GgaINT0069290 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000015546 | TBC1D14
Description
TBC1 domain family member 14 [Source:RefSeq peptide;Acc:NP_001239243]
Coordinates
chr4:79461633-79480237:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
chr4:79461754-79480118
Coord C2 exon
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Length
18365 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.311 A=NA C2=0.692
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF085986=Sds3=PU(34.4=82.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]