HsaINT0187813 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000196458 | ZNF605
Description
zinc finger protein 605 [Source:HGNC Symbol;Acc:28068]
Coordinates
chr12:133498019-133509391:-
Coord C1 exon
chr12:133509299-133509391
Coord A exon
chr12:133503749-133509298
Coord C2 exon
chr12:133498019-133503748
Length
5550 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGG
5' ss Score
10.07
3' ss Seq
TCATTTTTTTCTCTTTTTAGAAG
3' ss Score
10.47
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTTTCAAATTCTCAAACCTGATGCAATGTTCAAACTGGAACAACAAGATCCATGGATAATAGGTCAAGAAATCCTAAATCAGAACTTTTCAG
Seq A exon
GTGAGGAATAATCAGGTTTATGAGATACAGTGAACATTTTATCTCAGGTTTTTGATGACAGGTGGGCACTTTTAAAGTGTTGTTTATAAAACTGTGTTTAAAGTTCCTGAATCTTTAGAGTTGACTCAAGATTGGTGACATGAGTTTTAATGGATGTGCTCCATAACCTGGTCTCCACATCGGGATGTGTCTTTTCTCCATGGAGTTTATGATGAAATGTATCCCTCTTATTCAGTGGCATAGATTGGTGGCCATTTACAACCCCACTTTCTTAGTTAAGGCTCTCTTTATGAATTCATAATTTTTTTCTTCTTTTAGATAACACTGATTGCCTTTGAGTTTATTTAAACTTCAAACTTTTAATTTATTATTTTTCTTCTCTTCCTCTAATTTGATATATTTCTATTTTAAAACCACAGAGAGTAGAAGATGAACCCACTGATACAGAGTGAAAATCTAGGCTGGGCGCAGTAGCTCATACTGTAATCCTCATGCTGTGGAGGTTGGGGAGAGGGCAGGGCACGACAGTCACTTAAGGCCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGGCAACAAAGCAAGACCCCATATCTACTACTACTAATAATACCTAACAATAATAATAATAATTCAGCCAAATATGGTGGTGTGCACCTCTAGTGCCAGCTACCTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGACCCAAGGAGCTGGAAGCTGCAGTGTGCCATGGATGTGCTAGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAAAACAAAAACACACACACACAAAACCCTAATACCTTAAACATAGTAAGGAGATTTTGCTTCTTACCTTCCTCTGTACAAACTAAGGATTTTCAAGTCAGTTCCCAGTGCATCTTTCTGGTACATTTGATGTTTAACTTCTCTAAAGCTTCTCTCTCATACCATCACATAGTCAGGTGGGTTTAAGTCTCCATTACCTGCTGTGTGATATTTAATCTCCGTTTTTGTTGAAGAATCTCATGGTATGGGAACATCTTATCTCTCCACTTATTTTTCTATGCTCAAGAGTCATTATTAACTCCATTTGAGCTAGATTTGTGCTCAAGAGTCATTATTAACTCCATCTGAGCTAGATTCTTCCTCACACGCTCTTCTGAAATTTTTCTCTGCATCTGTACCTCTGATTATGGTACATTTTCCCCAGGTAGACTTCACTTTGAGCTCTTTTCTTCAACTTCAGTGAATGTTCCTTGACTCACAGCTTTCTCTGAAATCTCTATCCACGTAGCATCTATAGTATAGTAACTCAGGCCTGATGGACATTATCTGAAATTCCTAAAACAACTAGTCCTAAGATTTTTTTCCCCATAAAGAGAGATTGCCAGTAACGTAGTCTGTGTTCTCTGTGGAATTTGTGGTATGCACTTACTTGATTTTTAAAAATTGGTTATTATGGACCCAGATAAGGAAAGGTCTTGTTTATCAGATGTCCCTTCAGTAGAAAAGTTTCCATCTAAGCCTCTACCCTGGGAAATATTTATTTAAAAAATTTTTTTGAGACAAGGTCTCACTTTGTCACGCAGGTTGGAGTACAGTGGCGCAGTCACAGCTTACTGCAGCCTTAACCTATCTGGACTCATGAGCTCCTCCCACTTTAGCCTCCCCAGTAGCTGAGACTACCACCACACCAAGCTAATTTTTAAAAATTTGGTTTTTCTGGAGAGACAGGATCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGAAGAGCCATAATGCACAGCAGGGAAACTGAGATTACAGGGGTGAGGCATAATGCACAGCAGGGAAATATTTCGGGTTACAGATGTCTGGGCACCATTCCCATTGTTGTTTAGGTCTGAGTGTGTGCAGTTTGGAAAAGCTGTAAAGATAGTTGTTATATTCCCCTATTAATTTAGAACCACTTCTCATGTGGAATGAGAGGAATTGAAATGAGTCATGAAATAACTTTATAGGATTTTAATTTAGAAGACAATATAAAACCATAAAATATTTAGTGATGCAGTATTTGAACATGAAGCATTTGTGTTAAAGTGCAAAATTAATTGCCAAGATTAATGATACCAAAAGGAACTATATTAGAAGCTCAATGACAAGTGAATAATATTTATCCTACCTATATTGAGGGCTTGTTATGTGCTATGCAGTGGGGGTACATTAGTGAAAAAGACAAACCTGTTCCCTACACTCATACAGTTTACATTCTACTGGGAGAGACACGAGTAAGAGGATTACCTATTTGATAAGTACTATGAAGGAAAGAAATAAAGAGGGTATTTGTTGGTGTGCCATCAGAATGACATTTTGGTGGGCGTGACATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCAAGACAGGAGTATTGCTTGAGGCTGGGAGTTGCAGGCCCGCCTGGGCAACATAGCAAGACCCCATCTCTACAAGAAGGATATTAAAAATTAGCCAGGTATGCTGGCACACACCTACAGTCTCAGCTACTTGTGTGATTGAGGCAGAAGGATCACTTGAGCCTGGGAGTTTGCAGCTGCAGTGAGGTATGACCCTACCTCGTCACTCCTTGGGCGACACAGTGATATCCTGTCTCTAAAAAATCACCAAATACTACTTTTAAGCCTGTACATAAACTACTTTATTATTGTTTATCATTTAATCCATTAATTTGGATAGACATATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGGCACGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTACAACCTCCGACTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTATCTGGGATTACAGGCGCACACCACCACGCCCAGCTATTTGTTGTATTTTTAGTAGAAATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGATCCCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCCGGCCTGGATAGACATATTTTTAATCTCATCTTGATTTGATTTTAATTTAAAAGTATTGTTTTTCTTTTTTCCCACATCTTATAAAACAATTTTCTGTAAACTCTTCAAGTGGATCTCACACTTGTCTACATATGACTCTTGCTTTTGATCTTCAAACTTCTTTGCATAGTCTTTTTCATCTCAATGAATAGTATTATCATCTTTGTTTATGCCCGAAACACTGAGTCTTTCTTTAATTTTCCATATCAGCAGTTGTGCTTCCTCTGAAATTCTATTTTCTTTTTGAGATGGGGTCTCACTCAGTCACGCAGGCTGACGTGTAGTGGGCTCACTCTCATCTCACACAACCTCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTGGGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGGTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCCCCTGAAGTGCTGGGATTCCAGGCATCAGTCACCGCAGCCAGCCTGCTTCATCTGAAATTCTGATATCTGAGAATTAGATGAGGCTTTTTCCCCCCTAGAAAAGAGTAGTTTTTGGGGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGCCTGTGTCTCACTCTGTCTCCTAGGCTGGAGTGCAGTGATAGTTATGGGTCACTGCAACCTCAACCTCTCAGGCTCTAGTGATCCACCCCCTCTGCCTCACAAGTAGCTGGGACTTCACGTGTGCACCACCACACATGGCTAATTTTAGAAAAAAAAAATTTGAAGAGACAGTTTCTCCATATGTTGCCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTGTTGTTGTGAGCTGCCACCAGGCCCAGCCTCGTTTTATATTTGAGACCATGCCAGATCTTTTCATCTCGCAGAGTACTTCCTGAGAATATTACCCCACAATTGCTAGTAAATAATATCATCAAAAAGTCAAGTAAATAAACCTTTAAAATATGCAATAAATGGTCTTGTAGAAATCACAAACAATTGTACTTATTGGATGAAAATATCTGTTCTACTATTATAAAAAAATTATTGTGGTTAGGAGTAATTTCCAGTGATAGCATTACATATACATAAAATATATACTTTACAGATCCAATTAAAGGAGGATGAATGTGAAGAAGTTGAATAAAAGTGTTGATACTGAGCTCTGGAGAACTCTTGGATAATTCCAAGAGGAAGTTTTACTGATGATGGTGAAGTTATTGATATCAGTGATTTAAGTAATGATCCCGAATAAGAATATTTTATAAATGCAATAATAGTACAAAAAAATGTTTCTTATCTTTCAGGTGTAAAGTTGATATTGTACATTTATTCTGCATTATATCCCTTACTTTTTCTATTATACCATTCAACAATATATACTAATGTTGCATTTTTATGTTTTTATTATTCACATTCTTAACTATATTACCTCACTTCTTCTCTGATCTTCTGATACTAAGTTCTGGACACATAGTAGATAATCATAGATTATTGTCAAAAAAGTAAACTAATCACTTCAGTATTTGATTGGAAATTGCTCCAGGCTCTTTCATCTCATGATCACTGTTCTTTGAGTATATTTAATATTTCCTTATTTAAAAGTTCATGTATTTAGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCATGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACGTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGATGGCGCACACCTGTAGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCGTGGTGACAGAGTGAGACTCCCTCTAAAAAAAAAATAAGGCTGGGCGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAGTAGCCGGGTGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGACAGCACGAGACTCCATCTCAAAAAAATATATATAAACAGTAAAAATAAAAGTTCATGTATTTAAACATTTGTAATTTAAAAGTTCATTTTCATTTCTGTTAAAATTGTCAATGCCCAATAAGTACACATTATTTGAGGGAATTTTAAAAACTGGGATTATGGCGCCATTTCAGAAGCTTTATGCAATAAGCATAATAATTGAAGGAATTACACAGTATGGTTCATTTTTTTCTCTTTTTAG
Seq C2 exon
AAGTCTGGCTAGATAATCCCAAAATGTGGCTCCGAGATAATCAAGACAACCTTAAAAGTATGGAGAGAGGCCATAAATATGATGTTTTTGGAAAAATATTTAATTCAAGCATAAACATTGTTCATGTAGGACTGCGATCCCATAAATGTGGCACAGGAGAAAAAAGTTTGAAATGTCCTTTTGATTTGCTTATTCCAAAAAATAATTGTGAAAGAAAGAAAATTGATGAACTCAATAAGAAATTATTGTTCTGTATCAAACCTGGCAGAACCCATGGTGGGATAAAATACTGTGATTGCAGTACATGTAGAAAATCCAGCAACGAAGAGCCATGGCTCACTGCTAATCACATAACACACACAGGAGTCTATTTATGCATGGAATGTGGCAGATTTTTTAACAAGAAGTCACAACTTGTTATACACCAGAGAACTCATACAGGAGAGAAGCCCTATCAATGCAGTGAGTGTGGAAAAGCCTTTTCACAGAAGTCACTGCTCACGGTTCATCAAAGAACTCACTCAGGAGAAAAACCGCATGGGTGCAGCGAATGTCAGAAAGCTTTTAGTAGGAAGTCACTCCTCATTTTACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCGTATGGATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCAGTAGGAAGTCGCAGCTTAAAAGACATCAGATAACGCACACAATAGAGAAACCCTACAGTTGCAGTGAGTGTGGGAAAGCATTCTCCCAGAAATTAAAACTCATCACACATCAGAGAGCGCACACAGGAGAGAAACCCTATCCATGTAGTCACTGTGGAAAAGCCTTCTTTTGGAAGTCGCAGCTGATTACTCATCAGAGGACCCACACAGGGAAGAAACCTTACGGATGTGGTGAGTGTCAAAAAGCCTTCAGCAGGAACTCACTTCTCATTAGGCATCAGAGGATTCATACAGGAGAGAAGCCCTACGAATGCAACGAATGTGGTGAAGCCTTCATCAGAAAACCACAGCTGATTAAACATCAGATAACTCACACAGGAGAGAAGAACTATCGATGCAGTGATTGTGAGGAGGCCTTCTTTAAGAAGTCAGAGTTAATAAGACATCAAAAAATTCACTTAGGAGAGAAACCATATGGATGCATTCAATGTGGGAAAACCTTCTTTGGGAAGTCCCAGCTCCTAACGCATCACAGAACACACACTGGGGAGAAGCCTTATGAATGCAGTGAGTGTGGGAAGGCCTTCACCCAGAAGTCAAGCCTGATATCACATCAGAGAACACATACAGGTGAGAAACCCTATGAATGCAGTGAATGCAGGAAAACCTTCAGTGAGAAGTCAAGTCTCATTCATCATCAGAGAACCCATACTGGAGAAAAGCCCTTTGAATGTAGTGAATGTAGGAAAGCTTTTGCCTGGAAGCCACAGCTTCTTAGGCATCAGAGAATTCATACAGGGGAGAAACCCTATGAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCATTTGTTCAGAAAGTGCAGCTCATTAAGCATCAAAGAAATCACACAGGAGAGAAAACCTATGGATGCAGCGATTGTGCAAAAGCTTTCTTTGAGAAGGCACAGCTGATTATACATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAGACCATATAAATGTGGTGAATGTGGGAAATCTTTCACAAGAAAGTCACACCTTATGAGGCATCAGAGGATTCATACAGGAGATAAATACTATGGATGCAATGAGTGTGGGACCACCTTCAACAGGAAGTCGCAGCTTATGATACATCAGAGAAATCATATAATATAAAAATCATGACTTTGGCGAATGCAGAAAGGTTGCTATCAAGTGTCATACTTTCTGACACTTTTGAGGATGCATGTGGGAGAGAAACCCTATTGAGGCAGTGACTGTTGAAAAAGCTTGAATTGAGGAGTCAAGAGTCACTAAGCAGAATTTAGAAAGAGAAGTTTTTAAAAAGCAAACAGTGTAAAAAAAGTCATCTCCCAGAAGACACTACTCGTTACATATTGGATGACTCATTGAGGTGAAAACCTTATTAGTGTTGTGATAGTAGAGAAGCTTTTAGTCAAAAGTCAGTTTATTAAATGTTTAGAATACCTAAACAGGAAGAAAATTCTATTGTTTTTTATAACAAAGTGGAAGATTTCAAGAAAGGACAACTCACTGTACACTTGAGAATAATACCTACAGAGGTTCATACTGAAGAGTAGTCTCAATAATGTAAAGAATTTGACAAGCATGATGCTATTGAAATAGTTCTGTAAGGAAGTGGTGTTCTTTATACATCAATTATTACAAAAAGCAGTGAATTGTAAGTGTGAGGTGTGTTTACTTAGATGTGAAGAGTTCTCCTTACTGCTGTGATGGAATAACAAGGGTCAGATTTCCTCTCCTGCCTTAAACAACTGGAAGCTATACAATACGTATAATAGGTAATGGTTTTTAGACATAGGACAAGCACAGGTTTGTGATCCTCAGGAGACTGCAGACAGAGTGAGGTGAGCACCATGGTTTCTCAGCCTGCCCCCGCATGGCAGTTCCTAGGTTGCAGTTCAGGGAAGGGAAACAATAAATCTCGCTGAATTGAAGAGACAGGACTGGCAGTTGGGGAGGCCACAGCAGCTAGAATTTCCAGGGGAAAGTACTGGAGAGATGGGATCCTTCTAGATACAGGGCTCAAGAAGTCTGCTGGGAGTCCCCTGAGTCCTTTGACTTAGTACTGACTTGCACTGAGGCCAGGAAAAGAAGCACTGGAAAGCAGCAGGCTGAACAATTCCTGGAACTCATGCAGGGCTGGGAATAGTTTATGTTCTCAGCAGCCAGAGTGGAAACAGAGTGGAAACACATGGAGCATCAGGTAGAATTCTCAGAAAGGTTTTGTTTTAGTAGTGCAGCTAATTAACTCTAGATTAAAAGCTACTCTGGACCTACAGTGTCCGGCATCCAAAAAAACTAATGTGTTATGCAAAGAAGCAATAAAATATGACTTATAACCAGGAGAAAAATCAGTAGAAACCCAGAAAAGACAGAGGTGATGGAATTAGTAGACAAGGATATTAAAAGAGCTATTGTAAATATAAAGTAGAGGAAAACATAAGATTGATGAAACCTGAGGTATAAGAGATATTTTTACTGGCCAAAATGGAACTTCTAGGGATGAAATCAACTTCTGATTTTGTTAAAATCCCGAGTGGAGAGATTAGATACAGAAAAAGAAGAAAAAATCAATGAACTTGAAGAGTAAGAATAAAAACTACCAAAGTGATATACAGAGAGAAAAAAAGACTTAGAGAAGAGGAAGAGAATAGGAAAACCATTACAGTAGTGTAATATATGTTTAACTGGAGTCCCAGAAGGAGAGGAGAAAATGAAGAGGCATGAAGAAGTATTTGAATAAATAATGGCTAAAGATTTTCCAAATCTGGTGAAAACAATACCCCCACATATTCAAGAAGCTCAAATGACCTGAAGTAGAATAAACATAATTTACATCACAGCAGTGCACCTCAGAGTCACATTCATGAAAAGCACTGATAAACAGAATACTTTTAAAACACCTTGAGAAAAAAAGATAATACATACACATGAACAAAGAATGGCAGCATATTTCTGGTGAGAACTATGCAAGCTATAAGACAATGGAGTATTATCTCTAAATTCCTTAATGAAATAAACAACAAACCCTGCAACCTAGAATTCTGTTACTGTCAAAAACGTTTTCAAAAATGAAGGCAAAATAAAGACTGTTTCTGAGAAACTAAATCAAAGGTAATTTTATTACCTGTAGACCTGTCTTTGGGAAACATTAAAGGATGTTTGAGGGCAGCAGGAAAATAATACAAAACTTAAGTTTGGGTCTGTACAAAGGAATGAAGTTCTGAAAATGGTGAATATGTGGGTAAATATAAAAGATATTTCTCTCTTTTTAAAATCTTTTTAAAAGGGAATTGGCTGCTTAAAGCCAAAGTAATGATAACGTATTTGGAGTTTATTTAGAAGTAAAGTGTGATGACGATAACACTTAAGTGTGAATTTTTAAATATAGTTGAGTAGACTGCATCATCTGAGTTAGAAGCCTATTCCTTCAGGGCTCGGGGTAGCTTGAATTTGTAGCAGGCACATGACAGAAATTGTATGTATTGTGGATCTGCATGTGTGCTGAGTATTCCCTATTTCTTTGATCCCTTTTCCCCCATTTTCTGCTCTGCTCCCCCCTGAGGCTGTCTTCTAGAGACTGGGGTTTCTTCATAGGTTTGAACAGTGGGAGATACCAGAGGTGGGAGGAGAAAAAGTTATTTATTACCGTTCCCTTCCTCCTGCCTGGACCATGGTAGCTTCTGTGTTCCCGTAAGGATACAGCTTCCTTTGGGAAGCCCCATCTATGGCTGTAGATCTCTCGGTTTCAGTTGACACCATTCCCTCTCCATGATCTTCAGACTTAACTACTACTGGGTGCTTCCCCAACCCACTGGTTGGGTGTCTTTAATTGTGAACACATATTTGTAAATAGTGCCTTTATTAATTGTTCTTGAGTTAATATTCTGAGTGTGCCATTTATTTTCTGTGCCATCTGTTAAATGATGAGCATTTAATAAAATTGTGATAATCAGTTATCAGTACAAGTGCCGCATAGTGCATAGGCTGAAATGTCTCAAGATTCCCCACACTACATATCAGTATTTTCTATCTGTATCTGGACAATGCAGTAGAAATTATAACAAATACAAAGTTCTTTGTGCTTTTCTGCTGCATATGTCAGTGGCTCTGGAGATTGTTACCATCTGCTACATATATAAATAGACTTGCAGTTATTACTAAGCTCCTCTTCAGTAATAGAAAGACTTATGAAGTCTTTTACTACCTCTGGGTTAGCCAAACAACCTTCAAAAAGCATTGTTATTTAGGTTAAATATCTGTGGACAAGAAACAAGATAATCAGTTACTGAGTGAAGAAAGACGGGAATGATGTCCCATACTTCCCAGCTCTCTAAAGTGTTATGCTGTACAATTAAAATACCCCTGACCCATCATCTGCTACCATTCGTTGTGGATAATTCATGTAATCTCTAACCTGTGGGCAAGTCTTTACCCTTCAGTAGTCAAGATTACGTTAGAGACTTCGTCCACGAATCCACACCACCTTTCCCATCAGTTCTCACCGGAAATATGCTGCCAAAAAGAAAATCAGCTTTTCTAAGATCAAGCCAGAGTTGCTTCTCTTACAACCTTACGGCGCTAATGCATTAAGTTGAAGTCGACTGCCAAAGAGGCCCAGCAGAGGGCAGCACCCCCATCATTTTTTTGAATTTCTCCCTTAGGAATTTTGCCTTCCTTTGTCTTCTGTCCACCAGGCCTTCTCTCCAGCTGGACACAAACCTCCTTTGAAGGGAAATAATTGCCGTTAGGCTTCACAGTAGTGCTTTTTCCTTTCACTTGGATTTGCATTTTAACCTGCATTTCGAAGATTTTTATACATGTTTTCTATTTCCGACAATGCCAGGAGGCTTCATTGACGTTGTAGTCTGTGTTAATAAACTTGTGTATCACTCTGCTCTGATCTTTTAGGAATTAACTTGCAAATGAAATGAATATGTTGGGACTTTGGCATAATTTGAATATAGCATTGTGTGAGTTGTGATTGTCTCTTCCTAATTGTGCTGTAATAACCTGTGTATGAGAATAAAATGATTTCCACCATCAGGATTCTCCCATGCCCCCCTTTATT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000196458-ZNF605:NM_001164715:4
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.022
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)