DreINT0047633 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000005908 | clk4b
Description
CDC-like kinase 4b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-050227-19]
Coordinates
chr21:32255941-32267851:-
Coord C1 exon
chr21:32267745-32267851
Coord A exon
chr21:32256099-32267744
Coord C2 exon
chr21:32255941-32256098
Length
11646 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTGAGG
5' ss Score
9.16
3' ss Seq
TTCTATTCTGGTGTGGTCAGATG
3' ss Score
5.58
Exon sequences
Seq C1 exon
ACCGGAAACGTTCAGTTGTGTTAGGCGGAAGTGTTAACACACAGTGCTAGAGTTCAGTCTGGAACGCAGAGTTTCTTATTTCACGACTTGAAAGTTACGAGTGAAAG
Seq A exon
GTGAGGATATTCTAAGTTTAAATACGTAACATAACACTTTATTTTACAAGTTTATTCATTACCTCAAGGCTGACATTAGGCGTAGGTGGCTTGTGGTCCCCTGTATGCTAACCAGCTAAGTTAGCCGCCCAATGCCAAAACATTTCCGAATAAACTGAATGTTTGAAGCGTTTTGTTTTAATAAATGTTATTTTCATTCTTCTAGCTTCTTTAACGTTAACAATAAATTAATCGAGTATATGCACATTGTTTAATGTTGTAACCCTCCCGAGTTGGCAAAATCTGCCAGGCGGTGGCTAACGAGATTAGCTCTTTGTTAACGTTGCGAACAAACTAACGTTACGACTGTAAACAAACATCACACACAAACAGCGTTTATAACTTTACATGCTGATGTTAGTTTCAGGATGTGTACTTTTTGTTTTTAACGAGTCTTTTAACAGTTCCAAGTTAATGTATCGAGCAATAAATATTAATTATTAATTTCTGTATCACTTGCACTGACGACATTTACAGTTAGATTATTCATCTATATTCTACGTTAAAGTTTTTTTTTTCTGAGGAATATGTTCATATTTAATTTGCCCGATAACAAAAATTGTGTAACTGTATTTTGTCTGGCTTTAGGCTGTGTTTTCTGTTTTGTGTTATAGGAGCTTCTCAGGGCTCTCGAAATTTCAAAATCTCTGGTAACCTAGCCCTTCGGACAGGCACTCTTCAGTTTTTGCTAACCCGAATATACATTTAAGTAGCCCAAAACAGAAAATACATTATTTATTATATGAAAAATACAAATAAATAAAAAAATGGCATTTGTTATAGAATGTTTATTTTTAAAATAACCAAAATATAATTTTAAGTCCCTAAGAAATCAAAACTAACCATATGATTTTGTTAGCTCACATTGCTAGTTTTGTGGTGAACAATTCATCTGTGCATGTCATTAAGGAAAAAAATGCCCTTCTAATCTTTAATTGAAATCTGTAAAAGCACTTCCTGGTTGTTTTCAGTTTATTTGTCAGATTACATATATCTCAGGAATTGGGCGTGGCTAACATATTTAACCACGCCCCTCCAACTGTCAGTTTGGACAACAAACAGAAATGGTGGCAGGAGAACTCTGTAATTTGAGTTGTAATAACTCTCCCCAAACCCTTTCCCCAATCTTTTTGAATGAAAAGCCTACTTTCCTATATCTATTCAGTTCCCAGTAGAAAAAAAACAAGCCACGCCCACTGTTTTCTCATTTAATATTCTGTTTCTCTAGAAACTGCTCAAAATATGGAAAAAATAATAGTTGCAGCTTCCGGTTCACAGGAACTTTAACATTTTCATTTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGATGTTACTACTTCAATGTGTTCCTTGTGCCGCCATTCATATCGCGGCGACGGCGGTACTTGATGCGCCAGCAGCATTTGACCGCTGGGTGGCACTTTAACCACAGATATTCAGCTTTGCCTTTTCACAATGCTAAACAGACTGTTCTGTAGGCGTAGCTTACTGTATGTGATGTGATGTGTTCAAATAAAATATAATTTTAATTTAGTTTTTCTGGTAATAGACATGCTCTTACACTATACTATGCTGTAGAAAAGATACATGGTGAGAAGTCTAAAAGCAAATATAAGAATTAAGTTATTAGCCTTCAGTGCCCGATTAAATTGCGTTGGGGTGAAAATAATGTTTTGATTTCTTTGACTATCATGGCAATGTTATTATCTTAAATCTTAAACGTGCGCATATAAAAAACAGCAAAATAATATAGATTATTCTGCCGGTAGAGCACATCACCTCACAGTTGTGAACTTGCGATCACCTCAACTTACATTTAAATTTTGTTTACCTGGTTTATTGTAAACTTTTTAAGTGCAAAGAGGATTCGTTTTGGAAAATAGAATTAAAGAAATGAAAGACAACTAAAGTGAAAGCATAAACATTCAGTACAAATAAGTAGTCTTAAGTAAATAAATCAATAAATAAATCAATAAATAAATAAATAAAGCAGTCTTTTAGTCTAAATATAGAGAGATGTAGTTTGCTATTTTGATAGGACTAAGACAAGATATTTTCATTTATGTTTTTAATTTACGTTTTTATTTACATTTTCGTTGTTGATTATATTTTACTATCTCATTTTATGTTTCAATTATAGTACATAATAATAAACGAATAATGAAAATAAATAAATAATGAAAATAGGACATAAATTAAGTCTGGCAGGTTTATTTTTAATAATTTAGTTTCAGTTCCGTTTTTTTGTTTCAAAACGTCAATGTTCTGCTTTAAAGTAACTGTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTACTTAATGGCTCAGTAAGTTTTGTATTTTAATTTCATATTCAGTCACCTTGCATATGCGTGTGAAATATAATGCCGCATAACCGCGGAAAAAGAAGAAAAGGCTGTCAGTTAAAGCTAATCAAAATTAGCTATATTAAAATACAGCATTTATGTTAATACAGGCAGAGTGTGAACAAACTCAAGGCTAAGATATGCGCTTGTTTTTTAATGCATTTAAAAATAAATGCTACATAAATAAATTATTTTTTTTTTTACTTTTTTTGTATGGTAAAGGTCAATGCACATTATGTTATTGATGTAAACTTAGGCTAAAACTTACCATTGATAAACGTGACCTACCTCAAGCAGATCACTTAAAGTGTAATAAAAATAATGTTGCCGCAGGACATATTAGTATAGTACATAATAATAAACGAATAATGAAAATAAATAAATAATGAAAATAGGACATAAATTAAGTCCCGCAAGTTTATTTTTAATAATTTAGTTTCAGTACTATTAATTTTTTTTTCTCAAAAAATCAATAGCACCTTCAATAATCTAAACATTAAAGATGGACCGCAAGATGTGTTGAGTGGCTATGTGGTGAAGAACGATGGCAAAGCTAAGTGTGATTATTGTAATAAACTAATAAGTTATAAAGCAGAGAGTCCCGACCAACAGGACTGACTTAGCATATGCGGTTGGCTCATTCTTCACGAATATAGAATTAAAATAATGGCGCGTTAGGTTCATTGTGCATCCCGCAGGTGCAACCAACAAGTTGTGCATTTTAGTTTAACTTTTTTGAGCGTTATAAGCAGCTTGGTGATAGTTTTTAGTTAAATATATCGAGCCGAAACTAAGCAGCGCATTCTCTCCGCCTCCTCCGTTATAACCAGCGGGACACGCTACTGAAGCAGGAGAGACACTCCGTCGTTCATAATCTTAGCTGACGTGTCGGAGTCGAAAGAATATATCAAAGAGGAATGTTCTTTTTACAGTGCCGATATGTTTAATCTTTTTTTCCATGTCATTTCTCTTCAGCAAATTATATTTTTAAAGCTGCTTGATTCTTTTAAAACCGAAAGCAGAGCCCGTCAATTGGTGTTTTTTCATAAGATACTCCTTTATTAATGTTTTATTTTATGAGTGTCTTTAATGTGCTTTTTAATAGTTTTATTTTATTCAAAGCAGCGCCTAAAAGCGAATTTATCCTCAAATCGTGACATGAGAGCAATGTCATGTCGCATATATTGCCTTTTTTTCTGATCTTTTTGCATAAAGGTTTTAATCAAAATACAGGTAATTTAATTACTTTCGATGTGCTAAAGTATTTGTTAAATAAATGTTATTTAAAAAAAGGCATATGCAATGTGCTCTGACGGGTAAAATCAGATTCTTTCTCTCTTTCAAGTTCAAAGCAAATTTGAATGCCAAAGGATTTTAGATATGCATATACAAGACTATATGTAGTATATTAACATCAACAAATTAATAAAATAAGTAGCAAATGAGAAATAAATGACAGACAAGTTGATAAAAACAAACATTATCTCTAAAAGTTATCAGAATTGCAAGATTAAAACAGCTGAATATAGGCCTAAAATAAATCTAGAAAGCTTGCGCACTGATATTTATTCTTTTTTTTTTCGAATAACGAACAATTTCAACCACGGGGAGATACCGACAGCTTGATTTGCAGTATTTTCTAACATGTTAGAAGAGGGCAGCGGACATGGCTGCCGGTGGGGAAGCGGCTGTGCCCTCAGCAGCTGATTGAGACGGAGCTGCATATCCTAACTAAGTGCACTAAATAGGCTACTCCGAGACAGGCACGTGCACACATAGGGCTCAACCTGTGCAGTGCACATGCCCTTTTTAGTCTTGGATAGAAAGTGCCCTTCCAAAATGATCAAAAGTGCCCCCGCGACGCAGCACACCCTCGGTCCCGCCCTTCAGTAGGCGCGCGACAACACCGCGTCAACACCGCTCTTTAGTACTTGCGCAACAAAAACCCCCAACCACCCCCCTCGCTCTTCAAAAAATTTATCCTGCACATGCCACGGGCCTGCTCCGAGATCCGGGAGAAATTCTACCCGATAATCCAACACATACAAAACAATTTGAGTCCCTGTCGAACAGAACCCATCTTACTGGGGGAGTGTGTGTGCTGCTGTGTGTTCAATACCCGCTCCTGTCTCCAATACACAAGCTGGAACTTATGTGGACCTACTTTTGATAATAGGCTACTATTATTACCTTTATACTGTTTAAATGTTATCAAAAATCTATTTTTATTTTTATTATTCTATTTTTATTTTTTTATTCTATTTTTATTTTTATTAATCATTTTTTTTTATTATATGTTATTTTCATATTTGTTTGCACTACTGCCCTTTTTGCACTGTCTTGTTTGTGAGACGCGACGCTGCACTGCTTTGGCAAAACGAATGTACAGTTACTTGTCATGCCAATAAAGCACCTCAAATGTGAAAATGTGAAAATAGCCTAGGCAACAAATAAATAGTAGTCTAATAATAACAAAAAATGCCCTTTTCATTTTCATACAATAGGCCTATGTGTGGGTTTTGACAATATGTGTTTAATTAAGCTATAAAGATTTGCCTATCAGATGAAATGCATAGTAAAATATGAAATAAATGTCTCTTTTGCTGAATATTTAATTAATCTATATATTTAATATTTTAAAAATCAACTCCTTTTTGCCCAGAGAAAGAGGCGCGCGGCACTAGCGGACATGGGGTGCTTTCCCAAAAAAAGACGTACAGTAACTTGCGGCTGAACTATGCACAGTTTGGGGAAAAAAAAGGATATAGTGATGCATGTTTCCCAAAACCCCTAGTTTCTCTGTCGCAGATCCATCATTTGAATCACGTTATAAGTAAAACGCACATAATGATAAAGCACACCATCATCACGAGGGCAATTAAATAAAGACAACCTAAACATATTTTTAATTGTTAATTTATGTAATGTGAGTTTTTATAACTTTGTTCTTTAAATTATTTCAATATAACTTAGGCTATTCTATCGTGATGACACCATAAAAGGCCTTCAATGCACTGATATAGGTAATAGGGATACAATGAAAAGCCGATTTCACTATTGACCCTGTTTTTATTCATTGACGGCTTCCCAACACCACAATTCTGTTGCGCGAAAAAAAGCTGCTGCAAATAAGCAAATTTATGACAATACACATTTAATAGTTTCATGAAAGTAGTAGCTGGTGTGCTTCATCTGCGTGATTCTGATTTGACATTCTTCCGCTAAACTTGCTCTGTGTTGAGGTGTAAATGGGCTGTGCTCTTTGCTATTAAGGCTAAGACATCAAGGTGTAAATGAGCTATAGTTCTCTTTGCAACTTTCAATTCTGAGGTGGGGGAAGTGGGAAGAGGCAATTCAAATGTACCATCTCTAAAAATAAAAAGGCCGCTTAAGCGGCATTTGTGTTTAAAGATTATTACCTTATTTTTATTTTATTATTATTAATTTATTCATTCATTCTTCATTCATTTTCTTTTCGGTTTAGTCGCTTTATTAGTCTGTGATCGCCACAGCGGAATGAACCGTCAACTTATCCAGCATATGTTTTACGCAGTGGATGGCAGGAGGGCCAGCTGGGGCTTCGGGACGGAGTGAAAGGAAAGGCGGAATTTGCACCGAGTCTGGGAAAGATGGCTTGCCGTCATTACACCGATCGCACACGAGTTACATGCGTCAAACACATAAATAAATAAAAAAATAAAAAAATAAATAAATAAACAAATAAATAAGGGAAAGAAAACATCTAACCTTATAGGCTGAGGTCTGTTTGCTTATAATCTCCCTTATGTTTCCGTTTTAAAGGCTGTTGCATACAATTTTAATTTATAAGTGACTTTGTTGCGTCCCCTTGATGTTTGAATAACGCATAATTATCTATACACCATATTAAAGACAACAGAAAGACATAAATCTTTACAAATTACCTGTCCCCTTTTGTAGACTCAAAACAAGTGTCAAATCTTGAAAAAATTGCCTGAGCCATATTAAAATATAATTTAAAGAATTACATTATCGGATAAAACCGCATTAAATAAATAAACCAATATAAAACAAGCAAAAGCAAGCTATAACAGTTTAGGTAGGTCTATGTAGCCTACATAAATTAAACCGTTAAAGTCAAATTAAACTTTCATTTTACAAGATATTTTTTTTTAAAGATTTTAGATATTTTCTAAAAACAATAAACACCAGAGAAGGTTTAAATAATTATATGGGTACGATGATAATAATTAAATCGTTCAAACAGAACATTTTTTGGGGAGAGTGAAAGCAGAATGCGACCTTTTGATGAATTAGCTCTAACCTTTGACAGTTTTTTCTTTCTTTCTGCGGTTATGCGCGCATTATATTTCAAATGCATATGCAAGGTGACTGAAATTGAAATTAAAATACAAAACATACTGGGCCATTAAGTAAAAAAACAAAACAACAGTTATACTTTAAAGAGAACTTTAAAGAGAACATTGTTGTTTTGAAACAAAAAAATAACTGAAAACTATTAAAAATAAACCTGCGAGATATGTCCTGCGGCAAAATTATTTTATGAAGCAGTATTCAACTTAAGCTCTTTAGACCATGCGCCTGACCGTTTCTTAGTGTTTCACCACATGTCCTTAAATACATAAGGCCTATTTTTTATTATTTTTCACTATTCGTTTATTATTATGTACAATAATTGTGACATAAAATTAAATAGTAAAATATAATCAACAACGAAAATGTAAATAAAAAGGTAAATTAAAACATAAATGAAAAGGTCTTGTGTTAGTCCTACCAAAATAGCAAACACTGAAAATCTCTTTACATTTAGGCTAAAAGACTGCTTTAATTTTTTAATTTAGGCATACTTAGAATATTTGTACTGAATGTTTGTGCTTTCATATTAGTTGTCTTTAACTTCTTCAATTCTATTTTTCAAAACGAATCCTCTTTGCACTTAAAAGTTTAGAATAACAATAAATAGTGTTAACAAATTTTAAATGATTAATAAAGGAATTATAATGCTTTGACTTATTGTTTAATCTCATTTACAAGCACAATAGCATATTTAAGGCTGCTGTGTGGGCTATTTCTGTCGGTTCGCATCCCGTCCCTTTGCGCCCCCTGGCGGCTCATTCACAAACTGCGGTCATACACTAAAAACAAAGCGGCTCCTATTTCAAACGGCGGCGGTATATGACGCGGCGGTAATAGTCACTTTGAACTCTCACCTACTGTATATATATATAATTTATTTATTTTTAATAAAAGTGAACATTGTTTCAGGTTATTTTTTGGCAACTATAAAGACATTCCAGAATCTTACAGGGTAGTTATTTTTCAAATAACAATAATACACAAGTACTCAGAATGTTCACTCATGGTTATATATGACAATTTATTATATATGCTACTACCTGTAAAATCTAAATGATTTTAGTTTTGAGCTGAATCACGGAAGACACACTTAAATAGATGGGATTAGTTCACAACTCTGTCATTAACACACCCTTCACAATTCAGACCTGTTTGGGATTCTTTCTCCTTTTTGGGAACACATAAGAAAATACTTTTGAAAGAATAAAAGGCTTCAAAATATCTTCATCTGTGTTGAAAAGAAGATAAATGAAAATAAAACTGGTTTAAAACAAGTATCCCTTTAAGTGTAATAAAAATAAATAAACTGGTATTTCATTTTACTAGCTGACTGACGGTTGTTAATTGTTCTTGTTGAATAATAGCGAAAAGTAAACATAAATCATTAACTTTAACTGTCATTAACTGTATTCTATCTTTCATAAACATGTGCGTCTGATCGCATGCTATTCAGTACGCACTTTACACGAAGACGTGCAATCTCGCATAATTTAAAAATGAACAGTTATTTATTTACAGTCTGACCAAATAACTAAAATATATTGATCTTAAAATTGAATAAGAGCACCGCTCATACATAATTGTTCAATTTTTTGAGTGAATTTAAAGGCATTGAAATATGTTTTTTCCTCCCACTAAGCTTGCCCGTCAGGTTAGGTGGAGATGGACTTTGGTAGTCCGAATGAAAAAAGCAATTTCAGGGTTCAACGCTAAGGATTTTTTCTACTGGCCCGATCGGGCCAGTGGTTCTGATTTTTACCTGCCCTGCCCAAATTTTCACTGGCCCCACCAAAAAAAAAAGAAGTTAATTGCTATTTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACACATACACATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTTGATATCAGAATTATTAGTCCCCCTAAATTATTAGCACCCCTGTTTATTTTTTTCCCCAATTTCTATTTAACAGAGAACAGATTTTCTCAGCACATTTCTAAACATAATAGTTTTAATAACTCATCTCTAATAACTGATTTATTTTATCTTTGTCATGATGACTGTAAATAATATTTTACTAGATATTCTTCAATACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCTTAACTGGGGTAATTAAGTTAACTAGGCAGGTTAGGGTAATTAGGCAAGTTATTGTATAATGATGGTTTGTTCTGTAGACAGTCTGAAAAACAATTAGCTTAAGAGGCTAATAAATTTTACCTTAAAATGGTTAAAAAATGCTTTTATTCTAGCCAAAATAAAACAAATAAGATTTTGTTCAGAGGAAAAATATTATCAGATAAACTATCAACATTTCTTTGCTCTGTTAAACATCATTTAGGAAATATTTTAAAAAGAAAAAACAAAAAACAAAAGGGGGCTAATAAATCTGTATATATATTTACGGTAATTTTTAAAATGTTTTTTAAGGAAAATTATTCAGTTCATCAAGGCTATATTTATAAATGTTAAAAAAGGTTTAATTGTTAAATATTTATCAAAATTTTAAATAACTACTTTGTTATTGTATGTAGTTTCAAATAAAATCATTACTCCAGACATTATTGATTTTATAACTATTACCATTAATAAATATAATAATAATTAATATTAGTGATTTCTGAAGGATCACGTGACTGGAGTAATGAAGCTGAAACTTCATCTTTAAAATCACTGGAATAAATGAATAAATTATATGATAAACTACTTTTGAACAGTTTTTTTATAGTGCAACATTTCACAATTTGTATTTATGATGAAATAATTGCAGCCTTGGTGAGCAGAAGAAGCTTGTTTTAACATATTTAATTACACTGACCCCAAACTTTTGACCAGTTGTGTATAGAATATTTTATAAGTGAAAATGTGCACTAAAATTTTAACAACCCACAGACATCGTCACCGAATACAAATCGAGGTCAGACTTTCTCATATATACAGACCCTTATTTCAATTGTCAGGTTTTGTAGAAATAGATCTATTGAATTAATCAATCTATTAAAGAAACGTTGGCTAGAATTCTGTATTTTAGGCTTAAATTATAGAGAGACATAGCAGATGAACCGAGACTGCATCAGATCAATGTAAATCTTTCTTTCGAGCTGTCAGTGCGGAAATGAACAAAACAACAGGCCTAATACAACATATTATACGACTAAAATATGGAAAAATTAACAGATAGTAATTTCGGTCAATTTTGCTGACGGATAAACCGAGAACAGGCTGGATAAACAGCTCTCGGTAATATTTCAGCATGCTTTCACTTTCTCATTTACCGGTAAGAATGACATCTCGCCCTGCTCATCATTCTCTCTTCATATAGCGGTATATATGGCTATTACACGATCACAATACACTGTGATATAGCCTGGGTCGTTAGTTCGTTGCATTGTTTTGTTTTCTCGCTACAATCGATCCGCTCAATAGGACAGAGACCGCATCTCATTCAGGCGATCTTGGACTGATTGATTTGGCGCGGAAGCGAGCGCAACTGCTGGATATATGCCAAAAAAAAAACGCGCTAACGGGTGAAACGAGACAGATTCCGAAACAAACGTCTTTAAGATTGTATTTGCACACAATTGACAGACAGTCGCAGCATGCAGCTCTGGCTCGATCTGGCTGGCAAAAAGGCAGCAGCTGGCCCGATCGGGCCAGTAACATTCTGTACACTGGCCCGAGTGTCTCGCACGCTGGCCCCGGGCCATCGGGCAGTCCTTATTGTCGAGCCCTGAATTTCCCTGGGATGTCGGGCTACCATTTTAGCAAGCCCTGTTTTCTGAATATCCCCTCTGTAAAAACTTTTAACTTTAGGATGGCAGAAATGTAATCTATTGTTCAGTTTCCAATATTCCATGTTCATTTAAGCAAGGAATTTATGGCAAATTTGTCTATTAATGCATATTTATTAAATCCGTTTGTTACGTGTGACATCACGCTTAGCGGCTTCCGGGTCCAATCAAACTGTTTGGGGAGGCTCAACATATGGTAATAATAAACATTTACAAATCGGTGCAATACTTTTAAAAATCACGATCGCAATTTATATGTCCATCTCTAATATCCAATGGCCAGAAAGTGATTTTCCATACGCTATGACTTAAGCGGATAAGTTAGATAATTTAATTGCACAATTTGTATATTTACATTTTTAAACAATTTACATTTGTCTAGTTTAGAACTTAATTATATAAGCACTAACGTTTCCTTTGGATATTCCCTCTTGTTGAATCGCTGAATGCCTCATTGATTGTAAGTCGCTTTGAACTAAATTGTCTACTAGATATAATTTTAAAGTAACATTTTAAGAAGCTTGTAATACAAAAATAAAATTGTATTTCTTAACACAGCTATGGAAACAACTCTTATATTCATCTAATTTTTTTTCTTACCCTATTCACTTGCAGCATCTTGTCTTTATGAGGGACATTGCGTTCAATGTTCTGCATTGAATATTTGTTCGGTCAGACCTTAATTTATTATAACCCAACCTGATTGCTGAGGTTCCATTGCCTGTAAATTAGTTATATAATATCCGTAAACACGGATTTACTAGATGGTAAAATGTTCACCACTTCTAACAAGTCAAAACAACTGCAGCAACAACTCGGCAACATGACATTTAATGACTTTTGAAGTGAAGAGCTGGCATAACCTCGGCAGTCTTGAATTTTACAAGCCAGCGGGGTGTGGGGAATGTCCTGGGATACAGTTTCCCAATCGTCAACTTGTTCCTTTTTTCTATTCTGGTGTGGTCAG
Seq C2 exon
ATGCGGCGATCTAAGCGGATGCGGTCACCGGATGGCTGGATTGCGGAGTACAGCTGGGAGGAGAGAGTGGAGGTGCACAAAAGACCCAAACACAGATCGCGGAGCGGGGAAAGAGAGAGGCAACCTGGCCAAACTCATCACTATAAGACATACGAGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000005908:ENSDART00000139890:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.717
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]