DreINT0021381 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000078362 | TNC (2 of 2)
Description
tenascin C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:5318]
Coordinates
chr5:5246681-5270303:-
Coord C1 exon
chr5:5270028-5270303
Coord A exon
chr5:5246954-5270027
Coord C2 exon
chr5:5246681-5246953
Length
23074 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTACTC
5' ss Score
7.04
3' ss Seq
CATTTCCTCCTCTCAATCAGAGG
3' ss Score
6.02
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]