MmuINT0157276 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000029192 | Tbc1d14
Description
TBC1 domain family, member 14 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1098708]
Coordinates
chr5:36867579-36885946:-
Coord C1 exon
chr5:36885826-36885946
Coord A exon
chr5:36867698-36885825
Coord C2 exon
chr5:36867579-36867697
Length
18128 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGG
5' ss Score
10.51
3' ss Seq
ACCTGATGTCTTTGTTCTAGGAA
3' ss Score
11.03
Exon sequences
Seq C1 exon
GAATTTGCTTGCTAGAAAACAAAATGCAAGGCTTGATAGACAGAGAGACTTGGGATGGAAGCTGTTTGGAAAAGTCCCACTCCGAGAGACTGCTCAGAAAGATTCAAAGAAGACCCAGAAG
Seq A exon
GTAAGGCATTGATGAGTGCAGCGTGTGCTCATCAGCCACACCGTACTCTCACGGAGGCTGGAAGGTGTAAAGCTCTCTGTGTTCCCTGGGTGCCTGGGATCATAGACCCGAGTCCGAACACAGTGTGTGCTGGGATCTAACTCTCTTCTCCTCTTTACAGATTGTAGCATGCATACAGGGAAGTTCAGCAGGGCTTTAGATATTTAAACTTGATGCGTTTTAGTCAGTCTTTCCAGTAACAGTTGCAGATGTGTTTATAATCTAGCTTTATTGTGCTTGATACTAAAGCAGGCTCCATACATCCTGGAGCTTAAATCCTTCATTTTGCTCTGGAACATGGATAGGCCATCATGCTCGAAGGTCCGCTGTCGGCCAAGTGCTGTGGCCTTGAACCTGTTGAACTGAAGGTCTGCAGTTGGCCGAGTAGTTGTCCTCAGCAGCAACCCCCTTAGATCTCTGTTCACGGGCAGTTAGCTATTCTCTGAGTCCTCTTGGGAACCAACTAAGTGGTAGTCCTCAGGTCTGAGAGAGGACATAGCCCACCTAAGGCTATGGAAAGTAGACAGGTCTTTGGAGCTGAGCCTGGGGATCAGAAGGGAGGCTGTGACCTGAGTGGTGTGCTCATGCCTCTCTCTGGCGGGAGGGCCTTCCTATGCTGAGCTCACCTGCAAATCCATGTTGGAGAAGAGGCACCTGTTGGGGCTGAGGTCGTGAGTGCCAAGAACAGGACTGATGACTGTTAGATGTAGGAATATAAGATGGCTATCCACACAGTGCATTTTCATGTCTTTCCAAATTAAATTTGTTAGACTATTGTTTGTCATTTCCCTGGGAAACTCACTAAGGTTATCAATGTTGGGGGGAAAATGTTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTATCCTTGGCTGGCCTGGAATTCACTCTGTAGGCCTTTCCGACTCTGCCTCTCAAGTCCTGGGATTAAAGGTGGGCACCACCTCGTTTGTAAATTACATTTTGATTTTTTTAGTCATTATGGAGACTTATTAAGTGAGCATACGATTAAATATGAGTTTGTATGCAAAACTCAGTTGTAACTTTCCTAGGAGATAAAGTAGGGTAATTTCATCTGCAGTTAAGAAGGAGTGACAGTTATGTTAGTAGGCATCTGTGTGACTCTGGGGGTCACTTGCTTCATGTGTTACCTGCTCTGGAGCCTTACTGGGGAACTGTAGAGGCCAGCTGGCTGTGCAGGAACACGGTTCTGCTGAGAAGACCTTTGGCTTTAGCCATCAATAATGAAGAAAGTAACTGTACCCTATGCATGAGTCACACAGTCCTTCCTGGGACCGGTTTGTATATGCTTTGTGTCTCTGTCCCTCTCATATTTTAGGTCTGACTCCAACCTAGCAAAGCCAGAGAGGGAGAGAGTCAGGGTGACTACTTTGGGCACCACTGCCTTGAGCTGGCTTCTGTCACTCTTGCTGGCTCTGACTTTACAGAAGCCAGAGTTGGACCCTTGATTGTCCATATGTGTGATCTGAGACAGTGACAGTAACTGTATTTAGAGCTAAAACATAACCAAGGATTCTTGGAATTCCCCATTTTGCTTTCTGGAATTATTTTCGTTGGAGAAGCATCATCAAATGGTGCTTTAAGAACATAACTTTGGGCCAAGTGATGGTGTTGCACACCTTTAATTCCAGCACTTGAGAGGCAGAGGCAGGCTAATCTCTGAGCTAGAGGCTAGCCTGGTTTACAGAGCAAATTCCAGGATAGCCAGACTTGTCTTAAAGGGGTGGAGGGACTACCAAAAAAATGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAGTCTAATTCCCTGACTGCAGTCTATGAGGACTCCACTCCACACAGTGGCGGAGAGAACTGACTCCTGCAGGTGTGTTTTGACCTCTGCCCACAGGCACATAGTGCACACTGTGCTGCATCAGGTGGTGTGCCAGGCACCAGGGCCGTGAGAGTGTGTGTCCTGATGTGGCTGCCAGCTTTGTGGTAGAGCAGTGGAACAGATGTGTACAGAGTCACTTGTATGACCTTGGGACAGTTGTCTCTTTTGGGTCTCCTCAGGTGTGGACTGGGCATTAGAATACAGTGTTGCTCTAACATAAGACATAATTATGTGGTGTATTTTGCCCGGAGTTGGTCAAGGGATGCTGTTGCAATTTCCAGCTAATAAATAGGCCTACGTTGTAATGGAAGTACTCTCTGTGCTTTGCCCAAGGCACCTGACCTCATTCAGTCTGAGTTACATTTCTTGGTTTTGCCTTAGAGACTTCAGTTTCTTTGAAAGTATGGGGGACAGGTGGAGAAGAGGGATGTTAAAATGTTACTTACCTTTTTCTTTTTCAAATTTCATAAAAACCTTGAAAATTGTCTTGCTTTCCATCAGCTTACATGATGACTTTGGAGACACTTTTTTAGGGGAATAAAAAATGACCCAGGATAAGAGAATAAAACCAAGGCCATGATTCTTGAAGTGAGATGAGGCCTGTCTTTGTTACCTGTATGTGAGAAGCGCAAGTCTGTAGGCTTTGTGCCTCCAGCACACTGAAGTAAACCTGCGTTTTGGGACCCAGAGCCATGTCCTAGTAACTACAGATTATCCCAAGGGTGATGGCTATTCAGTGAGAATGTTGGCTATTGGGAGGAAGTAGCCATCACTGTGGCCAGCTCCACACAGGGCCAGAAGTTCACCCAGCAGCATGCAAACTCTCTAGCCACTGAGCTACAGAGTAAGGTGCTGCCTACGGTTCTCCACCCACTGGGCTTGAGTGACAGGGCTGTGGCCACTCAGCAGGGTTGGTGATAGCATTTCAGAAGTGCAGTCCTGTCCCTTGTGAATAAGGTGAATAAAATGGGTGTCTTGTTCTGTGTGCGCTATTCGCTGTTTGTTAAGGAATTCACATAGTTCTCTGGGAGTGAGGTTGATCAGAAAGCTGATGCGCTGTTGGTTCTCACTGAAGCAGCTGCTGGTTACCGTAACCATAGGCTTACAGGTTTGTTGTTAGCTTTGTTTACCCAGGATCGTCTTGTATGGTTTTGCAGAATCAAGCCAGTTTTTAGATGTTAGAAAATGCCGGAAAGTGGTAAATCCAGGGCAGCTTAGAGTGACATTCATTCTTCTGAGCTCTGGTTTCTGAGAGGTCTGGGATACAAAAGATCACACATTACAGGAAGAGTGTATTTGGGTGCTCAACAGAGGTAGCTGAAAACCTACAGACACATTTTAAAACACTAAGAAATGAATACAGCCTTCATTTTCATCAGCACCCTGCTTCATTTCGTCAACTTTACTAAGTATGACTTCTAACCCAGGACCTACAGTTGGAAGGAGAGAAGGGACTCCTGCAAGTTGGCCTCTGACTTACTATTGTGTGCTATGGCATGGGCATGTACATGCACGTGTGCACAGGCAACGCATGCACACACGCACACGTATACACACAAACTCAGTTTCCCAGTTTTAGGTGGGTAGAGTAAGCATACGGTGCCTCTCCAGGCCCAGTGAGCACACTGCATGGACAGAGGCACAGAGCATCCACTCGCCAGTGAGCACACTGCATGGACAGAGGCACAGAGCATCCACTCGCCAGGGCTGGGGAGCACATGGTAGCAGGACTGTGCAAGAAGACTATAATTCAGAGTGCTGCTGAATAGAAACTGACATTTTTAGCCTGAACTCAGGCAGACCAAACCCAGAAAGAGAACACCAGATGGGGCTCTGTGCCTGGGAAAAAGAGTGGGTCCAGTACTTAGAGATAGGCAGAGACCCTCCTTTGTGTTATTTTCCCCTCTGTTCTTTAAAAAAAATATTATTTTATGTGTATTTATATGCATTTTATGTGTATTTATAAGCATTTTATATGTATTTTGCTTGGCTGTATGTATGTGTACCACATCTGTGCCTGGTGCCCAAGGAGGTGCCCAAGATGTAACAGAACTTCTGAGGCTGGAGTTACAGACTGTATTGAGCAACCATGTATGTGGGTGCAGGGGGTTGAACCTGGGTGAGCTGAGCCAACTCTCCAGCCATCATTACAGTCTCATGGCGGGCAGCACTTGTGGTGTCTGACAGGAGCCTAACACTCTTGGGAGGGGAAGCTGATGAGAAAAGGAGATTGCACCTCTCTTGCCAACATAGTTATGGGAAGTGTGTGGCTATTTAACCACAACAAGGAGACTCAGGGAGCAAGAAGGCACTTGGTGATTGCAAAGAGACTTGCCGGAAAGTGATTTCTTTAAGGTTGTTATGACTTCCTGCCACTGTCTGTCTGGGTACGTGGACCTGACCCTAAGTAACTTCAGTAGAACTGGATGGATAGAGCATGCAAATCTCTGACTGGCCACTGGGTGGTGCACATACAAGACAGAGTCAAAAGTGCTGAAAACTTGAGTTCAGAACTTGAATTTGATAGAAAAGCTGGCTGGAACTTGTAATTCTTTCTATCTGGAATCCAAATAGGTTATAACAGCGTCAACATTTACACAGGCCATGTCTTGGAACATAATGTTTGAAAAGTCTGTGGGCTGGAGAATTGGTCCAGTGGCTAAGAACACTCATTCTTGCAAAGGACTTGGGTTCGATTCCCAGCATCCACATGGAGGTTCACCACTTCCTTGGCATCAGTCACTCATGTGCTGCACAGACATACACTCAGGTAAAATGCACATACACAAAATACAATACATTTTAAAATATTAAAAGAAAGGTCTAGAACATTGTTCAGAATTATTGGGCTTCAGGACTAGGACGTCCTTTGGTGATCAATAGACACTGATCCTAAGATCAACACGTGTTGGGATTGTGTAAGACCTTAAAGAAACAATTAGAAGAATGTTTCAGCAAATAGGGTAGATACTCTTGAGAGTGAAAGACAAAAACAGTTGAGAAACAGAAAATGTAAGAAATAAATGGACATTTATAAATAGAAACACACACCTGAATGCAGTCAGTCGGACAGTACAGATCAAAGTAAAGGCAATAAAGTAATATAACCCTGAACACAGGAGAAACCACTAAAATGTTTTAAAACCCAGCAAGATGGAGACGGCTTAACAGGTCCAGGTGCTTGCGGGCAGGTCCCACAACCTGAGTTGAATTCCTAGATTCTGTATGGATGTGCCTGTACTCACCTGCAGCCACATACCCAGTGAATAAAACAAAAATCATAATAAAAACAAAACAAAACAAAAAGAAGAAGCCAGAGTCACTGGTTTGAATTTATGTCACTGCACTGAGATCCCCGGAGAAAGAATTTATAACAACAGCAACAACAAAATTATTAGAATAAGTAAACGAATATGTCCCAAATTTGACAAAAAACCACAAACCTACAGATTTAAGTTAAGTCAGTGACTCCATAAACAGGGTAAGTTCTAAGAAGTTCATGGCCTGGCAAGTTATAACCCAATGTTGAAAGTAAAGGCAAAGATGTCTACAATCATCAAGAGAAAACAGTGCATTACTTATTGAGGAATAATAATTTGAATGTCTATGAATTTCTCATCAAAAACAGAGGGGGCTGGAGAGGTGCGAGCCCAACAATCAGAGCAGCTACAGCGCTTGCACAGAACCAGGTTCCGTTCCCAACATCCAGGTTGGCAGGCTCGTCCACCTGTAACTCAAGCTCCAACCCGGTGCCCCTTTTGAGCTTCTGCTAGCACCCACAAACACCTGCTCATAGCCCCCACATACACACAATTAAAATACAATGAAAATATTTGTTAAAAACTCATAAAGGGAATCAATAATTTTAGACTGTTAAGAAAAGAACTGTCATTCCAGAGTCTTGTATCAAGAACAAAGGGGAAAGGAAAGGGCGCTCAGATGAAGACTAAACGTGTTTGCTGGCAGGAGCCTCGTTGTAAGAGAGTTGGCCAAAGACTATACTTTCAGGGATCGTTTCATACAAGAGTTGGCCACTGCAGGGTCATTGCACTAGAAAGAACCTTGGAACACAGGAAGAAAGAGGAATAGAAATGGTAGACATATGGGCAGAAGGCATAATTCAGATAGGCAGTTAGTTCTCAGTGGGTTCTTTAAAAATGTGTTAGGTTAATGGTAAAGGTTAGTATTGCTTGGGTCTTTAACTGTATATAGAAGTAACATATTAGACAATCATGTACCAGGGAAAGGCAGTGGGTTCCTACTTGAAGTCATAAAATACTGATTCTAATCAGGTCATGGAAAATTGCACGTATCATTCAGCTCCTAGGCCAATCAGTGAACTCTGCAGAAAGATGACCAAAAGCATGATAGAGAGATTAAGATGGAATTACAAAATTCAGAAAACTCAAAATGAAGACAGAAAAGAGGAAACGGGAAAGAACAAATGACAAGTAAGGCGGTACTTAAACTTAGACAGACCATATCATGTTAGGTACAGATGGCCCCAACACCAGTGTTGTTAAAGAGGCTTGAAAAAAAATAACCCAATTCTGTTTTCTACATGGAACTTTTCAAATACAGAACATGTAAGAGAACACATGTTAGGATAGGACAGGAAGAGATAGGGCTGATGGTGTAGTTTAGTGGTAGTTTGTGCTTGGTGTGCATGGAGCCCTGGGTTCAGTCTTCAGCACTTCCCTTAAGGTAGATATTAATGTCATAAAAAGTAAGAACTGGCCGGGCAGTGGGTGCATGCCTTTGATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAACCAAACCAAAACAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAGAAAAAGTAAGGACTGGGTTTCAAAGCCAGTTTCCAGAGATAAAATGGGCTCTTGCCTGATGAAGACCAGATAGCTCGGAAGGCTTTCTCTGCACTAGTGACTGTAGCAAATCCAAGCAGAGATGCAGAAAACTGGACCTGTTAACTTCACAAATGGAGAGTCAATGCCACTCTGCTCTGAGACACATGAGAAGAACCAGCTGCAGACAGAGCAAGCCAGGACCTGGAGGCGCTGAATGACCTGTGGAGACATTCCACCCTTCAGTGGTCGCCAATCCAAGTGCTTGTGGAGCACTCCCCAGGCAGATCATGTGTGGGACATAAAAGAAACTTTCAGTGGAAAAAGGACTGAAGTAAAATATGTTACTCATCACAGAGAAACAAAGCAGTAACAAATATTAAGAACTTCTCCCTAAATGTGGATGTTAAATAAGTAGCAAACTACTGAGCAAGCCACAGGAAACTCAGAAAATATTTTGACACAGTAAAAATACAACATACCAAAGCATGGAAGATGCAGGTTGGGTAGGAAATATATAACATTCAAGTGAAAGAAGGAAGGTCTCACATCAGTAAGCCGGGTTTCTATCTTAAGACTCTAAAAAGCAGAAGGAAACAAATGATACAAAGACATATGAATGAAATTAGAACTAGAAAGGGGAGTGTGTGAGAGCAGACTGGGCTCTTTGAATGTCCCCGTCCTGATCCACCTTAGCGGAACTGCCAAGGAAGAGAAACAACTCTTCTCTTCTCTTTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTTCTATTTTTAAAAAAAGATTTATCAATGTATATGAGTGCACTGTAGCTGACTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATTGGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAAGACCTTTGGAAGAACAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTTGCCAGCCCCAGAAACACATTTTCAATGAAAGGGATGAGCAAAGGGGGTAGCACCTGGATCCTGTAGAACTGAGAGGGGAAATGGAATTCTTTGAATAACTCTCTACAGGAACTTATCATGTCAGATGAAATAGTCTTATTTCTTTGGCAATTAGAAATCACCAAAACTCGTCCAAGATATAAGATTTATCCTGCACTTTTTATGTTAAGACAGGAACATTACAGTTCAGTACTGTGGTGGTTTGAATGTGCAATATCCCCATGGGCTCACATGTTTGAAGACTTGGACACAGCTGCTGAGCTGTTTGGGAAGGTTGTGGAACCTTGAGGAGGAAGTGGATCCCCAGGTGGGCCTTGGGGTGCTGGGGTTCCATTTCACACTCACTCAGTGCTTCCTGTGTGTCAGTGCAGTGTCATTAGCTGGTCGTCTGCTCTTGTTCCGTGCTTTCCCCACCATGGTGGCCTCCATCCCTCTGCAACTGAGTCACAACAAACCCTTTCTCCTTATGTCGCTTTTGTCAGGGTATTTGACCACGGCAAGGAGAAAGATAAGACAGATACTGTCCAGGCCCACATGGTTTCACTGATAGTGTGTTGTTTTAAAACACTGCCAAATTTAGGAGGAAGAAGACATTTCCCAACTGCTCCTTGATGCTCCGGACACTGACCCCAGCCCAGTGTCCACGATCCTCAGATCTCACTATTAGCAGAGTGAACCCCAGACACTTGTTCAAGCCAACACTGAGGACTAGGTCATGTTTATCCTAGGAATCAAGGAGGGTGTGATGTGTGAAAACAACCACTGTCATCAGTTGTGTTATGACCTAAAGAAAACCACGTGGTCCTGTTGAGGCAGAAACAGTATTTGACAAAATCCAGTATTCATTTCTGATAAAAACTCAGCAAAGTAGAAACAAAACTTTTCACTTGGTAGAGGATGTTACAAAGACAGGCACAGCAACTGAGAAGGACCAGGTCCATGGTGAGGTTTCTTACAGTATGAAACCTAGAGAGTTGGGTCTTAGTGTCATGTGGGAGATTTGTTTCAGAACCTTCCATGGATCTTCAAATCCTCGGATACTATAGTCCTTTTTGTAAAATGGTACTTAACACCACCATGTACTTAAACTATTTCTACATTTCTTACATTTCCTAATACAGTGTAACACTGTGTAAGAAGCATTGTGTTGTTTGGAGAGTTATGGCGTGGTCAGTCCAGGCATCTTGGCTTTCTGATACTTTTCTTTCTTGAGGGATGGTTTGATCTACAGTTGGCTGAATCTGAATGCAGATTCTGCAGACCACCTGTTGTTAATGAAGAAGCTAACATCCGTGCTGGTACATACTGGTGATACAGAGTCTCTCAGTGCAGACTGTCTCCTGGCTAGTGATCACATTTGGGCTGAATACGTATTCTTGGCTATGAATGTGGGTGGACCACCTCCGCCCAGTGCGCCCCAGCATATATTTTCCCTTCCCTGTTCAGGCTTCTCTGGCTTGCTTTCTGTTGCCCTAAGCCTTTGCTTGTGCCCTTCCTTCAGTGTGGTTTTGAAAGGTGGTCACAGCTCAGGCGTGTCTTCTCAGGTTCCCCTTGACCATCTAGTCTAAAGGGAGTTTATCAGGCTTCAGGGACTATTCAAAAATAGTCCCTGTACAGTGTCTTTCTCCTTCCTTCCTCCCTTCCTCCCTCTCTTCCTTTCCTTAAAGATTTATTTATCTGTTTATTTTATATGAGTACTGACTTCAGACACACCAGAAGAGGGTATTGGATCACATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTAGGAATTGAACTCAGGACCTTTGGGAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCACGGCGTTTTCTAAATTGGGATTCCTTGTCCATTTGTTTGTGGCTTTACCATGTGTCTCTCAAGCAGCACCAGCTTGTGTTCAGGAGAGCAAGGGTCAGACTACATTTGCTAGTTAATGGCTTAGGAGGATGCTCAGCTTTAGTATGTGGTTAAGACCAGTTCAACTTTTTGAAAACATATATTTCTCTATAGTTTTATATATTGTTGCATAATTTCATTTTTTACATAGTGGCCTTTGGAGTTGCTGTTTAATAATTTACTGACCAGCACCCTAGATTAGACATTGAAGTTTTTCTTACAACTGTCATTTGGTTCTTATGGTATTCAGTATCCCATGAGGCTCTTGAAGCTTTGATCTGCTAGGAAGTGAACAGTGAGTCAGTCTTGTTTCCCTGACTTCAATGGGTAGAGATATCAGTGTTACAGATGCACAAACTGAGCAGATAGACCAAACACACTAACGGGGGAGGCATGAAGCCTGGGAATGCAGGATTCTATGCCAGTGTTTGATGGAGAAAAACGCTGAAAGATATACTTGGTCCTTTATGTTTCCCATGTTAGTAGAAGTCACCCTGCTCACTATCTCCTGGTATAACATGTAGTCAATTTATAAATGATATTCAGTTCTAAAATACGGTATAAAAATCACATGAGCCAGCACTGTTTTAGGGCATGTTTATAGTCATCTTGGATTTAACGTGAGTGAATCTGAGGACTCAGTTCTGGCCCCAGTTGGCTAACTTGTAAAGTGTTGGGTGGGCACTAAGCTTTGAAAGTCTGAGTGATGGTAGCGGATGGACAGGCTAAGGGGAACTTGCTCTCGTCACTGAGAACTGTTCTTCACCAGTGCTTAACCCGAAGGCTAGTCCACAGCATTCTTTCCAGAATGATGCTTTTAGCTGCCCTCCTGGAGACTGCAGTAGGGGGTGTCCTTTCCCGCCTCCGTTTTCTGTCCCTTCTTCTAGCACTGACGTAGCCATTGCCTGCTTGCTTGTCTGAGTGACTTAGGGCGAGGGCCTTGTTCTGCTTCATTGTGTACTTGCTAGATGACAGGCAGGAGAGCGGATGGATGGCTTCTTGTGACGGCACACTGACTCCACAAGCGCTGTGTGCCTCTGCCACGTGCTCACTGGACCCTCACCAGCTCAGTGAGAGAAGGTGAGTCTGTTGCGCATGGGATGACAAGTTGTCCATGCCACTGAAACCAGGCTTCGGGACCGTGCTGAGTCCCGCACGGGGTATTTCTGTAAGGGTGCACATGTTACCCAGCCTCCTCTCTCCTCTTTACTATCAGGAGCAGCCGTGACGTCTGCAACTTCTTTCAAAGGGTAAATGTTTTAAAAATAAGGTGAATACTGTAACATTTTTACTTTATACTCTGGGTAGAGCATGTGTATGTGTTCATTTTTTGAGCATTTGCACAGATTTGAAAAATCACACCCTCCCCTTTAAAGTAGTGAAATTGATCCCGGTGCCTTCCACACTGGGCATGCATGCTCCCCGTGGACTCCATGCTATCTACTCACTGTAAATGCACAGTAGTTCCTAATGTACAGTTACCCACCTGCCATTGTATGCAGTCTTGGGATATCTCTGTCATCAAATGTTTGCAGCCTGTCCCCATCCCTTCTCCAGACAAATAACCAGCTATATATTTGCCTTCTGACGAGATTTTATATAAGTGGCTCCACCCTGGCTGGCTTCCTGGCAGCTTTTGCTTCCACAGTGTTTCTGAGGCACACTGACCGGCAGCGCCGATGTGTGAGTAGTTTCCTCTTGTCACTGGTTCAGGGCTGATCATGTATTCCTCAGCTGGTGGACATTTGGATCGTCTTAGTGTTTGATTGGTACACAAATGCTGTCAAGTTTTGCGTGCGGAGCTTTTTATAGGTGGTTTTTTTTTTTTGGAGAGCTGCTCAGGTGTGTGGTTGGTGTATGTTGAAGTGTTAAGAAACTTGCTTCCAAAGTGGCCCTCTTGTTTTGTATTGCCCCAGAGAGGCCCAGCTTTTTTGCATGGGAGCCACTGTGGGCTATGCCAGTGTCTCCTGCTTTGTGAGGAGGTTCCTGTTGGAGAATGAATAATTAAGTTCTGAGTTGTCAGAAAACCAGTGGTGGGTGAGGTGCCTTGTAACTCCTACTCTGTGTGTCCGTGCGTGAGTGTGTGTGTGTCCAGGAAGGAAAGAGAACTATGTGGCGTTCTTGCTGACTTTGTTCCAGTGCTCTGGACTAGCCTACTCACTAGAAATAATTTTGGCCCTTAATACAGATTTGTGAAAATTTTTCTAAGGTGTAATTTACACTGGAGCCCTCTGACCTAAAGTTAATAGTTTTAATGAATGCATGTTCAGATAATGTCCAGTCACTCTGCAAAGTGTCAGGTGACCCTCCAGGTAACTTTCCAGAAGGAGGCTCTATCAGTATGTACTTTATGCTTATAACCGGCCAGCTTCTGAGAAGTGCTAAGTATATTTATGGAGTTTCTTTTGCTGACACATATTTCTTGCTTTTTTTTTTTTCCTATAATCTTACAATGTAGAACTTAGGCCTTTCTCTTCAGCATGCTGTCTTTTGCTAGCTCCCTTCTCTGTAGTTAGCACCCCCAAGGTTTCTCTGTGGAGCTGGGAGCTACACAATTGGCAGGGAGGCCTCTGAGCCTTGACTCAGCCAGCCCCGCCCCGTCTGTTGTGGAGGAGGTCCTTGACAGCTCGCCCAGCCCAACCTAGGAACACTGAGCAGGGATCCGGGAATCGCTGCATCTGTGAGCGATTGAGTGTCCTGCCGTTCCGGCCACCAGCCCGCCTCACCCGCCCAGTGTGGAGCTGCGTGTAGATCCGTGGTCCAGAGGCAGGAGCGAGGCTGGCCTCCACTCACTGGGCATGGAGCCGCCGGCCACGCGCCTCTGAGGCCTGGCGTTCATGGTGAGTCTTATGCGGGTCTGCCATCCCAGCTTGGCCTCCGCTAGTGTCTCGGCCTGCCCTTCCAGGCCTGCTTGGTCCTGTGCGGGGTACGTGCGGCTGTGTGCATGTGAGCCCGAGTGCAGGTGAGCGCACATCACATGCATCTGTGTTACCCACTAGCAGGAGCTTGCCGGGGACACCAGTGAGGCACCTCCTCCCCAAGGCCTGCCTTCTTTGTGTCTGCTGCTCGCAGGATTTTCTTTCAGGGTAAATTGTCCAGAGACCTCACTCTTCAACCCCATTCTTATTCCAAGAGCCACCGCTCCTTTTCCAGAGTCAGGTCAGTTTAGGCCAGGGGCCACCTAGAGATAGGATGGTCTTATTGAGGAGTCTGGAGGACAGGAGACTCAGGACAGACAGGAGCTGGGTTTCTCAGAGCCCAGTGCAGTTTTGGTACATTTCAGTTTCCCGTGCCTGTGTTAACTTTTGTGTTCTTGATGTTTGTAAGTAATTTGACCACCAGAGAAGGTCTCCTGAGAGCGGCTGTGCCCGGTGCCAGCATTCCCGGGAACTTAGAGAATGCTTTCTGGGAGGAGGGACTTTCCCGGTGTTCAGAGCCTTTACCTACTTGCCCTGGCCAGGTGGCCAAGGCTCTGTCACCATCACTGTCTTCTGGAAAGCTGAGCACCTGTAAAACCTGAGTGGGTCCCTCCCTCTTCAGATGGCAATACAGCTCCATGTCCTACAACAGCAGTCTTCTCTCAAACACTGCTTGTTACAGACAGCGAGGAGTAAAACCAGCCTGCCATGCCACGCGAGTCTCCTTTGTCTTTCTTACAACCCTTTTCGGAGAAATGTTGCAGGAAGTGATTTTATAGTAAAAGTGACAGCCATACGCCTGACGTTTCTGGCCTCTCCTTTGGGTACATGTCTCATATGCCTACTTGTTCTTGTTTAATCTTCCCCTTAACAGACAAAGGAGCCGGTATGGAGGGGAAGACAGTACTCAGGGAGGTAGTCCTCCGGGATGGCCCATCCTGCAGCTCCTCCGTGCTCCCTGCCGTGCTGTTGGCAGACTCGCCCTGTGCTGTCTCTTAAGTTAGTTTATGCTAGCCCAAGTACCCCATGGGATAGCCTATTCCAGACATAGGTCCTGAAGCCTGGACTTTATCAGCAGACAGATCCTGCTGCTGTAGATGGCTGAGTCAGATGTGAGCACAGGCCTGATTGATGTCCTGTCTTCTCGGTGGACTAATTGAGGAAGCTAGTGGGGGTCTGATCAGATTATCGACATTCTTGCCTATCTCTTTAGTTCTCTGGATAGTATTGATAGATAGCCATCTCTCTTCTCTTCCTCCTGGGAAACATTCTTCTATTGCTTCAGATCCAATCTTCTCTCCCTTTTAATACAAATCTGTCTGTTGCTGTGTGTGTGTGTTTGTGTATACATATGCACTCTCACACACACAAGACATGCACATGTATGTGTTCTGTCTCTTTTTTAAAACAAATCCCGTTGCCTGCTGACTTTTGTTTTCTGGTTCCTAGCCTTAGGCAGTGTGCAGATAAGATTTAACCATGTTTACACTCTCCTCCTCTTCTTTGGATTGTTCCACCAGCTGTGGGGAGCTGTGTGTTGAGACCATCGTGGCCAGGCAGAACAATTTTGACTCAGTATCAACTGTTTAAAATGCTCTTGCTAACCCATTGACCAGGGTCTGTGTCTGAAGTAGGCCATTCCATGAAGGGGAGACTTGGGCTAGCATAAACTAATGGAGGAAACAGCATGGGGTAGGTCTGCCATGATCAGCAGTGTCCAGGGAGGGCCATCCCCACCAGCACTGTGTGCACTTTGGTTATTGCTTGTCAGAAGGTTTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCCCTCCCCCTCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCCCTCTCTCCCTGCCTCTGGCATAAACCTTATCTATCTCTGCTTAAACAGCACAGGTACCGAGATGCTGTTTCTTGTTCCTTCTGGCCCTTTACTTGTTGTTTCTCACCTCTCTGCATCTCTCATGGTCTGCACTGTGCAGTAGCTTGTGCCTGTACTTACTTTCCCTGTACAGGGGCCCCTGCAAGGCTGTGGGTGAGGGTCTCATCCTCATGGTCTCTTCACGGATGAGCTTCTCCTTTTGTGTGGTCTTCTTCCCATTTTCCCTGTTAAATTTGCTTTGCTCATAGGCCCCGCCTGAGCTAAGGCCTTGCTCAGGCTTCTTGATGCTGCTTCTCTGAATTTGCTCATTCATCAGACTGCACCCTACAGATTCTCCCACGGTTAGCAGCTGCATTGGCCAGGTCCCATCCTTACTGGGATTTATTACCAAATGCTCAGGTCAGAAAGTTCATCCAGGTACTTCCAAACCAGGGGCTTGTAGCGTTTTTAAGTCTTTGATAACCAATTAAACTGACCTGCAGTAGGACTTTGAAGAACACTGTTCTAAATTGCTCTCTACTGGGATGATCAGGGTGGGCGAGGCCACAGCTGATTGTATGGGCAGTTTATTTTACTCATTGATCTCCAGGGCTTTTGATGAGCCCAGTGGTATAGAGAAGCATTGCTCAGCTTAAGGCCGAGAGACTCCCTAGCTTGTTTCCACGCTGTGACGTTCGATGGACAGATCCCAGAGATTTTACCTATTGGACAGAAAGCACTCAGCTCATCAGAAGACAGGCCGTCATTACAGTATACTACCCTGTTTAAGTCTCACAGTGGTCTGTCTTACCAGTAGTCCCTTCTGTTTATAATGATGGAGTGGAAGCAGGAGACAGTCCAGACTTGCCTAAGGTAAAGGCAGGGCTTAGATCTTGGTCATTTGAGGCTTTGCTCCTGCTGCATTGTGTATGGCCCTAGTCAGCACCAGTCAGGAGTGAGCATTCTTTCTCAGGCCTTAGAGTGAGCATTGTCCTCCTGTATCTGGAGCTGGTTTGTCTGGCTGCACAGAGAGCCTACTGTGGCCATCTCTGGGGGCTGTAGAAAAAGAACTCGGTTTGGGGCAGGACTTGTGATCATGCCAGCACCGCTCTGTTTGTACCAAACAGGTGCCGTATGAGTTTTTAAAATTGATTTATATTTTTATTTTATGTACATTAGTATTTTCCCCACATGTATGCCTGTGGGGACCTTCTCTCCAGGCCTCCATTTGGGTTTTTCAAAGACTCTACCTGGGATTTCAAGTTTTGGCAGGCCATGCTCTGTCATTAAAGCATGTGTCACTATGTGATGACCCTTGCCATTTGACCCCATTTGGCATGAACTGACTCAGGATTACAGGTTGTCAAGGTTGGAAGCTTTGTTGAGGCTGAAGGCAATGAGATTGCTTCCTATGGAGGCCTCCCTGTGAGCAGCTCACTGAGTTGGTGGGAAATGTCCCTAACGAACCCAGTGTTTAGAGTCTGATCAATTTCCCCATTCTCTGAAGAGCAAATCTGAGGGCCTCCAATATCCATTAGGATTGGGGTGGTGGTGGTGGCATCTTTTGCCTCCTGGGCTTTGTGTGCAGATTAAATCAACTCTGCTTGGGAGGCCCCTGGAATGTTCTTGGTACATCAACCTGATCAGCTGCCACTGCCACTGCTGTTACTTGAGTTAGTAACAAGTGCCTATTAACAAGACCTGATGCTTTGGCTTCTAATCAAGGCATTCCCTTCATTTTGCTTCTGTGTCCCATATCTTCGACTTGCAAACTTTGCTGGACTCTCTGATCCACGGTATTTTGAACTGCAGTGTTTCCCCTTGCATTCCACAGTCATTTCAGGTCTGAGGGAAAATGGAATGGTGCGTGCAACCCTGTCCCCATGCTGTAGGGCTGTACTTGCTGACTGACTGAAGTATGCGTGTCTCCCTGTTGCTGGCAGCAGCCTGTTCAGATAGTGCTTGTATCCACCTAGTGGCTGTGGGACCAGGCCACAGCCTGGAGAGTTCTGTGAGCATTCTTTGCCTGGATTTTAGCTGCTGGCTAGTGGGCCAATGTTTTCTTCAAGTTTCACCTCTGTAACCCGTGGAGGACTTGGTGTTTTCACTCCCAAACTACACATTTGCTTGAGTATAATCGCCAAGGAGGCCAGACCTCCTTAGGGTGGCAGTGCAGAGGGCCTGCAACCCCAACCCTGCACTTTGAACTTGTGTCCTGTCTATAAGGTGGGTGACATACTGATTGTTCAGGAGATCAGGTCAGACAGTGTCTGGAGCCACAGCAAATGGGAAGAAGCATCCAGACTCTGGCCTCTGACTTGTGGTGGGAGATTACGGGCCTTAGCATAATGGCACTAGATCAGGCTCAGCAGATAGGTAGCACCCAATGGGATGATTGCCAGATGCCACTTGAATTATAATCCCTGTCAACACAGAGCCTTGGGTAGATTTCTTGTAGAGCTGAAGATGTTGATACCTACTTACTGGACTTGGAACATCCTGCTGCTAGCACTGGGCTGTCACCACTCAGCCGTGTACCAGGTCCATGAGCAGCATCAGTCTCTCAGCTCTGGGTAGTTAGGTAACTGGAAAGGATTTCCCTCTCCAGTGGGATCTGCTCAGGGTAGGCAAGGTAGAAGCCTAACCCTGGGCACCCAGTGCTCTTGTACTTTAGAGAAGCTGTAGCTGTCTTTTCTGGGTGAGAGAAAATTGCTTGTGAAATAGCTCTTCTAGCTAGTGTCAATAAATCCTTTTCACGGGATCTTGTGGCTCTTGTCATCCAGAATGGCATGAATCTGTGGCAACTCCACATTTTCTTCCCAACCGGATCATCTCCCTTAGAGATGCTTCTCACCTGTGATAGACAGCCAGAGAAGAACAGGTTTTGATTTTGCAGGGAGCCCAAATCATGCATTATTCCAGAAGCTGACTCTCCTGAACCCTTCTACTGGGTGTTTGGAATCTGGGTCACTAGGTGTGACTAAGCTGCTATGGCTACAGTCCGTGGATCTAATTAGTGACTCAGTGGGTTTGGAGGTCACTTATAGATTCCCAGGGCATGAGAGAATTATTGACAGGACGTTGTGCAGTGATGGCATAGCAATGGCCATCACAAAAGCCATTCATCTCTTACCAAGAAGTACCACACTATGTGGCAATTGTGGTTCAGGGTCTGCTGACCCTTGTAACTTTGTAACCACCACAGGGAAGTGTGTGGATCTGACCTAAGGCATCACCACAGCAGGGAGCTCTTGGAACCCTTCTTCTGCCCAAGGCTTTCCTTCTGAACAGCAGAGAAGACTTGAAGTGCACTCACCCTTACAATGAACTCAGCTACAAGTAGCTCCTTTTTTGATGATACAAAACTGGTTGGGCCCAGAGACACCTGATGTCTTTGTTCTAG
Seq C2 exon
GAATATGAAGACAAGGCTGGAAGACCGAGCAGGCCACCCTCTCCCAAGCAGAATGTGAGGAAGAACCTGGATTTTGAGCCACTGTCCACCACGGCGCTCATCCTCGAGGACAGACCTGC
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000029192-Tbc1d14:NM_133910:3
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.268 A=NA C2=0.712
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF085986=Sds3=PU(27.8=62.5)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: