BtaINT0096162 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000035705 | MTMR8
Description
myotubularin related protein 8 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16825]
Coordinates
chrX:101239545-101268952:+
Coord C1 exon
chrX:101239545-101239679
Coord A exon
chrX:101239680-101268819
Coord C2 exon
chrX:101268820-101268952
Length
29140 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATCT
5' ss Score
7.56
3' ss Seq
TTATGTTCTCAATATTACAGTTA
3' ss Score
7.18
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF066029=Myotub-related=FE(12.7=100)
A:
NA
C2:
PF066029=Myotub-related=FE(12.7=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]