DreINT0019525 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000104005 | SLC4A3
Description
solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:11029]
Coordinates
chr9:46809858-46830516:+
Coord C1 exon
chr9:46809858-46810078
Coord A exon
chr9:46810079-46830373
Coord C2 exon
chr9:46830374-46830516
Length
20295 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGC
5' ss Score
7.31
3' ss Seq
CCCTTTGCTTTGACTTTAAGGTC
3' ss Score
9.71
Exon sequences
Seq C1 exon
CTTTAGCCCATCTCCAGAAGCTGCCAGTATGACAACACGCGGCTGGTTTCGCAGGAAGCCTGTCCACCGTCTGGCTGGAGCCCAGAGGACCAGCTATGACCTCCGCGAACGCATCTGCATAGGCAGCATGACTGCAATGGAGACTGCGGTCTACCAGAAAGTACCTACAGACGAGGCGGAGGCGCAGATGCTCGCCAGCGCTGACCTCGATGACATGAAAA
Seq A exon
GTAAGCAAAGCCAATTCTGAAGGAGATGTGAAAATAACAGCGTGCTAACACTCACTGATTTTTGACAAGACATCTCTTTACTTTTACCTGCCTTTAGTTTTAGCATTCTCTCAACAGATATGATAATCACTGGGATATTTTTACAATTTAATTTTTTAAATCAGATTTGCTGTAAATTGAATCAAAAATGTAATTATTACTTACACAATTAGTATTATTCCTTGAAACATTTATCTTTAGACTGGATACATAAAATAATAACAATAAATGAAGAGTTTATTTGCTATAATGGATGACCACCTCCTTAGAATTTAATAATAATAAATTTACCAAAAAACAAGTTTTATTCATTTCCAAAAAACATGTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTGCAATTGTACTTTTCAATACACAACATAAAATCAGGATATCTGATTGACTAAAAATGGAGATTTATTAAAAATGTATAAAAAATAAATGAAACATGTATTTAGGCGACACAGTGGCTCAGGGCTTAGCACTGTCACTTCACAGCAAGAAGGTCGCTGGTTTGAGCCTCAGCTGGATCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAGTTTGCTTGTTTAACCCGTGTTCACGTGGGTTTCCTTCGGGTGCTCCGGTCTTCCCTACAGTCAAAAGATATGTGATACACGTAAATTGGGTACGCTAAATTGTCCATGGTGTATGTGTGTGAATGAGTGTGTATGGATGTTTCCAAGTGATGGGTTGTAGCTGGAAGAGCATCCGCTTTGTAAAACATGCTGGATAAGTGGTGACCCCAGAGGGTTTAAGCCGAAAAGAAAATGAATTAATGAATGAACTATAAACAATAGCATTTTGGTTAAGTCCTGTAGTCTTTTTATATCCCATATCTAAAGAGTCTGGTCAATCTCCAATTTGAATTTTCAGAGTGTGTGTCTGTGCATTTGTTTTCCTTGTATTCCTTACATAGCGGGGACCGATGTCCCTACATTATATGAATACCAGTAAATTTTGACCTTGTGGAGATGTTTCTTCTTAGCGATGCAGTATGTTGTATTTATTTATTTATTTTTTTTTGATTGACACATTATAAAATCAGCAGAGGAGCACTGCGAAGGCACAAACCATGTAAAAAAGTAATTCCCCATGGAACCTGCAATTTATGGTTTTAACAGAGATGGCAACAGAGAGACAAATGTCTGTACTGCAAATTTGATGTATCCTACTTAATTTATTTCAATATTTTGTTTTAAGGGTTTTCAGATATTATAACATATATGCAGTAATTAATATATGTTTATGCAATGTGGTGAGCATAAAACCTTTCATAGGTGAAAATCAAGTATTTTTTAAACGATCATATTTATAGTGTCATTATTTAAAACTTATCTTCAGCCTTTTAAGTGTCATGTGTGTAAATTAAAATAACTAAAGAAAATGAGGTTGGGTTTATAGATAAGGTAGGGGGATAGAATATACAGTCTGTACAGTACGAAAATCTTTAAAGGTGCTGTATGTAAGTTTTACACTCTTCTAAATCATAAAAATACCATAATTTGTTTGCAGATATTTAAGAAACATACTAGGTGAACATTCTTGTTTATCTGAAAAACAATGCAAAAGTCAGATATTCTGTATTTAAAATGAATGTTATGTGCCAAAACGTCTGTCTTTGTTTTAGTCATTTAACCCCTCCCTCCACCCCCCCAATGGCAGTTTAGCCAATTACATTCCAGCACCAGGGGTTGCTTTGGTGCGAATCATTCAGTTCTGAAGGCTCCCAAAGCAAGAAACGAAGGTGTTTGTGACCGAAATGCGACCTTTGGTGGACAGTAGCAGACTCTGAATTGAGAAGTAGATTCAGAGTTTCACATGAGGTGGTTATTAAATATGAAATAATATAAATATTCTGAACGTAAACATTAAGCGAGCAGGTTACATTGTAACATGACGAGATTTGCAGTGATAAGCAATTGGGCTGTTTGCACCGGAAGAAACGACAGACATTTGAATACAGCCTTTCAGAACAGAACAGAATAGTGCACTCACTGCACTCCAACGAAATGTTAAGGTGTATAATCTAATTAATACAAATGAAACCTCTTTATTAAATGTACATGCTGAATTACTGATATGTGTTGGTTTGCACTGAGTCACAGTTATAATGTTTAATTTCAAATGGTTTATTTTATTTTTAAGGCATGCGCTTTCAGTCTCGTGCCTAATGTTGGAGCACATCTGATCATTTCTGGAAGCTGATTCCAGCAGCGAGGGGTGCAGTAGCTGAAAGCAGATTCACCCTGCTTTGACTAAACTCTTGGAATTTCTAGTTTACATGATCCTAAAGATATGAGTGATCTATTAGGTTTGTATTCAGCGAGCATATCTGTGATGTATTGAGGTCCCAGGCCATTTAGTGATTCATAGACCAGTAATAATACTTTAAAATCTATTCTTAATGTAACTGGGAGCCAGTGTAAAGACCTGAGGACAGATGTGATGTGCTCTGATTTCCTGGTTCTGGTCGGAATCCTGACCGCAGCGTTCTGAATAAGCTATAACTTTCTGTCTGTCTTTTTGGGAAGGCCCGTAAGGAGCCCGTTACAGTAATCCACCCTGCTGCTGATAAAACCATGAACAAGTCTTCACTGGAAACAAAGCATCTAATTCTTGCAATGTTTTCTGAGATGATAGTAAACTATTACTATCTGTGCAATTGTATTTATGTAAACTATGATTATCTCAGGTAAACTATTTGCTGCTGCTTTCAGTAGTATGGCTTTAAATGTCAAATGGCATTCAAACTCACATTATTAACATTTAACACTGAATAAAGCACATGAGGTGATCTTTGTCAGTTTATTCTGATGTTTAGCAGCAAGAAATAGAAGCCATTGCTAAAATATAAATTCCAGGTGTTGGTTAGAACAAAAACTCCTTTTAATATGGAAAATATTAATGATTTAAATCAGCCTTTAGGCTCGATAGTCTTGGTCATGTTGGTTCTCAATCTGGCAATCTGTGCTTGCATGTGAACCAGGCGTGCAATACCTAGTTGAACCAATGGGTGTCAAACTTACATACTCCACCTTTTAGACCAGGGCTGCTCAACCCTGTTCCTGGAGATCTACCTTCCTGCAAAGTTCAGCTCCAACCCTGATCAAACACACCTGAACCACTTAAATAGGACCTGAACTGCACTTGATAATTACACGCAGGTGTGTTTGATATGGGTTGCACCTGAAATCTGCTGGAAGGTAGATCTCCAGGAGCAGGGTTGAGCACCCCTGTTTTAGACTATGGGAAGTCCCCATAAGGATAGCTGTACAAGTGTGTGTGTGTGTATCTATAATGATTAAAAGGATTAAAGCAGACAACTTGCATGTTGTTGCGGTTGCTTGATCTTAATTGAAATCAGTGCAGCAACTCAAACTAAATTAGATAGGCCTGTTTGATTTCACGTGTCACTGGAAGTACACTAGTGACCCAATCTCGGGCCGATGCTTTGACTTGATCTTAACAAGCCAAAGTCCAAACACTCATTAAAACCACACTCTGGAGTCGGCGAGCGATGACAGCGAGTGTTTGTTTAGCGGATACAGAGGTCTGCACTGGCAAGCTCAATAGTAAGTTTGGGGGCGCTGAGATATATTCACGTCCGTACTCATAAATGTGTTTTGGTGGAGAGCAGAGCCACGGTCAGCTCTTTGCCTGCCCCTTTCTTCATTTCCAGCGGTCGTAAACAAGCTTTGGGGATGTTCAGATGTGGTCAGGGTCACTGGATCTTAGCCATGCTCCAGAGTGCTTCCCGTTGTTTTTACATTAATGATTATGCTTAATAAAGTAAGCTCAGCTGATTATAGGGTATGACAGCCCAAGAATACTACTGCTGCATTATAAACCCCTGCATGAGTGGAATTGGTGCTTTCCACAAATAGAGTATGCCCTGCCGCGCCATTACTTTGTTTTTAAGAATGATAAAGTCAAATCCTATGTTTTTTTTGGTTGGAAAACATGTTAGATAAACTTTTATTTAAGATGAAACTGATATGATATTAGTAGGTTTTATGAAATATCAGTTAACAGAAATGTTGAGTAAAGTTGTTCAGACAAAATTTTCAGTCTGAAAAAAATAAAAATAAATAAAAATTTATTTAAGTAACAAGTCAGTTCTTTTACAGTCAGATAATAGTAAAACTGGCCAAATTAAGGCTTAAAAAATTATCTCAACTGTATTTGAATTCAGTTTTTAAAGGTGCAGTATGTAAGGCCTCCTTTCCACTGCAAACGACAAGCAACAGACCGGAAGTCATTCATTTCCAATAGAGAGAAGTCCGGGAGCTGCATGGAGTTCCGATCATCTTTGTATGCAGAAAATTCGGATCCGGATTGAGCTTCGGATCCTTTGAAATATTTGAACTCCTGCGACTAGACTGTATGCGATCGGCTGACAGGATGTGATGTATTGCAGTGTTGTCTAACCAGGTCCTTGTGCGAAAGATGAGAAATAATACTTTTTTGGTTATTTTTTAATCAAAAAAAGTCTATATAAAAAAAAAACATTTCTATTCATAAATGTATGTAATAAAGTAATAAAAATATATATTTTATGTTGCCTCCAATATTTTTTAGTGGTCTATGAGTTTCTAGTATTCATTCATTCATTCAATCATGGTGAACGCACAGATAATACTGGCTCTTGCTTTTGGACTTCTTTATTTCGGACACTGCGAGAACATCTTCTCTCTCATGGTGCACACCAGAACTGAAAATTCTGTGCGACTGCCACAAGGGGGCGTATATTCCGACAGTCGTGTCCAAATGTCGTGTGGAGTGGAAAGACGGCTTAAGATTGAGACACATTGGTTGAACTAGGTATGGCACTTCTGGATCATAACACATTTTCACTCGGCTCCTCTTCTAAAGAGTCCAGATTGCCAGATTGACGTGAGTGTGCCTGACTGTAGAGCCTAAAGGCAATTTTAAGGCTCATTTTTCTATATAAAACCACGGGCACGCAATAAAAGAAGTTTATTCCATACTAAAAGGAGTTTTTATCCTAACCAACACCTGAACTTTATATTTTCGAAATGGCTTCTATTTCTCACAGTTGAACAACAATCCCCTTAGGTACACCTCATGTGCTTTATTCAGTGTTAACTGCTAATAATGTGAGTTTGATTTTTACATTTATTGCCATACTATTGAAAGCAGCAGCAGATAGTTCATCTCAGATTTTGAAAATAGGATAAACCATTTAAAATTGAACTTTAGAACTGTGACTTAATGCAAGCCGACACATATCAGTGATTCAGCATCTACATTTAATAATGCTAAAGAGGTTTAATATGTAATAATTAGATTATAAACCTTGCCATTTTGTTGGAGTGCAGCAAGTGCACTATTCTGTTCTGTTCTGTTAATAATATTTGAATATTATTTGTGCTCCATTATATTGCAGTCTGGTTAACAAAGAAAATAAAAACTGTTTATTTAATTAATATAATCAGTGCTTTATTTTATTTTTTTTAATTAAATCTTTAAAAAAATGCGGTACCCTAATTTTGTTTGATTTTGGTTTTTGATCTTCAAATCTGAAACAAAATGAATGCAAAATAGCAAAACAAATCTAATATTTACCTTAATTTATAAATATATTGAGAAATTAATAATTCATGGTAATCAATTATAACAAAATATTTAAATAAAGTTGAGGAAATGCATTTTTTAAATATTTAATTTGATCAGTTTGACTATTAGCTGTATTATTACTAGTAATACAGTAATAATGATCCTATTAATACTATTACTACTATTAGCTATGACTGTAAAAGCACTGATATGTTACCTAAAGTAATTAAATGAACAGTGTTTTCTTCTCTTTGTTAACCAGACTTCAATATAAAGGAGAAAAATATATATATTATTACATGCCATTTCCACGATTAAGGTCAAAAATAGATTCTTTAACTTGAAATTTTTTAGAGAAGTTTAATATATTATTACTTTAATGCAATATTTAGTTTGAACTAAATTTGATAGGCAATGGATTATTGTATTGAAAATTTCTCTAAAATATTTTAAGGTTAAAACCCTGATTTGCACCTTATTAGTGGAAATTGCATATAAGTATTATTATTATTTTCATTATATTGTACAAGAATGGTTTCAGAGTTTGTTGATGTTCACTGAAGATAAAAAACAGCATCTGGGAGGATTCACGAATGTGTTTTTGCAGAAACAGAGCTGTAAAGATGTTTCTGACATGAGGGCTGTGGTTTAATAGTCTCTCATGCTCTGGTTGCCCTCTCAGCTCTTCCTCTGTGTGTCCTGTGGTCATTTTACAAGCCATGATAGAAATGACTGGACACTGAGCCAGACAATCTTCATGGAAAGGAAGTTTATGGATTAATTAATTTTAGTTTTGAAGTGTGTCCAGATTATTTGGATCCACAATGCTCATCTATAATGCTAACCCTCTAGTTTATGAAAAGATGGACTGACAGACAGACAGATAGATGGCTTATTACAAGGTTTTTGTACCGTATACAACACCAACCCAGAAAATATATCCCTTTTGGATTATTAAAAATTTATAGGTTAAAAGTTGTCTGAAGAAAGATCAAGGTCTCATAATATGATTCAAAGCATAAATAAACAAGGAAAAATAAAAACACAATCAAAAAATAAGATTTTAAGGATATTTTTTACAGTGTGTGTTTTAAACAAACTAGCCTGCATATGGTCAGCAATGGCCCCATGTTGCCCAATGGCCAACCATCAGCTTGGTTTTTCCCAGCCTTAACCTGCATTAGACTAGATTTTAAAGGCAGCATAGATGTTTCCATGTGACGTAGTGATAAGGGCTCATTTCATGAATGAGCCTTCTGTTTACTCTACGTGACGTACTGTACAGCTAATATGGCTAAAGAGTTCAGACTCATCCGCATGAATGAAGGCACCAGAGTCCAGCAGATGAACTTTTAGGTGAGGCTGCATAAAAATCCTCCGGCTATAATTAACTTCACTGTTCCAATTGATTATCCTTCCCAAAGATGTGCCCGCAGCCCTTCCTGCTTTTAGAAACAAGGAAACATCGACTGCTGGACTGCAGCACATTACAAATGAGGCCGGCATGCTGGAACAGGCCATTCATACAGCGTGTTACGTGTTTGTTGTTAAAATGGGATGAGACGTAATTTTTATTTATCGAACTAAATATTCATTCATTCATTTTCCTTATTTAGACAGGGGTTGCCACAGTGGAATGAACCGTCAATTATTCTGGCATATGTTCTACGCAGCAGATACCCTTAAAGCAACAACCTACTGGAAACACCAATACACTCTCATTAACACATGAACTCATACACTACGGCCAATTTAGTTTATCCAATTCACCTATAGTGCATATCTATGGACTGTGGGGGAAACTGTTGCACCCAGAGGAAACCCACACCAACACGGGGAGAACATACAAACTCCACACAGAAATGTCAACTGAGCCAGCTGGGGCTTAAACCAGTGACCATCTTGCTGTGAGGCGATCGTGCTAACCAATGAGCCACTGTGCCACCCCTTGAAGAAAATAATAAATGGAAAATTATTCAGTGGGTAGCGCTGTCGCCTCACAGCAAGAAGGTCGGTAATTTGAGAACCGGCTGGCTCAGTTGACATTGACTGTATGGAGGTTGCATGCTCTCCTTGTGTTGGTGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCAGTTTATCCCACAGTCCAAAGACATGCACTATAGGTGAATTGGCTAAGCTAAATTGTCCATAGTGTCACACTACACCTCGTAAAAATTAGATGTTACAAAACACCAACATAGTGTGGCTAAATATCAACTTCAATATAAATGGCCCTGGGAATAAGTAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAGCAAACAAGCAAACAAGCAACACATATTAGAAGAAAATTAACAGATTCACATGTTTTGCTTCAGCCACAGTGACAGTATATACTCTAATACTGGCACTCTTGGTGAATATTTCTTTGTTTTGATGTTTTGGTCAATATATTAACCAAAAAAGGAAGCTCCTTGAGCTTGTTTTTGGATGAGAGTAGATGTTTTTCCTTTAAACTATCTCAGTTTTGGAAACTTTCAGAGCACAAGACCAGACCTTGGTATTTTTGATGTTTATAGATTATATTAAATTCAATCATTCATTCATTTTCCTTTGGCTTAGTCTCTATTTCAGAGGTCACCACAGTGGAATGAACCGCAAACTATTCCACATATGTTTTACGCAGCGTATGCCCTTCCAGTCGCAACCCAGTACTGGATAACACCCATACACACTCATTCATACACACGTTCATACGATTTAGTTTATTTACCTGTAGTGCATTTGTTTTTGACTGTAAAGGAAGCTAGAGCACCCGGAGGAAATCAACACAAAACAATCCACAATAAAGAAAAAATGCTCATTTCCTGACAAGGAATCTGCAGAAATGGGCAATTGCATATTATTGCAGTTGCATAATATTATTTTGTTTGCATCTACATAAACAGTACATAACAGTATTTCCAATAGCATGTTTTACAGTATGTGTTCCCTGTTTCTATTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAGCTTACACCCACAGTCTCCTCTTGTGTGACAATAAAGCATCCAGACTGGTCAGAATAAAACATATTAAATACATTTCTACTGACCAGCTACCTCCTAGTGGTTGGGAGCATTTTTGTAGTTTATGGCTTGATTTTGTTGCTTTGGGGCAGCACGGTGGCACAGTAGGTAGCACAATCACCTCACTGCAAGAAGGTCTCTGGTTAGAGCCCCGGCTGGGTCACTTGACATTTCAGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCCCCGTGTTCACATGGGTTTCCCCTACAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGTAAATTGGGTAAGCTAAATTGTCCGTAGTGTATGAGTGTGAATGAGTGTGTATGGATGTTTCCCAGTACTGGGTTGGAAGGGCATGCGCTGCGTAAAACAAATGCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCTGCTGTGGCGACCCCGGTTATTAATGGGACTAAGCCGAAAAGAAACTAAGTTAATGAACTTTGTTGTGTTGTAAACTTGTATTTGCTGTTTGTGTTGTGCTGTGAACTTTTGTTAGCTCTTTTAATTGTATTGTGTTGTGGTTGCTGTGTCTATTGGCTTGTAAACTTTGATTTGCTGTTTAAATTCAGGGTAGCACTTTAGTTTAGGTCACAGTTCACTCCATTAACAAGCCATTAACTAACTGCTTGTGTTTATTAATAGTAAATATGAAGATTGGTTTAGGTTTTGGGTACAGTTGAAGTCAAGATTATTAGGAGTCCTGTGATTATTTTTTTTTCTTTCTTTTTCAAATATTTCCTAAATGAGGTTTGACAGAGCAAGGAAGTTTTGCACAGTATTTCCTATAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTATTATTTGTTTTATTTTGGCTAGAATGAAAGCTGATTTACTAAAAAAAAAAAACATTTTAAGGTCAAAATTATTAGCCCCTAACTATATTTTTTGACTGTCCACAGAACAAACCATCATTATACAAAGATTTATAATTACCCTTACTTACCTAATTAAAATGTCACTTTAAATGTCTGAAATTAAGATTCATTCTGAGCTTAAGCTGTATAGAAATGTCTTGAAAAATATCAGGTAAAATATTGTTTACTTTCATCAAGCAAAGATAAAATAAATCAGTTATTAGAAATTAGTTATTAAAACTATTATGTTGAAAAAAACCTTTCCGTTAAACAGAAATTAGGGGAAAAATATTTAGGGGGGCTAATAATTCTGACTTCACCTGCATATTCATAGACATAACACTTTCCTTGTTTTTCAAAACAAATGAGTTCACTGTTAAACACAACTGAGATCTCCCTTGGCAAATGTTTTGAGAATTAAAATGTTCCCCTAACATGCGTAATATCTTGTAAATATCCAGCTATAAAAGCTATCGGACGCATCTGGATGGTAACTGTCTCATAACCAGGCAGGTAAAACTGCTTGAAAACTGAGTTCTGGAAGCAGCTGTGGTTTCCATGGTGACAGCTTATGTGGAGACAGTGCTGTGTAATGTGCGGCACCATATTGAGCACTTCAGCGGCACTGCTGTTGTTTTGGACGGATGTTTTCACCTGTGCTTTCTGACAGGGTGGTGTAACCAGCTCCGGACCTGATAGAGGAAAATCCTAAACCACATTTCTGTCCCTCGCACAGCAGGCAGGATCAATCGAACAACGTCATGGAAAGCACACAGACAGCCAATAGATTAGTGCGAGACCTCAAAAGTAGTTCAGTTGTATCAACATTTCCTCTGGATCATCAGCCAATTCCAGTGTTCCCCGCGGTTTGCTTGCGTACAGACGGACGCATCTCTTAGATCTGTCGTGAAACTCTGAGGCTAGGTGTCATTTTTCCTATTGGGTGGATCTTACAAACTCTTGAAGGCCCAATTGAGAGATTGTCTTCTCGGACCGACATCATCATTCATAGTCCTTTCCCTTAATAGCGTTTGCAGGATCTACTTAATCGAAGACGACAATCGTTTTGAGATTCACTTTTGTTATTGGAAGATCACACAAAATACAAAATAGCGGCGCAGAAGAGGGTGGCATCCTGGATGATCCGGAAGTGCCAGGTGTGGAGATGACAGACGTGGGGAAGGAGAATGATACGGGTAGGAGTGGTGGTCCTGATGATTCAGATTTTGGAAAGGAACATAATGTAGATCAGGAGACCCATTTGGAGAGCTTCACAATGGACGGCTTTGAGGACTTTGAGGAGTTTGTGCTGGATTTTGATGATTATGACCTTCTGGAGTCTATCCACTCACACCTTGGCTCTCCAATTGAACCGATCCGTAAGTGTGCTTACTGTTAAAAGATGGATGTGGTAATATTTTCCAACCTCAGTTGTTGCCAGTGTCACAGCGACCTCCACTTTGATTCACACTTACATCATTTTTTGTGTGTAATTCCATTGTCTGTTTTTGACAATTGCAGTTCAGTTTCATAAATGTTCGGAAAGCCTCAAAGTATGCCTCCAGAATGTGTGACAGATGAAATCCAATCGGATTTTCCATTTACATGACTGCGGTTGTGACATTGTAGAAATGCACTCTTGCTTGCTCGCATTGAAAATTGATTGGTGAACCGAGTTGTTTTATTGATCCTGTAGGGAAATAGAAGCTAATTAATGTCAAGCTGAGTTCTTTCCAACGGTTGCTGATATGAAACATGCCACTGCCTGCAGTGATGTGGCAGGGCTGATGAAGTTTCACATCCCCTCATGTTGACACACAAATGCTCAGCCAGACCTCCACATGCGTCTTCTCAGGGCACAGTCGTATTATGTAGTAACTTGATTCAGACATAAAGCACAGTGGATTCTAATCAGCCTCATGCATTGTGGCTAGAGGCTTGTTCTGTTGCAGTTAATTCGGCCTGAACCATTTAACATGCATACTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGGGTGTGTGGGTGTGTTTGTGTGGGTGAGTATGTGCAATGGAAAGTAGTGTGTGTGCATTGTTTGTGTGGTTTACAAGGAGACACATCTGTATAATGACAAAGGTATGACCTAGGCTTTCTAATGTTGAGGTGGTTTATGAGGACATGTTTTGTGTCTTCGTAATTCAAAACAGTTATGTTATATATTATTATTATTTATACTCACCGGCCACTTTATTAGGTACACCTTACTAGTACCTGTTTGGATCCCCTTTTGCATTCAGAACTGGCTTAATCCTTGGTGGAATAGATTAAACAAAGTACTGGAAATATTCCTCAGAGATTTTGGTCCATATTGACATGATAGCATCACACAGTGGCTGCAGATTTGTCAGCTGGACATCCATGATGCGAATCTCCCTTTCCACCACATCCCAAAGTTGCTCTATTGTATTGGGATCTGGTGACTGTGGAGGCCATCAAGTGTTTGTGTTGTTCCTGAAGTTCTTGAAGGGTTGGCATCATCTTTTTAGTCCTTGTAGAGTTGGAATCATCTCTTCAATCTTCGTTGGGTTGACATCATCTCTTCAAGTCTTCGTAGGGTTGGCATCATCTCCTCAATCCTTGTAGGGTTGACATAATCTTTTCAAGTCCACAAAGGGTTGGTGTCATCTCTTCAAACCTTGTAAGATTGGTATCATCTCTTCAAGTTCTCGTATGGTTGGCATCATCTCTTCAAGTCCTTGTGCGGCTGTAATCATCCCTTTAATCCTCATAGGGTTGGCATAAACTTTTCAATCCTTATAGGGTTGGCATCATCTCTTCAAGTCCTCATGGGGCTGGCATTATCTCCTCAATCCTTGCAGGGTTGAAATCATCATTTCAAGTCCTTGTAAGGTTGGTATCATCTCCTCATACCTTGTAGGATTGGTATCATCTCTTTAATCATCATAGAGTTGGAATCATCTCTTCAAGTCCTTGTAGCATTGGAATCATCTCTTTAATCCTCATAGAGTTAGCATCATCTCTTTAATCCTCATAGAGTTGGCATCATCTCTTCAAGTCCGTGTAGGGTTGGCATCATCTCTGCAAGTCCTCATAGGGTTGGAATCACCTCTTTATTCCTCACAGGCTTAGCATCATCTCTTCAATCCTTGCAGGGTTAGCATAATGTCTTAAAGTCCTTGTAGGGTTGTAATCATCTCTTTAATCCTCAGAGGGTTGGCATCATCTCTTCAATCCTCATAGGGTTGGAATCATCCCTTCAGACCTTGTAGGATTGGTATCATTTCTTCAAGTTCTCATATGGTCGGTATCTGTTCAATCCTTGTAGGGCTGGCATCATCTCTTCTATGCTTGTAGGGTTGGCATCATCTCTTCAACTCTGATTGAGTTGGAACCATCTCTTCCATCCTCGTAGGGGTGGCATCATCTATCCAATCATCTTGTGGTTGGCATCATCTCTTCAAATCTTGTAGGCTTGACATAATTTCCTCGTAAGGTTGGCATAATCTTTTTATAGGTCTTGGATCTAATCGAGTGATCTTGCACTTTCACTTTCTAGGGGTCTTGACATGGGCATCACCATCCATTCCTTTTGTTTTCAACCAAAAAAGAAAATTGTTCAGGTTTGGATCTACTGTAAATAGAAATTTTTCTTGATAAAAAAAAGAAAAAGATATATATATATATACTGTATTTGGGGCTTAATCATTGATATTGTCAATCAGACTGTCAAGCTTCTCTCTAACAGACAGACTTGTGTTCTGACTCGATGCTTTTGTCTTTGTGCAGATTGTTTACCCTTGTGTTTCCCTCGAGGTCTTTCTCTGTATGTGACTCTCTGCAGTCCCTCTGGAAAATGCCTGAAGAGCAAACAAACAGTCTAGCAGAGATCAGTTTACCCGTTATCTCTCCATCTCACTGTTTTTCTACAGATGCAAACACAATATGTAACTCAAAATGTGTATTATTTGTATTTAGGTTAATAGAAAATGTGAAAAAAAATGAACATAATGTAATTTTAGTAATTTGGTTTGCTTTTCTCAGTTTTATTTTATTTTTTATTTTATTTACTTTTTAATGTCAGTATAGTTTTTGTCATAGATTTGAATCTTAGTTGTAGATTTGGGTATTTTTTATTTTACTTTTATGATTTTATTTTCTAAAATGTTCAGTTATTCATTTTCTTTTTGGCTTAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTCGCCACAGCGGAATGAACCGCTAACTTATCCAGCATATGTTTTACCAACGGATGACCTTCCAGCTGCAACCCATCTCTGGGAAACATCCATACACACTCATTCACACTCATACACTACGGACAATTTAGCTTACCCAATTCACCTGTACCGCATGTCTTTGTACTGTAGGGGAAACCGGGGCACCCGGAGGAAACCCATGCGAACGCAGGGAGAACATGCAAACTCAACACAGAAACACCAACTGACCCAGCCGGGGATTGCACCAGTGACCTTTTTGTTGTGAGGTGACAGCACTACCTACTGCGCCATTGCGTCGCCTTTTCTAAAATGTGATTATTTGAATTGCACATTTTTCTCGTAATTTCACCCCCCAACCCCCGGCCATCAGCCCTTTGGTACAATCTGTGACACCCCTGGGTCGCCAACTTTGTTATACAGTGGTATCTGATTGCAGCGGCCGCCCGAAACCCGCTTCATAGTACAGTTACTAACACCACAGTAAGCCTATAGTTACAGTATTAACCCGGTTTTTGACAGTTAATCAGAAAACTCGACCCCGAACACCCCTCCAAAAGGAAAAAGGAAAGCCGGATTTGTACCACGTTTTCAGATTTTACCACTTTCTAACCTTGTTATTCACTTTTCACAATTCACATTTTTTTTTCGGTTTTTGTTTTACCTGCTTTTTGGAACTATTGTTCACCTGGCTCGCACCACGTCATCATGGCCAACTTCGCTCTGCGTCTTAAATCCTGCGACATACGCAACGAGCCACTGGACAGCGTCACACCACCCCCTAGCGTTTGTTTTAAAGACAAAATGCAGCCATAGTGCTTTTGGCTACATAATTTGCGATCTCCAGAAATGTGTATTGGTCTACGTTTTCAGAATGAGCCTATGTTGCTCTTATCAGTGGATATTGAGCCATAATGACATAATATTTAGATGTATCTGAACATTCAATAAGTATTGCCATTGAATAAAAAAGGAGGACAGATCAAATGCACCAACTGATTTACAATCAGCACTTTTGTGCGTCAAACACACGTTTGTGGCCCGAGTTGGTTTCACCCTGCGGTGGTCTCCTTCAGGATTGTTGCTCTCCTGCCATGAAAAGCACAACCAGAGTACAGCCAAAAGGCACGGCCACCATATTGATCGCGCTCTACCCCTGGGAAAAGGCCCAGCACCAATGTGTGAATGTCAAATTTTCTTTTCTATTTTTTTTAATGAGGGGGGTTACCGTCCTGAGTGACGATAGCAAGGAAAAATGAACTCTGTTTACTGAACATCCCCGGGCCATTGGGACAACGCAAACCAGCTGAGGCCTTGGGCGTCCTGGCAGACCTCAACCCTTGGAGAGCCCTGGCCTTTTACTTGGCACTCAGAACAGCTGGAGAGAGAGGCTTTCACATAATACACCCCTTCAATTATCCCAAATTCAATAAAAACCTCGGTTTGCGGGCTAAAATGATACAATATTAAATCACAGCAAAAGGCTTTGCATCCAAAGTACGCCTCGTAGTTGCACTCAGCTGAGAAAGCCTTGTTTTTCTAGGCCTGTTTTTACCCTCAATCACACAAATGCATGCCGGTTCATTGCTACAGTTGAGTAAAAGCTATGCAAACCCTTGAATTTACCATGTAGTTTTGTGCGGATGGGTCATATAGTCTATTTTCAATGCTGTGGACCCATGAATATAGAGGCTTTTGGATGTGTTAATAAGCTAATTTTCAACATTTCTAGTTTCCTTTATTTAAATATGACATTTATTCCTTATAGTCAGACAGAGGTCACACGTCTGACTTCCTCATGTCAGACCTCTGTGTGAAGCACTGGCTGTTGTCAGACTCGTTTGTGCAGACAATAATCTCACTGCATATTTACAATATTAATGACAAAATTAGTGTTTGGAAATGTAAATTGATATTTCAAACTTGCATGCTACAGAAAAATATAAAAGTAACCATCTTGAAATATTCTTTGGTTGGTGAAAATACAGGTGGCCTGAGAGATTTGCCTTTGAATTTTTGTTTTAGTGTTTTACATTATGCTCAATAATTTTGCTGAAAATGTTCATATATATACACAGTGATATATATACACACAGTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCACTGTGACTCAGTGGTTAGCACTGCTGCTTTACAGCAAGAAGGTCTCTGGTTTGAGCCCCGGCTGGGTCAGTTGGCATTTCTGTGTGGAATTTGCATGTTCATGTTTGCATGGGTTTCCTCTGGGTGCTCTGGTTTTCCCCAAAGACATGCACTATAAGTAAATTTTAAAAAAAACTAAATAGGCCAAAGTGCATGAGTGTGTGTGTGTGTTTCCCAGTACTGGGTTGCAGCTAAACGGACATTGGCTGTGTTTAAAACACATGCAGGAATAGTTGACGGCTGTGGTTAACTCTGAGAAATAATGGACAAAGCCAAAGGAAAAAAAATAAATAAATAAAAAATAATATCACACCGCTGTGATCAGCCCCAGTCTGTTCCCTTAAGTGTACCATCACATTCAGAGCGCACATCATCAACTGCTAAAATTCTAATCTAACGGTGTGCGCTGAGGTACAGAAAGAGGTGCACGGCACTTCTTATTAATCACAATTCTTCTAACAAAAAATGATTTCTGACATACAAATACACATGACTTTGAGCACAACATACCAAATAAGGTTTGTAAAATACACTCGAATGTCTATGGAGACGGCAATAATACTTATTTGTCAATATAACTAGACAATGAGGTTTGTTCAAGTAAGACACACTGTTTCTGTTGCTAGAATATTTTCTCTATTCCTCTCTCGAATAAACAGTTAACTATCTTCATGTGTTTTGGAAGAAAATTATGAATAAATGTTAATGTAAATCCAGCAGCTCATATCTCTCCTGCAGTTGTTGCTAGAAAAGATACAGCTGTAGTTACCGAGAAGTATTTATATTATTTATTAAATTTCACATTTATTTATTAGTGTATGCCCCTTCCTCAACCCTAGAACCCAACTCCCCCTTCAATGTAAAAATATGTACTCATGTATATTGATATGAGTATCCTCAGCTGTTTCCCATCCCGTGCTGCAATGAGAGGGTAAAGTCTAGATAGGTGTAATGTGAAGTAGACGCTGACAAGGAAATGCAGATCCAAATGCAGGTTTATTGAGAACGATCAGGGCAAGCAGCAATCACAATCGAGAGCAAACAGATGTATGAAAACAGGATTTGTAAGATTTAGATTGCTGGTGATTGTGACAATGGGATACAGCTGAGGATGACGTGTGTGTGCGTGTGTATATACAGTATGCTATGTATGTATATATATATATATATTTTTTTTTTGCTTTTTATTTTTGGTTAGCTTTTTGTATTTTACTATTTTTTATTTAACTGCAATTTATTTTCAGGTTTATTTTTTTAAATGTACCATACAAACATATTTCTCTTAAGTATCAAATCACTATTTCTGATAATCATTATCAGATTTTTAAATGATTTTCATTCAGATGTTATTTCAGCTGTTTCAGCAGCCTGTTTGTTTGGCTGTGGATTGATGAATATGAAAGCTTATGCTGGTTTTAGCTTCAGTTCAGTCAGTGATTCTCAATGTTTTGTCTACCGGGTTTTCTTTTTCCATGCATGGCAATGGTTTGCGAATGGAAAAAAAAACGGGGTTTTATAGCTCTAACACCTTCAATGTGTTCTTGGTGGATCTTAAATTACATATTTTCTGTATTTGGCCCACGTTTTTGAGTAGGTGTAAAGACCGCAAGTGTACGTACAGTAGACCCTTTGATTATCTGATGGGACACACTTACTGTACCACAAAGTGCTGTAGGAACACATATGTTTGCAGAGCTTTGTTTATACATAACAATTTACAATGAAAAGAAATGACCCCTAAATTATGGAAAATACTTTTATTATAAGAAATAAACCAACTTTAGATCACTTCACAAACTTAATTTAATTAATTTAGAAATTTGAGCTTTTTTTTTTTAATTGGTGTATTTTTGTTTTAGTGTGTCATAAAATGCATTATTATTATTTTTTTAAATTTATTTATTATTATTAATTTATTATTATTATTATTATTATTATCATTATTATTATTATAACAATATGTCTGCAATTTCTATTTAACACTTAAAATATGTTCTTAAAAAACTTTGAGTAGTTTATTTAATTTATTTTTCTTTTCAGTATATTCATTTGCAGAGCATCATTATAGCTTCTTTAAATAAAAGTGTCTGGCTGGTTTGGTTCAAAATCCCTATTGGCAAAAAATATGGTATGATGGGCCTATTTCTATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTTGATTATTATTATAATGTTTTTATTTGTATTTTTATTTATTAATTCATTTGGTTGTTTATTTGTTTGTTTATTGATTTGTTCGTTCAATTATTATCATCATTATTATTATTTTATTTTCAATTTTTTTTTTACAAAATACACATACCCTACTTATCTCTTTACAAATGCTCTCTTTACATTTTGCTAATTTAATTTAAACTAATAACTTTGCTTTAAAGTCTTGGTATTAATTTTTGCCGCGCTGAGAAGCACACATGACAGTTAGAAGTATTGCACACTAGACACGTACATTCATATGGTATTTAAGATAAAACTATTCCGATGGTGCTCTGTGGCGCAGCAGAAATATGAACAATGTCCAGAGGTGTAGCTGGTGACTTGTGGCTGCTTGCGGCACAGGTGTTTGTACCCTGATAGAAATCTATGTTTAGAAATGCATGGTGCCGTGCGTCCGATGTGTGACCTCCTTCGTTTAAAAAAGGTCCAGGACACTCTTGTTAAAAAAGATTTTAAGTCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCTATTCATCAGCTTTATATAGTTTTAATAGTTTCCTTCAGTTAAATACAATATTTTAATATTTCTTTTTACATTAAAACCATGATATGATTGTTTATTTATAGTGTGTTTAAAGTCTGTGTTAAATGTGTGTCTTTATTGTTGTGGCTTTGTTGCAAACTCTCCAGTTCTGCAAAATTCCACACACTGGATTAAAGTGAAAATTCAAGCCCTAAAAAGATGAAGTAATAAATCAAAATGCATTCTCACTTGAGAAATCAAATGTATTTAATGTTTATTTTCATGAACAACTCAGTAAAATTGTGTAATAATTAAATGACACATCAAATGCTCAAACTATAATTAAAATGGAGGAACCTCCTGATTACACGCACACAGCTGGAAGATCATAATGAACTGATATCCAGGACTATAGACACCTCATTCACTTACACACTCTTACATTTTTCCCTGTTTGTCCTGCAATGTTTTGATCCTTGTCGTGCTTACCGTTAATATTGTTTTACCTCCTGTTTTTAATTCTGTGTCTAATAAATGATTAGTTAACATTTGTCTCTGTCTTAGTTTTTGTCTTAATTGAACTACGTTTGTTTGTTCTGATTTGTTGTTGATTTGTTTTATTTCTTAGTACCAGTTTATAAAAGAGTTTTGTTCACACTTGATGGCAGCAGCTGATGTTTTCAAGAGTTGAATACTCAAGAAAAAACGAAAGGAAATAAGGATTATGTTTTTTTGTTTACTCAGTTTCAGGCATTTCAGTTCTGCAGACAAAAAAATGTTCAGTTGGCACAACTTTTGGGTCCCACTTTATATTAAGTGTCCATTACTACTATGTACTTGCATCAAAAAATAAATACAATGTACTTACTGTGTTCATAATGTATTTGAGAACACTTGTGGTGCTCTTGAGTTGGGATAGGGGTTGGGTTATGGACAGGTTTGGTGGTATGGGTAGGTTTAAGGGTGGGTTAAGGTGTAGGGAATGGTCACCAAAATGTAATTACAGAAGTTAATTACAAATGTAATCACATACAGGTATTTAATCAATCATAAGTACACAATAAATACATGTATTTACACAATAAGTACTAAGTAAATAATAATAAGTAAATTGTAACAAACTATTAATTCCTGTGTAAGTACATATTAGTTAAGGCCACTTAATATAAAGTGGGACCAAGTTTTGTTACAGAGTAGTTCACCTCTCCAGAAAACGAATAATCTTATGTGAACCCAACTAAATGTTTTTTGGATTACTAACAAATTATTTTAGGTTAGTGAAGCTGATGTTTTTAAAAGTTGAGTGAACAAGAAAAAGCGAAAAGGAAAAAAGGATTGTTTTTTTTTTTTTTGTACTGGCTTAAATTTTCTTACAGTGCAGCAAGTTCAAGGGGTTCATTTATTATTTCTCCCCCTGTGGATCTGTAGCTGCCTTCACGAAAACTGACAGCTCAATTTATTTTATTTACCTAACCTTTTCCCTTTGCTTTGACTTTAAG
Seq C2 exon
GTCACCGCTTCGAGGACAATCCTGGGGTTCGACGTCACCTCGTCAAGAAATCATCGCGCTGTCAACTTCCACGAAGCAGTAATGGCTCTCCGCCGTTGTCCAGCCTGAAGAGGAGGAAGAGGATGGACAAGAAGACGCATGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000104005:ENSDART00000160285:6
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.733 A=NA C2=0.812
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]