HsaINT0186055 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000132950 | ZMYM5
Description
zinc finger, MYM-type 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:13029]
Coordinates
chr13:20412840-20425588:-
Coord C1 exon
chr13:20425495-20425588
Coord A exon
chr13:20413126-20425494
Coord C2 exon
chr13:20412840-20413125
Length
12369 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTAAGC
5' ss Score
8.69
3' ss Seq
TTTCTTGTTTCATTTTTAAGATT
3' ss Score
9.66
Exon sequences
Seq C1 exon
ACCAAGACTGGAGTAAGACCTTTTAACCCTGGTAGAATGAATGTGGCAGGAGACTTATTTCAGAATGGAGAATTTGCAACTCATCATAGTCCTG
Seq A exon
GTAAGCAGTAAGTGATACTGTTTCTACCTCAAGTAAATAAGCCTTTGGCTGTTCTTTTTAGTAAAGCTCATATCTATTTTATTCACATTCTGTGGCTTTGCTTTTTTTGTTTGCTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGGAGACCGAGTTTCGCTCTTCTCACCCAGGCTGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTCAGCTCATTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTTTTTTTTTCCTGCCTGAGCCTCCTGAGTAGATGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACACTCGGCTAGTTTTTGTGTTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACCATGTTGACCAAGCTGATCTCGAACTCCTAACCTCAAGTGATCCACCTGTCTTGGCTTCCCAAAGTGTTGGAATTACAGGCGTGAGCCACCACTCCCGGCCTTTGACTTTCATATTAAGATAGAATATTTTACTTAATAAAACTGTACGGTCTACTTGGTCTCTGAAATTTTGGGATTTTAATCTATTTTATCCAGTAAGATTTACATCTAAAATATTTTAATTGAAATACTTTACCTTCTTTACTTTCTTTATATAAAAATCAAAGGATAAAGATACAGTGTAATGAAAGAACAAAGTAATATATAATGATTGGATTTTATTTTATTTATAATTATTTAAAATTTCAATTTTTGCTTAAGCTTTTAATTTTAGGCTGTTTTTATCCCTGATTTTAGTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGAGACAGAGTTTTGCTCTTTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTCATCTCGGCTCACTGCAGCCCCTCCCTCCCGGGTTCAACTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATTACAAGCACGCCCGTCTCCATGCCTGGCTAATTTTGTCTTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCAGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGACTGGCCTGATTTTAGTTTTTAAATCGGCGTTTTATTAGTCGCTTAATTCTGAAAGTTGGAAAACTTTCTTGCCTTTAAATCAAGGAACTGTATTTTTAGAACTTATATAGATAGTCCTATTCTGATATAATTAAAACATAACAAGTGATTTTTTAAATAGCAATGCCTTTTTGTTGCTTTTATGTGACTTGTGAGGGGTTTGGGGGAGAGTTGGTATTGTTTTTTTGACCATTTTAGTGTTTATAGCCTGTTGAATTTTAGGAAAGTACTGAAAAGTAACGAGAACCTGAGAACCTAATCATGTTGTTGCCTTCAGGAAAATAGTGCTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATCCCCGGGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTGCAGGCGTGTGCCATCACGCCTAGCTAATTTTTTGTATTCTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATTCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCGCGCCCGGCCAACTTTTTTCCTTATTTTTAAAATTAATTTTATCTTCTGGTTACGAAATACTATGTGATTATTATAGAATATTTAGAAAAAAATCATAGAAATCAGAAAATATGTCTCCTTACCCCAGTAACTAGAAATAATGTGACCACTGTGAAGAATTTGGTTTGTTTGCTTTCAATCTTTGGTTTTTAAAAATATAATTTAGAGCACTTTTTATATTGTTTTGTATCCTGCTGATTTACTTAATCTAAATGCTAATATTTTATGTCATCATAAAAATATAGGCTGGGTGCAGTGGCACACCCCTGTAATGTCATCGCTTTGTGAGGCCAAGGAAGAAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAACCCAGCCTCAGTAACGTAGCGAAGACCTCATCTCTATAAAAAGTAAAAAAAAATTAGCCAGGCGCCATGATGTGCACCTGTAAACTCAGCACTTAAGGAAGCTGCGATGGGTCAGTTGAGACCTGGAGTTTGGGGTCACATTGCGCTTTAATCCTACCGCTGCACTCCAGCCTAGGCAACAGAGTGGGACTCTGTCTCTAAAAATATGTATATATAAGTTTTAGTAACCACAAAATATTTGTCTGAAGTACTCATTCCCCTATGTATTTTTTTCATCATTTACATGCTTTTTCATTGTTTTGAAGCTACAATAAATACGTATGTTTACATTTTTTATTTTTTCCATAGGGTACTTATTCTCAATTTTTTTGGTCTCAGATTCACTCTTAAAATGAAGACCCCAAAGGTTTCTTTTATTTCTATTATTAGATATATTAAAAATTAAAGCTTTAGCCAGGTATAGTGGCGTGCACCTGTAGTCCCAGCTATTCAAGAGGCTGAGGTGGGGCTGGGCATGGTGGCTTACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACTTGAAGTCAGGATTTTGAGACCACCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAAATTAAAAAGTAGCCAGGCATGGTGGCATGTACCTGTAGCCCCAGTTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACTCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGTGAGACTTGTCTCAAAAAAAAACAAAGAGGCTGAGGTGGGAGGGTCACCTGAGCCCAGGAGTTTGAGTCCAGTCTGGGCAACATAGCAAGACCTAATGTCTTTAAAAAATAATAATAATGGATGGACGTAGTAGCTCACATCTGTAATTGCAGCACTTTTCGTAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCGAGGAGTTTGAGGCTACAGTGAGCCATGATCACAACACTACACTCCATCCTGGGTAATAGAGTGAGACCCGGTCTCAAAAAATAATAATTACCTGGGTGTGGTGGCTCTCACCTGTAATCCTAGCATTTTCAGAGGCCAAGGCTGTCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTTACAAAAATACAAAAAACAACAAAAAAAAATTAGCTGGGTATGGTGGCATGCTCCTGCAGTCACAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCATGAGAATTGCTTGATCTCAGGATGCTGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAAATTTTTTTGTTTCAAAAAATAAGATAAAATCTTAAGAAAAATTAAAACTAGTCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATTCTGGCTAACACAGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGACCTGAACCCGGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACGCCACTGCACTCCAGCATGGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCACAGAAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAAAACTATTCATTTCACAATAATTACCCATTATATAACATAAATAACATTTGTAATGAAAAATAACTATTTTCAAAGAAATTTAGTGAAAAGTAACATTGTCTTACATTTTTGCAAATCTCTTTAAAATCTGGCTTAATAGAAGACAGGTATATCTGGCTTCTCATATGTATTTCTGTATTGAGTCTGTTGTAGTATTTTGTTTTGCTTGAAGTATAAGAAGAAAATCTGGCCTCACATAGATAGGTGGTTGGAGAAGGGAGGACTATTTTCCACGTCTTTTTAGATGTGGATAGTTTTCTTTTGATGCAGCACCAAAACTTGACAATTAGTAGTTTTCGAGGTTGTTACAATGTGGGATTTGTAACCGTATAATTAAGTTTTCATCACCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTTTGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACTTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGACAAAACCCCATCTCTATTAAAAATGCAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTTGTGCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTGGGGAGGCTGAGACACAAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCCTAGGTTGCAGTGAGTTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAATTTTTTTCATACTGTTTATTTTTAATTTTTTTATGTGTCAGCATCCCACTCTGTTTCCCAGACTAGAGTGCAGTGCCATGATCATAGCTCACTGCAGCCTCAAACTTCTGGGCTCAAGTTATCCTCCCACCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGAGACTACAAGTGCATGCCATAACACCCTGCTAGTTTTTTTTTTCCTTAAAAAAAAGGGGGGGACTGTATTTGGTACAGACTGGTCTATTAGTTTAAAATCTATTGATTTTGAATGGATTTTTAACCTTTGTATTAATAACATTGTGCATTGGTTATTTGGAAAATATTGGTTCACTCAGATCCTAAATGTTGACACTTTAGGAAGCTGTCAAGTTCATGGTGGTGGATACAGGCTTCCAAAAATTCGCCTTTTTTTTTTGGCTAGTGACACAGCCCTCAGGAGGTCCTGAGAACATGTGCCCCAAGTTTTCAAAAATTCTGATTTTTCACTTGAAAGCTCATATTTTCTCATCAGCAACAAATACTCTGTTTTCTTGAAGTGATGAACTCTTTTGAGTTATTTTTAAGAAAATGTCTCCAATAGTCATAGTTTGTCATTTTTTTCAAGTAAAAATGGTATTCCATGAAAAATGGCTAGTTCAGCTTATAGTCCAGCAACTGTGCAAGCACTTTTCTGCTTTTCAGTAAGATAACCTTTGTACTTTGGTATGAAACAAATACTTTATGCATACTACCCAGTTTGTCATACAGAAAATTAAGATGTCAAAGGCTAAACTTTAATGAAATTATTAATAACTTTTACTGTTTCACCAAAGACATCTGTAGTAAAAATTATTTTTGTCCCTGGTTCCTGGAAGAGAGACTCTAAATCCTTAAAATTTCCAAGTATCTTTGTTATATTCATAAGCTCCTTGGATCATACCTGAATTTACGCCAAGAGATGAGATGACTCACAGTGGAGTCTAAACACCAGAAAGATGAACTATAGGATTGAAACTTGGGTCTTTGAGCCAGCCCAAAGTCTGGGAGAGGAGGGGATCTGGAGCTGAGTTCAGTCATATGACCAATGAGTCATGCCTACGTAATGAAACCCAAATAAAACTACTCTAGATTTTGAAGCTCAGTGCAGCCTTTTGGTTGGTGAACACATCAGTGTGCCAGGCAGGTGATGCTACTGCTTCCACTGAAAGCTGGCCCAGAAATTCTGCATTTGGGACCCTCCCAGACCTTGCCTTATGAGCTTCTTCATTTGGCTGTTTCTGATTTGTATCCTTTGTTTAAAAAAACAACAAACAACTAAATGTAAATATAGAGCTTTTCCAGAGTTCTGTGAGTCTTTCTAACAAATTATCCAACCTTGGGAGCCCCTCCCAGATTTGTGGCCAGTTGATTAGAAGTGCAGCTGGTATCTGAAGTGAGGGCAGTCTTGCTGAGAACCAGGCCTTTAAACTTGTGGGGTCTCATGCTAACTCTGAGTACATTAGCATCAGAATTGTTTTCCATATATACCAGTTGGTGTTAGGATAACATTCATAAGTGAAGGTGACCAAATGCATACTAGTGAAAACTGCTAGTACGGTTTAGTGCCATTGCCAGAGGTTTTGCATTTCCATCATTAATGCAAATGCCACATAATACAAAAAGCAATAAATCTTGGTATTACTATGGAAATAGTTGACTTCACACATTCCCTTTTGTTTCTTTTTCTAATACAAGGCTGAATACAAGTAGACTATAAAACCTTATTTTGTTCTTGACCTCAGGGAAGCATTGGACATATCATTATATTATTAGATCATATTAAATATAATTATCTGTTAATGTTTATATGTCATTTAGTAGTTTGTTATTTGGGGTAGTTTCTACTGTTTGCAATTACAAACTGTTTCTCATAAACATCTCTAAGTTTGGCACCCTTATTTTCTTGAAAAGTTTTTAGAAGTAGATTTGCATTCAAGATGTCAACATATTTTTAAAGCATGTGATGGTTAATACAAAATTCCCCCACCACCAAATTGTGTTACTTTTCTTGCAGCATAAGAGTTTCAGCGGGGTGCGATGGCTGACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAAGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTCAGACCAGCCTGGCCAACATGATGAAACCCCGTCTCTGCTAAAAATATAAAAAATTTGCTTGGCGTGGTGACGGCCACCTGTAATCCCAGCTGCTCAGGAGACTGAAGCAGGAGGGTTGCTTGAACCCTGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCGATATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGCAACAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAGAAAGAGTTCTTTTTCTGTACTGTAAACACTCCTTAACAGTAGGTGTTATTACTTAAAGCTTGCTAAACTGAAAGGTGGTATCATCATAATTTGCATGTCATTGACCATTGACAAATATATTTGAAATTTTTAATGAATTTTCTCAAATTCACATCTGTCACCCATTTATTACTATGTACATGTCTTATTAATAGTTAAACCTGAGACAACATAGAACTCTTGCAATCTCTAGGTTGTGTTAAAAGCAATGAAGGTGTCAAAGACTTTGAAATAATGTCCATTGAAAATCATCCTTTTGAGTCTACTTTTACTTATTTATTTTTTGAAACAAGGTCTGGCTCTTTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACATTCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGCTCAAGCCATCCACCCACCTTAGCCTCCCAAGTAGCTAGGATTACAGGTATGCATACCACCACACCTAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGGGCGATCTCGGCTCACTGAAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGTCCACCTAAATTTTTAAGTATTTTTTGGAAGAGACAGGGTTTCACCATGTTATAGCCAGGATGGTCCGATCCCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCTGGCCCCCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGACGGAGTGCAATAGCGCAATCTCAGCTCACTACAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCCGTTCTCCCACCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGCCCGGACTGGTCTCGAACTTGTGAGCTCAAGCCATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCACACTGTGCCTGTTTATTTCTTTCACTCTTTATTTGTTTTATAATACTTTCTTACATTTTAGATATTTATTGCTTGTTTTAGATGTCATTCATGTTTATATAAGCATGAATTCCATCTTATATAAATAAAAGCTCTTTCATGGAAACTAGAAGCCTTGCTATATATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCTGCTCTACCTCTACCCCGTCTCTGCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCACGAGAATCACTTCAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACTCCAGCCTCGGTGACGGAGTGAGACTCTATCTCAAAAAAGAAAAAAAAAAACTGTTAAATCTGCTGGATGCAGTGGCTCACGCCTGTAATTGCAGCACTTTGGGAGGCCGATGCAGGAGGATTGCTTGATCCCAGAAATTTGAGACCAGACTGGGCAACATAGCGAAACTCCATGTCCATGTAAAAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTGGCTCTTGTCTCCCAGGCCGGAGTGCAGTGGCATGATGTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGATTCAAGCGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGCCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCAGCCAAGAAACCTTTTTTTTTTTTTTAATTAAAAAAAAAAAGCTTAAGTCATCTGTCAAAAGGATAGTCTTTTTGTAGTTGTTGCTATTTTTACTCTTTAACTTGACATAGCATAGATAAAAGAAGTCCGTTTTTAGTATTAACCTTAAATTTTCTTTTTACTTGCTGTCAGCATTAGTACAACAAATTAGGTTTTACCAGGAAGCTTTAAGAATAAGATGACATTGATTATATTATTATGTTGTTGTTTGAAGTCAAAGTTCCTCCAGAATGTGTTACTTTAGTTGCTGTGTATTTCCCATGTAGATAAATTGAAGGTTTTGTAGTACAAGAGAAAAAACGGGCAAGGATTTCTGGAGTTGAATTGTATTTAAATTTAGGTCTTATGGGTTTAAATTTCATCATATAAAACTGGCTCTTGACAGCCCCCTGCGGGAAAGGGTCTGGCCAGCCCATGGGGTAGGTGGGTTGGTGGAAGGAAGCTGGCAGCACCAAAAGGAAAACCAATACAACTGGCTCTTCATAAAGTACACGTAAAACTGCATTCCGTTTTATGAAAATAGGATTGGCCAGGCGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGAGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTATTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGACGCAGGAGAATGGTGCAAACCCAGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCACGCCCCTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAAATAGGATTATATTTGTTAGAAAGGACCATTTAATTCTTTCTTTAACTTTTAGGGTACACTATGTTTCAGTGAAAGTTCTCCAGTTCCCACATACTTTTGTATAAACAGTACAAAAAAAAAAAAGCTCATGAGAGAAAATACCTAAATTTAGAATTTGCTCTTACATCTTTTGTATTTTTGTTGCATTATAAACATTTCTGACCATGATACTGACTCTAGGGAGTTTCATTTCTGATACCTAGGTAACTCCTATCCCTCTTGCTGAGAATAATTAGGGAAAAAATGACAAAATGTATAAAGTATCAGACATCAAGAGCTACAAATAACAAATGGAAAAACTAAGGTTCCAAGATCTGAGAGAAGAATTGGGGCTGTTTTTCCCTATTGAATATGTGTTCAATTCCAGAAAAGGCTGCAGAGAAGCTAAATGGAGTTTTCAGTAGACACTGAGGACCTGCAAAGAGGAGTACTGATAAAAACCCCCTTCCAACCTATGGATTAAAATGCTAACATCATCCAGAGCCTCACAGATTGTTGTAATTTTTCATATAAAAATAGGTCAGGCCCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGTGCTCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGCCTGAGGCAAGGAGAATCCCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCGTGCCAGTGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAAAAGTGGCCAGGTGGGCCGGGCGCGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGGGGCCAAGGCGGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAATACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGTGCTTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTTGAGGTAGGAGAATGGCATGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAATTAAAAAAAAAAAGTGGCCAGGTGTGGTGGTTCATGCCTATAATTTTAGCACTTTGGGAGAGCGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGTCCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGCCTCTACAAAAAATAAAAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCATGTGCCTGTTGTCCCAGCTACTCAAGAAGCTGAGATGGGAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTGCAGTAAGCTGTGATCATGCCACTGCACTTCAGACTGGGCAACAGAGTGAGAAGCTGGGACTGCAAGCGAGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTATTTTTTGTAGAGATGGGGTTTTGCCTTGTTACCTAGGCTGGTTTCAAACTCACTGGCTTCCAGTGTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAGCCATTGCACCCTGCCTAGGCTGAGTCTTAAACCTCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCGCCTTAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCTCACCTGTCCAAAAGCTGTTTTTGAAGATAGATTACAAAATAATTCTTTATCATAGAACCTTGTTTCTCAAAGCTTCACCATCATCTGAGAGTTGGTTAGAAATGCAGAGTATCAGATTTCTTCTCAGACCTACTAATTTAGAATCTCCATTTAAACAAGATTCCCAAGTGATTTAATATGCACAATAAAGTTTGAGAAGGATCTCGCCTATAAGTAATACTGTACCTTTTGAAGCTAACAGTAATTTATGATACTGCAGTTGCTATGTAAGGTTAGGAAAGCTGAGTTTTTCCTGAGTAATCCACAATCTATATTAATGCCTGATAAGTAATATTTTAGAAGGCTGGGAAATAATAATAGATTTATATTAAACTACTGCGTCTAAAGTATTTTGAAAGTAAGTGTACTAATGTCTACAATTTACTTGAAATACATAGAAAGAGATGGATTGATTGTTTAGTGGTATGAGTAGACAGAAAGATGTGATTAGGCTGGGAGTGGTGGCTCACGCCTGTAATGCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATTACTTGAGGCCAGGAGTCCGTGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACACCCTCTCTACTAAAAATAGAAAAAAAAATTTAGCTGGGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAAAATCGCTTGAACCTGGGGGGCAGAGGTAGCAGTGAACCGAGATTGTGCCATTGCACTCCGGTCTGGGAGAAAGAGCGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGTAGCTAATATTTTTTGAGTGTGCCTGTGTGCCAGGCATTACTTTTATGTCATGTGTTCTTCATAGCACTCTGATGAGTTAGGTATCATCAATTAGTATATTTGTATAATATTACATTCAGGAGATCTTTGAACCTGGAGTCTGACTTAAGAGCCGATGGCTACCACATTACACAATTCCAGACGCCAACATTTACTTTATTATTATTGTTGGCACAGTGGAGTATCATTCACTTGAGATACAAAGTGGATAGTCCCCCTGGGATTGTGCATCAAGAGTGTTTGGCCTTAACCACATGTTTATACGCCTGCCCCACTTGTCTCTTAAACTCTTAAATGAAAATGCAAGTTATTTTTCTGATGTACATTTTGATTTGTTCCATGATTTTTTTCTTGTTTCATTTTTAAG
Seq C2 exon
ATTCTTGGATCTCCCAGTCAGCTTCATTTCCCAGTAATCAGAAACAGCCAGGGGTGGATTCTTTATCACCAGTGGCCTTACTTCGTAAGCAGAATTTCCAGCCTACAGCCCAACAACAACTTACTAAACCAGCTAAAATCACTTGTGCAAATTGCAAAAAGCCTTTACAGAAGGGACAGACAGCTTATCAACGAAAAGGATCAGCTCACCTCTTTTGCTCTACCACCTGCCTTTCTTCCTTCTCTCATAAACGTACTCAAAACACACGAAGCATAATATGTAAAAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000132950-ZMYM5:NM_001039650:4
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.766 A=NA C2=0.243
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF064679=zf-FCS=WD(100=41.7)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)