HsaINT0188232 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000227124 | ZNF717
Description
zinc finger protein 717 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29448]
Coordinates
chr3:75741610-75785567:-
Coord C1 exon
chr3:75785384-75785567
Coord A exon
chr3:75741737-75785383
Coord C2 exon
chr3:75741610-75741736
Length
43647 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGCAG
5' ss Score
4.95
3' ss Seq
ACAGCCTGGTATCATTACAGGAG
3' ss Score
5.39
Exon sequences
Seq C1 exon
GCGGCACCCAGAGGCGGTCTTGTAGCTGGGCCAGCCTGGGGCTTGGTTCTATGTCCCTGCGGGTCGGTGCGAGGGCGAAGAGGAACCCGTGGGCCCGGGGGATCCCGGGGGGCCGGACCAGTGTTCCCCAGTTGTGGGAGCAGACGCGTGGGCGCATCGCGGGCGGGCAGGGCCTGAAGTGCAG
Seq A exon
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Protein Impact
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Features
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains