Special

BtaINT0050147 @ bosTau6

Intron Retention

Gene
Description
dynein, axonemal, heavy chain 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2940]
Coordinates
chr22:49091689-49110195:-
Coord C1 exon
chr22:49109943-49110195
Coord A exon
chr22:49091847-49109942
Coord C2 exon
chr22:49091689-49091846
Length
18096 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CGCGTGAGT
5' ss Score
8.4
3' ss Seq
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3' ss Score
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact

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NO
A:
NA
C2:
NO


Main Inclusion Isoform:
NA


Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
NA


Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
ALTERNATIVE
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]