HsaINT0188204 @ hg38
Intron Retention
Gene
NA
Description
NA
Coordinates
chr19:12466724-12484829:-
Coord C1 exon
chr19:12484655-12484829
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr19:12466724-12466850
Length
17804 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
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Exon sequences
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Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
NA
Protein Impact
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No structure available
Features
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Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains