCTTGGTCATGTTTTCACCACTGCTGTGAGTTCATTTGTGCATGTTCCCTAGTATGTCTGGGAAACACATTCATCAGGGTCATTTGTGGTTTCTGACCCTTTCTATTCCCTCTTCCTTGATGATTCCTGAGCCTTGAAAGGAAAGGTGTGATAGAGATGTCTCATTGAGTTGAGTGCTCTGACCAGGTGTGGGCCTTTGTGTTGATTGCCATCTTCTGCAGGCAGCTTCTCTAATGAAGATTTAGAGATGTACTAATCTTTATTAGGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACACTCTGTCTCTTTAGCAGAATAACAGTGGTAGGTCTAGGGTCTAAATCCTATCTAGCTATGGTTTCTTGGCTCTGATACTACTAAGTATGGGTACATGGTTTCTTGGAATGGATTCAATCTTGTGCAGAGAACCTTAACTCCAATCAGAAAGTATTCCCATGATATTTATGCCACCTTTGCATCAGTGGGCATATCTTTCCAGGTTGGTTGTTATTACAGAGTTCATAGCTGGATATGATTGGTGATTCCTTTTCTCTTTTAGTAGTGTGCATAACATTCAAGCTAGCCAATGGGGGTGAAGCTTTCATCTTAATACCAGCTTGATTTCTTACATGTTCTGTGGCTGAATTATGTAGTGACTTCAGCAATAGTGTCTTATTCTCAGGTTCTGGAGGGTAAGCAAGAGCAGTGGCCATAGTCTGTAATGTTTGGAGGTCTGTGCAGTACCACTGGCCAACAAATCCAGAAGAAGTAATTCATTTCTGACACTGAATTTTTTATGTGTTAGCCTGTGGGTTCCAGTAGAGGCATTGTTGCCTGATTATAGGGTAACTCTATTTAACTCCTTTTTTAAATATAAGTATGAATTTCAGGAAGGTAGGTTTCCATATAATATTTTCAAAAGCCTTTAGTGTTGTCTTTCCCATACTCTCTCTTCTGTTCTGCCCTCCTGCCCCACTTCATTTAACCCATCCTATTGGATTATTTATTTTTCTCATTTGTGATTTAATAGTTAGCTTTTAACTTGTCAGCATAGAGTCTCCTGGAAACAGTCTCAGTAAGAAACTGTGTAAATCAGATTTGCCTGTGAGTGTGTGAGTGGGGGCATTGTCTTGATTGTTAATTCCTATAGGAAGGCCCAACCTGTTGAGGGTGCCATTATTTCCTGGTTTTGGACTCTGAAACATATAAGACAGGAGAAAGCAAGCTGAGTATGAGGGAGCAAGCAAGCAAGGAGCCATTCATTTCTGTGCTCTTGATTCCCAGTGTGATGTAAGCAGCGGCTTGAGCTCATGCTAGACGTCCCTCAGTGACAGACTGTGGTGTCTAGGAGTAACCCCAGTAAATCCACTATCCCTGTAAGCTGCTTTTGGTAAGACTGCTTAGTTCATGGTTAGGTGGCGACAGACCCTTTAATCACAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCTATGAGTTCAAAGCTAGCCTGGTCTACAGAGCAAGTGTCAGGATAGCCAAAGCTGCACAGAGAAACCAAACCAAACAATACAAACAAACAAGATTGTTTAGCTCAGGGAGGTGGGTGACTCAGTATGCAAAAACACTTGTTCTCTAAGTCTTGTAACCTGAGTTTGATCCCTGGAGTCCACAGAGGAAGGAGAGAACGAGTTCTTGAAAGTTGTCATCTGACCTTAACTTCTGCATGCTGCTCTTCTAGAGGATCCAAGTTCAGTTTCCAATATCCAAGTCAGACCACCAGTAATTCTAACTTCAAAGTATCTGATGCCCTCTAACACAGGCACTTGCACACCTGTGCTGAATGCAAATGTGTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAGTTATCAGGAATAAAGGTGCACATTTATAACCCCAGCACCTGGGATGATCAAAAAGAGAAGGAGGGCTAGTAAGATAGCTCATGTGGTCAAGGTGCTTGGGGCTAAGCATGGTGTCCTGAGGACAATCCTGGGCTCATATGGGAGAAGGAAGGAACCAACTCTCACAAATTGCTCTCTGATGGCTGCGTGTGTGCCATGGAGCATGGGCGGGCACACGCACACACACATGTACAGTAATAACGAAGCCTTTAAAAGGGTGATGAGATGCTCAGTGGGTAGAGCGAGGGCTGTGCAAGCTTGGTCAGAATTTAGTCTCTGGAACCCAGAGTTGAAAGAGAGAACCAGCTAGCTGTCCAAAGTTGTTTGCTTACTTTCTCCTGTGTACCATGGCATGTGTATCTGTGCACACTCGCACACACGCACACACACACACAGTATAATAATTGATAATAATGAAATATAGAAATATAAAGGCTAGAGAGAAGACTCAACAGCTGAAGGTACTTGCTTCCAACTTAACAGCTGATGTTCAATCCCTGGAACTCACAGTGAAAGGACAGCCTGTTTCTGGAAGTTGCCCTCAACCTCGAGTGTGGTTTATTGTATACCTCACCACACATCACCATCATCATCACTTTTAGATCAAACCCACTAAATTCATGTTGTTAGGGTGCAAGGGCGATGGCTTAGCAGTTAGGAACATTTGTTGCTCTTGCAGAGGAACTATGCTTGGTTCCCAGGACCTACACAGTGGTTAATAATTATGTAACTCCAGTTCTGGGGCCATTCAGTACCTGGATTTTCTAACTTCCTTGGACACTAGGCATGTACATGGTGCATATATGTGAGTACACACACACACACACACATATCCCACTACAAAATACATCTGAAAAAAGCTTATTAAAAAGAACTCACACTCGATGCTGGTGTGTACAGTCAGGTGGTGGCTGGTGGGTGAGTGCACAAAACGGGGGTTCTCACCCTTCCATTCTCACCATTCCATGTAACATAGTTCCTGCCAATTGAAACTTATATTGTGTTATGAACAATTACTTAGTTAAATCAAGTTAATACTCAATTGTAGAATTTCACAAGGTTCTGTAGTTGTCATGGTGGGGATAAAGGCATTCCAAAGGGAAGAGGGGCCGTCAGACTACTGAAAGCACGGAATCATCTCAGTTTGTTTCTACAAGAATCTTGTGTTGGGGGAGGGAAAGACTGGGAGCCTCTGTCTTTCTGTCTTTGTCTCCCCTCCCTCCCTCCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCCCCTTCTCCCCCTCCCTCCCCCCTTCCCCTGTGGTCTCCTGGAAAGAGTTCAGATCATGTTGCAGGAGGCTGGAGCCTGGACAGTCATGATGCAGGAACCACATACTAACCAGGACTGCCTAGCTATGCATGATTCTTGCCCTCTATTTAAATCTGAAGCTCATGTTAGGACCTCAGAGATAGGCTTAGAGGTGCAGGTCTCTGGACCTTTTGGGGGTTTAATTTCTTTTGAAATGGGGTCTCACCACTGTGTAGCTTAGGCTGGCCTGAAGTTATAGACCAGACTGGCCTATAATTCACAGAGATCCACCTGCCCCTGCCTCTTGGGTGCTGGAATTAAATGTGTACCACGATGTGCAGCTTATAAGCATTTTATAAGAATGACATGTTAGGATACAGAAGTTGCTAAGACAAAAGATTTTGTTTATCAAGAAATACTAATGTTCAAAATGTGTGCCCAGCCCATAATACAAACTGTATATAACAAATATTTCAAGTCAAGTCCATAATTCCAGAAGATGATACTAATTTATTTCTTCCAGGTGTTTTCTTAAGTAGGGGATAAATTAGATTAAATATCTTGGAGACAGGATACTCAAGGCATGAGAGTAAAAGTATTTCTAGATCAGAGTTAATACAAAGTTTTAATGAAGAATGGATGTTATGGGGACGTAGAGATAGCTCAACTTGATGACAGCCTGAAGGTGGTCCTATAACACACATAATGATGGTAGGTGAGAACTACTCCAGAAATTGGCTTCTGACCTACACACACACACACACACACACAAAACACAAGTACACATATACACACGAACACACAAATACACACACAAGCACACATATACACCCATACCCCCCACATACACACACATAAACACAAACACACACAATACACAAACACACACAAATACACATATACACACAAACACACACACCAACACACATACACAACTAATAATATAATACACTAATGACAGAAACACAGCAAAACACCTCTCAGGGAATTGCTGCTGCCAAGAGAGATTGGAGACCTTCTGTAGCAGCTAAGAGAAGTTTTCTGACTTGTCTCCTGGGTCATTTGTATGGGGTCATTGAGATAAGAGTTGATAATTCAGTATCCTGTTAGGTAGCAAGCTTTATAATGCTATTTCCTCCCAAAGATTGGTGTAATCAGGATATATTATATAAGAAAAGAATCTTCTTTTAAAAGATTACTTATTTTATGAATATGAGTACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACATTGGGTCCCATCACAGGTGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGAATTCAACTCAAGAACTCTGGAAGATCAGCCAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTGCGGCCCTGAAAAGAATCTATTTTTAATAAAAGGGGAAAGAGGTTGGTCATTAGGGATGAGATGCCAGGGCTCACTAGCTGTCAAGCTCTCATTGGCTAAGGAGACATCACAAGTCACTGGAGCAACAGAGTGTGAGATTCTGCTTTTTTGGCTTTTTAAGCCCCCACAATCAACATTTGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAGCAACTTGTCCCATATCCATATGTAGATTATTAAATCTGGTAGACAAAATAAGTGCTTGTCTGGGAGGCAGGCGTGTGGTACATGCCTGCAATCCAAGCACTTAGCACACTGAAGCAAGAAGAGAGAAAGGGCTGTGGGCTTTCTGAGGAGATACGTTTTTAGTCTTGTTTAGGCATGTGTTGGAATCCATGCTGTTGTCAAAACTGCAGTGCATAGTTAAGATGTGTGTATTTGAGCTGAGGAGTTGGCTCAGTGGGTATGAATATGCACTATTCAAGCATGAGAAACTTGGTTCAAATCCCCAGTACCCATGGCATAGTCATTTGTGTACCTGTAAGCCCAGTAGTATACCAGGCAGATAAAGGCGGATTGCCAAGGCTTGCTGGCCGCCGGCCTGGCTGCATGTTTAGTGAGACTCAGTCTCAGTGGAATATGGTGGTGAGACACAGAGCAGGGCATCCAGTGTCCGTTAGCCTTCATGCACATGGCATATGCTTCCCCTCTTCCCATGGGAAAAAAGTATGTGTTTCAGTTTTAATTATATCTTTGAGTCAGTGTTTTAGTCGGATCTGTGGAATAAGGTGTGTGTAAGGTTTCTGAGTGAATTTGTTGTATAGCTAATGAACTGTAACTTAGGCCACAATTCGGGGTCAATGAATAAGTAATTGTCATTAAATTTTAACAAAGATATTTTTTATGCCTTTGGTTGTAAGCCTAGGATTTAATAGCTGAGCCATCTCTCTGGTCTCCATAATTATTTATTAATATAATGCTTAATGATGAAAGAATCAAAAGGAGGGCTGGGGGCATAACTCAGTTGGTAGAGTGCTTACCTAGCACGCACAAAACCCGGGGTTTGTTCAGCATTACCACACATACTGGGCATGGTGGCACACATTTATGTTAATTCCAGTCCTTGAGATATGGAGGCCAGAGGATTAGATGTTCAAGGCCAACCTTGGCTACATAGTGAGTTTGAGGGCCATGTAGGACATGATACCGTGCTTGTTTTGTTTTGTTTTAAGGCCTTTATTTACAGTAGTCTGAAGTCAGAGGCGGATCCCTGGTCTACAGAGCAAGTTCCAGGTTAGCCAGGGGAACACAAAAACCCTGCCTTGGGGGTAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAACTGCGAAAAGTATGGTGTGAGGAGAAGGGTGCACATGTCACCTCATGAGTGGAACTCAGAAGACAGTTTATAGAGGTGGTTCTTGCCTTCCACCTTTACATGGGCCCTGGAGGCCAAACCCAGGTTTTCAGGCTTACATTATCTGGTGGCAGGTACCTTTATTTGTTTAGCCATCTCGCTAGCTCCCTGTTTGAGAGAAGGTTCTGTTTTGTATGCCAGGGTAGCTTTGAACTCACAGCAATTCCCCTAACTCAGTCTCCCATGACTGGCATTATAAATGTGCAGCACCATACTTTGCTTTGACTGTAGATCTTTTTAGGGCAGTGATATCTACTGTGAAGGGTGGTTATAATGATTAATTGAACACACACACACACACACACACACACACACACCCCTCCTTGCTTATTGTCTGCTACATAGCATTTCTCAGTGAACCCCAGTATCACTAGGAATCGTGTTTCAGGGAGTGCTGTGCTTAGTGGTCTACTTGTGTATTTCCTGCATATAGTTTATGTATGGCAATTGACAGATAATGACTCTCTAGTTTTTGTTAATTAGTGGTTGATATTACAGGAATGCTAACAGTTGTGTACAACAG
Seq C2 exon
GTGACAGAGTGCCACTGTCCACTGAAATTCATCAGCTGCACTAAAGCAAAGCTTGCCTCAGTGAAAGGAGTATTCATGCAGACTTCTGTGTTACAGGATGGCAGCTCCTGCTTCGTCCCATG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000059475:ENSMUST00000115562:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.972
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Skipping Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types