HsaINT0008159 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000151150 | ANK3
Description
ankyrin 3, node of Ranvier (ankyrin G) [Source:HGNC Symbol;Acc:494]
Coordinates
chr10:61898722-61926411:-
Coord C1 exon
chr10:61926349-61926411
Coord A exon
chr10:61898846-61926348
Coord C2 exon
chr10:61898722-61898845
Length
27503 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATTT
5' ss Score
7.64
3' ss Seq
CTTACTCTCTACATCTGCAGGTG
3' ss Score
10.58
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000151150-ANK3:NM_020987:23
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.913 A=NA C2=0.458
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA

Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
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F:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
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AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
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DEU primates (Only for human)