HsaINT0188812 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000176371 | ZSCAN2
Description
zinc finger and SCAN domain containing 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:20994]
Coordinates
chr15:85147051-85166947:+
Coord C1 exon
chr15:85147051-85147564
Coord A exon
chr15:85147565-85163832
Coord C2 exon
chr15:85163833-85166947
Length
16268 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GTGGTGAGA
5' ss Score
5.46
3' ss Seq
GTTTTTCTTCATTGTTTCAGATT
3' ss Score
10.16
Exon sequences
Seq C1 exon
CGGGACTACTTGTTGATATTTGAGGAGGGAAGTGTCTTACCTGAGAGCCTGGCTGGAGAAGACTGAGGTCCAAGGCTTGAAGCCTAAGTGATTGCCCCAGGACTGTGGATGATGGCTGCAGACATCCCGAGAGTGACCACTCCGCTGAGCTCCTTGGTCCAGGTGCCTCAAGAGGAAGATAGACAGGAGGAGGAGGTCACCACCATGATCCTGGAGGATGACTCCTGGGTGCAAGAAGCTGTGCTGCAGGAGGATGGCCCTGAGTCTGAGCCCTTTCCCCAGAGTGCTGGCAAGGGCGGCCCCCAGGAGGAGGTGACCAGGGGACCACAGGGTGCACTCGGCCGCCTCCGAGAGCTCTGCCGGCGCTGGCTGAGACCAGAGGTACACACCAAGGAGCAGATGTTAACCATGCTGCCAAAGGAAATTCAGGCTTGGCTGCAAGAGCATCGGCCTGAAAGCAGTGAGGAGGCAGCGGCCCTGGTGGAAGACTTGACCCAGACCCTTCAGGACAGTG
Seq A exon
GTGAGACGCAGAACCTCATAGGGAGAGGGCGGGAGCACCCTTCCAAGGTAGAGGAGTGTGGTGTTTCGGAGGAGGAGAAGGTGGTGTCCAAGGCAGAGTGGGGGGCTAGCGCCATCCCTCTGCTCTGTCTGCAGGCAGTCAGCGTGTTCATCAGCCTTTTAGTGTCCTCACTGTGTGCAAAGTCAGCTCCAGAAGTGCTAGGAGGGCCTTAGAGCTACATTTGAATTGTAAGCACAGTTTTTACTTCTGTGTTTATTTGGAGTGGTTGGGAAGGTGATGGAAGTTAAACGGGAGGAGATGGAGACCCCTGGCACCTTCACGTGGTTGTGCAAGAAACATCCAAATGGTTCTTGCAATTAGAGAAAACAATCTGATATTTTCAACATGACTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGGGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGTCTTCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTTTTGAGTAGCTGGAATTACAGGCGTGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTATTTTTCGTAGAGATGGGGCTTCACCATGTTCGCCAGACTGGTCTCAAGCTCCTAACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCCCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACCACGCCTGGCCCCAAAGTGGTTATTTTTATGAAACCAAGAGAAATGACAAGTAAACCAGCTAATAACTAGGGACTTTCTGTGGTATAAAGTAATCCTGGGCTCTTAAAATCGTAATTTCAAACTTGAGCTCTTTGCAATAGTTACTCTATTTTTTTCCGGTGTTACTAATAAGTATTGGGATTCTGGCTTGCCGTTTAACCGCTGTCTCCCTCCTGGTTTTCCATTGTAAAGTAGACTCACTTGATGACCAAATGTTTACTTCAGATGTGCCTTGAGGGCTGTCTCAGGGCTCGAAGGATATGGCTGCCTTTGTGCTGATGAAAACTACGGAAGTTCAGAGAAGGGAGCGTGGAGAGGAAAGGTCAGGTCAGAGAAGGCTTCCTGGAGGAGGTGACACCTAAGCAGGAGGTTGTAGAAGGGAGTAGGGTGTGGCAGCTGAGAGGAGCTGTGCTGAGCAGAGGCTTGGAAGGGCAGAGCCACGGTGGTTTATACCTTTGGGTGACAGGAGAGCTGGCAGATTGGAGTGGCAAGTGTGTTTTTAGGAAGTGGTAGGAAGTAGAGTTTGGGGGAAGGGTGGGTGAGGGCTTGGACTGAATGTTTTGCCTCAGTGGGTTCTTGAACTAGACCCCCAAGGGGCATGGAAGGAAGCGGAGTTTGGCAACAGGATGTAGGTTTGATTAGGGTAGTGAGAGGCTAGGGGCAGGAGAGCAGCCAGGAAGCTCCCTTGTCTTCAGGTGTGCAGTGATGGGGGTCTGCCCCAGATGGGGCACGTGTGAGAAAGAACTGATAGTCACCATGGCTAGCACTTTCCAAGCTCTTTCTGCAAGCCAGGAAATATGCTTAGCATCTAATATGGAAAACTCATGTAATCTTCACCACCCTGGAAGATAAGCAGGATTATCATCACCAGAGATCCCTTAAGATCATGTGCCTTTGTACCAGGCAGAACCAAGATTTGAACTTATGTGTGTGAGGACATAGCCCATGTTTTTAAGCGTTGTCATATGTATGATTCTAAGAGACACTTCCTAGTGGGTGTTGGAAGTTGGGGATGCAGATGGAATTAAGACAGTGACTACAGAGCATCTGGCCTGGAGGATTCAGAGGACTGGGAAGAGAAGAGAAGGAAACTGAAGGGGATTTGGGGCAGAGACTATCACAAACTCCAGGGACTGGGTGAATGAGTAGAGCTGTCCTCTGGAGAAAGGGACTGACGCCGAAGGTCTGCAGTGACCCAGCCCTGCCCTGGGCACCTTCATGCTTGTCTCACTAAGAATCCTGTGAGTGGCTGGCATTGTCATTTCACAGATAGGAAATATAAGTGCAGGAAACTCACATGGCTGTTGAGTGGTGGAGCCAGGATTCAAACCCAGACCTGTCTCTTTCTGCATGGAGATCTCAGTTTTGCTTGAAGCAAAGTGCTTGATTTTCTTTGGCCCTGAAAAAATAACTGCATTTTATTCCTTCTATTAAAATAAGCAAACCTGTCTCCCTATTTTACAGCTGTAGCTGTCGTTGCTTCCCTTCCGGTGGAGGTGACCAGTTTGTAATGAACTTCTGGATCTCCAGTCAGATACTATGGAGGAGAGAGTGATGGAGGGCTGAGGAGAGGCCTCAGGTTGTTATTTGGTTGGGGAGGCACAGAGCAGAGGTTCAGGTCTCAGCAGGTGTCAGAGGTGATTACAGCCCTTCCCATCCACCTTGCAGCAGGGGCTTTGTGCCTTTCATCTTTAACTGGGCACCTGAGATGGGAACCAATGGGGACCATCCCAGACACATGGGTTTGTCTGTCCCTGACTTCTGCCTCTGAGATTGTCTTTGTTGGTCTTTGTTTAATAAACGCCCCGACCTTCCTCATGATTGCTCACAGGAGTCCCTGCGTTTGTCTTCATCCCTTCTCAAACATTTACTCGACATAAGGCCGCGTGACCTCTATTCTGTTTGTCCAGCTTATGACCTTTGGACACATTCACCCAGCACAGGATATTTCCAGGCCTGGTTAGTCAGTGGCGGTTTAATGTTTTTCTGACAGGAACCTCTGGGCACTCAAAATTCAAGTACCTTCTAATTCTAATGAAGATCGGACCTATATTAATAGATTAAGTGGCAGAGCTTATGTCTCTCTGTGACTGTTTCCAGAGGACATTTTACTCTCCATACCCAGCCCTAATCCAGATGCGTGGAGTTTCTCACCTGAATTCTTGGAGCAGCTGCCAAACTGAACCTGTCTTCAGCTTCTGCCCCTTCATCCCAGCTCTTCCACTTCTACCAGAGTGATGGGGCACTCCTGCTTAAAAACCTTCATGAGCTTCCCAGTATCTACCAAATCAAGCATGACCTCCTTGTTCTGCTTGGAATCCGTGGCTCTGTGGGACCTGGCCCAAACCTCCCCTGCAGTCTTTTCCCACCCCTGACCCCCCATGCTCTATCCCCACTCCATTCAGACCAGATCTTGCTCTTTCTTGAACACAGCCTGTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGACGGTCTTTCTACGTTCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTGGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCTACCGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGAGTTTCACCACGTTGGTCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCCTTGCTCCTGGATTTTTGGCTTGGAATAGCCTTGTCCCATCTCTGTGATAAAATCCCAGTTGTTCTTTGAGTGCCCACCCGTGGAGACCCTCTTCATAAAGCTGCTCTTAAACCCTGTCCCTTTTCCCCATCCCCAGTTCCACACACCTGGGAGCACCTCTAATCACCTCTGCTAGAAGTCGTCTCCCCCAGAACATTTGGATTCTCTCTCTTGGCTTTTTATCATAGTTCACCTTCTTTTCTGTTTATATGAATACTTGTCTTATTTCTTCTAGGAACCTGTAAAATCCTAGAAGACAAGGAACCTGTCTTTTTCCTTTCTCTTTCATTCCCCCTCTTCCCTCTCTTCCACCCTACTCCCTCTTCCTTTCCCTCTCCCTTCAGTATCATGAACCTCGGAGCCCCACCCTAGAACTCCTGAATCAGACACTTTGAGGGTGGCTGGGCGCAATGGCTCACGGCTGTAATCCCAGCACTTGGTGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACTCGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCTGTCTCTGCTAAAAATACAAAAAAAATCAGCCAGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGAGGGCGATGCCCAGCATTCTAAGTGATCCTGATTCAAACTCCAATTTGAGAACCTCTGCACTAGACCTCTGTAGACCTCTGGTTCTCAAACTCAGCCGCACATTAGAATTACCTGGGGGCCTGGAGCCTACTCCAGGGATTCTAATTTTCTGATTTAATTGGTATGGGGTATGGCCTGGGCAAGGGAGTTTTGAAAGTGCCCAGGTAGTTCTATTATGCTGCAAAGTGTAAAGAGCACTGCCATAGAGCTTTGTTCTTCAGGGGGTGGTCAGTGGGCCAGCAGCATCAGCTCACCTGGGAGTTTGTTAGACTAGGACTGTCAGTCTCACCAAGCCCCGCTGAAGCAAATTTGCATTTGACAAGATCTCCAGGTGATTCCTATGCTCTTTGAAGTTTGAAAAGCACTACCCAGGAGAGGAATAGAGGTTATCAACTTCAAGCCTACTCTTGTCCAACAGTTGAGTGAAAGAGTCACAGCTGACCTCTCCAGCCATCCTCAGCATCATCTGGCTTTCAGCCATCAGAGGCAACAGGTGATTTGTTTTGAGCTTGCTGCCCCAGCAAAATGCTCCCTTAATGACCACAAATGAACACATACATTCATTTGTCTCAGCCAGAAAGGGAGTGGAGAGTGTTACAGCTTATGTCTTTTTAAAGCTACAATTCTTAGCTTCAAAACAAAATTACTTTTATATATATATATACACATATATATCTATGATATATATCATATATGATATATGAGATATATGATATATCTCATATGATATATATATGAGAGAGAGACAAAGTCTCACTCTGTCAACCCAGGCTGGAGTGCACTGGTGTGATCATAGCTCACTATAACCTCGAACTCTTGGCCTCAAGTGGTCCTCCTGTTTCAGCCACCCAAAGCACTGCGATAACAGGAATGAGCCACTGTGCCCAGCCCAAAAATTACCTTTAATTTACTCAAATGTTTGAAAAGTATACCGGACAGAATTCTTAGGGAGCGGTAACGTTATACCTATGAAATGTTTAGCATTCATGTATTTCACCTGATAACAGTCCATTGCTGTTTTTATCAGCAGTTAGTCTTTCAAGCAGCCAGAGTTCAGGGGGAACAATGCTCCCAGTCCCACTGGGCTTGCCAGGGCAGCGCTCTAATGGGGAGAGCCCTAGTGAGAATGGAGCTGGGCATACCCTATATCAGAACCACTTCTCTATTTTAGACCAGTGGCTGAGACACAGGGGTAGGACACAATCAGGCAGGAAGGGGCTGGAGAAGAATTTTGAGCCAAACACACACCAAAGCACCAAAGACTGTGACCAGTTTATTTCATTGTTACAGCAAAGTCAGGTCTATCCCCTATTGACATGAGTCTTCCCCATGTTCATTCTGGTATGCTCTATGGTGCGGGAGAGAAAGAGGAGGCCTGTGGCCAGGCGAGGACACGCAGGGCCCTGTGAACGGCCACGGGAATTTGTGCTGTGCACGTGAGGCCAGAGCTCACGTGGCAAGTGCGAGAAATACAAGGACCGTTGGCTGAGATTGAGCTACGGTGGCAGCTTTTGTCCACTGACAGATAAGGGGAGAGGTCCTGTGGCCCTTCAGGGACTGTTCCAGTGAATGATTTTTGGACAGTGGTCAAATCATTTTGAAAAAACTAAAATTGGATACCTACTTTGCAGCTTACAAAGAAATAGATCCCTGCTTTACAAGTTACACAAAAATAGGTCCCAGATGGATTACAGATCTGTAATAGACAGGATCTGAAATGACATGTGAGAGAATATTTTTGTAATCTTAGCATGCGGGAAGGACTTTCATGTTTGTTTGACAGGAACCTCTAGGCACTCACAATTCAAGTATGAAGTGTGAATAAGCAATACAGAAGTCATCAAAGCTAGATTGGACTCAAAACAGAAGTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACCCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCGGCACTGCAACCTCCACCTCCAGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGGTGGGACTACAGGCACCCACCACCACTCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGAAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAATCTCCTGAACTCAGGCAATTCGCCCGCCTCTGCCTCCCAAGGTGCAGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCAGCCAAAACAGAAGTGTTTCATATAAAAAACGATACTGTGAATCAAAAGACAGCATACACATTAGGAGGAAATATTTGCATCCAAGTCTAATGTAGCAGATCATGAGTCAAAATCCTTGATCTACAAGAGCCTCTGCAAATTCATAAGAAAAGTCAACCAAATAGAATAAAAGGTAAAAGATATAAACAATTTAGAAATGAAGAACTAAAAATTATGAAAATATGTTCTGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACGAAAAATACAAAAAAAATTAGCCGGGCATGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTGGGGAGGCTAAGTTAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGACAGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCCAAAAAAAAAATTTTTTTCTTTTTAATTAGCCAGGCATGGTGGCACACACCTATAGTCCCAACTACTTGGGGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTCAAGACTTAAGTGAGCCAAGATCCCACCACTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGTGATATACTGTCTCAAAAAACAACAACAGGCCAGTCGTGGTGGCTCACACTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAACCTGGCCAACGTGGTGAAACCTCATCTCTACTAAAAATAAAAAAATTAGCTGGGAGTGATGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGATTCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAACACAAAACAAAACAGAAAAGCAAGAACAACAAAAAAGTGGATGTCTGGGCCATCCAGCCTCTTACTCATAAGCCTGCTTCCTTAGAAGCCGCCTCCCTACATCTACTCATATCCACAGAATGTGCTCCTCTTGGCATCCTGGAGTAGCCAAAGCCATTGCTATCAGTAAAAAAATTTTTTTTTAATTCCCAGCTGCCACCATCTCCTCTCATCTCCATTCACAACGTGGTAAGAATATTATTTTTGTATCTGACCAAAACCAGTTTCTGAGTTTTCATTTTCTTAATTGGCCACCAATAAATAAAGGAGGGACTCACCTGCCCTTGAACGTGCTCTGCTGTGTGCTCTGGATCTCATAGGGGCCAGCCTTTCTCAGGGAGCCTGGAGGGGGCCAGGGATCCCTTATTCTTCCCAGCTCAGTGACTTTTTCCCATTTTGGAGGCCCTTGTCAGTCAGATCACCTGAAGGGCCACTCTTTTCTGTCCTGTAGAATGACTCCTGTGTCTCTCTGGTCTTAGAGGGCAACTTGTGAAGAACTGCCAACCTTCCTTTGGTCTTCGCTGGATAGCAGCGGTGTTTGTAAAGATAGGACTGGTCTTTGAGCAGTACAGTGAAGGGGTTATTGGGCCTGGATTCTACTCAGAGGGACCTCCTTAGTGAGGTTTATGATATTTATGTTATACAGCAATGTAGAAATGACCTTCTAAAGGCCAGGAGCGGTAGCTCATGCCTGTAATCCGAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACTATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGACGTGGTGTCCGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGTAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGTACTCCGGCCTGGAAGACAGAGTGAGACTGCGTCTCAAAAGAAAAAAAAAAGGGGGAAATGACATTGTAACCAAAATTGGGGTTGGGAGGAATAAGGTGGTTTTATAGGATATGTTCTTTGATTGTCTTGTATGTAATACCTGGGAGTTCAAAGACTTGACATTTAAAAGAAGATAGCCCCATAAATTAAGTATCGCACTTAAAGGCTGCCAGATTTTAAAGAAATTCTTTCATATGTTCATCTAATAGTTTGATGCTGCTATTTGGGTTTTTTGTTTTAACATTTAAATCTTAGATCCATTTGGGATTTGTCCGTTTCTGGGTCCAGCTTGAATTTTTCCATTTGAATTGAATTTTTCCAGTTTTCCGTAACTAGTTCTTCCAGCATCATTTATTGTATGTTGTGTCTCTTCTCCATGGATTTAAGAGGCCAACCGTATTGTATGCTAAATTTTCATAGTCATTATACAGATTATCTTTTCTCTTCTCTTGGCCTGTCTATTTCTGTTCCACTTGTATTAAATTCTGAACTTACATATCTATTGAATCTATTTCTGGAGTTTTTATTTTGTTTATTTGGTCTGATTGTCTATTAATGTTTTAATTATTGAGATTTCATAATGTTTTTGTTTTTGTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACAATCTCGGTACACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGGTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGGTAGTCTAGAACTCCTGACCTCAGGTGATTCACTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTTTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCCGGCCGAGATTTCATAATGTTTTAACATCTGACAGAGATAGTCCCTCTCCCCTCCAATTTTAGTCAGTAATCTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGAATCTCAGTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCTGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAACGATTCAACGATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAACTAGCTGGGATTACAGGCATGTACCACCATGCCCAGCTCATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGAGCTTGCGATCCGCCCACCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAGCCACTGCTCTTGGCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTAGCATGATCATAGTTTACTATAATCTCAAACTCCTGGCCTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGGTTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCAACACACCCGGCTAATTCTGTTTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTTGGCTGTGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCATGCAGTCCTCTCACCTCAGCCATCCAAAGTGCTGGGATTGCAAGCAATAATCTTATCTTTTTTAGTGTTTATTTTTGCAAACCTCTACTTAGCTGCATGCTTTACCAGTTTTAAATGTGAATTCTTTGAACTCCCAGGTTATTACAGATGAGGCAATCAACGAACATATCCTATAAACCACCTTATTTCTCCCAACCCCAGTTTTGGTTAGAATGTCATTTCTACACTGCCGCATAACATTCACAAGCTCTTTAATCACCCCAGTTGCCATGGTAGTTTTAGTCTTCATTCTAAAGTTAAATTTATTAGGTGTTCACCCCTCTAGCAGTCCATTAATTTGTGTATGTTCAAAGCTGTTTGCCTATAGGTTTATACTTGAAGGACAGTTTTGTCGAATATAGAGAAATCTTTTTTTTTTCCTGAGATAGAGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACCACGACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGTTGGGATTACAGTCACGTGCCACCACACCCAGCCTGAATATAGAGAAATCTGAAACCAGTTGATTTTCTTTCCCCTTGTAAGTGATTTGATCCTTTTGCTGTTGTCCACTGGTCTTACTGTTAGCCACCCTGGGTTAGTTTTTGTTGGCCCATGGTGTAACTTTCACATGTTCTTATATCCTTACAGGTTTTATCTTTAAGTATTAGTTCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTGTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGACTACAGGCATCTGTCACCACACCCAGCCAATTTTTGTATTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGCTGATCGTGAACTGCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCAGCCCCCCAAAGTCCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCTTTAAGTACTAGTTCTATTGCTTTGTTTTTTTGAGAACTCCAGTTATGTTTACTGATTCTCCTTTTGCCTAACTTCTGTTTCTATCTTTTTGTTTAAGATAGGGTCTCACTCTGTCACCCGGGCTGGAGTCCAGTGGTGCAAATATGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGCCTCAAGCAATCGTCCTGCCTTGGCCTCTTAAGTAGCTGGGTCTACAAGTGTGTACAGCCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGATGGGGTGTTGCCATGTTTCCTAAGTTGTCCCAAACTGCTGGGCTCAAGCAATCCACCTGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACCTGAGCCAACGCGCCTGGCCCTCTGTCATTCTTTTTAATCCTTTTAACCTATTCCTTTGTTTCCATTTCCTGTCATTGCTTTCTTATTTTGGTCCTCTTTTTCCCATTCTTGGAATGGTGCTTTCCAAGATGCCTATTCCCATTGCGCTCCTTTTCCTGTTGTCTTCATTTCTCTGGCTGATTTTCCCTCCTTTCCTGAGTTCTTCTAGTGTACATTTAATCTCTTCCTGTTGTCTCACCATCCCTTCTTCAAGCTCTTCTCTGTGGTATTCCTTTATAAAGGCAGTTGCCTCATTTAATTATTTTTATGGATGGAAATGATCACTTTTCTCAGTAATAGTAATTCCTTGGGCCGGGCTCCAGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGCCGAGGCAGTTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGACACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAAACAATGAGCCGGGGGTGGTGGTGTGCACCTGTAATTCCAGCTTGTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGACGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTTCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAATACCTTGGATTAATGTGCGTGGGTCAAAGGCTCTTTCCTTCTCTGCTTTCCAGAAACAGCTTCCTGCGTACATGGCTGCCCTGTGTGATTCCAGTTGCAGCCTCACCTCCTTTGCCTCTCTGAACCAAAGAAGCCAGCCCTGCTTACCCCAGTTCCCAAACACAGGAAGTGATTTTCTGCCTGAGCTTTCTGAGTTCTGTTCCCTCCCACCCCAGGGCTCTCCATGCTTATTCATTGCATTTCCTTCCTCATTGCTTTTACCCAGTCTGCTGTTTTGGGAAGCCCTGACATGTATTTTGGTGCCTACATATTTTATCTTCTGATCTCACTGAAAATAAAATTGGATTTTACTTGTTTTCCTTGTTGCTTCCGAGCTCATTGGAGAGCTAACCAGTTCTGATTTTAAAACAGCAAAAACAGCCTTATTAGCTAATGTTACCTATTCAATTACTAAAATCACCCAAAAAAATGTTTTTGGTCATGTTAGTTTGCTAAAAATTAATCAGGGTCTTGGCCTGCAGGTTCTTCTAGAAGAGAGATGCTGGCAGGGCTCTGTGCTCAAAACTTGCCAAAAAACTGTCTTCCGGCCAGACATGGCAGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTCTAGGAGGCGGAAGTGGGCAAATCACCTGAGGTTGGAAGTTCGAGACCTGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGCCATGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGTTAATTGGGAGGCTGAAGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGGAACAGAGGTTGCGGGGAGCCAGGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACTGTCTTCCATGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTCTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGCTCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACGTGGTGAAACCCTATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGTTGGCGTGCGCCTGTAGTACCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCCCTGAGCCAGGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCCAAAAAAAAAAAGACTGTCTTGCAGGAAGTTGAGGAAACACAGAATTCCTGGTTCTGCCGAGTCAGAGTATACCTTGTGCCCCTTGTGCCTGTATCTGTCCCCTAGTGATATGAGGGGTGGGGCTGGAGGGCAATTCTGTGAACCCACAGATTACCAGCAGCATGTGTCAGTGTAAGCATGGAGTTTAATTATATGCCTGTTTTCAACTTTAAAGGTGATCTTATGGCCAGGCATGGTGGCTTATGCCTATCATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCACTCAAGCCCAGGACTTTGAGACTAGCCTGGGCAACATAGCAAAACCCCATCTCTACAAAAATACAAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCATACACCTGTGTAATCCCAGCTACCTGCAAGGCTAAGGTGGGAGCGTCACCTGAGCCCAGGAAGTTGAGGCTACAGTGAGCTGCGATCTCGCTACTGTACTACCGCCTCGGTGACAGACTAAGACCTTGTCTCAAAAAAATAAAAAATAAAAATAAATGTGATCTTAAATTGACTGAAGGCAAGAGTGGAGCCCAGGTCCTGCCTGAGAGGGGCATGTCCAATTTTATCATGTTCATATGTAAGAGTTTATATTAACTTACAGAAAATTAATTGAGCATCTAACCTTAAATAAAGTTTTTTAGCTTTAATAATAGAAATGTCACTAGGAGTTCGAGCGCGATAGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTATAAGAGGCCCAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGTGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACTCGGGAGGCTGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATCTCGCCACTGCAGTCCAGGCTGGGTGACCAAGTGAGACTCTGTCTTAAAAAATAGAAAAAAGTGCAGCTTTTTTTAGGATTGAGGTCAAGAGGGAAATTTCCTCCTCAGGCTCATCAAGAGGACATTGTGTGGTATAAACAATGTCATCAACAACTTCCTGGCAGCATTAATGTTCCCAACAGCCATTAATTTTTTTTTTTTTTTTCGAGACAGAGTCTTGGCTCTGTTGCCCAGGCCGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACCAAAGCGTCCACCTCCTGGGTTCTAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCTACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTATTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAGATAATCTACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGTGTCAGTCATTAATTTCTAATGACACTTCTTAGAGTGTCAGCCAGGGCTATGAAGCCAACACACTATTCAGTAAACACAGTTCTGCCGGGGGTCAGAACAGTGTGATCCAGGCTCAGCTCTCTGCTGCTTTGGCCTCATCCTCGGGTAGATTTTACAGTCCCTCATCTAAGGAAGGGGCTATGTTCTTCTAGCAGTCCTCCCTAATGATTTCTTTTACTCAAATATTTGGGCACTGGAAGGTTTAACAAGTTCCTGGAAGACATATTACCAATTAAAGATCTATTCATGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTCTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATGGCGTGAACTGGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCCACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATCTATTCATAAGCTCCCACTGCAGACAAATTTGAGGGCTCTTTTAACAATCCAGTTAACTTGCTTCTAGTCATTGGTATACACACCTAGGGTCCTTATTGCACGGGCTCTGTCATCTTTCCTGTGTCTAAATACAAAGTAATGCGGTCATAAACACCAGATACATGTCAATACAAGAAATTATTATATAAGCTCCTTTTGAAAGGAGACTGAGCTTTAGGGAAATGTCTATGGTACCAATAAAAAAACTCATTCATGCACTCATTACATTGAATCAAGCACCAGGCATTATGGTGAGTGTGGGGGTAATTGGGTAGGTACCCTGTTTATGTCCTTTAAAATTCCCACCTGACCTCATTTTCAGATGAAGACACAGGTAGTGGGGACATGGAACCCAAATCTTTAAGGCTTTGAAATTCTGGGTGATTGCCACAAAGATTATGAGGCCTGACAACCAGTCAGAATGAAATAAGCCTGGGTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATCAGCTTTTAGGTTCAGGGGTACATGTGCAGGATGTGCAGGTTTGCTACAAAGGTAAATGCGTGCCATGGTGGTTTACTGCACAGGTCATCCCACCACCTAGGTATTAAGCCCAGCATCCATTAGCTATTCTTCCTGATGCTCTCCCTCCCCCTCCCCCACAGGCCCCAGGGTGTGTTATTTCCCTCCATGTGCTCATGTGTTCTCTTCATTCAGCTCCTGCTTATAAGAGAAAAGATGCAGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTATGTTAGTTTGCTGAGGATAATGGCTTCCAATTCCATTCATGTCCCTGCAAAAGATATGATCTCATTCTTTTTTTTGGCTGCATAGTATACCATGGTGTATATGTACTACATTTTCTTCATCCAATCTATCATTGATGGGCATTTGGGTTGATTCTATGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCAGCATTGAACATGTGTGTGCATGTATCTTTATAATAGAATGATTTATATTCCTTTGGGTATATTAAACCTGATTATTAAAGGCTTTGAGGATTTTCTAGCCTCTTTGTGTTCACTGGAAGTTTAATTTTTATAAATTTCCCCCTTCGTTTTCTTTTGTCATCATGACAGGGAGTTGAGTAGACATTGTATGTTTTTCTTCATTGTTTCAG
Seq C2 exon
ATTTTGAGATACAGAGTGAAAATGGGGAGAACTGTAATCAAGACATGTTTGAGAATGAATCACGTAAGATATTCTCGGAAATGCCTGAAGGTGAAAGTGCTCAGCACTCCGATGGGGAAAGTGACTTTGAGAGAGATGCTGGCATCCAGAGGCTCCAGGGACACAGCCCAGGTGAGGACCACGGGGAGGTGGTTTCTCAGGACAGGGAAGTTGGCCAGCTCATAGGCCTGCAGGGCACCTACCTAGGGGAGAAGCCCTACGAATGTCCCCAGTGTGGGAAGACCTTCAGCCGGAAATCCCACCTCATCACACACGAGAGGACCCACACAGGAGAGAAATACTACAAATGTGATGAATGTGGAAAAAGCTTTAGTGATGGTTCAAATTTTAGTAGACACCAAACCACTCACACCGGGGAGAAGCCCTACAAATGCAGAGACTGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGAGTGCCAACCTCATAACCCACCAGAGGATCCACACGGGGGAAAAGCCCTTCCAGTGTGCCGAGTGTGGCAAGAGCTTCAGCAGGAGTCCCAACCTCATTGCACATCAGCGCACCCACACAGGAGAGAAACCCTACTCGTGCCCCGAGTGTGGAAAGAGCTTTGGCAACCGATCCAGCCTTAACACGCATCAGGGGATCCACACTGGAGAAAAGCCCTACGAATGTAAAGAATGCGGCGAAAGCTTTAGTTACAACTCCAATCTAATCAGACACCAGAGAATCCACACAGGAGAGAAACCCTACAAATGTACCGACTGTGGGCAGAGGTTCAGCCAGAGTTCAGCCCTCATCACCCACCGGAGAACCCACACAGGAGAGAAACCCTACCAGTGCAGCGAGTGTGGGAAAAGCTTCAGCCGCAGCTCTAACCTGGCCACACACCGGAGAACCCACATGGTGGAGAAGCCCTATAAGTGTGGGGTGTGTGGGAAGAGCTTCAGCCAGAGCTCCAGTCTGATTGCACACCAGGGCATGCACACAGGGGAGAAACCCTACGAGTGCCTGACATGTGGGGAGAGCTTCAGCTGGAGCTCCAACCTCCTCAAGCACCAGAGGATCCACACGGGAGAGAAACCCTACAAATGCAGCGAGTGTGGGAAATGCTTCAGCCAGCGCTCCCAGCTCGTAGTGCACCAGCGGACCCACACGGGCGAGAAGCCCTACAAATGCCTCATGTGCGGCAAGAGCTTCAGCCGGGGCTCCATTCTGGTCATGCACCAGAGAGCCCATTTGGGAGACAAGCCCTACAGGTGCCCTGAGTGTGGGAAAGGCTTTAGCTGGAACTCAGTCCTCATTATACATCAGCGAATCCACACTGGGGAGAAGCCCTACAAATGCCCCGAGTGTGGCAAAGGCTTCAGCAACAGCTCTAACTTTATCACACATCAGAGAACTCACATGAAAGAGAAACTTTATTGAAGTGGCAAAGAGTGAAAGTGAGGGACTGGCCTGGAGTGGGAGTTGCCACACTGCCCCAACAGTGATTCCCTTTCAAAGAGCTGTGCTTCCTAAACATTCTGGGGGGTTTTGCCAGAGTCTTCCCCTTGCTCATCCTCATTTCCAGGACACTGTCATTTTAGTGGTCTGAGTCAAGTCCCGTATACATTCAAGAACAGGGCATAGGCGTGGAAGGTCTGGAAAGTTGGGTCTTTTTCCCTTACATTGGGTGACTTGATTGGCCCCCTCTCATGATTCCTCTGTGCCTCAGTTTCCTCTTTGGTAAAATGGGGGGAAATGTTTCTCCATGTGGAATGGAAGACAGCATGGCCCACAACGTGGGCCGAGTCCTCAGAGAAATACTGGAAATCATTGGTGTGGTTCTGGTTGTTTTGTTGTTTTGCTGCCACGTTGTTGGGCTAAGGTGCCTTCACCCCAAGCTGTTAGTGTTCCAGGGCACCCCAAGCTGTCAGTTAGAATCTGCTCTTCTGGCTTTGGTGTCTTGGGCTTTGATTTCAGGTCAAGATGGAGGGGCTTCTCCAGTTCTGAGTCACCCACGTGAAGGTAAAGACCCTTTCTATTTCCAGAAAGTGTCAGGAGCACAGAAACTTGAGGAAGTACAGCCTGGAGCCAGTGTCCCAGTGTCCTTTCCATTGGTAAGAGTTGGACAGGGCCTTCAGGAAAGGGGTAAACCGAGGACATTTCAGTGCTTGCTTTTGTCTCTGCCTACTGTCCTGTGGTAGATCAGCTACCAGGGGAACACATTTGTTCTCGTGGGGTTTTGTCCTGGAGAGTGTAGTGAAGTCCGAGAGCCCTAGCTGCCAACCCATGGTGGATGGTAACTTCTGTCTCATCAAGAGTAAAACAGTCCTGCACACAGCAGGGTGGGTTTGTGCCTTTGGCCCAACAGGTACATAGCCCCATAATTTCTGAATTATTCTATGCACTTGTTTCCCTCTTCTTTTATTTTTTATTTGATATATGCCGAGCTAGAATCCTGTCGGGTAGCTTTTGTATACTAAGAACATTATTATTATTATTATTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTCTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGCGTTAGCCAGGATGGTTTCGATCTCCTGTCCTCGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAGCGCACCCGGCCAAGAACATTATTTTTAAAGAAGTGTTAACTTTGAGGACATATCTGTTCCCTGGAGATATTTGGGCTTGAATCAGGAGTTTGTCCTACAGGTGTCGCCCTTGATCTCAGGATGCTACCAGGGCTTTGTTCTCGGGATCCTCGCACCTGGAGAGTGAAGACGGGCATGACGGCAGGTGAAGGGGTTTGCTGTGAAGGAAGAGGAGATAAGGCATTTCCAGGAAATGGGAAACTGCCTCCTCCTACACATGGGGCCTGTGCTCAGAATGGGCTTAGTTCTTATAGGATGGATGCTCAGTATTCCTTAATAAAGTAGAGTTCCATTCTT
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000176371-ZSCAN2:NM_181877:2
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.831 A=NA C2=0.239
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0202312=SCAN=PU(95.5=62.5)
A:
NA
C2:
PF0009621=zf-C2H2=WD(100=4.9),PF127602=Zn_Tnp_IS1595=WD(100=9.9),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF097235=Zn-ribbon_8=WD(100=9.5),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF127602=Zn_Tnp_IS1595=WD(100=10.1),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.4),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.2),PF097235=Zn-ribbon_8=WD(100=8.8),PF134651=zf-H2C2_2=WD(100=5.6)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)