BtaINT0109211 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000012945 | PDE6A
Description
phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:8785]
Coordinates
chr7:63195344-63213658:-
Coord C1 exon
chr7:63213551-63213658
Coord A exon
chr7:63195408-63213550
Coord C2 exon
chr7:63195344-63195407
Length
18143 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CATGTGAGT
5' ss Score
7.83
3' ss Seq
GTTGGTGTCCTTGTGTGCAGGGC
3' ss Score
7.05
Exon sequences
Seq C1 exon
GAAAAGGACGATGTTCCAAAAGATCGTGGATCAGTCTAAGACATACGAGACTCAGCAGGAGTGGACGCAGTACATGATGCTGGATCAGACACGGAAGGAAATTGTCAT
Seq A exon
GTGAGTTGAGACAAGGCTTAAACCCTGATTCCCTTAAGCCCAGGGTCAAAAGGCAAGATGCTATCCTGTCAGGCCTCTCCGTCTTCAAGAGACCCCTGCAAAACTTTTCATTCTGGAGGCCTCTGACACACAAAACAAAGAAGTTATGCCAAAACAGCACTACAAAAATGATATGTTTACTCTTCATTCTAGCACAAAAATACAAGACAGTATCTGTGGCTCAGTAAGTAAAGAATCTGTCTCCAATACAGGAGACCACCTGTAATGCAGGAGACATGGGCTCAATCCCTGGGTGGGGAAGATACCTTGGAGAAGAAAATGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGACAGGGGAGCCAGGTGGGCTACAGTCCATGGGGTTGCAAAGGGTCAGACACAAGTGAGTGACTAAGAATGTACGCATGCATGCATACCTCTCTGTATACAAAAAGTACAAGATTTGAAGTAATTCTATGCTAAAATGCAGAATTTTGGTGGTAAAGTGATATAACTTTTGGTGATAAAGTTTTTGGTAAAACACAGAGCATTAAACCAATTATGGTTTGAGTGATAGCTAAGTGTTACTCAGAATATATGGGCTTAATCTCTTTAGTATTCCCTTATACATGGCAAAAGCAGGCATGCAATTCACAAGTTAGTTCCCTGGTTTGTGTGACATTCATAGTGCTTTGTTGGCACGAGGTCTGGTAATGCAACGCAAAGCTTTCTGGTGAATATCTTCTTTTAGTTTCTCAGTATGCTTCCTTGATTCACCTCAGCTGATGATGGGGTTAGAAATGCAAATTTGAGTCTTTTCATGACTACGTCGCGCAAGCTAATGGGTCCCCTGGCTTCCCTATGACAGGTCCTGGGTGATATTAAAGGAGACAATGCCTGACCCAGGACCCAGAGAACTGTTGTTTGTTTATCCCTAGATGCTTCTGCAGAGGTGAGGTTTAATCAAGTCACGAATTTCGCAAATCCAGAGAAGAGACAGCTGCTGGGACAGGCTCAGGGAAGATGGGGCCAGTTGTCTTTCCCTCAGCTGTGAAGTTGTCCAACCAAGCCTCCCCAAAGGTCCTCCCACCCTGAGGAGCAGTGTGACCTGTGCCCACTGAACAATGAGTCATGCTCTAGTGATAGCTGCTCCCAGACAGACCAGGAGTTGCTCCACAATGTTTCAAAAATGGTGCTGCAGAAGGGCTGAATGAGTGGAAAGAACCCTAAGTTCTTGGACAGGGGGACTTATTATTACAAAGTTGTCTGTTCTCCCTATTTAGTTATTTATTTAAAGTGATTCCAAAGAAAATATCAACTTTATTTTGTGGAGAATTAGGAAGCCAATTCCAAAATCCTTATGAGAATTAAGTATGAAAAAGAGCCAGAAAATTCTGAGGAAAAAAGGAAATAATAGGGGCCAGCAGAACTGAAGATAGCTCAGTCCTAGGTATGAGCAGGAGAGGTCAGTAGACAGACTCAAAAGACAATGCCTGTGCTAAAAGTAGATTTTCTGCCAGTGGAGAAGGATAATTTCATAAATGGTGTTGGGCCCATGAGGTGATCTGATGGATGTTTTTTTTCCCCTCAAGACCAGCAAGCAGTTCTCCAGTGCTCAGTGAACACTGACAGGCTGTCCTACAAATTTAACTCAAATCTCACACTATCTACCTGGAGATAGCGGCAGGCCCCACAGACTAAGGGCTCAGCCTCACAAGACTGGCTTCCTTTCAGATGAAGCCAGTCCGGGCTGCCTGTGCTTCTGATTGCCCAGCTATAAACTGGAAGTTGCTGTGAACTCCTCCTTGGGTTTGATTAATTTGTTAGCATGGCCCACAGAACTCAGAGAAGCATTTACTTACATTATTAGTTTAGTATAAGGATTATTACAAAAGAACAGCCAAAGAGGTACATAAGGTAAAGGCCGGAAGGGTCCTGAATGCAGGGGCTTCCATTACTACAGAACTGGGGTGTGCTCATCCACGCTGATGCTTATTAAATCTTTGTTCAATAGTTTTTACAAAGCTTAATCTGCAGCTCCCCCCACCCCTTTCCCAGAGGCCAGCAGTTGGGCTGAAAGTCCGTCCCTCTATTCCATTGGTCTTTCAGGTAGGCTTGACCCCATCTAGGGACCCTACCCTCAGTCACTCTAAGTCACTTCATTAGCATAGCCCCAAAGGGGGCTTCTTGGGAAGGACAAGACTCTTGTATCACTAGGGAAATCTCAAGGGTTTTAGGAGCTCTGTGTGAGGAATCAGGGACAAAGAAGAAATATAGTTCAGATTCTGCCATAGGTGGTCACAGAGGCAGACCCCTATTTCACTCCTATAGCAAATAAATTCAAGATGAATCAAGGATTTTAAAATAATGAGAAAATAAACTAATAATATGGAGAGAGGAAAAAAGCTTGGGAGAATTGAAAAGAGTAAGCTTTTCTAAGTGTGACATAAAATTCAAAAGTCGTAAAGAGACTGATAAATTTGACTAATGAAACTTTAGAGATTTCTGGACAACACCCACAAGAACTCAGAGCTAAAGTAAGAATTTAAATGGTACACCGGGGGGAAATATGTGTAATGCTTCTGACAGAAGAAGAGCTAGTTTCCTCAGTCGTGTTAATATAATTCAAGAAAAAGACTAATCCCACAGAAAAATGAGCAAAAGGCGTGAGCAAACATTTCCCAGAAAAGGAATTACAGTGGGATGTAAACATATGAAAAGATGACCTTAGCCACAGTGAGACAAATGAAAAATAAAACTACTTTGGGATATAACTGTTCATCCCTCCTATCGGCAAAGATGAAGTGCTTGCTAACACGTGGTGTTGGGCAGAGTGAGGGGCAACAGGCAACCCTATTCACTGTGCTGGGAATGTAAATAGGCGCAGTTTTGTTTCTTTGGTTTTCAATGTTGGCTTATACTTTTTTACCCTGACCACCCAGGGCCATGGCAGTGAAAGCGCCAAGTCCTAACCCCCGGATGGCCAGGTAACTCTCCAAGAGGTGCAGTTTTACGAAGGGCAATGCCTATCAAAATTGAAACCAGCCATACTCTTTGGCCCAGGAAATCCCAGATCCAGGATTTACCCTACAGAATTTCTCCCACCTGTGCTACAAGAAGTATGCATAGAGTTATTCATTGCAACATTACTTGTAACCACAAAAAATATTGAAAAAAACTTAAAAGACCATCATGGGGGACCAGGTTAAATACAATATATTATTTACACACAGTGCGGTGTCATGCAGTTTACAAAGATATGACATGAAAGGTTTCCAAAAAAATAAATAAATAAAGCCAGAAGCAAGACTTCTTGAATCATGGTAAAAGCCAACGTAGTCTTAAGCGGAGGCTCTTGCAAAGCCTTCCAAGACAAATACAGGCTTAGATGGTCTCAAGGGAATCCGTATTTTCTCTCTTTACATTATCTTCTGGAGAAAGTGCAGTAAGTGAGGCATGGTCAGTTCCTCATTCTTATCCCATGTGACAAAATAAAGACAAATTTGCCCTTTCTTGAAGTCTATAGTGTGAAGACCCCTGGGGCATCAAACAGAAGGACAATAAATATTGGTGTTTTCAAAGCTCCTTTTAATCATGGCGTTATAAACCCAAGGGAGGGCTTTGGACCTTCCCTGTCTTATATATTTATTTTGTTAGGGCGTTAGAAGTGGAAAGCTTTGTCCTTTGATTGTACAGTGGGGCAGCAGAAGCTGAGCATCTCTTATTTAGCACTCTACTTCCTTCAGAGAATGAACCTCATTCTCTGCTGTTAGGGATGTGGGATGGCCCCCTGCTATCAGGGCCATCAAAAAGGTAGCAGTACTTGATTTCATCCATGCTTCTGTCTGTCTATCCATCAATCTATCTAGTCTACCTACATACCTATCCATCTATTAGTAGCTCTGCCTTTCTTAGAATTAAGAATAAAAAATAAGGTGGGTGTCAGCAGAATGCATTCTAATAACATGCTTATATGAAATGAAAAATAAGGGTCAGATTCTTTCTGAAACAAGTCTTATTTTCAGGCTTCAGTTGACAATAAAAGACTGGCATTTCCAATTGTTACATGGCAGATATTTCCAGAAATAAATGAATCAAACTTGAAGGTTCAAAGTTTTGATGAAAATGTTGCTAAATGTTGTGATAAGATAAAAGCACTTTATAAAAAATACAGCACTGGGAGGGGGAGGGATAAATTGGGAGTTTGGGATGACATATATACACTACCATATTAAAAATAGATAACCAGCAAGGACATACTGTGCAGCACAGGGAACTCTGCTCACTCTTCTGTAATAACCTAAATGGGAAAAGAATTTGGAAAAAGAATAGACACATGCATAACTGAATCACTTGCTGTACACTTGAAGCTAATGCAACATTGTTAATCAAATTGCTCCAATATAAAAAAAAAAGTCAAAAAATATAAAACTGGAAGATATATTAAAGTGAATAGTGTTTTAATTGACTTAACATATTCTGAGTGTCTTGGGTTAACCAAAGTGCCACAGAGAAAGTGTCTGGGGTACAATTAATAGTCATATGAGGAATCTTAGTCAAATCTTTATGGCACAATTCCCGGAAACTGAGGAAGTGAATGACTCTAATGTTTGCTTTAGACAAACTTAAAGGAGAATCTGATTAAACTGTCAACTGATAATGTGGAAGAATTTAAAGAATGGAATGATGTTGTAACAAAACTTTTTCCATTCCCAGGGTTTCTAAATGTTGCATCTAATTAGTCTTGCAGTATGAAATATTCACTAATTCATTTTTGGCCATGTCACATGGCTTAGGTCCTCAACTAGGGATTGAACTCTCCCCTTGGCAGTGAAAGCTCAGAGTTCTAACCACTAGACTGCAGGGAATTCCCCATGCATTAACTGATTAAAAAAAAAAAAAGTCCCATCCTCTCTATCAATAGATGAACTTCCAAAAATATTTGAGTTTTTAATAATTTCTAAAAAACAGGTAATATAGTTTATTGTATTGGTTAATCATGTAATAATAGTAATTCAATCCAGAACAAAAATTTTCTATACTTGGAGATCTATGGTCAAAGACGACAATATTTAGTTACATATTTTAATTAATGGACATATTTGGTTAAAAATCAGTATGCAAAAGTGATCAACACATTTCATATATATATTTGAATATCTGTGATATATATACAGTTATACACATATATAGATATACATACACACATACACACAAATATAAAACCTTAGGATAAACTCTGTAGGGGAAGTTAACTGGAAATACATGTTTATGGAGAAAAAAAGAATGCAAAGTTCCAGACTTTTGTTTTTAATTGAAGCATAGTTGATGTACAATATTATGTAACTTTTAGGTGTATAATATGGTGATTCACAATTTTTAAAGGTTATACTCCATTTATAGTTATTATAAAATATTGGCTATATTCTGTGCTGTACAATACATCCATGTAGCATATTTTATACATAGCAGTTTGTGTCTCTTAATTTCTTATATTGTTATTCCCCACTTCCCTCTCCCTACTGGTAACCAGTGTATCTCCAGTTTGTCCTTCATATCTGTGAGTCTGCTGCTGCTGCTTTTAACATGTTCACTAGTTTGTTGCATTTCTTAGAGTCCATGTTTAAAAGACATCATATAGTATTTGCCTTTCTCTGACTGATTTCACTTAGCATAATACCATCCAAGTCAATCTATGTTGCTGCAAAAATAAAATTTCATTCTTTTTTATGACTGGATATTACTCCGTTGGATGGATGGATGTGTGTATGTGTATATATGTATGTACACACACATATACACATACATACCACATCTTTATCCCTTCATCTGTTGACAGACACTGAGGTTGCTTCAATATCTTGACAACTGTAAATAGTGCTGCCAAGAACATTGGGATGCATGTGTCTTTTTGAATTAGTGTTTTTTCCCCAGATATATAACCAGGAGTGGAGTTTCTGGGTCATATGGTTCTGTTTTTAGTTTTATGAGAAATTGTCATACTGTTTTCCACAATGGCTGAACCAATTTACATTCCCACCAACAGTGTATGAGTTCCCTTCTCCCCACATTCTCATCAGCACTTTTTTCATGATGAAGGTCTTCCTGACGAGTGTGAGGTGATCTCTCATTGCGATTTTGATTTGCATCTCCCTGATGATTAGCAGTGTTAAGCATCTTTCCATGTTCCTGTTGGTAATCTGCGTTTCCTCTTTGGAAAAATGTCTATTCAGTTCTTCTGCTCATTTTTTAATCAAATTGTTTGCTTTTTTGCTTTTAGGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGATATTGTAGGAATAGTTTATATTTTTGGATACTAAACTTCTTATTGGACATGTCAATTGCAAATATTTTTTCTCATTCTATGGGTTGAATCTTTGGTTTGTCAATGGTTTCCTTTGCTGTGAAAAAGCTTTTCAGTTTAATTAGGTCCCATTTGTTTACTTTTGCTTTTCCTTCCTTTGCTTCAGAAGACAGATTCAAAAAAATATTGGAACAATTTATGTCAAAGAGTGTTCTGCCTACCTTTTCCTCCAGGAGATTTATGGTTTCTGGTCTTAGGTTTGTGTGTGCATGCTAAGTCGCTTCAGTAGTGTCTGACTCTTTGTGACCCTGTGGATTGTAGCCCATCAGGCTCCCCTGCCCGTGGGATTCTCTAGGCAAAGCCTTCTATCTCCTGCATTGGCAGGCAGGTTCTTTACCACTAGCACCACCTGGGAAGCCTTTAAAACTCTAGAATCTTAAAGAAATGCTGGTTCATTTGTTTTTAAATGGATGGTACACTGATGGTTGATATAAAAATGCTATGCTATTTAGATTTCTTTATATTTAAAGAATAATGAAACCATTTTATTTATTTTTATGATCATAATTATTTTTATTAAGCCAAAAACATAACAGAGCTTTACAGGGAGAACCCAACTACATTTAATTAAACATAAAAATATAGATTAAACAACAACAAAAGAAGCAGCCTATCACTGAAGACACATTAATACAAGAAAGTTACAAGGAACCCATTTAAGATTTTTGGAAGGTAACATTCTCAACAATATAAGTAATCTGGGTACCATGATGTAGAAGGAGGTAGTAATACTATTTGCAGAGTCCTTTCAATCTTTCAAGACTGGGTAAGTAAGTCAAGATGTCAGCTTAAAAATGTACAAGAAGGTAAACACTTTTCAGAATTCTTCTGGTAGGCACTCAGTGAAAAATGTTCAAAGATCTATAAAGTAGGGTTCTCAATCTTAACACTATTGACATTTGGGAGCAATAAATATAATAGGGGCTCTCCTGTGCATTTAAAGATATTTAACATAATCCCTGGTTTCTACTCAGTAGATCCCAGTAGCAGCCCCTCCTCCTCAGCTGTGACAAGCAGAACTATCTCCAGACATGGCCAAATATCCCCTGGGAGCAAAAGTGGCACCTGGTTGAAAAGCACTGTTGTGAAGCGGTCTTGGGGCTGGTCCATCTATTAGGTGATTAGACACATAATTAGAGCTACTACACACCTGGGTATAGTGTACCTGTTACACACTTAGGGCTTCAGCTCCAGAGGGTCTGGTCTCATCTCTCTCACTAATTGGTGATTGACCTTGAGCAGGTAACTTCACTTCTCTGTGCCTGTTTCCTCATCTGCTCAAAGAGAGTAATGGTAGTATCTACCTTATGGGTTATCACAGGGGCTGAGCCAGGACACGTGGAGTGCTGTGCTGCATTGCTCATGGCAGGCATGGTGTCAGGCTTTTCCTGTGATATAAAGAGACCTATGTATTTTGGCCTTTGTCCCCATTTCCCAACACAGATTCTAAAACCCTTGATAGTGATGAGTCATAGACTTGATAGGAGTGTCTTTGGTTCTAAGGGTTTCCCTGGTAGCTCAGCTGGTAAAGAATCCACCTGCAATGCAGGACACCCCAGTTCAATTCCTGGGTCGGGAAGATCCACTGGAGAAGGGATAGACTACCCACTCCAGTATTCTTGGGCTTCCCTGGTGGCTTAGCTGGTAAAGAATCTGCCTGCAATGCGGGAGACCTGGGTTCAATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGAAAGGCTACCCACTCCAGTATTCTGGCCTGGAGAATTCCATGGACTATACAGTCCACAGGGTCACAAAGAGTCGGACACGACTGGGCCACTTTCACTTTCTTTTGGCTCTAATGAGGCAACTCTTGGTGGAACCCTAGAGGGCTTCAGGATAGGTGCTGATCACTAGAAAGACAAAGATTTCATTAGAAGCTTGAAACTTTCAGCCCCAGCCCAACCTCTGGGGAGGGGAAGAGGACTGAAGACTGAGTCAGTCAGTGGCCAATGATTTAATAAACCATGTTTATGGGGCAAAATCTCCATAAAAACCTATGAAAAACAGTTTGAAGAGCCACTAAGTCAGTGAACACATCGACAGGCTGGGAGGGTGACATGTCTGAAAAGAGCGTGGAAGCTCTGTAGGCACTCCAAACCCCATACCTTGTCCTGTGCGTCTCTTCCATTTGGCTATTCCTAAGTTATATCCTATGGACTTCCCTGGTGGCTCAGACGGTAAAGCGTCTGTCTACAATGCAGGAGACCTGGGTTCGATCCCTGGATTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGAAATGGCAATCCACTCCAGTACTATTGCCTGGAAAATCTCATGGACAAAGGAGCCTGGTAGACTACAGTCCATGGGATCGCAAAGAGTCAGACATGACTGAGCAACTTCAGTTTCACTTTTCACTTTCAAGTTATATCCTATATGGTAAACTGGCAAAGAGAAGAGTTTTCCGAAGTTTTATGAGTTGTCCTAACAAGTTTTTAAACCTGGGGTTCATGAGAACCCCTTGCCTCTGTAGTCAAGTCAGAGGTGTGGTAGCCTGGGGCTCTGATACTTGCAACTGACTTCCAAGGTGAGGGCAGTCTTATTGGATTGAGCCCGCCAACCTGCAAAATCTGACGCTAGTCAAATGTTAAAAGTGAATTGTATTGAATCGAATTGAATCAGAGGACACCCAGTTGGTGACAGAATTGCTTGTTTTGAGGAAAAAACCCAGCACTTGCCTCCTCCGCTCTGATTATCTGGGAGGGCTCCGGTTGGTAACCTTCATCTTATTTGAGGTCCACACCTCAACCCTTGAGGTATCTTTTTTTTTTTCCTCCTCATCCTGAGGTATGTGGGCTCTTAGTTCCCTGACCAGGGATCAAACTCATGCCCCCTTCAGTGGAAGTCCCTGCAGAATCCTAAGCACTGGACCACTAGGGAAGTCCCAACCACATTTGAGTCTCCTGCTTTGCTGTCTCTTGGGTCACCCTAATGCAGTGTGCTTACTGTAGGACCAGGATGTGACAGTACCTTCAGAATCAGGGCATGACATCAGTGATGCCATCCAACCATCTCATCCTCTTTCGTCCCCTTCTCCTCCTGCCCTCAATCTTTCCCAGCATCAGGGTCTTTTCCAATGAGTCAGCTCTCTGCATCAGGTGGTCAAAGTATTGGAGTTTCAGCTTCAACATCAGTCCCTCCAATGAACACCCAGGACTGATCTCCTTTAGGATGGACTGGTTGGATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCCCAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTTGGCACTCAGTTTTCTTTATAGTCCAACACTCACATCCATACATGACCAATGGAAAAACAATAGCCTTAAATAGACGGACTTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTATAATATGCTGTCTAGGATGGTCATAACTTTTCTTCCAAAGAGAAAGCATCCTTTAATTTCATGGCTGCAGTCACCATCGGCACTGATTTTGCAGCCCTCAAAAATAAACTCTGTTACTGTTTCCCCATCTATTTCCCATGAAGTGATGGGACCAGATGCCATGATCTAGTTTACTGAATGTTGAGCTTTAAGCCAACTTTTTCACTCTCCTCTCTCACTTTCATTAAAAGGCTCTTAAGTTCTTCACTTTCTGCCATAAGTGTGGTGTCACCTGCATATTGGAGGTTATAGATATTTCTCCCAGCAATCTTGATTCCAGCGTGTGCTTCATCCAGCCCAGAATTTCTCATGATATACTCTTTAAATAAGCAGGGTGACAATATACAGCCTTGACGTACTCCTTTCCTGATTTGGAAACAGTCTGTTGTTCCATGTCCAGTTCTAACTATTGCTTCCTGACCTGCATACAGATTTCTCAAGAGGAAGGTCAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTGAAGAATTTTCCACAATTTGTGGTGATCCACATAGTCAAAGGTTTTGGCATAGTCAATAAGCAGAAATAGATGTTTTTCTGGAACTCTCTTGCTTTTTTGATGATCCAGCAGATGTAGTGATGCTTCCTAAGGCCCACTTGACTTCACTTTTCAGGATGTCTGGCTCTAGGTGAGTGATCATACCATTGTGATTATCTGGGTCATGAAGATCTTTTTTGTACAGTTCTTCTGTGTATTCTTGCCACCTCTTCTTAATATCTTCTGCTTCTGTTAGGTCCATACCATTTCTGTCCTTTATTGAGCCCATCTTTGCATGAAATGTTCCCTTGGTATCTTTAATTTTCTTGAAGAGATCTCTAGTCTTTCCCATTCTATTGTTTTCCTCTATTTCTTTGCATTGATCATGAAGGAAGGCTTTCTTATCTCTCCTTGCTATTCTTTGGAACTCTGCATTCAAATGGGTATATCTTTCCTTTTCTCCTTTGCTTTTCACTTCTCTTCTTTTCACAGCTATTTGTAAAGCCCCCTCAGACAGCCATTTTGCCTTTTTGCATTTCTTTTTCTTGGGAATGGTCTTGATCCCTGTCTTCTGGACAATGTCACAAACCTCCATCCATAGTTCATCAGGCACTCTATCAGATCTAATCCCTTGAATCTATTTCTCACTTTCACTGTATAATCATAAGGGATTTGATTTAGGTCATACCTGAATGGTCTAGTGGTTTCCCCTACTTTCTTCAATTTAAGTCTGAATTTGGCAATAAGGAGTTCATGATCTGAGCCACAGTCAGCTCCCGGTCTTGTTTTTGCTGACTGTATAGAGCTTCTCCATCTTTGGCTGCAAAGAATATAATCAATCTGATTTCAGTATTGACCATATGGTGATTTACATGTGTAGAGTCTTCTCTTATATTGTTGGAAGAGGATGTTTGCTATGACCAGTGTGTTCTCTTGGCAAAACTCTGTTAGCCTTTACCTTGCTTCATTCTGTACTCCAAGGTCAAATTTGCCTGTTACTCCAGGTATTTCTTGACTTCCTACTTTTGCATTCAAGTCCCCTATAATGAAAAGGACATCTTTTTGGGGTGTTAGTTCTAGAAGGTCTTGTATGTCTTCATAGAACCATTCAACTTCAGCTTCTTCATCATTACTGGTCGGGGCATAGACTTAGATTGCCGTGATATTGAATGGTTTGCCTTGGAAATGGACAGAGATCATTCTGTCGTTTTTGAGATGGCATCCAAGTACTGCATTTTGGACTCTTCTGTTGACTATGATGGCTACTCCATTTCTTCTAAGGGATTCTTGCCCACAGCAGTAGATATAACGGTCATCTGAGTTAAATTCACCCATTCCAGTCCATTTTAGTTCACTCATTCCTAAAATGTCAATGTTCACTCTTGCCATCTTCTGTTTGACCACTTCCAATTTGCCTTGATTCATGGACCTAACATTCCAGGTTCCTATGCAATATTGCTCTTTACACCATTGGACTGTACTTCCATCACCAGTCACATCCACAACTGGGTGTTGTTTTTGCTTTGGCCCTGTCTCTTCTTTCTTTTTGGAGTTATTTCTCCAATGATCTCCAGTAGCATATTGAGCACCCACTGACCTGGGGAGTTCATCTTTCAGTGTCCTATCTTTTTGCCTTTTCATACTGTTCATGGGGTTCTCAAGGCAAGAATACTGAAGTGGTTTGCCATTGCCTTCTCCAGTGGACCACGTTTTGTCAGAACTCTCCACCATGACCCGTCCATCTTGGGTGGCCTTACGCAGCATGGCTCATAGTTTCATTGAGTTAAACAAGGCTGTGGTCCATGTGATCAGATTGGTTAGTTTTCTGTGATTGTGGTTTTCATGCTGTCTGCCCTCTGATAGAGAAGGATAAGAGGCTTATGGAAGCTTCCTGATGGTAGAGACTAATTGAGGGAGAAACTGGGTCTTGTTCTGATGGGCGTGGCCATGCTCAGTAAATCTTGAATCCAATTTTCTGTTGATGGATGGAGTTGTGTTCCCTCCCTGCTATTGACCTGGGTCCAAACTATGGTGGACTTCCCTGGTGGCTCAGCCAGTAAAGCATCTGCCTACAATGTGGGAGACCCGGGTTCAATCCCTGGGTTGGGAAGATCCTCTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGACGGAGAAGCCTGGTAGGCTACAGTCCATGGGGTCGCAAAGAGTCAGACATGACTGAGAGAGACACTTCACTTCAGTAAACTATGGTGGAGGTAATGAAGATAATGGCGAATAATATTTCCTGATAAATAGAAATGATAAGAATTCCAATTTTAGTACCCATAGATTGATATTCTTTAATAGAGGGTCACATTATGACATTTGTAGGTGGGTCATAGGTACTTTTTGCCTTAATTGCTTCTTCCTCCATTTAAATAAATAAAAATCATATTTCATGACTGTTAATATAAGTGCAAATATAATCCAGGCTTAATTCATTCTTCATATATTCACTATTACTATTTTTTTTAAATAAACTAAAATTTAAATATTTTCACAAGTGCCTAAAAGTATCCTGAACCCTACTTAGGCACTACCTTAGAGATAAGTGACCCTGTCATTTTCTTTTTTTTTTCAGCAGCTCATCCTCCCCTTCCCCATCCACCCAACCATCTAGAAATGAATGTTAAGAATTTAGAATCTGCCCACACTCTGTCTGTGGAGTGTTTTTCTCTCAGGGCCACTCTTGAGGGTCACTTTTGAGACAGACCACATGTTGTCAATGGAATGTGTACCTCTCTAAATAAATCCACTTCTTACCTATCACTTTGTCTCTCACCAAATTCTTTCTCCATGAGACATAAAGAAGCTGAACTTCAGTAAGTCCTACCACCAGGAACTAAGGCCCCCACCCAGGTGAGGGGTGGAATGATAATGTGGACCCTCCTGACTCCAACCAAGTGAAACTTGGACTCAATCTTTGCTCCAATTCTGTGCTGAATTCTGCTCTACTCAAGCCCCCTCAGAAATACGCATGTATCTATAGTTTAAAATGCCCCCAATTTTGCTAGTTCAGGGAGACACGGCTTTGGGAAAAGATGCCCTGGTGTTCTCCTTACTTGTTGCAACTAATAAATCCTTCCTTCTCCACCCTTTTCCCCACCCGTTAAAAGAATTTTAAAAGTTTTTTGCATTTGAATCCAAAGGCAACCACTGTGCTAAACATGTTCTTCTAACATACATCCTGCAAATAATGGAATAGTGGCCAAGACTTTGTATATAGCTGTTGTCAAGCAGCAATTAAGAGCCACTTAAAACCCAGTGAGCTCATTACCTCGGCTCCAGCGTCCGCTGCTACCTGGAGTAAGGTGCTCTCTGTGTTCAAGAGGGTGGAACTTTGGGAAGGACCAGAGGGAAAGTATGAAAACCACGAAGACACCAAAAACACCGCAAACCGCACAATTCATAAACCACAATGGTGTGGGGCCTGTCGATTAAGAGCTACTTTAATGGTAAATGCCTACAGGGCTGCTCTCAGTCCTAAGTCCTCTGCAATCTCTCCAGGGCCTGACATGCAGTGAGCACTCAGCAAAGGTGTGCTGGGTGAGTTAACAACTTCCAACCCCACTCAAGCCCCAGGCCACGAAGCCCAGGCCTCAGCAGCGCATTTCTGGTGGCCAAGCACCAACTGATCTTATCTGTGGCTGCTTTCTCATTGCAATGATGAAACTGAGTAATGCAATCGAGTCCACATGCTCTGCAAAACCTAAAATATTTGCTATCTGGCCCTTTACAGAAAAAGTTGGTGCCTCCTGGTCTCATGTTTTACAAATTAAAAAAATGAGGCTCAGAGAGACAAAGTGACTTACCTAGTGTCTCATGGGCAATCGTGGAGCATCAACCAGGTCACCCTATCCCCCTCCCATACACCCACAGCTTTCCTTGGCTCCCTTCAAACTTCCCCTGCAGGCTACCCACTTCAGACCAAGGGTAATTCCAGGAAGAGTCTGAATGCCTCGCAAGGGTGCCTGGGATGCTTCCAGGGTCACGCTTCGAGCTAAGGGTCAAGGAGAAGCACTGCTGAGCATCCCAGCTGAGCAGAAGTAATGTTTGCTTTGGGCCTGGTGCGCAGGAGCCCATCCTGGTGCTTAATATGATGCAGGTGATAGTGATGAAGATAAGGCCCATGGTAGCACTTGTAAAATCATCCTATGTATTGGTCACAGTAACCCCTAGGACAGATATATTGCATTGAGCCCATGAAATTGCTGACTTTCAACTGCTTTTTTTTTTAACTTTTTTATATATAGCTGACGAACAATGTTGTGATAGTTTCAGGTGAACTGCAAAGGGACTCAGCCGTACATATCCATGTATCCATGCTCCCTCGAACTCCCATCCAGGCTGCCACATAACATTGAGCAGGGTTCCATGTGGTGTATATTAACAGTAGGTCCTTGTTGGTTATCCATTTTAAGTACAGCAGGATGTACATATCCATCCCAAACTCCTTAATTATCCTGTTCCCCATCCTTCCCCCTGGCAACGATAAGTTCACTAAGTCTACTACTCTCTGTTTTGTAAGTTCATTTGTATCATTTCTTTTTAGATTACACATATAAGGAATGCCATACGATATTTCTCCTCTGACTTACTTCTGTCAGTATGACGATCTCTAGGTCATCCATGTTGCTGCAATCGACTGTTTCTGACCCACAAAATCAGAATTTTGTACGACCCAACCTAATGTGATTATCTTGTTTCACCAAAGATCAGAGAGAGCCTCAAAGACATAAGTCACTTGTCCTGGATATGACAACCAAGGACAAGAGTGAGGATCTAATTGCTCGGTCTGACTCCAAAGCCTTGCACTGGATTTCATACTGTTTAACTTCACCGCCCTCGCCCCCCTCCCCCTGCAATTGATGACTCTCACCCACCTTGAGGATAAGGTTCAAATTTCTCCACAAGTCTTTAGGACTTACTCTAGCTCTCTTCTGCATAATAACCACGGGGTCCTCTTTCATCCTGACACTGCCGTCTTCCTCACTCTGCATGTCTAATCTATCCCCAAGCCATGCTGAGTTTATTTTTAAATGCCTGTCTGTCTGGATACTTCATTGTATTGCCACATCCATCTCTTGTCTGGACCCTTCAGTGGCTTCCTAACTGGGCTCCTGGGACCTCATCACTGAAACCACTGTGTTGTTCTCTGCAAAATGCAAATATGACCCCTCCCCCACTCTTCAGTGACTCTTCCTGTTGCTCTTAGTATGGAAATGTCCCCACACCTGGGTTTTGGGTCTACCCTGTTCATCTCAGGTCCCCTCAACCCCTCTTCCATCTGCTCCCTGAGCCCCTCCTTGCTTCCAGGCTTCCTTCCACAAAGGCCTTTGCGCTAGATGTTCTCTCTGCCTAGAATGTGTTTCCCCTCTGCTCCTTACGTGGCTCCCCACAGGCCTCTCTGGGTCCCTAATGCCTAGCATAGCATCTTGTTCACAGGCTTCTCTGGGTCCCTAATGCCTAGCATAGCATCTTGGCCAAGGAACACCTAAGGCCACAGTGCTGACGTGAATGTAATGCCTTGTCTTTAGGGCACGAAGCTTGGGACTGGCTTTTCTGGTGTCCAAGTGTCCCCCACCCCCAGCGCCCATCACATGCACATACCAAATATCTATCTATAAAACACTTAGGTGTTTCCCTAACTCCTGGGAGTAATTGTCACATGCTTTCTTCAGCCAGGGAAAGTAAACATCCAGAGCTCTCCTGAGTATGTGGACACTGACAGGTAACAAGGAACCAGTGACTCCTGGATGCACAACCAAACATTCATTTGCTTAATGTGTTTGACAGTAAACGTAGCATGTTGACACTTAACACTGAGCATCAGGCATGTGTTCTGATGTTATTACAAGGAATAAATGTTTTCCTATGGGACTTCTCTGTGGCTCATATGGTAAAGAATCTGCCTGTAATGCAGGAGACCCAGGTTCAGTCACTGGGTCAGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGAACGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCATGGACGGAGGAGCCTGGTGGGCTATAGTCCATGGGGTTGCAAAGAGTCAGACACAACTGCACGACTAACACTACCACTAAATGTTTTCCTAAGAAGATGTATGCATTCCTGAAAGCTTATTTACTCAAATAATTTTTTGAGTTTTTGAGGGTTTACTTAAAGATAGTTAAACTTGTTAATATTTCATAACTCTTAAGGCCTCCCAGACCAGCTTATGTAACCTATGCCAGATACAGCTGGTTCACTGTAAAATCATCCAAGTGCTATTTAGGTTCAGAGCCCCAAGCTTCTCCAACTGTCCCCCACAGTCTCTGCCCATCCTCTCACCAAGTGGGGTTGACTCTCCCACATGGGGTTGATCCCATGCTCTCCCGGCCAGGGAGCTCAGGCCCTCCTGCTGTCCTTCCTGAACTGCTGCAGCATCTCTCTTTCCTCCCTCCCTGCCTCCCTCCCTCTCTCTGTTCTATCTTACAGGTGCTGCCAAGCAGCTCTGATGAGTCATGATCCGACCCTGCAACGTCAATGCGCTCCCTGCTTATTGGATACACCTGCACTCCCCGGCATGGGATTGACACCCACAGCACATGACCCTGGATTCCCCTCCCAGACTTCACGCCGCTGTGCCCCATCTCTGAAATACCTTATCAAATTCTCTCCTCTTGCTCCAATTCTTTTCACATGTCCCTTCCCTTTCTGTCTTATGTCATACCTACCTGTGTAACAATACCTGTCTTACCTTCCTATTACTGTGAAAGTACTTTAAGAGTTTATCTTTTAATCCTTTCTTTCCTCAGTCTGTTCCTCTACTTTTTAACATAAGGCTTCCTCACAATGACCAGGGTCGTCCTTCTCCTTTCATCATTCATTACCTGCTGGGGCAAAAAGTAGTTCTCAGGAGAGGAGCAAAAAACTCTTAGATAATACAGTGATCTGTGGCCCTCCAGAGGCACAGTATGTCCATGTTATTAAAATTTCTCGGTGAAGTGGTTATAGGAAAGATGTATAAAAAGGTCCTTTGACAATAGATCAGGGAGGATAAAGAGAAAAAGGTTGAGAAATACGGTTCCATTCTAGTCAGAAGGAACTCTGAGGATGTGATGAGATTTAAATGAAATTGCTATTTATAAAATGCCTAGAACAGCGTGGGGCACATAATATATAGAAACCCAACATGTGTTCCTGATAATTGCCAGTTTATTGTGCACGTGGGCTTCCCTGGTGCCTCAGACAGTAAAGAATCTGCCTGCAATGCAGGAGACCCCAGTTTGATCCCTGGATTGGGAAGATATCCTGGAGAAGGGAATGTCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCGGGAAAATTCCATGGACAGAGGAGCCTGGTAGGCTACAGGGTCACAAACAGACACGACTGACTCACACACACACGTTGTGCACATAATATATCTAGGCACCATGCTAAGATTTTTACACACATTATCTCATTGAATCTTGCACTCACTCCATGAAGAAAGTAGCAGTATTATTACAGACAAGGAAACTGTGGCCCAGAACTTAGTTTAATTGCTTAATGCCAAACTCCTAATAACTGACAAAGGCAGGATTTAAATCTGTTTGACTACAAAACCTGACCTTCAGATGCAGTTGGGCATTGACACCTCTGCTCACAATGGGATGAGGCCACCTACTAGTAGGGGCAGAAAAAGAAGAGATAGATGGAATCAATCAGATATACAGCACTGACTGCCTCTGGACTGATGGTTGGTGTCCTTGTGTGCAG
Seq C2 exon
GGCCATGATGATGACCGCCTGTGATCTCTCAGCCATCACCAAGCCTTGGGAGGTGCAGAGCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000012945:ENSBTAT00000036662:17
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0023314=PDEase_I=FE(14.5=100)
A:
NA
C2:
PF0023314=PDEase_I=FE(8.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA

Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]