RnoINT0047776 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000015288 | Dip2c
Description
disco-interacting protein 2 homolog C [Source:RGD Symbol;Acc:1560155]
Coordinates
chr17:63716672-63740125:+
Coord C1 exon
chr17:63716672-63716786
Coord A exon
chr17:63716787-63739985
Coord C2 exon
chr17:63739986-63740125
Length
23199 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTACTG
5' ss Score
7.67
3' ss Seq
AGCTAAAACTACCCTTTTAGGCC
3' ss Score
4.7
Exon sequences
Seq C1 exon
GGTCTATTTCTTCTTGTGATGCGTTTCTCAATGTCTTCCAGAGTAAAGGCCTTCGACAGGAGGTCATCTGTCCCTGTGCCAGCTCACCAGAGGCCCTCACTGTGGCAATCCGGAG
Seq A exon
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Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
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Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
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Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]