RnoINT0078075 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000013312 | Kcnt2
Description
potassium sodium-activated channel subfamily T member 2 [Source:RGD Symbol;Acc:735074]
Coordinates
chr13:57380035-57403624:+
Coord C1 exon
chr13:57380035-57380143
Coord A exon
chr13:57380144-57403453
Coord C2 exon
chr13:57403454-57403624
Length
23310 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCAGTAAGT
5' ss Score
9.07
3' ss Seq
GTGTTTTCCTTTGCCTGTATGTG
3' ss Score
3.05
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Human
(hg38)
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Mouse
(mm10)
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Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]