RnoINT0028256 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000007666 | Cacnb4
Description
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4 [Source:RGD Symbol;Acc:68385]
Coordinates
chr3:37959637-37972250:-
Coord C1 exon
chr3:37972155-37972250
Coord A exon
chr3:37959823-37972154
Coord C2 exon
chr3:37959637-37959822
Length
12332 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCTGTAAGT
5' ss Score
7.52
3' ss Seq
GATTTTCTTATAATCTGCAGGAA
3' ss Score
7.95
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTTTACAGCGGCTGATTAAGTCCAGAGGAAAGTCCCAGAGTAAACACTTGAATGTTCAACTGGTGGCAGCTGATAAACTGGCCCAGTGTCCCCCT
Seq A exon
GTAAGTAAAATCTTATTTTTTCCTCTTAACCATTGATGACCATTTACAAGGGGGCGGGGGTGGGTGCTCTTTCCTTTCACATCATGGCTTCTATTCTAACAGAGGTGGTAATGGTGAGTGGTTTCTTGGAGTGAGCTGCTGGTGTTCTATTAGGTGGACTCGGACTTCCAGGACAGCATAGTGTCTGCCTTGTCCTGAGAACCGAACTCCGAGTCTGAAACCCTCTCTTTCCTACTTTCGTGGTTACCTTGCAAGCATCCAGGCACCACATCCAGTTAGGTGTGCATTTGTAAGAAAAGAGCAAAAGAAAGTACGACAGCTTACCTTTCCTTTAACTTTCCTACTAGAAGATTCTGGCGGGCATGAAAGAGTGTAAGGTTGAATGAAGGTCAAAACTGGACTGCAGCTGGAGGGTCCGGGTGTTGCTAACAGATGAAGGAATAAGTTTTGAGGGGTGAAAGCCTATATGTCACTTAGTGTCATTGCTAGAAAACACCTGCAGGATTGGAAGGCACACATTGGTGGGCTGGGCTGGGCAAGGTGACTGTTTTCATAGGCATTCAAAGCATGGTATGCCAGTCATGTCTGTGTCGGCTCAATTGACTAGTGGTTTCTGTGCCTACATTTCTCTAAAAGATATAACCATCATCTTGGCTCACTAGATCTTTAAAAATATTTATATAAGGGTCATTTATGCTCTGTGACAGTATAGAGTCCCAATTCAAGGACTTGGAGAGGTGAGACAGCATGGCTGTTCAGAGTAAGACAAGCTATATAAACCTGCTATAAAGGATTGGGGTAAAAATCCAAGAGGTACCTGTGTGCGCGTGTGAGAAAGTTCTTAGAACAGTGCCTGGCACATGATACATGCTGTCCAGGAGCCACTGTCGTCATCCCCACTGTGCTCTGTGCTTTGCCATACCTGGTCTGTGGGAATCTGTGAGGGTGTTCCTCTCAGGTTCAAGGTCGAACTATATGACTCCATCATCGTGAGCTCATAATAAATGTGTGGTGAAGGAGTAGAGAATGAACGAAAGGTTGCACAGACAAGAAAAGCAAGAACAAGGCTACATCTCTTAATTAGATATTTAACATGGGCCTGCCACACAACTTGCTGGATGCTTTTCACTATGAGCTAGTGAATAGACAGCCTTAAGTCCCACTTGTTGCTTAAACCAGAGTCGATAGATGAGTTTGCTGAGGTCACATAGCGAATTAAGATTAGAAGTGGATCTGACTTCCAAGCTGTTTCTTCTTCTCCACCACCACCTACCCTCCTCGCACAACACAGCTATCAGGTTACCCACCCTGCAGATAGATCCAGGGATCTATGTTAATGCCATGTGGCCTACTAAAGATGTCACTTACAGAGTGGAATGCTTGGATAAAACACAAGAAACCAGAAGAGAACGTGTCACCCAACCCCTGGCCCTGTAATGTTTCACAGTTGAAGAGAAATAATCTTTGGTAAAGATTATTTCTTCAGTATTATTTTAGCAAAATACTCTTTACAGGCATGAACAGCCACCAACTGCACTATTCTTTCTACTTTTTAGGACAATCTGAGAATAGTAGTTATAATCAGTTCAGTATTCTAGCAAGCAGTCACTAAAAATGGAGATGGAATTACAAGAAATTTATTGGAGAAGATAACTTTTCTTTTTATGTCAGTTTATTAGCACTCAGTCAAAACAATTACAGAGAAACTAATTTATGACCTATTGAAATTGAGATTTTCGAGGTGGTAACAGATAAAGGGATAAGTGTGGAGGGGTGAAAGTCAATATGCCCCCTAGTGCCGTTGCTAGAAAACACCTGCAGTTTTTAGAGTGAAATCCTGGGCTTCAGTCGCCCTGAGGAGCAAGGACCCACCACCTATCCAGTGTGCCAACTAAAGAAACAAGGAATGAAGAGCAGAGGAAATCAATGTGTCCAGGCTGGCGAGAAGAACAAAGGCATCCAGTGGTCCCCTATCCACCTTCAGGATGCTAGCATGTAAGTTTAGGCTTAAATAAGGGGCAAGAATTTCTGGTCCTGGTGTGGTCCAGCTCATCGACACATCACATCCCCATCTGCTCTGAAAGCTTGTCATCTGTGGAAAACCCCTTCTTCCTTGGACACCATGGCTTCGGCCTTTCTATGCACCACCCAAAGGTCCCCGAGTAAATCCTCGTCCCTTGGAGTTCGTTGTTTCGGTAGTCTGACAGTCCAAGAGAAGTTGACAAGTATCTCTTTAGAATGCCTTCCCTCATGCCAGGATGATCACAAGGGGGCCTTTACAGAGATGTATGTGCACGCTGTGCTACCTCTGAGATAAATGGGACCAAAATTAGGCGCCTTCACATATTTACGTGTGAGCGACATGCTGGGTTTGTCTCCAGGTCTGCAATCTCAACTTGTCAGAGTACTAGGAGGACCTCCCTCCTCTATCACGACATTAGCAAGACAGGCACATCTTTGTTCTGAATAATTGGTCAGAAAGCCTAGCATTTTCAACAGAGTAATAATTAAGGTAACCATGTACTTAACATTTTCAAAGCATGTGATATTGTGTGCATATAGCATTTGTCATTCTGGGGAAGAATCATGCATTCTATTTTGGCCCACATGAAGAAATGTTCAGATTACAAAAGCCAGGAACATTTTTTAAAAATGTGTCTGCATTTGCCCCTTCACTTCCAGACCATAATTATCACTGTCTCCCAGAGACTGGCGATCGCTGGGACATTTTAGTTCCTATGGAAGGATCTGCAGCTTGTTTACTTGGCTTCTGTGTCTCCAGTCTGCTGAGTCTGCAGACTCCAGGAGCAGGGTCTCACTCACACTGCGATGATGTCATAGGCAGCAGGTTCTGCAAAGGGAAGGAGAAAAATTAACTTTCTGGAGCTAGAAAAGATATGTCTGGTTCCAGGGACTACCAGGTACAGACCTGGTAGTGTGCACCTTATTGTTGGATGATGTCAGATGGTATTGGGGAAAAGAGCACTGCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTAAAAAGATGTCTAAGCAAATGCTAATGTAAACACTGGTCATCAGGTTTCTTTGTTTAGAAGACCAGTATGTGCTTTCGGTATCTCCAGCAGGATAGAGGATATCTTGTGCTTCTCAGTATTGTGTCTGCCGGTCTTTTTCCATAGAAAAGCCAGTGGGTTTAATGTTTCATGGAATACTTAAAAGGAAATACAGTTCTGTTCCAATCTTCTCATTTTACAAGTGAGGGACCTGAGACAAAGAAGAGGTGAACTGGCTTCCCAAAGGGTAGATGCCTTGGAAAATGAGAGTGTCTTAATTCAGGAAGACTCCAGATCAGTGGTTCTCGTACTGTGAGTCATGATCCCATTGGGAGTTGCATATCAAATATCCTGCATATCAGGTATTTATATTATGATTCATCACAGTAGCAAAATTACAGTTATAAAATAACAATATAGTTTTATGGTTGGGGGGTCATTACAATATAGAGGACTATATTAAAAGTCACAGCATTAGGAAGGTTGAGAACCAATACACTAGATGGTAAATAGCAACAGGTTAGTTACTACATGTATTAGAGTTTCTGTTGCTGTGATAAAACACGATGAGCAAAAGCAACTTGGAAAGGAGAGGATTTATTTCATCTTAAAGCTTGTAGTCCATTACCTAGGGAGGTCCGGGCAGGAACTCAAGTCAAAAACCTGGAAGAATAAGCTAAAGCTGGAGCTATAGAACTTTGCTTAATGTGTTGTTCCTGGTGCTTTTCTCAGCCTGCTTCTTATAGCACCCAGGACTACCGACCCAGTGGTAGCACTTCCCACAGAGATGGGCCCTTCCACATCCATCCTTAATTGAGAAAACTTTTGGGGACATTTTCTCAAGTGAGCCGTCCCTCTCCCCACATGACTCTAGTTGTGTTGAGTTGACATATACTAGCCAGCACACTGCATATTCTCTACTCGAGAGAACACGAGGCTCTATTGGTAAGGATTTTGCTAGAAGAGTCAATAAAGGGTCAGAGAGTAAATAATTTAGGTTTGTTGAGCCAAGTGGTATTCTTTCCAAAACTATTCAACTTTGCCTTTGAGTAGCAATCATCACTGTGCATATAAATCATGGGGATGACTAGACTCCATTCAAACTCTGTAGAGGCAAGAGGCAGGACCCATGCAACTGAAAGAAATGGCCACTCTTCTTCTAGAGCAAGCTTTGTTATCTATTACTGCAAAATACATAGGCCTAAACATGGTGACTTCAAACAGTGGTGAGCAAGATATCAGCAGGGTTAAGTGGGAGGGATTCAACCTGTTCTTCCTCTCCACTTGGTTCAGGGCCTTTGTCATGAGCCCATTTCTGCAAGGCTATAGGCTTCTACCATAGTCTCCTAAGGGTTTATCTTAGGTCCCATCCCAGCATCTCCTCAGTATTTAGCTTAACAGAGTGATCACAGAGGCTACCCAAATCCAAGGAGAGGGGACATAGTGTACCATCTCAGTACCGAAAGGACTGAGGAATTTGTGGTCATTTAAAAATCTGCTCTAGGGAGAAAAACGTAACTCCCAGTAGGGAGGCAATCAGGAAAGTGTCCCTAGGCACGGGGATGTAGGAGTCCTTGCAGACTCTTTGTCCGGTAGTTAACCAGATTACATTTTCTTGGTGTGTGTCTACACACCATATATTTATAGATAACAATTGTCTTCTTCAGCTATTAGTATCTTTTCCTTGTCAGAGAAAAGGCCAGGTTCAACTTGTCCCAGTAGTGTGGTAATAAGAGTTGCTTGGCACGACCAGCAGATAGACAATTGGATGATAAATGAAATATAATCCTTTAATCCCACTTAGTTGCAGGCTGGCTTGTGTTACCAAATGCTGACCCGGTGGCTCTTTGAGCTGCTAATGGCTTTTTGTCTGTATAAAATGACATGGACCACTTTTCCTGTAAGAGGTGAGTTCATCTTCTCAGCAGAGGCTTGTAAACCTCTAACGTCTTGAGAACCAGAATGGTCCTCTTCTCATCTCCTTTATTTCCCATGGCTAAATGGACTTGAAGTCATTCTATCACACAGGCAAGTGCTGAGGGGAATTTTCCACTGCCCAGTTCCAGCAGCATTTAAATTATTGAAAACTGTACGGATTCACTCATCTGCTTGACATATTCTCTCTGCTGTTGCATTCATGCATATGAAACCCTGGACGCTCGCTGTTTAATTATTCATACTGCTTTTTAAAAAAACAAAGTAATCTGCTCTATATCTTCTCTTCACGAAACAAGGCCTCGCAGGATCGAATTTCATTCTATACATTTCGAGAGATTTCAAGCCACCAACCTGGCCGTAGTATGATGGAAATGGCCCCTTCCTACGAAGGCTATGATATAACACACATAATTGACATAAACTTAACAAAACCACCGATTGCCTTTTCCGTGGACATCAACACTGCCAGATATTGTCATGGTCTTTGAGGAATAAGAACAGGCAGCAGAGAGAGACACGGGAGGAAAATGCATTGAGATTCAAAATCAGTGTTCCTAAATTCTCACCTTTGTATCAAGAACTGATTGTTTTTTCTTTAGTGCCTTAAAAAAGAGCTTCTGCCAGAGTCGGCCACTCTTGTTTGACTTTTCTCTGTCTCCACATCCTAAACAGCCTAGATCCCTAAACAACAGCAGACATCTAAATGTGGACTCTGGTTTCCAGCTAGTGAGTTGAGTATTCAAGAACCCAGACACTTTGATAATACAAATAATGCAATCTTCATGTGGAGGTAACATTTACTGGCTGTCATGTAATTAGTATTGGGGCTGAGCCATCCAGCCATGCTATTTTACTGACTAGCATATGCTGGTCATTCTTCTTAAGTGGTGGCCCCTTAGCGGCCTCTCTATATTACAATAGTAAAGAAATGGAAGTGTATAGATTCCTAGTATTGCCCTCTTCCTCTTAGAAATAGGAAAGGTGATACACATAATACTGTATCTACACACAACAAATAAATGGAACCAAGGTATGAGCCATGAAATTGCCACACATATGCTCTCCTGTCTTGCTAAAACTCAGGAGTGAACTGTCTTCTTAAGAGGTAAAACTAAGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGCAATCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAGAAGAAAGAAAAAAAGGTAAAACAAGGGGCTGAAGAGAGAGCTTATCAGTTAAGAGCACTGGCTGCTCTTCTAGTGGACTTTGGGTTTGACTCCCAGCACCCACCATGGCATCTTATATCAGCATGTAACTCCAATTTTAGGGAATCCAATGCCCTCTTCTAACCTCCTTGGGTGCACAGACATATATGCAGGCAAAAACACTCATACACATAAAGTAAAACATTAAAACTAAAGGGAGATAAAGCTAACAGCACAATTGGTTTCTTGGGTTTTAAGCTTTGCATTAAAAATAGTTACGACTTCCTCCATAAACATGGTGGACAAAATACATGAGTAGTTTGTACTTTGTAGTCAATCAAGGAAAACTTACCAGTCACTCTCTGTATGTTCTCCCTCCCAAAAGAATACAAACAAAGGGCATTTACTCCATTCCTCATATAGGACCCAAACACTAGTGTTTGTTATGTAAAAACTGGAGTGACCGTTTCTGTTTGCTCCTTGTCTGGGTTTTAGCACAGACAGCTCACGCAGAGGCACTCAATCCCCAGTGAAGCTGCTTAACAAGGGAGGTGGGGGAGGTTCTTAGGACTTTCTGAAACATCAAAACCCTTCACACTTTCCTATCTCCTTTAAGCCTTGCTCTTCGCCGAGCTCTGAGTATATGGCAAGCCTGTTTCTACCCCCTAGAATTCAGTGCTTTTGCACTCTGTGCTTCTGGGAATGCCTATCCAGACAGCAGGTCTCCTGCGTGTTCCTGCTCACTTGTTTACTTCAGCAGCCGCACAGACCCAACATGCCTCAACTGCAGAAAGGGCAGAGGTGTTCAGCATGGCAGCTCTCCGGAACACGTCTTGTTCCTTTTCACTACGGGCGTCACCACAGGCCCGACAGCAGAGGGGCAGACTGCTCACTGCCAGGGACTTTTGCTGATTAAATGGCTCTTTCTGTCTCTCTGCACGCTTAGGACCTCCTGCATTGCACAGCAAGTGGATGATGAGACATGGCACTTACATTCATTTTCAAGTGAGCTCAGGCTGGTTTGCTTCACTTCGAATTTCTCTTCAAGTTTGAATATATATATTTTTGAAATCCCCCTTCCTGGTGTCATTCTAGTGCATTGTTCTATTCAGCTGTGTTATTTTCTAAACAGTTAGAAGACAATTGTCGGGACACATAGTCTGTGAAGTTCTTCCCAGTTGGAAATGAGTCCGTACATCAGGGTCATTCAGAAGGTGGAGTTTGCTCTCTCTCTGCTTTTTGAAAGCCTGGGAACAGTTTCCAACCATCCTTTACCATATAGCTGCCACCTAGCAGTAAAAAGGCAGTTTGCAAGAACTGATCAGGCTTACGCAAACAGCCCTGAGCAGATGTGTACGAATCCTACCCACTGGCAAAGAGAAGCACTTTATTAAAATTCTATGCAATTAACTGTGCCGATTGTGGTTTCCATAGTGATGGGGTAATGGAGGAGAGCCAAGTGATATACACCTCACTCCCCACCTTGCAGTCTGGCAAAAAGTCTTTCTCTTTACTTGAAAATTTTTCATTTTAATTGTCAAATGTAAACTGTTTGGATTAATGGGTTCATTGCTACTCATCAATATGCCATGCACCCTTCTACAACCTGGGACCCCCACGTTCTCCTACCATTCTTCCCTGTCCCTAAAACTTCCTGTTTGTCCCTACCCCCAACTCCTTTCTCTTCTCCTGCCTTCTGTTCCATTCAGCCCTTCTACAGGTCAACTTACTGCATCCCGTACGTGAATGAGAAGGTGTGACTTGCTGCGTTTTTCCCCCTCAGCCCACCTTCTCTAGTCCATCCTTCTTCCATGTCTGAACAGTACTCTATTATATAACTATACTGCATTTTCTTTACCCCTACATTTATGGTCGGCCATCTGGGTTGGTTCCACATCTTGGCTATTATGAATAGTGCTGTGATGATCTTGGGAGTGCAAGTTCATTTTAGTTATAAACACTCCACCCCAGATCATGTGGTACTTCTACTTTTATTTTGTGGGAAGTCTCCATCTCTTTTCCATAAGGTCTACACTCCTGTCCGGTCTCACCAAGAGTGTGTAAGAGTTCTACCATTCCTTCTATTTTGATAATTCCCACTCTAACTGGAGCGAGAGGCCATCTCAACTGTGGTTATTTTTGCCGTGCTGTTTGTTAAGAATCAAACCAAGCCTAGGAAATGTACTTTAGTGCAGAGCCTTATTTTGTTCCTTCACAGACAAGGTCTCATTATGTAACCTAAGCTGGTCTAAAATTTTCCTGGCTGACCTCAAATGTGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTTGTGTGTGTTGGGACTACAGCCTTAAGCCAACACGCTGTGCCCCGTTGTGGTTTGATTTTCATTTCTCTTATAATTAGTGAAAGTGAGCTTTTGTTATGTGCTTGTTGGACACTTACATGTTTCATTTTAAGAAGTACCTGTGATGTTCATCCTTTCAAGTTCCTTCTGCGTGCTGAATGTCAGTGTGCAGTTTTCCATTGGCAGATGTTTTTCTTTCTACCTTGTCTCTTAATTTTGTTTTGCTGCGTCAGCATTTCTTATTGTGCCGTGAACTCTCATTCGTCTATCTTGACTTTTGTTGCCTGTGTGTTTAGATTACTATCACCCCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCAGACACCCCCACACCCTCAGACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCCTCACACACCCCCACACCAATGTCTTAAAGTACTTGCCCTGTTTTCATATTCCATGGTTTCAGACTTAAGAGTTAGTTATATCTTTGATCTAGGTTGAACTTGGTTTCTTGTTTGGTGAGAGAAAAGAATCCACTTTCATTCTTCTGCACAAGCATATCCATTTTTGCCAAATATTTGTTGAAGAGATTGACTTTTTTCCCACTATTAAATTCTTACCACCTTTGTTGAAAACTATTCATGTTGGGATGTGGCTCAAGGCCAGAGCGCTTGCCTAATATGTGGGTGGCTGTGAGTTCTGGGCATAGCATAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGGGAGGAGGAAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAACTACATATACATTGTTGAGATCTTTCTAGCTAAGGTCTTTAATGCCTTACTGGGAATAAACAAACCCAAAATCAGGCTACATGCCTATGCAACATAATGTGTACAGTGGCCAGGAGCAATAACAAAGCACCATCATGATCTCTAAGTCACAGAATTGTGTGAAACAGAGGAGCTGGGTAGAGCTGAGAGGAGCCTTTCAGCGAGCGCCGCCCATTTCCAGACCTGTTCTTCCAGTCTGTGGTGCTTTTGGGGTTGTACTTGATCTTGTTCTGCTCAAGTCAGCACTGAAGCAACACGGTGTCTGTCATAGCATTGAGGGTGGGTCTCAGGGCTCATCTTGTGATGGCTGAAGCCTCTGCTAACCAGGGGAGGAGGTTTTTGATGGCAAGAGAGAGAGGCTTCTTTGGTTTACTTGGTGGGAAGCAAGATTTATGGTGAGGGTTTTTGGCAACCAAACTTCTAGGTACTAAGTGCCTAGAAGTACCTAGGTACTGTGCCTCATGGGCCACAAAGGTCTTCTTTACCTGTTTTATTTTCTTTCCTCTCCATATAGAATTATTTAATTTACTCACCATTTTCCCTCCTCATAAGTTAAACCAGTCTCTCTAGACCTCTTTCTAACTATAAAACTTTTTAAGTCACAGCTCCAAACATTAACTTTCTTGGTCTCTCTATTGTTCTGAATTATTCTTGGTGTGACAAGGATTGTTAAGAGTTTGGATACTTTAAAGCTTGTCTCTCCTACCATATGGTATGTATGACTTTCAAGCACAGGGTGAAATTGGGCTTCTTTGCCACTGAATACCCATAGAGCCTGAAACAAAGTAAATGTTGAGTAAACATTGTGTGGATGAGTGAAATATGCATAGGGAATGCACTGGAAATTCTATAGATTGCAAGGGTTGGGACCAAGGTCATCTGATAGAGCCATGAGGAATGAAACCAGATGTAGGCTAGAAGAACTATAGTTAAGATTGAAGCTGCTACGATTTTATTGAGAACAACCAAACTTTTTATACTTTGATTAGGAACAAATTACAATGGCAGTTGCCAGGATCAATAAAATTGTAGTTCCCAGGATACAATAAAGTATTCAAGTTGTCCATGATATACCACGGACTTCTTTGCCACTGAATACCCATAGAGCCAGATAAATATCTAAGACCAGTTGTCCCGTCAAGCTTCCATGGTTCCTTAACTACTAAGGGAATGTACAGAGAAACACAAAATGACAGGGTTTCTTCTCTTCCTGAGGGAGTGTGTTGGTCTCTCAGGAACTAGAAGGCACATTGTACCTCAGGATCCATGGACTCTAACCTAAAAAGCCTAGGACACATGCCTGTCAGGACAGCTAGGTCAGGTCAACTCCATGGTTCCCTGCAATTGGAAAGTGTTACAGTGTTTCTCTGTAAGTTGACCTGGTTGAGTCTCCTCTGACAAGTCAGTGTGGATGGAAGTCACTAGCTTTCAACATTCCATGATAAGGGCCCTCAAATTTTTTCCCAGCTTAAGCACAACTGTTTTCAGTAAAGGTTGATACAGTGAGGAGTCAATAGTAGACTGGAAGACAGCTCAGTGGCCGAGTACGTGTTCAGCTTTCCTGAGTTCATGGGTTCAACCCTTGGCACCAAGAGCAAGCAAATAGTAAACACTGGCGTTGGGACAGTTACATGGTGATGACAGCCTCAGGAATCCTTTGTTCTAAGCCCTAGGGAGTATGAACCAGCTGGAACACTGCTAACTCCACGTCTTCCTGTTGCCTCTAATCTTTACCCCGCAAGGCGAATGCTGGTGACAGTAACTATGTATTTGGCTTAGTACTGGAAGTTCTTACATAGGTAAAATAAACTCATAAAAACAGTGGGGATGTAGTGAGGGTGATGGAAGAAGCAAGGTTCGCCACCACCTTCTACTTGTATGTGGTATGTTAGCACTTCCCTCTCGAATGGCTTTCCCTTGACAAGGCGTCAAGGTTTTCTGCCTTTCCCTCCAAAAGTCTATGTGGTGGGTAAATCCTCTTCTCATTCCCAGCCACACTGCCATAACACAAGAACCATTCTACTCTTTTGAAAACTATAAACTGCTTCTTGTTTATAGGCAAATGTGGAGCAAAGTCCTTACTACTGACACACACATGGACGCCAACTGCTTCTTGTGTGGTTTCTTCCCCAGTTAAAAGTCTCTTGTTCTTAACCATTTCACAAAACAGTCTCATAGTAGCAGACATCACTGTTGTAGGCTCTCTAATGTCAGTCCCAGACTCTCTTCCCATTTGTTTTATCATGGAACAGATAAAACCATTTTCATGAGCATTCTGAAATGAACTATGTACTACTTATTACCTTCAACTCAGTTACCAGAATAATACTTATTCCAAGGGTCTGGTCATGGTGCCAGTCATTTTCAGAACTCTATTTCTGGCATCATCATTAACTTGTTTCTTTTGTGTTTTGAAATTGGTGGAATTCAGCAGTGTAGGAATACTTGGACAAAAATGTGAATGTGTGTTTTTATATTCATGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGGTTTTGTTGTTGTTTTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGGTGTCCTGGGACTTACTTTGTAGATCAAGCTGGCCTTGATCTACTTACCTCTGCTTCCGAGTGCTGGGATCAAAGGTGTGCGCTCTGACTCCCTGGCTTCATCTTTTTCTCTTTAAATCAGGAAAGATCCAAATAGTTAATAGTCACTATTACATATGAGGAATGCTACTTCCGCCATCAGTGGAGTTTTCAGTAAAACCTACAGTAGGAATATGATGGATTTTCTTATAATCTGCAG
Seq C2 exon
GAAATGTTTGATGTTATATTAGATGAGAATCAACTTGAGGATGCCTGTGAACATCTGGGAGAGTACCTGGAGGCATATTGGCGTGCCACCCACACAAGCAGTAGCACCCCTATGACCCCATTGCTGGGGAGGAACGTGGGCTCCACAGCTCTCTCACCGTATCCCACAGCAATCTCTGGACTACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000007666:ENSRNOT00000059430:11
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.435
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0062516=Guanylate_kin=FE(17.1=100)
A:
NA
C2:
PF0062516=Guanylate_kin=PD(13.8=40.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]