HsaINT0026590 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000182389 | CACNB4
Description
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1404]
Coordinates
chr2:151841903-151853543:-
Coord C1 exon
chr2:151853448-151853543
Coord A exon
chr2:151842089-151853447
Coord C2 exon
chr2:151841903-151842088
Length
11359 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCAGTAAGT
5' ss Score
9.09
3' ss Seq
GATTTTCTTGTCATCTACAGGAA
3' ss Score
10.41
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTTTACAGCGGTTGATTAAATCTAGAGGAAAGTCACAAAGTAAACACTTGAATGTTCAACTGGTGGCAGCTGATAAACTTGCACAATGCCCCCCA
Seq A exon
GTAAGTATGATCATTTTTTGTCTTCATCATTCTTGACTAGTTAGAAGAGGGTGGGTTTTTTTTTCTTCATATTGTTGTTTTCATTCTAAAATGATGGTGATGATGGTATGTTGTCATCTAAAAGATTTCTTGGAACAAACTGCTGCTGTTATGTTGCTTGTATTCAGGCATCCAGATGTGGATGGTGTTTGCCTTGTAATAAGAAATGAACTTAGTGTCCGGGGTCTGTTCTTCTCACTGCTACCTTGTTTGCTTTGCAAACATGCAGCAAACCACTTAGCATTCAGCCTCCAGTCACATGGATACGCTTAAGAAAAGAACAAAAGAAAACATACCAATTTGATCTTCCTTTAACTCTTCTGCAAGAAAATTCCAGCAGGCATAAAAGATTATGACACTGAAGGTCAAGAATTGATTGGAACTAGAGAGGCCCTGTGGTTATAGTAGATGAAAGAGTCAGGGCTGAGTCAGATGAAAAACGAAATTATAGCAACTCTTCTTCTAGTGCCATTGCCAGAAAACAGCTGCTGGGTTAGAAGGTGAGCAATGGTGGGATGGGGTGGGAGATGGAACTGCTATCACATGGCACTGGGTCCCCAGTGGCCAGTCTCTCCACTTTTCCCACTGACTTACTATTTCTGTGCCTATGTTTCTGTAAAGGAAATAACTGTCCTTCTTACTCAATGGATTCACTAGATTGTTTTATACACTTGTGTAGGATTGTTTAAGCTCTATGGAAGCATGAAATCTGATTCAAATGTTTAGAGAGGGCAACACAGCATAACCTGTAAAAGCACAGACTCTGGAGCCAGATATTTGGGTTTTGAATCCACACTGACTAGTTATGTAATCTTGGGCAAGTACCTATCTCATGGGATTGGTGTAAGGATTGAGTGAGTGAATATGTGGTAAAGCTGTTAGAACAGCGCCAGGAACATAAGAAGCACCGTCTAAGTTTTCTTATTATAATTACTGGATACACTTTGTGTGACGTCATGTCTGGTCCAGTAGACTCTGTAAGAACCCGTGCCCCTCTGGCTCACTGTTGTATGTCAGTTCCCTATCATAGTAGACCCATAATATATATTTGTGGAATGAGTGAATAAATGAAAGGATGTTCAGACGATAAGAGTAATAATGCATCCTTTCATTAGATGCTTACAGTTGGCCACACAGTGTGCTAGATGCTTTACATAGATTATCTCTAATCTTCACAGTTACCTGGTGAGATAGGCCATATTATCTCCATTTTATAGTTTAGGCAACTGAAAACAGAGACATTAAACGATTTCCCTAAGGTGACATAGCAAATTAGGATTCAATCTATTCTAGATCTATCTGGCTCCAAAGACAATTTCCTACCCCCTAACCCATCCACCCATACACACATGTACCTGGTTACCTACCCTGAAGATAATTTGATAGCTTGGAGCATGGCGTGCTCTGTTAAGTTTCACTTCACGCTGCCTGTTAGTGAAGCCCAATTACACAGTGGAATGTATGATTAAGGCACTGAACAGACAGAGGAATGTATTGCCCAGCCCTGACCTTCTAATGTTTCACAGTTGAAGGAAGATAATCTTTGTTGTCTAGCTATCAAAAGCCGGGAACTATGTTATTATTTCCAATTTTTGGAACAATCTTATAAGGATAGTTATATCAGTTTGGTCTTCTGGGAAGCAGACACCTAAATGGAATTACAAATGCAAGAGATTTATTGGAGAAATTTTATCTTTATGAAAATAAGTTTATTAACATTTATTCTAATAATTACTAGAGAAAATTCTTGTGTCCTATTAAATTTGAGGGATTTTAGCTGCTGAGAGGGTTGATCATTGAGTAGTTGTACATATAATATGGTTTGTTACATCTGAAATAGCTGGAATCAAGAAAAGATATTTGCATCTGTAAAAGCAACTAATATACTGAGCTACCTTAGGACTTGTACCCAGGTCAGAGATTTCAAACAGCTCCATGACTGGAAAGACAGCCTTGCCTTACCATTATCTCAGTAGGATAAACACTTTATCTTTTTATATAATTGGTAAGATAACCTGGAATTTTAAACAGGCAGTCTGGATGGATAAGGTTACCTTGTACTTAGCATTTTCTAAACACTGTTTACTTTATTAAACATGTTCAATTGATACTGCACAGATGTAGTAATGCTGAGGAGGAATAGTATCCTCTATTTTGGCATGTGTGAAGAAATCTTTGGATTATAAAAACCAGTAGTAACCTTAAAATGTGTCTGCATTTGCCCCTGCTTTACTTCAAGACCATAATTATAATTGTCATCCAAAGATTGGTGATCACTGTGTCATTTTAATTCCTTTAGGAGAATTTGCGACTTACTTAATTGGCCACCATATCTCCAGTATGAAAAGTCAGCAAATTACATTGGCAGAGTATCACATTGCTAAGAAATGAAAGGCAACAGTTTTTGGAAAGGGAAGCCTATAGGAGCTCTGAAAAAAGTTAACGCTGTAGCCAGAATTAATCCTAGATCCAGGGACTGTTGAAGCAAAAGGGGACCTTAAAGAGCACCCAATATAGTATTTCCTAGACTATATTATTTATAATATGGGTCCTATGTGATATCAGTAAGTGTTATGGGAAAATAATCCTGATACCAAAAATGTTTGAGAAAACACTTAGGTGAACAAAGGTAGTCTGGTTTCTTTACTACAGAACCCTGAATATGCCAATGTGTATTTTATATCTCCAATAGGACAAATAGTGTGCACAGCTTCCCCTAAAATTGTGACTGCAGATCTGCTTTTCCATTGAGCATCCTATGGGTCCAGTGGAACATGTCTAGGGAAAGACTTAGTCCAATCTCCTCATTTTACAAATGATGGAACTGAGACCAAGAGAACTGGCTTTTCAAAGGTTGTATGCCTGGGCCAAAGTCAGCTTAAGATCTCTTTCTCCTAGTCTAGCAAGACTAGATGATGAATGGCAACAGGTCAGTTATATATTCTCCTGGAAAGAAAAGTATGGGTTTTGGCCAGGTGCAGTAGCTCATGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAATCCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGTTGAGGCAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAAGAAAAGATAAGTATGTATTTCATGGGTAAGGATTTTTCTAGGAGAGAGATCGGTGAACTTTTTAAGTAAAGGGCCAGATAGTAATATCTTAGGCTTTGTGGGCTATATAGACTCCTTTGCAAAACTACTCATCTCTGCTCTCGAGCAGGAAAGCAAACATAGACAGTGTGTAAACAAATGGGTGTAGCTGTGTTCCAATCAAACTTCGTAGAGGCATGAGACAGGCCTGATTTAGCTGGCAAACTGAACTTGCCCCCTTGTTCTGGGACCAAGCTATGGTTATCTATTACTCTGCAATAAAATAATCCCCAAAACTCAGTCACTTCAAACAATGGCCACTTGTAGTATTCAGCTGGCGGCTGACCTGGTACCTTAGCAGAAATGGCTGAAGGCTGGGCTCAGCCAGCTCTTTTTGAATACAGGCTCTTACGTGGCAGCTCCCAGGCTCCATGAGCAAAGATTCCAATCTTTTACAGCCTGGGCATAGATACCAGACCACATCATTTCCACAGCATTCTGTTTATCAAAATACTCACAAAGAGCTGGGTGCATGGTGAGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGTTGAAACAGGAAGGTGGCTTGAGCCTAGGAGTTCAAGGCTGCACTGAGCTGTGATTGTGCCACTGCCCTTTAACCTGGGAGACATACTGAGACCTTGTCTCTAAAAGGAAATTTTTAAAAATTAGCTGGGCATAGTCCTAGCTCCTTGGTAGGCTGAGGTGAGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGTTTGGAGCTGCAGTGAGCCAGGATTATGCCACTGCACTCTACCCGACAGAGTGAGACATTGTCTCTTAAAAGAAAAAAAAATCACAGAGGCTGCCTAAATTCAAGGAGAGGGGATATAACTCTTCATCTCCATGAGGGAATGTCAAGGAATTTGTGACCATTTAAAATCTGTCATAGACAGTAAGATGAGTGGGGAAAATGGGCTACTGGATAGTTCTACTTTGGAAGAGGAAGGACTTTCCTCTCGTTGCCCATTCGGAATTCACAGAAGAAAAGATGGGATGCAGACAAAAGGGGACCTAGGGGAACAGGACCTGCAAACCCATCTCATTTTTTTTTTAATATGACCAGCCTGATTTTGTATTGCCATTATACATCTATACACTACATTTTTTTATTTCTTTTTGCTTCTACCAAGTATTGATATTCTTTTTCTCTTCAGATAAGTTGAAAATAGTATGTTTTTTAAGAAGGCCAAGTGTAAACTTCCCCAGTACTATGGTAATAAGAAGAAAAGCTGAGAGACAGACAATTGAACATATAAATGAAATGTAATCCTTTAATCCTACTTAGTTACAATCTGGCTTGTGTTACCCAAAGCTGACCCTGTGGCTGTTTGAGCTGTGTAATGTTTTTTTGTGTGTAAAATGACATTGATCACTCCTTCTGGGAGAGGGGAACTCATCTCCTCAGTAGAGTCTTGCAAACCTCTAATGTTACAGTAACCATGGTCACTCTGTTCTGTCGCCCTTTATTTTCCACTGCTGAATGGACTCAGATTTATCCTATGAAACACAAGAATTCTGGAGCGAATGATAGTGCCCAGTTATCCTTGATCATATTGCTCTCACAGTAGTAATTTTCCACTGCCCTCTTCCAGTCATTTTATTTGAATTATTTAGAATCGTGTGGATTTACCTGTCTATTTGAAGTGCTCTCCTCATTGGTGCATTCATTATTCACAGCCCCTGGATGTCCACAGTTTAATTCCTAACATTGCTTTTGAAAAGGGGGGTAATCAATTTCAGATGTTTGCTTCATGAAATAAGACCACATGGGATCCAATTTCTCTCAGCCCAAAGGGGACTACACCTTTTCCAGGGATTTCAGCCACTGGACTTGGGTATATCGAGTTAGGGGTAGTTCATTCCCACCAATGCTATGATCTAGCACATCCAATTAATCTGACTTTAACAGAAGCATGGGATACCTTTTCTGTAGGCACTAATGTTGGTAGATGGTATTATCTTTGAAGAATACGAATGGACAGATGGAGGGGCGTGGGGAGGAAAACATGTTTGGGTTCACATCAAGTGTCACAAATTATCAAGAGAGAGGAAGTCAAAAGAATCAAAGTTATATATTTTTTGCCCTCATTTTAACCTCACCAATTACTGGCAAGAATTATGATTATCTTTCCTGTTTAGCTCATTAAAGTGGAAACTACCTGGAACTAACTGCTAGAGCCCAGTAATATTGTCACCCCGGTTGGAGTGCAGTGGCGCGATCGGAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTAAAAGAGATTTTTGTATTTTTTAAAAGAGATGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGACCTGCACACCTTGTTCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCATCATAGATCTTTTAAAAGCCCTTCAACTTAGAGTCTAATTTCCCATCATTAGTTGACCAGTGAGTTAAATACTCAGAATCTCAAAAGCTTTAATAATGTAAAGAATGGAGTTTTGATATGAAAGAACCATTGGGTTGATTATTTTTATAATTAGCATTACATGTTGTACCATTCAGCCGTTTGATTTTACTGAACAGTACTTGCCAGTCTTTTTTTGTGCATGGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTTGTTCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCATGACCTCCCCAGCTCAAGCAATCCTTCTACCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGTCCATAGGAATATGCCACTAAGCCCAGCTCATTTTTTGATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGCCTAGGCTGGTCTTGAACCTCTGGGCTCAACTAATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGCCCCAATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTCAGTTTCAGGGTCTCTATATTTTACAATAGCAAGGAAATAAAAGTGTGCTCACCCATATTATTTCTTTTTACCACTTAGAAATAAGAAAAATGCCCAACATGCAGTTTTATCTATGTACAACAAATAAATGTAAAGCAATGCGTATCATTATAATTATTATTATATGCATGGGAGAGTTTTGTTACATTTAATCCCCTGTCTAGCTAATATTCAGTAATGAGCCAACTTTAAAAAGTGAAGTTCAGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACTTGAGCCCATGAGTTCAATATGAGCCTGGGCAACATGGGGAAAACCCATCCCTACCAAAAACTACAAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGTGCATATCTGTAGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGACAATCACCCGAGCCCCAGAGATTAAGGCTTCAGTGATCGGAGATTACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGTTGGAGTGAGACCCTATCTCCAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAACAAACAAACAAAAGTTAAAATTAAACTGCAAAATTAGTTTCTACAGTTTATAAACTTTTTATTAAAAATATTCAATAGCTTCCTAGATTTAAAAAAACAGACAATATGCATTAGTTTTAATGAGATTCTCCCCTCCATGCTAGAAAATATGTATTTTATAGTCATTAAGGAAGACTTACCCAGTGTCTTTATATATCTTCCCTCCAAAAAGAATTGAAAAGAAATAAATGGAATATGCTTCATTTCCTCCAGGTAGGACCCGGAGAGCACTGTATCTTCTGTAAAAAGTAGGGTGACCCACCATTTGCTCAGAATTTTCAAGGTTTAGCAGTGATAGTCTCATGTCTCCTGAAACACTGAGATCCCCAGCAACCACAATCATTGGTCACCTTAATTCAGGTGGCTTCCCTAGTAAAGAGCATTACTTCTTACTCTGTAAATGGAGTACCAAACAGATGGTTAAATACTTTTTTTTAAAGACCTTGCAAGTATTCATTTCCATTTTATTCAGTTTCAGTCTTTCTTCCCCTTTCTTTCTTCTCTGCCATTTTAGCTTTCATACCCACTAAATGAGCTAGAGGCATGTTTTTCACTCTTCGTTATTTACAATGCTTTTCTTTTTAATTTTCTTGAAGGAGCTTATCCAGAAAGGGGGCCTAATGTGCCTGATTTTTTTGATGGTTTGTTTTGATTCCCCTATTCACTACTTATTTACTTTGGCAGCCACACCATTCTGTCTACCTCAGCTGAAGAGAATATCCCATCATACAAGGGCAAAGGTGTTCCCTGTGGCCATGCTTTGAAAACAGCTCAGCGTTGCCCTTCTCTTGGGCTGCACCAAGGGCATGGTATCACCGAGTGGGTAACTGTTCGCTGCCCGGGACTTCTGCTGATTAGGAGCTCTCTGCATCCATAGCCCATGCTGCAGGCCACATATTGCATAGTAAGGAGCTGACTACACTTGAACCTTTAAATTTATGAAAAATTGGCATAGCTGGTTTGCATAATTCATTGGGTTGCTTCTTTTTGCATTTCTTGTATGATTTTTAAAAATTGTTTTCCCTGATACTGAGTTTCTATCACTCTGATCTACTCAGCTGTGTTATTTCCTAAACAGCTAAAGAGAAAAATTGTCACAGATATACAGGCTGTGAAATTCTTCCTAGATGAAAATAAGCCACATATGTCAGTATTCATTCAGAAGCAGAAATTTGCTTTTCTCTGTGTTTTTTGAAAGCCTAAAAGCAGTTTCAAGTCATCTTCCAACCTGTATCTGTCTTTTAGCAGTGCAAAAGCAGTTTCCTAGAAATGACTGAGGCTTATACCATGTGCTGATATATACAAATTCTATCCATTCATTGGCAAAGAGAAGTGCTTTATTAAACTTATGGCAATTAAATGTGCCACTAATTATGTCTACAACCGTGACAATGTAACAAGTAGAACGGCCAAGTAGATATAAACCTCATTCAAATAACATTCTGCCATAGGTGCTGCTTACCCTCCTTGGGCTTTGCAATCCTGGCTGTGAATGTCAGGACCCATCCGGCCTAGGTATCCTTGGAAGGTTTTTCAGTTTGGCACTTTAAGAAACAGCAAGAAAATGATTTGTTGAGACTAATCAAACCCATATTATAGAATGAGACCCATGTAATCAAATTTTATGGTTCACATAAATAAAATGATATAAACAACCAACTCCAAGTCACATAAAATGTAGAACTTGCAGCACACTTTAGCCTGGAATGGCGGAAAGACTGGTCCTTTGTTCTGGTGCTGCCTCGTTTCCTCTTTCTTCCTCCTGTGCCATCTGAGTCTGTGGATGTCCTTTGGGGTGTAGCTGTCCTTGTCTCACTCAAGTCAGCACCTCGATGCCTCTATTTATGTCAAAGCATCATGGACAGTTCTGAGATTCTATATTTGTAACTGTTGAACTTTTACATGAGTTGGGGAGGGGCTTTTGATTGCAAGAGACAAGGAATTCCCTTGGGTTACTTTAGTGGAAAAGGGGATTTATTGTAAGCATATATGTTGACAGAAACTCTAGGCAGTAGCTGCTTTCCTTGGCACTCATGGCCATATGATCTCTTTCTTCCATTGTGCCTCTGCTTCTCTTTTTTTTTGTTTTATTTTCGTCCCTCTACAGATAACATTCTTTGGCTTACTCGTAACTTCCCCTTCCTTGTAAGTTCAGTTTTCACACATCTCTCCAAGCCTCCTTCCAAATCCAGAACTTTATGCTGCAGCTTCAAACGTTAACTGGCTCAGTCTCTTTATTTTTCTGAATTAAAGTCCCAGTGTGACATAGATTATTATGGATTTTAATACTTATCTCTCCCACCACACTTTATGCTTCTTGAGCATAAGATGTCTGTTTTCCTTGCCACTGTATACCCACAGTGCCTAGAAGAAAATAGGGACTGAGTATTTTATGAATGAATAAAATATGCAAAATAATCTGAAATCTACTAATAACTGTTCTTGGTTGGGGGGAATTTTCTACATGAGTTGAACTGGCTAAGTCTTCTCAAACATGAGTCCATTTGGACTGAAGTCATCTTATTCTTTTCCTAGTCTTGTTCCAAGAACCCCAAATGGCTTTCCAATTTAAGGCCAAAATTTTCCATAAAAATTGATGTGATGAAACATTTAAATAGTAAATGTTGGGAGAGAGATTGTTTCCATGGTGACTTCTGCTTCAGGAGTCCTTGTTCTAAGCACAGAAGAGAATGACTGAACTGAGACACCACTAACTTCACATCATCCAGTTGCCATTAACCTAATTTCAGCCAGCTTTATCAGTGCCGATGGCAGTGACCCTGTCTTTGATTCATTCCTGGGAGGTTCTTATTTTGGTAAAATGAGTTCATAAAAGCAGATGAAGGTGGTGGGAAAGGTCAATCCTACTATTGAAAGTTGAGATGTGAGCCGGGTGTGGTGACTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGAGGATCGCTGGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAGATCTCATCTCTACAAAAAGTTAAAAAAGTTAGCCAGGCACAGTGGTGCATGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAAGCCGAGGTGGGAGGATCGCTAGAGCCCAGGTGTTCCAGGCTGCAGTGAGTTGTGTTTGCTCCAGTGCACCCTGGCCTGGGCCACAGAGCAACACTGTCTCAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGTTGAGATGTGCTAACACTTACCTGTGGAATGACTTTTCTCTTTGTGTGGTGCCAAAGTTTTCTGGTTTCCCTCTGAAGAGTATATGTCTGGGGTATATCCTGTCTGTGTTCCCAGCCACACTGCAATGACAGGGGGGCCACCCTGCTCCTCTGGAACAGAACAACTTCCTGAGTACAGACCAGATGTTGAACAATGGCCTTACTGTCCGAAACGTGGACAGCAGATACTTCTTTTGTGACCCCCTGCTTTCCCTAACTAAACACCCCTTGTTCTTTTTTAACCATTTCACAAAATGATCTTGTGGTAGCAGAAACCACTGCCATGTGGTTTTCTGTTATTAATCCTAAACTTTCTTTCCTTATTGTTTTATCATAAAACAGATAATGTTATTTTCACAAGCATTCTGAAAATTACCTAAGTAAATGTTATTCCCTTCAACATAGTTACCTTAGGAGAAAAAATGTTTATTCCATTGATGTGGTCATTGCCCAAAACATGTCTAGAACTCCCTTCTCAGTGCCACAAACTTGCTTCTCTCATATTCCAAAGTGTGTAGAGTGCAGCTCTATAGGAATACATGGCTAAAGATGTGAATACACGTGGGTTTTTGTCATATTTTACCTGTAACACATTTACACTTACTTCATCTTTTTCTTTCTAAATAATGAAAAATCCGGCTGGGCGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGCCAAGGCAGGTGGATCACTAGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCATCTCTTCTAAAAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGACGCAGTGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACTCAGTGGACAGAGGTTGCATTGAGCCGAGATCGTGCCATTGCATTTCAGCCTGGGCAACAGAATGAGACTCCGTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATCCAAATATTGAATGAACACTTTCATTTTTATATTAATGTCTACATTCGTTCATGGATAACTGTGTAACTCTTCACTTGACCCTAACTTTAGAAACTGCCCATATAGCACCTCAAATTTGATTTTAGCTAATAGCTATTAAAAATGCTATTATCTGTGTTAAGTGGAATTTTAGGTTTCATTGCCTAAAACCTAAAATGGAAGTAAAGTGGATTTTCTTGTCATCTACAG
Seq C2 exon
GAAATGTTTGATGTTATATTGGATGAAAATCAGCTTGAGGATGCATGTGAACATCTAGGGGAGTACCTGGAGGCGTACTGGCGTGCCACCCACACAACCAGTAGCACACCCATGACCCCGCTGCTGGGAAGGAATTTGGGCTCCACGGCACTCTCACCATATCCCACAGCAATTTCTGGGTTACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000182389:ENST00000539935:12
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.131 A=NA C2=0.386
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0062516=Guanylate_kin=FE(15.3=100)
A:
NA
C2:
PF0062516=Guanylate_kin=PD(15.0=40.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
ENSP00000353425, ENSP00000390161, ENSP00000410978, ENSP00000443893, ENSP00000489621, ENSP00000489677, ENSP00000489679, ENSP00000489732, ENSP00000489779, ENSP00000489787, ENSP00000489876, ENSP00000489883, ENSP00000490208, ENSP00000490247, ENSP00000490250, ENSP00000490304, ENSP00000490443, ENSP00000490660
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development